pubmed如何进行医学信息检索

美国医学文献数据库

MEDLINE2008.9.222/1/20231复旦大学图书馆文献检索教研室一、数据库概况（一）主办单位：美国国立医学图书馆(NLM)编制。（二）收录学科内容：主要收录生物医学和健康科学以及生命科学相关领域的文献。包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺学，基础研究和临床、护理、公共卫生、卫生政策发展或相关教育活动的内容。2000年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学方面的研究内容。2/1/20232复旦大学图书馆文献检索教研室

（三）文献来源：收录全球70多个国家和地区的近5000种生物医学期刊，大都经美国卫生健康研究院的文献选择技术评估委员会LiteratureSelectionTechnicalReviewCommittee(LSTRC)评估挑选,由NLM和各专业协会的数据协作采集专家推荐。近年数据涉及37种语种，回溯至1950年的数据涉及60种语种。数据库47%为美国本土出版文献，90%为英文文献，79%的文献有著者撰写的英文文摘，（以上数据根据2007年11月数据库提供）。一、数据库概况2/1/20233复旦大学图书馆文献检索教研室（四）收录数据类型已处理完毕的数据（Indexed）1950-1965回溯数据1966topresent近年数据处理中的数据（Inprocess）:

最新的、尚未经规范处理的数据，只有简单的篇名、作者、出处等书目信息和文摘，没有标引规范化医学主题词、物质名称、文献类型等信息。该库中数据在所有标引工作完成后，每周一次转入MEDLINE-Indexed数据库中。一、数据库概况2/1/20234复旦大学图书馆文献检索教研室收录图示2/1/20235复旦大学图书馆文献检索教研室（五）MEDLINE的检索系统NCBI-PubMedOvidSPWebofKnowledgeEBSCOOCLCFirstSearch一、数据库概况2/1/20236复旦大学图书馆文献检索教研室不同检索系统中的Medline数据库2/1/20237复旦大学图书馆文献检索教研室二、NCBI-PubMed2/1/20238复旦大学图书馆文献检索教研室（一）NCBI网站简介

1988年，美国的参议员ClaudePepper发起，

1988年11月4日通过立法建立国立生物技术信息中心（NCBI）NCBI的任务:

建立基于计算机信息处理的分子生物学、生物化学、遗传学知识的自动存储和分析系统，并进行先进方法的研究。促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用。促进全世界范围内生物技术信息收集的合作2/1/20239复旦大学图书馆文献检索教研室NCBI主页2/1/202310复旦大学图书馆文献检索教研室NCBI生物信息整合系统

Alldatabase检索大分子生物学数据获取GenBank,EMBL等数据库的核酸序列；获取Swiss-port,PIR,PRF,PDB等蛋白质序列；从核酸序列翻译到蛋白质的序列；获取基因和染色体图谱；蛋白质三维结构数据及大分子模式（MMDB）等其他生物信息数据库检索。PubMed书目文献数据。2/1/202311复旦大学图书馆文献检索教研室（二）PubMed简介特点：

1.免费提供题录和文摘

2.提供与原文的网址链接(部分免费获取）

3.提供检索词自动转换匹配

4.操作简便、快捷2/1/202312复旦大学图书馆文献检索教研室PubMed

收录数据MDENLINEIndexed 1966toprensent的MEDLINE已标引数据，有MeSH字段和摘要，每条记录标有[PubMed-indexedforMEDNLINE]

OldMDENLINE 1950-1965年间的MEDLINE数据，没有MeSH字段和摘要，每条记录标有[PubMed-OLDMDENLINEforPre1966]

2/1/202313复旦大学图书馆文献检索教研室PubMed

收录数据MDENLINEInprocess

最新的MDENLINE尚未标引的处理中数据。每条记录标有[PubMed-inprocess]。NotMDENLINE

是出版商提供的电子文献，PubMed

收录，而MDENLINE不收录的数据。每条记录标有[PubMed]。2/1/202314复旦大学图书馆文献检索教研室基本检索输入框特征栏提供辅助检索功能侧栏提供其他检索如期刊数据库检索、规范词数据库检索、特定文献检索等执行检索PubMed

