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医学统计学χ2检验卫生部“十二五”规划教材1学习交流PPT医学统计学χ2检验卫生部“十二五”规划教材1学习交流PPT
是现代统计学的创始人之一,英国统计学家KarlPearson于1900年提出的一种具有广泛用途的假设检验方法。常用于推断两个总体率(或构成比)之间有无差别。χ2
检验2学习交流PPT是现代统计学的创始人之一,英国统计学家KarlPea四格表资料的检验χ23学习交流PPT四格表资料的检验χ23学习交流PPT实际频数(actualfrequency,A):a、b、c、d理论频数(theoreticalfrequency,T)基本思想4学习交流PPT实际频数(actualfrequency,A):a、b、c假设H0:πA=πB=π,即A组与B组治疗的总体有效率相等A组:理论有效者=(a+b)×(a+c)/n;
理论无效者=(a+b)×(b+d)/nB组:理论有效者=(c+d)×(a+c)/n;
理论无效者=(c+d)×(b+d)/nTRC为第R行第C列的理论频数,nR为相应行的合计,nC为相应列的合计。5学习交流PPT假设H0:πA=πB=π,即A组与B组治疗的总体有效率相等A
χ2值反映了实际频数与理论频数的吻合程度。若假设成立,实际频数与理论频数的差值较小,χ2值也较小;若假设不成立,实际频数与理论频数的差值较大,χ2值也较大。6学习交流PPTχ2值反映了实际频数与理论频数的吻合程度。6学习交流PPχ2检验的自由度自由度取决于可以自由取值的基本格子数,而不是样本含量。
χ2值的大小取决于的个数多少,即自由度的大小。ν愈大,χ2值也越大。对于四格表资料(ν=1),计算一个理论值TRC后,其他3个理论值可用周边合计数减去相应的理论值T得出。7学习交流PPTχ2检验的自由度自由度取决于可以自由取值的基本格子数χ2检验的自由度χ2检验,根据自由度ν和检验水α准查表得χ2界值。当ν确定后,χ2分布曲线下右侧尾部的面积为α时,横轴上相应的χ2值记作。当ν确定后,χ2值越大,P值越小。8学习交流PPTχ2检验的自由度χ2检验,根据自由度ν和检验水α准查表得χ2两样本率比较时,当总例数n≥40且所有格子的T≥5时,可用四格表资料的专用公式计算四格表资料χ2检验的专用公式9学习交流PPT两样本率比较时,当总例数n≥40且所有格子的T≥5时【例】某医生欲比较用甲、乙两种药物治疗动脉硬化的疗效,甲药治疗71例,有效52例,乙药治疗42例,有效39例。问两种药物的有效率是否有差别?10学习交流PPT【例】某医生欲比较用甲、乙两种药物治疗动脉硬化的疗效,甲药治⑴设H0:π1=π2,即两药有效率相同;H1:
π1≠π2
α=0.05⑵n>40,Tmin>5⑶,则P<0.05,拒绝H0,接受H1,故认为甲、乙两药的疗效不同,乙药疗效要好于甲药。11学习交流PPT⑴设H0:π1=π2,即两药有效率相同;H1:π1≠
χ2分布是一种连续性分布,而计数资料属离散性分布,由此得到的统计量也是不连续的。为改善χ2统计量分布的连续性,英国统计学家YatesF建议将实际频数和理论频数之差的绝对值减去0.5以作校正。四格表资料χ2检验的校正公式12学习交流PPTχ2分布是一种连续性分布,而计数资料属离散性分布,由此在实际工作中,对于四格表资料,通常规定:四格表资料χ2检验的校正公式T≥5,且n≥40时,直接计算χ2值,用基本公式或专用公式;1≤T<5,且n≥40时,用连续性校正公式(continuitycorrection),或四格表资料的Fisher确切概率法;T<1或n<40,用四格表资料的Fisher确切概率法。13学习交流PPT在实际工作中,对于四格表资料,通常规定:四格表资料χ2检验的【例】某医生研究比较A、B两种药物对急性细菌性肺炎的疗效,甲药治疗42例,有效40例,乙药治疗22例,有效16例。