医学信息检索与利用

生物医学信息检索与利用

2012年11月把握相关文献搜集过程的关键环节

（一）理解是信息检索的前提

理解项目内容的实质含义，灵活能动地扩展检索用词，避免用词局限；对检出文献进行鉴别、筛选、翻译、归纳；

项目名称：手持式心电图机

(手持+便携+微型+小型+袖珍+迷你)*心电图机

（二）选词全面性及其扩展思路检索词选择要齐全诸如关键性同义词、主题词、关键词、缩写词、分类号化学物质登记号、化学结构式等检索词要尽量的规范，特别是专业术语、短语

对文献检索中的一物多名要深有所悟,并尽量周全地对检索用词进行扩展。

项目名称：布氏杆菌荧光PCR检测方法维普:(任意字段=布氏杆菌*(荧光+PCR))20篇布氏杆菌709布鲁杆菌84

布鲁氏菌1813布鲁氏杆菌257

布氏菌887布鲁菌128

维普:(任意字段=(布氏+布鲁)*(荧光+PCR))

163篇勿忘检索词的缩写、简称与俗称——

项目名称：乙型病毒性肝炎的中医药研究维普:(题名=乙型病毒性肝炎*(中医药+中药))49篇维普:(题名=(乙型病毒性肝炎+乙型肝炎+乙肝+HB)*(中医药+中药))554篇

（三）检索途径多样以主题法为首选路径——选词并在不同字段组配维普库检索：食品接触材料用油墨及胶粘剂安全标准体系研究

分类法在检索中的应用分类法的主要功能则是通过学科知识的分类体系揭示知识的系统性。◆运用分类法可将特定类号下的专题文献系统包容，一网打尽。◆运用分类法可灵活进行文献的扩检和缩检

推荐主题-分类组合检索项目名称：抗生素骨水泥系列产品主题途径检索:抗生素and骨水泥维普:(任意字段=骨水泥)and(分类号=R978.1)

（R978.1——抗生素类）万古霉素骨水泥力学性能及洗提特性

链霉素复合骨水泥在全髋关节置换术治疗髋关节结核中的应用

含硫酸妥布霉素的磷酸钙骨水泥对外伤性骨髓炎作用的观察

（四）数据库选择与检索方式多样网络数据库：语种、文献类型齐全期刊库、会议库、学位论文库、专利库、成果库等文摘数据库与全文数据库互为补充网络免费资源国际联机检索系统同时查多种文献国家科技图书文献中心NSTL

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是根据国务院领导的批示于2000年6月12日组建的一个虚拟的科技文献信息服务机构，成员单位包括中国科学院文献情报中心、工程技术图书馆（中国科学技术信息研究所、机械工业信息研究院、冶金工业信息标准研究院、中国化工信息中心）、中国农业科学院图书馆、中国医学科学院图书馆。cnki期刊导航浏览文章查看期刊编辑出版信息免费全文电子期刊开放获取期刊指南（DirectoryofOpenAccessJournals/HighWirePress全球最大的提供免费全文的学术文献出版商

，生物医学中心开放获取期刊（BioMedCentral

）科学公共图书馆开放获取期刊（PublicLibraryofScience

）20瑞典隆德大学（LundUniv）图书馆开发维护。提供全球免费开放存取（OA）期刊目录的网站，共收录各学科8300种免费电子期刊，全部为同行评审或主编质量控制的学术期刊，制作了期刊简介及网站链接。提供按刊名、学科浏览，期刊关键词检索。可对4100种期刊中的文章进行检索。DirectoryofOpenAccessJournals开放获取期刊指南22收录1402种期刊，以生物医学为主，其中免费期刊约338种，免费全文190多万篇，占全部文献量的32%。刊名/主题浏览、关键词检索三种途径。同时提供Medline检索与全文收费获取服务。凡有FREE标记的文献，点击FullText或PDF链接可在线获取免费全文。HighWirePress生物医学中心BMC

BioMedCentral

(http：//www．biomedcentra1．com/)英国一家独立的商业性出版机构最重要的开放获取杂志出版商之一内容涵盖生物学和医学的所有主要领域，主要包括麻醉学、生物化学、生物信息学、生物技术、癌症、细胞生物学、微生物学、分子生物学等57个分支学科。能快速且免费提供经过同行评议的生物医学期刊的全文服务。采取向作者和机构会员收费的方式为开放获取期刊提供资助，在BMC期刊上发表的文章，作者拥有版权。已出版200种OA期刊。BioMedCentral公共医学中心PMC,PubMedCentral

www．pubmedcentral．nih．gov2002.2.由NLM与NIH联手建立的一个生命科学期刊文献全文免费检索系统。由NLM的NCBI开发和设计，并管理和维护的一个数字化全文数据库。涉及学科范围有生物医学、行为科学和临床研究等学科领域，提供完全免费的全文服务。

中国教育图书进出口公司：SOCOLAR-OpenAccess资源一站式检索服务平台

（）

——该平台收录了大量来自互联网的OpenAccess期刊、OpenAccess机构仓储等学术资源，并向最终用户提供一站式文章级检索和全文链接服务。旨在向用户全面、彻底揭示全球OpenAccess资源常用的医学数据库文摘型├CBMWEB数据库

├PubMed数据库

├荷兰医学文摘Embase├化学文摘CA

└生物学文摘BP

科学引文索引(SCI)