主页高级检索个性化服务检索帮助手册2/1/202315复旦大学图书馆文献检索教研室可以在检索栏中输入一个或多个检索词（系统默认空格为AND检索） 如：placentagrowthoxygen可以在检索栏中输入布尔逻辑运算式（运算符必须大写） 如：asthmaAND(therapyORtreatment)（三）PubMed

基本检索规则2/1/202316复旦大学图书馆文献检索教研室输入多个检索词2/1/202317复旦大学图书馆文献检索教研室字段限定符：[]

如：Stem[ti]ANDneuroscience截词符：treat*强迫短语匹配符：“brca1”

严格按输入形式匹配，不再自动转换匹配和扩展检索，常用于词组和专有名词检索。（三）PubMed

基本检索规则2/1/202318复旦大学图书馆文献检索教研室含字段限定的检索式2/1/202319复旦大学图书馆文献检索教研室自动转换匹配检索词：

对常用医学名词进行自动在规范词索引、文本词及所有记录字段中转换匹配。 如：renalfailurekidneyfailure[MESH]ORkidney[AllField]ORrenalfailure[AllField]……（三）PubMed

基本检索规则2/1/202320复旦大学图书馆文献检索教研室2/1/202321复旦大学图书馆文献检索教研室自动扩展检索：

系统自动对主题词、副主题词进行扩展检索。

如：输入hypertensiontherapy，系统自动检索高血压的药物治疗、饮食疗法（三）PubMed

基本检索规则2/1/202322复旦大学图书馆文献检索教研室2/1/202323复旦大学图书馆文献检索教研室著者检索(authors)：姓全称在前，名首字母在后。加字段限定符 如：genbacev

o[au]

moore

am[au]2002年以后的文章可以查著者全名

如：joshua

lederberg

（三）PubMed

基本检索规则2/1/202324复旦大学图书馆文献检索教研室著者检索mooream[au]（三）PubMed

基本检索规则2/1/202325复旦大学图书馆文献检索教研室期刊检索（journals）：刊名全称检索 如：newenglandjournalofmedicine[so]MEDLINE认可的标准刊名缩写检索 如：clinexpimmunol[so]国际标准期刊号检索 如：1059-1524（三）PubMed

基本检索规则2/1/202326复旦大学图书馆文献检索教研室刊名的检索（字段限定来源SO）2/1/202327复旦大学图书馆文献检索教研室PubMed记录字段说明文摘第一著者单位地址出版商提供文献识别号著者群版权说明参考评论文献合著者文献参考评论定稿版校样版输入日期输入完成日期电子出版日期2/1/202328复旦大学图书馆文献检索教研室电子出版日期文献出版日期数据加入PubMed日期文献勘误参考文献勘误全部著者姓名全部调研者姓名作为文章主题的著者全称文献相关注释基金编号基因符号期编号资助调研者资助调研单位国际标准期刊号美国立医学图书馆识别号期刊全称2/1/202329复旦大学图书馆文献检索教研室最后修订日期规范词表词规范词确立日期系统组织的文摘版权拥有者题录提供机构的识别号病史相关与原始记录其他关键词提供其他关键词的机构数据提供者机构文章总页数出版商提供数据时间期刊出版国数据库文献编号2/1/202330复旦大学图书馆文献检索教研室作为主题词的个人姓名出版状态文献类型出版模式（纸张或电子）参考文献数已撤回的文献酶或化学物质代码正在撤消中的文章初版文献修订和再版的文章子专题文档太空署提供的数据二次文献数据库以及文章讨论的分子序列访问号原文来源引用了病例的文献内部处理代码标准期刊缩写文献标题翻译标题更新文献文献正在更新期刊卷号2/1/202331复旦大学图书馆文献检索教研室（四）PubMed的辅助检索1.Limits（检索限制选择）：字段限制：著者、刊名、篇名、出版日期、滤过（filter原文收藏处）等限制。数据输入时间：默认检索可回溯到1950年，限制选择30天-10年。各种文献类型限制各种语种限制期刊类别与学科文档限制2/1/202332复旦大学图书馆文献检索教研室作者限定添加作者姓名输入框清除限定期刊限定作者姓名索引选词多作者逻辑匹配选项全文、免费全文、摘要限定日期限定Limits—检索限制2/1/202333复旦大学图书馆文献检索教研室出版日期限定入库日期限定研究对象人/动物限定研究对象性别限定语种限定子文档限定2/1/202334复旦大学图书馆文献检索教研室检索字段限定执行检索清除所有限定文献类型限定研究对象年龄限定2/1/202335复旦大学图书馆文献检索教研室2.Previw/index（检索策略预览/索引）：浏览检索式，预览检出文献数量修改检索式组配检索式 如：可用检索式编号#1OR#2浏览索引（index）选词检索（四）PubMed的辅助检索2/1/202336复旦大学图书馆文献检索教研室检索预览检索历史索引加词检索2/1/202337复旦大学图书馆文献检索教研室PubMed-Index索引检索例johnshopkinsasthma选择著者地址字段输入地址起始单词点击显示索引词表选择相关词条选择词条间的逻辑关系添加到检索框执行检索2/1/202338复旦大学图书馆文献检索教研室