问两种药物的疗效差别有无统计学意义?用校正公式,χ2=4.79;错用基本公式,χ2=6.69。14学习交流PPT【例】某医生研究比较A、B两种药物对急性细菌性肺炎的疗效,甲四格表资料的Fisher确切概率法当T<1或n<40,四格表资料χ2检验结果可能会有偏性,需采用Fisher确切检验进行分析。该法由R.A.Fisher提出,且直接计算概率,因此也叫Fisher确切概率检验(Fisher’sexactprobabilitytest)。15学习交流PPT四格表资料的Fisher确切概率法当T<1或n<40,Fisher确切概率法的基本思想在四格表周边合计数固定不变的条件下,利用超几何分布(hypergeometricdistribution)公式直接计算表内四个格子数据的各种组合的概率,然后计算单侧或双侧累计概率,并与检验水准比较,作出是否拒绝H0的结论。“!”为阶乘符号,n!=1×2×…×n,0!=1,∑Pi=1。16学习交流PPTFisher确切概率法的基本思想在四格表周边合计数固定【例】某医生用新旧两种药物治疗某病患者27人,治疗结果见表。问两种药物的疗效有无差别?组别治愈数未愈数合计治愈率(%)旧药2141612.5新药381127.3合计5222718.5⑴设H0:π1=π2,即两药疗效相同;H1:
π1≠π2
α=0.05⑵计算各组合概率在四格表周边合计数不变的条件下,共有“周边合计数中最小数+1”中组合。17学习交流PPT【例】某医生用新旧两种药物治疗某病患者27人,治疗结果见表。⑶确定P值,作出结论原样本四格表对应的概率为P3=0.245262,小于或等于P3的四格表为i=1,2,3,6,故双侧检验P值为
P=P1+P2+P3+P6=0.370>0.05,不拒绝H0。
左侧概率为P=P1+P2+P3=0.316,右侧概率为P=P3+P4+P5+P6=0.929,故单侧检验P值为0.316。18学习交流PPT⑶确定P值,作出结论原样本四格表对应的概率为P3=0配对四格表资料的检验χ219学习交流PPT配对四格表资料的检验χ219学习交流PPT计数资料的配对设计常用于两种检验方法、培养方法、诊断方法的比较。
特点是对样本中各观察单位分别用两种方法处理,然后观察两种处理方法的某两分类变量的计数结果,整理为一致:a(+)和d(-);不一致:b(甲+,乙-)和c(甲-,乙+)。概述20学习交流PPT计数资料的配对设计常用于两种检验方法、培养方法、诊断配对四格表资料的χ2检验,又称为McNemartest检验。由于该检验只考虑了不一致的情况(b与c),而未考虑样本含量n及一致结果(a与d)。因此,当n很大且两法一致率较高(即a与d数值较大),b与c的数值相对较小时,即使检验结果有统计学意义,但实际意义并不大。概述21学习交流PPT配对四格表资料的χ2检验,又称为McNemartest检验【例】用两种血清学方法对100例肝癌患者进行检测,有关检测结果见表。问两种血清学方法检测结果有无差别?甲法乙法合计+-+503282-15
318合计6535100⑴H0
:b=c,两种方法检出率相同;H1
:b≠c;α=0.05⑵⑶,则P<0.05,拒绝H0
,接受H1
22学习交流PPT【例】用两种血清学方法对100例肝癌患者进行检测,有关检测结R×C列联表资料的检验χ223学习交流PPTR×C列联表资料的检验χ223学习交流PPT行×列表资料的χ2检验,用于多个样本率的比较、两个或多个构成比的比较。
基本数据为:
⑴多个样本率比较时,有R行2列;
⑵两个样本构成比比较时,有2行C列;
⑶多个样本构成比比较时,有R行C列。概述24学习交流PPT行×列表资料的χ2检验,用于多个样本率的比较、两个或【例】某研究者欲比较甲、乙、丙3家医院住院病人院内感染情况,随机抽查同一时期各医院住院病人院内感染情况结果见表。试比较三家医院院内感染率有无差别。25学习交流PPT【例】某研究者欲比较甲、乙、丙3家医院住院病人院内感染情况,⑴设H0:三家医院院内感染率相同;H1:
感染率不同;
α=0.05⑶,则P<0.05,拒绝H0,接受H1,故可认为甲、乙、丙三家医院院内感染率总体有差别。⑵26学习交流PPT⑴设H0:三家医院院内感染率相同;H1:感染率不同;⑶多个样本率间多重比较进行多个样本率比较时,如果拒绝H0,多个样本率间差异有统计学意义,表明至少有某两个率之间有差异。为了获得哪两个率之间有差异,需要进行多个率的两两比较。27学习交流PPT多个样本率间多重比较进行多个样本率比较时,如果拒绝H多个样本率间多重比较采用Bonferroni法进行多个样本率的两两比较,步骤如下:对需要比较的行×列表资料进行χ2分割,变成多个四格表;对每个四格表进行χ2检验;采用(α‘=α/比较次数)计算调整的水准,其中α为事先确定的水准;以α‘调整作为检验检验水准,作出结论。28学习交流PPT多个样本率间多重比较采用Bonferroni法进行多个样本率【例】某医院用三种穴位针刺治疗急性腰扭伤,结果见表。试比较三种穴位针刺效果有无差别。穴位治愈数未愈数合计后溪穴801898人中穴202040腰痛穴243862合计12476200穴位治愈数未愈数合计后溪穴801898人中穴202040合计10038138穴位治愈数未愈数合计后溪穴801898腰痛穴243862合计10456160穴位治愈数未愈数合计人中穴202040腰痛穴243862合计445810229学习交流PPT【例】某医院用三种穴位针刺治疗急性腰扭伤,结果见表。试比较三⑶,故可认为后溪穴与人中穴、后溪穴与腰痛穴治愈率之间有统计学意义,而人中穴与腰痛穴治愈率之间无统计学意义。⑴设H0:任意两个对比组的总体治愈率相等;H1:
总体治愈率不等;
α=0.05⑵30学习交流PPT⑶若把人中穴针刺治疗急性腰扭伤设为对照组,另两组为试验组,则⑴设H0:各试验组与对照组的总体治愈率相等;H1:
总体治愈率不等;
α=0.05⑵⑶,故可认为后溪穴与人中穴治愈率之间有统计学意义,而腰痛穴与人中穴治愈率之间无统计学意义。31学习交流PPT若把人中穴针刺治疗急性腰扭伤设为对照组,另两组为试验行×列表χ2检验注意事项a、若有1/5以上的格子出现1≤T<5,则增大样本含量,以达到增大理论频数的目的;结合专业,删去理论频数太小的格子对应的行或列;结合专业,将理论频数太小的行或列与性质相近的行或列合并;用双向无序R×C表资料的Fisher确切概率法。32学习交流PPT行×列表χ2检验注意事项a、若有1/5以上的格子出现1≤T行×列表χ2检验注意事项b、多个样本率比较,若统计推断为拒绝H0,接受H1,只能认为各总体率或构成比之间总的来说有差别。若要进一步了解哪两者之间有差别,可用卡方分割法,或者调整检验水准。c、对于单向有序的R×C表资料,在比较各处理组的效应有无差别时,应该用秩和检验。33学习交流PPT行×列表χ2检验注意事项b、多个样本率比较,若统计推断为拒医学统计学χ2检验卫生部“十二五”规划教材34学习交流PPT医学统计学χ2检验卫生部“十二五”规划教材1学习交流PPT
是现代统计学的创始人之一,英国统计学家KarlPearson于1900年提出的一种具有广泛用途的假设检验方法。常用于推断两个总体率(或构成比)之间有无差别。χ2
检验35学习交流PPT是现代统计学的创始人之一,英国统计学家KarlPea四格表资料的检验χ236学习交流PPT四格表资料的检验χ23学习交流PPT实际频数(actualfrequency,A):a、b、c、d理论频数(theoreticalfrequency,T)基本思想37学习交流PPT实际频数(actualfrequency,A):a、b、c假设H0:πA=πB=π,即A组与B组治疗的总体有效率相等A组:理论有效者=(a+b)×(a+c)/n;
理论无效者=(a+b)×(b+d)/nB组:理论有效者=(c+d)×(a+c)/n;
