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文档简介

请统计侯凡凡院士所发表的期刊文献你选用的工具A中国生物医学文献服务系统(SinoMed)B中文期刊全文数据库C百度DGoogle外文摘要信息获取(1)南方医科大学医学情报学教研室梁丽明E-Mail:lianglm@PubMed简介PubMed与MedlinePubMed检索检索结果的处理个性化服务外文摘要信息获取授课内容

PubMed简介网址:世界最具权威性的医学文献数据库,由NLM(美国国立医学图书馆)NCBI(美国国家生物技术信息中心)向因特网用户提供免费文献检索服务(自1997-6-26起)收录70余个国家5400多种生物医学期刊的题录与文摘,其中收录中文刊100余种,是世界上最权威的医学数据库。现有1950年以来的1900多万篇文献的记录(其中MEDLINE记录1700多万条)目前每年增加60余万条文献记录记录中90%的文献为英文。PubMed简介PubMed的外部链接功能

提供NCBI开发的分子生物学数据库的链接,如Nucleotide、Protein、Genome、OMIN、Structure、Taxonomy等。提供美国国立医学图书馆多种资源的链接提供相关文献(RELATEDARTICLES)的链接提供其它外部资源的链接,如生物医学期刊网站全文链接、NCBI资源。PubMed与MedlineMEDLINEPubMed合作?竞争?没关系?PubMed与Medline历史沿革1879年→印刷版创刊-IndexMedicus(IM)1983年→Medline光盘数据库出版发行1997年→PubMed免费网络版JohnShawBillings

PubMed文献包括三部分:Medline文献占据绝大部分OldMedline

1966年以前的Medline文献非Medline文献Medline收录期刊的非生物医学文献及最新文献。PubMed检索认识PubMed主页基本检索高级检索NLMNationalLibraryofMedicine(美国国立医学图书馆)

NCBINationalCenterforBiotechnologyInformation(美国国家生物技术信息中心)

ENTREZPUBMEDNucleotideStructureGenomePopsetOMIMProteinPubMed—生物医学文献Nucleotide—核苷酸序列数据库Protein—蛋白质序列数据库Structure—大分子三维蛋白质结构Genome—完整的基因组汇编Popset—以DNA和Pro.分析生物间的进化关系Taxonomy—分类学数据库OMIM—孟德尔人类遗传学数据库Books—生物医学网络版图书Probeset—基因表达选集3DDomain—特定功能域三维结构Entrez系统包含的数据库基本检索检索某主题的文献检索某一作者发表的文献检索发表在某期刊上的文献基本检索:检索某主题的文献检索有关肿瘤(cancer)的文献cancer题目作者来源PubMed中的文献状态

PubMed数据类型(状态)PubMed除了1966年以前的OldMedline,其余文献按处理过程分4种类型(或状态)PubMed-assuppliedbypublisherPubMed-inprocessPubMedPubMed-indexedforMEDLINE

属于Medline收录范围,建立ti、au、ab等基本书目信息。(暂)不属于Medline收录范围,但也建立ti、au、ab等基本书目信息。赋予MeSH、PT等字段并被index。"neoplasms"[MeSHTerms]OR"neoplasms"[AllFields]OR"cancer"[AllFields]检索有关紫杉醇(paclitaxel)用于癌症(cancer)治疗的文献检索有关紫杉醇(paclitaxel)用于癌症(cancer)治疗的文献Paclitaxel

ANDcancer

PubMed检索式输入规则可输入单词、词组或句子进行检索可用的逻辑运算符:AND、NOT、OR(必须大写)布尔逻辑运算顺序是从左至右,圆括号优先

PubMed检索式输入规则可使用截词符*,但词组强制、作者检索时无效VaccinaVaccineVaccinesVaccinationvaccinatedVaccin*

词组强制检索(精确检索)用双引号,例:"lungcancer“词组强制和截词检索时,系统的智能词语匹配功能将不再被执行例如:livercancer*或"livercancer"将不映射到MeSH

词LiverNeoplasms注意:所有的双引号、*、()、-等都必须是英文输入状态下(半角)输入。可在检索词后加[字段名],进行限定字段检索。PubMed常用检索字段篇名字段检索[ti]作者字段检索[au]机构字段检索[ad]刊名字段检索[so]

缩写全称缩写全称ABAbstractLALanguageADAffiliation(机构)MHMeSHTermsAUAuthor(作者)