3.History（检索史）：历次检索式回顾编辑检索式 如：#5ANDgenbacev

o[au]（四）PubMed的辅助检索2/1/202339复旦大学图书馆文献检索教研室检索历史回顾检索式检索时间检出篇数检索式编号可替代检索式进行输入检索如：#6ANDgenbacev

o[au]2/1/202340复旦大学图书馆文献检索教研室4.Details（检索的详细匹配过程）：显示检索词转换匹配运算详细过程用途：转换、确定规范词如：livercancer

liverneoplasms修改检索策略（四）PubMed的辅助检索2/1/202341复旦大学图书馆文献检索教研室检索明细数据库匹配过程检索词转换显示用户输入的检索式2/1/202342复旦大学图书馆文献检索教研室检索策略（检索式）的修改 以下途径均能实现检索策略的修改：基本检索框中随时修改“Limit”“Preview/index”“History”“Details”2/1/202343复旦大学图书馆文献检索教研室（五）PubMed的高级检索在一个网页中集检索史、检索字段选择、检索词输入、词表查询、逻辑算符选择、检索限定于一体。选择检索字段后，检索框内只能输入检索词，不能输入检索式。2/1/202344复旦大学图书馆文献检索教研室多栏复合检索词表查询栏间逻辑组配2/1/202345复旦大学图书馆文献检索教研室（六）PubMed其他检索服务1.MeshDatabase（规范化主题词表）：确定规范化主题词查看主题词词义注释、树状结构表选择副主题词、扩展主题词、主要主题词 例1：欲查植物（plant）生长素（growthfactor）研究的相关文献。2/1/202346复旦大学图书馆文献检索教研室PubMed

基本检索输入检索式：plant*ANDgrow*ANDfactor* 默认在全部字段中检索结果太多，相关度低植物Synadenium

umbellatum

Pax的抗肿瘤和抗血管生成活性血管内皮生长因子的水平并非植物生长素2/1/202347复旦大学图书馆文献检索教研室PubMed

基本检索输入检索式：plant*[TI]ANDgrow*[TI]ANDfactor*[TI]2/1/202348复旦大学图书馆文献检索教研室MeSH规范化主题词表选词检索送至检索框2/1/202349复旦大学图书馆文献检索教研室输入自由词检索ANDgrowthfactor2/1/202350复旦大学图书馆文献检索教研室MeSH