理论无效者=(c+d)×(b+d)/nTRC为第R行第C列的理论频数,nR为相应行的合计,nC为相应列的合计。38学习交流PPT假设H0:πA=πB=π,即A组与B组治疗的总体有效率相等A
χ2值反映了实际频数与理论频数的吻合程度。若假设成立,实际频数与理论频数的差值较小,χ2值也较小;若假设不成立,实际频数与理论频数的差值较大,χ2值也较大。39学习交流PPTχ2值反映了实际频数与理论频数的吻合程度。6学习交流PPχ2检验的自由度自由度取决于可以自由取值的基本格子数,而不是样本含量。
χ2值的大小取决于的个数多少,即自由度的大小。ν愈大,χ2值也越大。对于四格表资料(ν=1),计算一个理论值TRC后,其他3个理论值可用周边合计数减去相应的理论值T得出。40学习交流PPTχ2检验的自由度自由度取决于可以自由取值的基本格子数χ2检验的自由度χ2检验,根据自由度ν和检验水α准查表得χ2界值。当ν确定后,χ2分布曲线下右侧尾部的面积为α时,横轴上相应的χ2值记作。当ν确定后,χ2值越大,P值越小。41学习交流PPTχ2检验的自由度χ2检验,根据自由度ν和检验水α准查表得χ2两样本率比较时,当总例数n≥40且所有格子的T≥5时,可用四格表资料的专用公式计算四格表资料χ2检验的专用公式42学习交流PPT两样本率比较时,当总例数n≥40且所有格子的T≥5时【例】某医生欲比较用甲、乙两种药物治疗动脉硬化的疗效,甲药治疗71例,有效52例,乙药治疗42例,有效39例。问两种药物的有效率是否有差别?43学习交流PPT【例】某医生欲比较用甲、乙两种药物治疗动脉硬化的疗效,甲药治⑴设H0:π1=π2,即两药有效率相同;H1:
π1≠π2
α=0.05⑵n>40,Tmin>5⑶,则P<0.05,拒绝H0,接受H1,故认为甲、乙两药的疗效不同,乙药疗效要好于甲药。44学习交流PPT⑴设H0:π1=π2,即两药有效率相同;H1:π1≠
χ2分布是一种连续性分布,而计数资料属离散性分布,由此得到的统计量也是不连续的。为改善χ2统计量分布的连续性,英国统计学家YatesF建议将实际频数和理论频数之差的绝对值减去0.5以作校正。四格表资料χ2检验的校正公式45学习交流PPTχ2分布是一种连续性分布,而计数资料属离散性分布,由此在实际工作中,对于四格表资料,通常规定:四格表资料χ2检验的校正公式T≥5,且n≥40时,直接计算χ2值,用基本公式或专用公式;1≤T<5,且n≥40时,用连续性校正公式(continuitycorrection),或四格表资料的Fisher确切概率法;T<1或n<40,用四格表资料的Fisher确切概率法。46学习交流PPT在实际工作中,对于四格表资料,通常规定:四格表资料χ2检验的【例】某医生研究比较A、B两种药物对急性细菌性肺炎的疗效,甲药治疗42例,有效40例,乙药治疗22例,有效16例。问两种药物的疗效差别有无统计学意义?用校正公式,χ2=4.79;错用基本公式,χ2=6.69。47学习交流PPT【例】某医生研究比较A、B两种药物对急性细菌性肺炎的疗效,甲四格表资料的Fisher确切概率法当T<1或n<40,四格表资料χ2检验结果可能会有偏性,需采用Fisher确切检验进行分析。该法由R.A.Fisher提出,且直接计算概率,因此也叫Fisher确切概率检验(Fisher’sexactprobabilitytest)。48学习交流PPT四格表资料的Fisher确切概率法当T<1或n<40,Fisher确切概率法的基本思想在四格表周边合计数固定不变的条件下,利用超几何分布(hypergeometricdistribution)公式直接计算表内四个格子数据的各种组合的概率,然后计算单侧或双侧累计概率,并与检验水准比较,作出是否拒绝H0的结论。“!”为阶乘符号,n!=1×2×…×n,0!=1,∑Pi=1。49学习交流PPTFisher确切概率法的基本思想在四格表周边合计数固定【例】某医生用新旧两种药物治疗某病患者27人,治疗结果见表。问两种药物的疗效有无差别?组别治愈数未愈数合计治愈率(%)旧药2141612.5新药381127.3合计5222718.5⑴设H0:π1=π2,即两药疗效相同;H1:
π1≠π2
α=0.05⑵计算各组合概率在四格表周边合计数不变的条件下,共有“周边合计数中最小数+1”中组合。50学习交流PPT【例】某医生用新旧两种药物治疗某病患者27人,治疗结果见表。⑶确定P值,作出结论原样本四格表对应的概率为P3=0.245262,小于或等于P3的四格表为i=1,2,3,6,故双侧检验P值为
P=P1+P2+P3+P6=0.370>0.05,不拒绝H0。
左侧概率为P=P1+P2+P3=0.316,右侧概率为P=P3+P4+P5+P6=0.929,故单侧检验P值为0.316。51学习交流PPT⑶确定P值,作出结论原样本四格表对应的概率为P3=0配对四格表资料的检验χ252学习交流PPT配对四格表资料的检验χ219学习交流PPT计数资料的配对设计常用于两种检验方法、培养方法、诊断方法的比较。
特点是对样本中各观察单位分别用两种方法处理,然后观察两种处理方法的某两分类变量的计数结果,整理为一致:a(+)和d(-);不一致:b(甲+,乙-)和c(甲-,乙+)。概述53学习交流PPT计数资料的配对设计常用于两种检验方法、培养方法、诊断配对四格表资料的χ2检验,又称为McNemartest检验。由于该检验只考虑了不一致的情况(b与c),而未考虑样本含量n及一致结果(a与d)。因此,当n很大且两法一致率较高(即a与d数值较大),b与c的数值相对较小时,即使检验结果有统计学意义,但实际意义并不大。概述54学习交流PPT配对四格表资料的χ2检验,又称为McNemartest检验【例】用两种血清学方法对100例肝癌患者进行检测,有关检测结果见表。问两种血清学方法检测结果有无差别?甲法乙法合计+-+503282-15
318合计6535100⑴H0
:b=c,两种方法检出率相同;H1
:b≠c;α=0.05⑵⑶,则P<0.05,拒绝H0
,接受H1
55学习交流PPT【例】用两种血清学方法对100例肝癌患者进行检测,有关检测结R×C列联表资料的检验χ256学习交流PPTR×C列联表资料的检验χ223学习交流PPT行×列表资料的χ2检验,用于多个样本率的比较、两个或多个构成比的比较。
基本数据为:
⑴多个样本率比较时,有R行2列;
⑵两个样本构成比比较时,有2行C列;
⑶多个样本构成比比较时,有R行C列。概述57学习交流PPT行×列表资料的χ2检验,用于多个样本率的比较、两个或【例】某研究者欲比较甲、乙、丙3家医院住院病人院内感染情况,随机抽查同一时期各医院住院病人院内感染情况结果见表。试比较三家医院院内感染率有无差别。58学习交流PPT【例】某研究者欲比较甲、乙、丙3家医院住院病人院内感染情况,⑴设H0:三家医院院内感染率相同;H1:
感染率不同;
α=0.05⑶,则P<0.05,拒绝H0,接受H1,故可认为甲、乙、丙三家医院院内感染率总体有差别。⑵59学习交流PPT⑴设H0:三家医院院内感染率相同;H1:感染率不同;⑶多个样本率间多重比较进行多个样本率比较时,如果拒绝H0,多个样本率间差异有统计学意义,表明至少有某两个率之间有差异。为了获得哪两个率之间有差异,需要进行多个率的两两比较。60学习交流PPT多个样本率间多重比较进行多个样本率比较时,如果拒绝H多个样本率间多重比较采用Bonferroni法进行多个样本率的两两比较,步骤如下:对需要比较的行×列表资料进行χ2分割,变成多个四格表;对每个四格表进行χ2检验;采用(α‘=α/比较次数)计算调整的水准,其中α为事先确定的水准;以α‘调整作为检验检验水准,作出结论。61学习交流PPT多个样本率间多重比较
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