PTPublicationTypeDPPublicationDateSOSourceCPPublicationCountryTAJournalTitle(刊名)TIABTitle/abstractTITitle(篇名)ISISSN

TWTextWords常用字段(检索时大小写都可以)请在PubMed数据库中检索南方医科大学(southernmedicaluniversity)发表的文献提示答案:southernmedicaluniversity[ad]请在PubMed数据库中检索南方医院(NanfangHospital,nanfanghospital)发表的篇名中含有糖尿病(diabetes)的文献选择正确的检索式:NanfanghospitalANDdiabetesNanfanghospitalANDdiabetes[ti]NanfanghospitalORnanfang

hospital[ad]ANDdiabetes[ti]Nanfanghospital[ad]ORnanfang

hospital[ad]ANDdiabetes[ti](Nanfanghospital[ad]ORnanfang

hospital[ad])ANDdiabetes[ti]

自由词检索:检索某一作者发表的文献BarryJ.MarshallJ.RobinWarren检索某作者发表的文献:→MarshallBJ→WarrenJR

输入采用姓前名后,姓全拼,名缩写

02年以后实现了作者姓名智能转换,可用全拼姓名检索(仅限于02年以后的文献)。

自由词检索:检索某一作者发表的文献作者姓名书写格式西方人姓名书写格式:Firstname、MiddleName、Lastname。美国肯尼迪总统名为:JohnFrankKenedy,Kenedy为Lastname(姓)。Frank为Middlename,比较少看到,多看到JohnF.Kenedy,中间名缩写了。如果看到姓名中间有逗号,则逗号前一定是姓。如:Kenedy,JohnF.

自由词检索:检索某一作者发表的文献BarryJ.MarshallJ.RobinWarren→MarshallBJ→WarrenJR

自由词检索:检索某一作者发表的文献2、作者姓名书写格式中国人姓名格式:Lastname、Firstname。如:钟世镇,就有如下拼写形式可供检索:Shi-zhen

Zhong;Shizhen

ZhongZhongshi-zhen;Zhong,shizhenZhong,shi-zhen

→zhong

szShizhen

Zhong,zhong

shizhen→zhongs

自由词检索:检索某一作者发表的文献查找PaulNurse发表的文献查找姓氏为“black”的作者所发表的的文献PaulNurseNursePBlack[au]自由词检索:检索发表在某期刊上的文献期刊检索检索时可输入期刊全名,如:molecularbiologyofthecell,系统自动转换为”molbiolcell”[JournalName];也可输入期刊标准缩写形式(如:molbiolcell)或期刊的ISSN(国际标准出版物编号,如:1059-1524)。如果期刊名是一个单词或恰好是MeSH词表中的词,如GeneTherapy、Science、Cell等,则必须在刊名后加[so](期刊名称字段标识符)。我不记得字段我想看看之前的操作有高级检索呢

高级检索(advancedsearch)解决问题侯凡凡院士参与发表的最早一篇英文文献是什么?检索历史记录了登录后系统执行过的检索式,最多可保存100条检索式检索式之间可进行逻辑组配检索历史中的检索式8小时后自动清空,要长久保存检索式,需使用MyNCBI检索下列各题,记录你的检索操作过程及命中文献数了解有关疯牛病(bovinespongiformencephalopathy,BSE)起源(origin)的情况,最早的报道在哪年,记录出处。2005年度诺贝尔医学奖授予了幽门螺杆菌的发现者BarryJ.Marshall(1951-)和J.RobinWarren(1937-),请检索两人合作发表的论文,记录最早的一篇文献题录。南方医院王继德教授在《Gastroenterology》发表了一篇有关FHL2表达的文献,请找到这篇文献,并记录篇名和在PubMed的被引情况烟碱(Nicotine),俗名尼古丁,是烟草的重要成分,对胎儿(embryo,fetus)有一定的影响。请用篇名字段检索烟碱对胎儿影响的文献,并写出最早一篇综述的出处。RNA干扰(RNAINTERFERENCE,RNAi)用于肝癌(livercancer)治疗的文献。参考答案BSEANDoriginBrVetJ.1989Mar-Apr;145(2):191-42.MarshallbjANDWarrenjr(可用作者字段限定)-----题录:MarshallBJ,WarrenJR.Unidentifiedcurvedbacilliinthestomachofpatientswithgastritisandpepticulceration.Lancet.1984Jun16;1(8390):1311-5

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