查找植物生长素结果2/1/202351复旦大学图书馆文献检索教研室详细结果2/1/202352复旦大学图书馆文献检索教研室检索分析一般检索逻辑关系粗浅、修饰概念匹配不特定、检索词涵盖不全面规范检索逻辑关系紧密、修饰概念匹配特定、下位词检索全面2/1/202353复旦大学图书馆文献检索教研室例2：欲查肾衰竭（renalfailure）饮食疗法(diettherapy)疗效观察(treatmentoutcome)的相关文献。基本检索肾衰竭的饮食疗法2/1/202354复旦大学图书馆文献检索教研室结果中有些主要内容并非肾衰竭2/1/202355复旦大学图书馆文献检索教研室MeSHDatabase规范主题词数据库检索肾衰竭饮食疗法课题1.输入检索词3.点按规范词可获详细注解2.执行浏览2/1/202356复旦大学图书馆文献检索教研室主题词注释可选副主题词限定作为主要主题词匹配不进行下位词扩检2/1/202357复旦大学图书馆文献检索教研室该主题词所替代的非规范词形式主题词树形结构表：显示该词的学科隶属关系2/1/202358复旦大学图书馆文献检索教研室检出结果更为专指2/1/202359复旦大学图书馆文献检索教研室进一步用主题词表检索综合疗效观察（treatmentoutcome）2/1/202360复旦大学图书馆文献检索教研室2.Journaldatabase（期刊数据库）：通过输入刊名全称或缩写等浏览特定期刊上发表的文献。提供电子原文的超链按钮。（六）PubMed其他检索服务2/1/202361复旦大学图书馆文献检索教研室期刊数据库检索2/1/202362复旦大学图书馆文献检索教研室输入待检期刊名得出期刊详细信息2/1/202363复旦大学图书馆文献检索教研室3.引文匹配器（CitationMatcher）:输入题录信息，查找特定文献进行补缺。刊名要准确，缩写要标准著者姓名大小写不敏感如查找：TaiwanIHsueh

Hui

Chih由ChangPY（taiwan

yi

xue

hui

za

zhi)撰写、1975发表文献的其他著者2/1/202364复旦大学图书馆文献检索教研室输入待检刊名、年份输入待检第一著者特定文献查找（已知文献第一著者，欲查其他信息如其他著者等2/1/202365复旦大学图书馆文献检索教研室得出其他著者2/1/202366复旦大学图书馆文献检索教研室4.临床问题（ClinicalQueries)专门检索临床研究方法学（循证医学）文献，主要涉及治疗、诊断、病因、和预后四个分类，并提供强调选择，即敏感度（强调查全）或专指度（强调查准）。2/1/202367复旦大学图书馆文献检索教研室5.临床警示（ClinicalAlert）1991年开始，NIH美国卫生健康研究所不定期公布能引起死亡率和致病率升高的临床试验项目重要新闻稿。2/1/202368复旦大学图书馆文献检索教研室（七）PubMed检索结果输出显示检索结果保存检索结果保存检索策略打印检索结果2/1/202369复旦大学图书馆文献检索教研室显示字段选择（Display）Abstract:来源期刊、标题、著者、著者地址、记录性质、文献类型、勘误、评论、PMID或UI、摘要。Citation:显示除上述内容外，加MeSH叙词、化学物质名称、资助项目号等字段。MEDLINE:（最完整，有标识符）2/1/202370复旦大学图书馆文献检索教研室显示格式选择2/1/202371复旦大学图书馆文献检索教研室排序/输出方式选择排序方式输出方式2/1/202372复旦大学图书馆文献检索教研室显示记录选择单一记录显示：著者姓名所有记录显示：选display旁的格式，及每页显示记录数选定记录显示:方框内打钩2/1/202373复旦大学图书馆文献检索教研室点击作者链接显示文摘增强格式文摘增强格式电子期刊全文链接2/1/202374复旦大学图书馆文献检索教研室输出格式选择（sendto）选中题录（或文摘）后Text当前网页文本格式，用浏览器文件保存File所有记录纯文本格式保存，用对话框保存Clipboad