语言入门与绘图-2.r01散点图

R基础——绘1散点频率直方盒形聚类热2小散点图的介绍与应散点图的绘制（R代码3散点图是典型的二维简单但应用最广合理使用，可以良好呈现数据的 用不同的颜色2） 4两组样本重复 整合不同类型的数据：火山

5不同处理的数据的比不同处理组导致的差异

不同组学数据的比较（转录—蛋白关联6 注：在 的系列课程中讲解各类曼哈顿图的详细画法73D图形虽然好看，但不直8 富集因子（X轴通路类型（Y轴通路 的数量（圆圈大小富集的Qvalue（圆圈颜色9BarshisDJ,LadnerJT,OliverTA,etal.Genomicbasisforcoralresiliencetoclimatechange[J].ProceedingsoftheNationalAcademyofSciences,2013,110(4):1387-1392. 遍在普通珊瑚组大于耐高温珊瑚组（在45° 练习中，有类似的练习来期望得到与处理相关的生物学结 反馈：tooboring 小散点图的介绍与应散点图的绘制（R代码plot(cars)cars是预存在R软件中的数main,sub,xlab,xlim,col,col.main,col.sub,col.axis,font.main,font.sub,font.axis,cex,cex.main,cex.sub,cex.axis,"p"for"l"for"b"for"c"forthelinespartaloneof"o"forboth"h"for‘histogram’like(or‘high-density’)verticallines,"s"forstair"S"forothersteps,see‘Details’"n"forno1：正常（默认）234 main,sub,xlab,xlim,col,col.main,col.sub,col.axis,font.main,font.sub,font.axis,cex,cex.main,cex.sub,cex.axis,绘制样品C1和C2的表达散点改变当 到“你个人电脑的路径/散点图 all.fpkm中含有所有样本 表达信参 备注：这 #readtheexpressionexpr=入数据框#draw

图结果导入png文

#对expr数据框的两列取log2值并画图，expr$C1_FPKM表数据框色红色，x轴和y轴的限定范围都是-5~10；并对x、y轴设定；表达量取log2后(让数据更加均一)，绘制散点图；$是下一级xlim=c(-5,12),ylim=c(- 保留三位有效数 #将相关系数的结果补充 上dev.off()#关闭画图程突变频率（MAF）与效长度与包含的SNP在两个物种中的拷贝…突变的人群频率与效 1学习来自《Rforbeginner》中的一个经典实例，了x<-y<-plot(x,plot(x,y,xlab="Tenrandomvalues",ylab="Tenothervalues",xlim=c(-2,2),ylim=c(-2,2),pch=22,customizeaplotwithR",las=1,cex=1.5)bg:制背景#bty:控制图形边框形状，可用的值为（边框和字符的外表相像）；如果则不绘制边标文本高度）百分比，默认值是-0.5；#las:控制坐标轴刻度数字标记方向的整数（0行于轴，12竖排xlim=c(-2,2),ylim=c(-2,2),pch=22,col="red",bg="yellow",bty="l",tcl=-.25,las=1,cex=1.5)title("HowtocustomizeaplotwithR(bis)",font.main=3,#图形都将按照par指定的参数来绘left,top,right),缺省值为c(5.1,4.1,4.1,2.1)#tile:加标题#adj:控制关于文字的对齐方式，0是左对齐是居中对齐，1是右对齐，值>1时，对齐位置的地方；如果给出两个值（例如c(0,0))，第二个:: 完全“手工par(bg="lightgray",mar=c(2.5,1.5,2.5,plot(x,y,type="n",xlab="",ylab="",xlim=c(-2,2),ylim=c(-2,2),xaxt="n",yaxt="n")rect(-3333,col="cornsilkpoints(x,y,pch=10,col="red",axis(side=1,c(-2,0,2),tcl=-0.2,axis(side=2,-1:1,tcl=-0.2,title("HowtocustomizeaplotwithR(ter)",font.main=4,adj=1,mtext("Tenrandomvalues",side=1,line=1,at=1,cex=0.9,mtext("Tenothervalues",side=3,line=0.5,at=-1.8,cex