全文型

中国知网CNKI万方数据库维普全文期刊数据库ScienceDirect(,免费检索)ProQuest检索平台（ARL,ABI,PQDD…）EBSCO数据库/（ASP,BSP,ERIC…）Springer电子期刊

…PubMed数据库

/PubMed

PubMed简介PubMed是美国国立医学图书馆（NLM）所属的国家生物技术信息中心（NCBI）开发的因特网生物医学信息检索系统。收录范围收录70余个国家4900多种生物医学期刊的题录与文摘，是世界上最权威的医学数据库现有1950年以来的1650多万篇文献的记录(其中MEDLINE记录1400多万条)目前每年增加60余万条文献记录在全部记录中有76%的文献为英文；在2000年以来的记录中90%的文献为英文；收录中文刊60余种内容涉及：临床、基础医学、药学、牙医学、护理学、公共卫生、营养、兽医学等专业PubMed检索功能基本检索高级检索其他检索途径:主题词、期刊数据库、特定文献检索个性化服务基本检索输入框提供其他检索，如：期刊数据库检索、主题词数据库检索、特定文献检索（一）单词、短语、词组检索（二）作者姓名检索（三）期刊名称检索（四）截词检索（五）带逻辑运算符的复合检索基本检索自动转换匹配原理PubMed对输入检索框中的检索词进行自动转换匹配，将其逐步地与其数据库中的各类词表核对转换、匹配MeSHTranslationTable主题词注释表JournalsTranslationTable期刊注释表CommonPhraseList常用词组表AuthorIndex作者索引表NoMapping检索词拆分AND

Pubmed检索实例

例:

查找有关“肝癌和肝炎的关系”的文献，

“livercancer”和“hepatitis”

检索结果显示显示检索策略自动转换匹配后的检索策略("liverneoplasms"[MeSHTerms]OR("liver"[AllFields]AND"neoplasms"[AllFields])OR"liverneoplasms"[AllFields]OR("liver"[AllFields]AND"cancer"[AllFields])OR"livercancer"[AllFields])AND("hepatitis"[MeSHTerms]OR"hepatitis"[AllFields])针对特定的短语和词组的检索，需要在短语或者词组上用双引号引起来。如“singlecell”，“oxygenfreeradicals”，作为一个不可分割词组在全部字段中检索，系统不进行自动转换匹配,也不进行Mesh词的扩检。词组检索/强制短语加双引号作者姓名检索姓全称+名缩写smithjaorJonesK.

smithJ[au]西方人姓名书写格式：

Firstname、（MiddleName）、Lastnamebowerm期刊名称检索Enterinthesearchboxoneofthefollowing:刊名全称(e.g.,molecularbiologyofthecell)刊名缩写(e.g.,molbiolcell)ISSN号(e.g.,1059-1524)如果期刊名称正好是一个MeSH中的词，(e.g,GeneTherapy,Science,orCell)，建议期刊检索使用期刊字段标识[ta]。否则系统会将其作MeSH词进行检索或在所有字段中进行检索。例：molecularbiologyofthecellmolecularbiologyofthecell例：Cell截词检索

在词干的末尾加“*”号，PubMed就会检索出以该词为词根的所有的词。截词检索将关闭自动词语匹配功能。输入bacter*，可检出bacteria、bacterium、bacterial等词的文献

如我们要检索肿瘤的诊断和治疗方面的文献，我们可以在基本检索输入框中输入：cancerAND(diagnosisORtherapy)，点击“Go”进行检索。复合检索式检索布尔逻辑运算符有:AND，OR或NOT高级检索

功能:查看检索历史构建检索式,选择检索字段检索史检索框选择字段高级检索举例：检索作者为Black，且标题中有Hypertension的文献单篇/多篇引文匹配

临床咨询专题咨询主题词检索

期刊检索临床实验外部链接MeSHDatabaseMeSH词表

《医学主题词表》（MedicalSubjectHeading，简称MeSH）是NLM对生物医学文献进行主题分析、标引的权威性词表，也是指导用户使用主题索引进行文献检索的工具。由于自然语言存在大量的一词多义、一义多词、单复数变化等现象，这就给读者查找文献带来了很大困难。MeSH的主要就是起到规范化作用，保证文献的作者、标引者和检索者在用词上的一致；将自然语言转换成规范化的人工语言，保证一词输入，多词命中，提高文献查全率。关键词（自由词）：carcinoma,tumor,cancer

主题词：

neoplasms

SubHeadings副主题词对一个主题词的某个方面进行修饰限定的词，又称限定词。例如，hepatitisb这个主题词涉及到的病因、病理、诊断、治疗、微生物学等多个方面。目前有83个副主题词并非每个主题词都能和83个副主题词组配。副主题词与主题词的组配不是随机的，而是有一定规则的。如“诊断”、”治疗“不可与药物、生物等主题词组配，只能组配疾病类主题词。第一步：输入检索词。

主题词检索例主题词检索界面的输入框内输入livercancer，点击GO按扭，系统提示livercancer不是Mesh词，规范主题词应该是liverneoplasms。

主题词第二步：确定主题词点击liverneoplasms，显示副主题词，可供选择。

可勾选副主题词第三步：确定副主题词用liverneoplasms选择副主题词surge