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文档简介
第五章基因表达的调控
主讲教师:刘静
中南大学生物科学与技术学院分子生物学研究中心研究方向1:造血发育调控研究方向2:白血病治疗的分子机制研究当前1页,总共59页。概述基因组(genome):一个细胞或病毒所携带的全部遗传信息或整套基因。在某一特定时期,基因组中只有一部分基因处于表达状态。在个体不同生长时期、不同生活环境下,某种功能的基因产物在细胞中的数量会随时间、环境而变化。当前2页,总共59页。Translation
生物基因组中结构基因所携带的遗传信息,经过转录、翻译等一系列过程,合成具有特定的生物学功能和生物学效应的蛋白质的全过程。基因表达(geneexpression)注:并非所有基因表达过程都产生蛋白质。rRNA、tRNA编码基因转录合成RNA的过程也属于基因表达。当前3页,总共59页。
基因表达的时间性及空间性1.时间特异性
按功能需要某一特定基因表达严格按特定的时间顺序发生。如病毒感染;胚胎发育。基因表达的时间特异性又称阶段特异性。当前4页,总共59页。2.空间特异性
指在个体生长全过程,某种基因产物在个体不同组织器官表达存在差异。空间特异性又称细胞特异性或组织特异性。当前5页,总共59页。
按对刺激的反应性分为两大类:
1.基本(组成性)表达
(constitutivegeneexpression)
基因较少受环境因素影响,而是在个体各个生长阶段的大多数或几乎全部组织中持续表达,或变化很小。如管家基因。
基因表达的方式当前6页,总共59页。管家基因(housekeepinggene)某些基因在一个个体的几乎所有细胞中持续表达。bcl-2β-actin12琼脂糖凝胶电泳图1.对照组2.实验组当前7页,总共59页。常用的管家基因中文名称英文缩写Beta-肌动蛋白β-actin甘油醛3-磷酸脱氢酶GAPDHTATABox结合蛋白 TBP18s核糖体核糖核酸 18srRNA微管蛋白α
α-tubulin当前8页,总共59页。2.诱导和阻遏表达
在特定环境信号刺激下,有些基因的表达表现为开放或增强。诱导表达(inductionexpression)
在特定环境信号刺激下,有些基因的表达表现为关闭或下降。阻遏表达(repressionexpression)当前9页,总共59页。
在一定机制下,功能相关的一组基因,协调一致,共同表达。协调表达(coordinanceexpression)当前10页,总共59页。
基因表达的调控
机体各种细胞内相同的结构基因,根据机体的生长、发育、繁殖及环境变化的需要,有规律的选择性、程序性、适度地表达,以适应环境,发挥其生理功能。
(geneexpressionandregulation)当前11页,总共59页。
基因表达调控的生物学意义
1.适应环境、维持生长和增殖;
2.维持个体发育和分化。当前12页,总共59页。
基因表达的调控因子
蛋白质(主要)
小分子RNA(某些环节)当前13页,总共59页。
基因表达的调控水平
基因组
转录后
翻译
翻译后中心法则(centraldogma)
转录当前14页,总共59页。
第一节
原核生物基因表达的调控
主要在转录水平,其次是翻译水平。本节主要以大肠杆菌为例介绍原核生物基因表达的调控。当前15页,总共59页。一、原核生物基因表达的特点
1.只有一种RNA聚合酶。RNA聚合酶用来识别原核细胞的启动子,催化所有RNA的合成。2.基因表达以操纵子为基本单位。原核基因一般不含内含子,基因是连续的。原核基因转录单位多为多顺反子。
当前16页,总共59页。操纵子学说开创了基因表达调控的研究F.JacobJ.L.Monod当前17页,总共59页。tayz
opStructural
genepromoteroperator(启动子)操纵子(operon)模型操纵子(operon)
:一个多顺反子转录单位与其调控序列即构成操纵子。terminator(操纵子)(结构基因)(终止子)当前18页,总共59页。PromoterGene1Gene2Gene3TerminatorDNAtranscriptionmRNA3′1235′translationpolypeptidechain123原核生物的mRNA是多顺反子mRNA当前19页,总共59页。多顺反子(polycistron)
原核基因中多个功能相关的结构基因串联在一起构成一个转录单位。通常依赖同一调控序列对其转录进行调节,使这些相关基因实现协同表达。当前20页,总共59页。3.转录和翻译偶联进行:原核生物裸露的环形DNA,在拟核内转录成mRNA后,直接在胞浆中与核糖体结合翻译为蛋白质。
4.mRNA翻译起始部位有特殊的碱基序列---SD序列。
当前21页,总共59页。
SD
(Shine-Dalgarno)序列
在起始密码AUG上游4~13个碱基之前有一段富含嘌呤的序列,其一致序列为AGGAGG,能与核糖体30S亚基中16SrRNA3′端富含嘧啶的序列结合,与蛋白质合成过程中起始复合物生成有关。
当前22页,总共59页。5.原核生物基因表达的调控主要在转录水平,即对RNA合成的调控。
通常有两种方式:
(1)起始调控,即启动子调控;
(2)终止调控,即衰减子调控。当前23页,总共59页。二、原核生物基因表达的调控机制
(一)转录起始的调控
1.б因子及RNA聚合酶对转录起始的调控
2.转录起始的负调控
3.转录起始的正调控
4.转录起始的复合调控
当前24页,总共59页。调控RNA聚合酶与特异DNA区域结合:确保RNA聚合酶与特异启动子序列稳定结合,而不是与其它位点结合。(1)б因子1.б因子与转录起始的调控
当前25页,总共59页。核心酶(coreenzyme)全酶(holoenzyme)
例如:大肠杆菌RNA聚合酶由5个亚基(α2ββˊб)构成,核心酶(α2ββˊ)能以DNA为模板合成RNA,但必须依靠б因子协助才能在正确位置起始转录。当前26页,总共59页。
不同的σ因子决定RNA聚合酶对一个或一套启动子序列的特异性识别和结合能力。最早发现的σ因子:σ70新发现:σ32、σ54
、σ28当前27页,总共59页。机理:б因子含有识别启动区的结构域。a.б因子独立存在时,N端抑制了C端DNA结
合活性,与DNA不能结合。b.当б因子与核心酶组成全酶后,N端对C端
抑制作用消失,可与DNA特异结合。c.转录起始完成后б因子脱落,核心酶向下
游滑动完成转录。当前28页,总共59页。
(2)启动区序列启动区序列是RNA聚合酶结合并启动转录的特异DNA序列。(共有序列)RNA转录起始-35区-10区TTGACATTAACTTTTACATATGATTTTACATATGTTTTGATATATAATCTGACGTACTGTN17N16N17N16N16N7N7N6N7N6AAAAAtrptRNATyrlacrecAAraBAD
TTGACA
TATAAT共有序列90%以上为嘌呤核苷酸当前29页,总共59页。
共有序列决定启动序列的转录活性强弱。某些特异因子(蛋白质)决定RNA聚合酶对一个或一套启动序列的特异性识别和结合能力。当前30页,总共59页。
2.转录起始的负调控
乳糖操纵子(lactoseoperon,lac)是原核生物基因转录负调控的最典型模式。当前31页,总共59页。
乳糖操纵子(lacoperon)的结构结构基因Y:透酶Z:β-半乳糖苷酶A:乙酰基转移酶
调控区CAP结合位点
启动子操纵元件ZYAOPDNA当前32页,总共59页。
mRNA阻遏蛋白IDNAZYAOP有葡萄糖存在,没有乳糖存在阻遏蛋白的负性调节阻遏基因当前33页,总共59页。
mRNA阻遏蛋白IDNAZYAOPpol有葡萄糖存在,没有乳糖存在阻遏蛋白的负性调节阻遏基因当前34页,总共59页。
mRNA阻遏蛋白没有葡萄糖存在有乳糖存在时IDNAZYAOPpol启动转录乳糖半乳糖β-半乳糖苷酶当前35页,总共59页。
mRNA阻遏蛋白没有葡萄糖存在有乳糖存在时IDNAZYAOPpol启动转录mRNA乳糖β-半乳糖苷酶半乳糖当前36页,总共59页。
仅有葡萄糖葡萄糖耗完有乳糖存在当前37页,总共59页。
阻遏蛋白与操纵基因结合分子机制:
操纵基因区域具有反向重复序列(能与蛋白质特异结合的DNA特征性结构)。
-10+1+10+20+305′ATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAA3′3′TACAACACACCTTAACACTCGCCTATTGTTAAAGTGTGTCCTT5′
当前38页,总共59页。
RNA聚合酶与阻遏蛋白互斥分子机制:操纵基因在操纵子的位置是从-7至+28,RNA聚合酶所占区域是从-35至+20,两者有部分重叠。当前39页,总共59页。3.转录起始的正调控
阿拉伯糖操纵子是正调控的典型例子。
阿拉伯糖操纵子的基因结构图
操纵子由结构基因B、A、D以及调控元件I1、I2、O1、O2和启动子构成。araC基因编码调节蛋白AraC。当前40页,总共59页。
AraC对阿拉伯糖操纵子的调节图不存在阿拉伯糖时,AraC二聚体与O1、O2及I1结合,DNA弯曲成环结构。由于I2不被占据,B、A、D基因不发生转录。当前41页,总共59页。
当有阿拉伯糖时,AraC二聚体与阿拉伯糖形成复合物,使AraC形状改变,I1和I2由一个AraC二聚体占据,从而激发B、A、D基因转录。
AraC对阿拉伯糖操纵子的调节图当前42页,总共59页。
4.转录起始的复合调控
在大肠杆菌的许多操纵子中,基因的转录不是由单一因子调控的,而是通过负调控因子和正调控因子进行复合调控。典型例子:糖代谢有关的操纵子,如lac
操纵子。当前43页,总共59页。cAMP与葡萄糖相关性:葡萄糖↑,cAMP↓
葡萄糖↓,cAMP↑cAMP:环一磷酸腺苷CAP:分解代谢基因激活蛋白(catabolitegeneactivatorprotein,CAP)
CAP的活性依赖cAMP,形成cAMP-CAP复合物,促进多种操纵子的转录起始。当前44页,总共59页。++++
转录无葡萄糖,cAMP浓度高时有葡萄糖,cAMP浓度低时ZYAOPDNACAPCAPCAPCAPCAPCAP当前45页,总共59页。mRNA没有乳糖有乳糖
葡萄糖低cAMP浓度高
葡萄糖高cAMP浓度低RNA-polOOOO当前46页,总共59页。※当阻遏蛋白封闭转录时,CAP对该系统不能发挥作用;※如无CAP存在,即使没有阻遏蛋白与操纵序列结合,操纵子仍无转录活性。当前47页,总共59页。
(二)转录终止的调控
原核生物的转录终止调控方式分两大类:A.依赖ρ因子的终止调控;B.不依赖ρ因子的终止调控。此外,核糖体也参与转录终止。例:色氨酸操纵子表达的调控有两种方式:a.通过阻遏蛋白的负调控b.通过衰减子作用当前48页,总共59页。色氨酸操纵子的结构及其调控
1.阻遏蛋白对色氨酸操纵子的负调控当前49页,总共59页。TrpTrp高时Trp低时mRNAOPtrpR调节区结构基因
RNA聚合酶
RNA聚合酶
?2.衰减子对转录的调控色氨酸操纵子6700个核苷酸140个核苷酸当前50页,总共59页。
色氨酸操纵子mRNA引导序列不同区域互补所形成的不同二级结构
1-2和3-4茎环形成当前51页,总共59页。色氨酸丰富时,核蛋白体顺利沿引导序列移动直达最后一个密码子UGA,合成完整的引导肽。RNA聚合酶停止在衰减子部位。当前52页,总共59页。色氨酸缺乏时,核蛋白体终止在1区Trp密码子部位,
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