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文档简介
5月份工作总结5月份工作总结
5月份工作总结
一田间工作
这个月在田间主要帮张师兄测株高,刘师兄育苗和挂牌。二试验室
1遗传差异试验
(1)发苗5.2号总在育苗盘中发了33个亲本和杂交组合(详见下表)的苗,每个组合五穴,每穴丢三颗种子。CMo17Mo1718白C478478自330C黄早四*A619C48-248-2A619C黄早四黄早四C478C48-2*18白C黄早四Mo17C黄早四*47848-248-2*18白CMo17黄早四C478*自330C48-2C黄早四Mo17478C478*48-2CMo17*48-2黄早四黄早四Mo17C48-2*478黄早四目前在这个扩大后的群体CMo17Mo17C478478C48-248-2C黄早四黄早四C478C48-2*18白C黄早四Mo17C黄早四*47848-218白自330A619C478C48-2*A619C黄早四47848-2*自330黄早四Mo17C48-2*478黄早四478CMo1748-2*18白C478*自330黄早四C48-2C黄早四Mo17478C478*48-2CMo17*48-2黄早四黄早四中,只有以下六个组合C47848-2C48-2*A619待多营取材478*自330待多营取材黄早四478*18白无种子还没有发苗,预备让徐浩师兄帮我取样。478*18白这个组合无种子,临时待找到种子。(2)DNA提取
以下是育苗20天后的生长状况图片
图一育苗结果图二育苗结果
图三育苗结果图四育苗结果将这33组合中得C48-2和48-2全部提取DNA,其他组合随即选取三株提取DNA,编号如下:组合提取个数编号C48-238S148-234S2A6193S3C48-2*18白3S4C478*18白3S5C黄早四*18白3S6黄早四*18白3S7C478*黄早四3S8C478*Mo173S9C478*48-23S10CMo17*48-23S11CMo17*4783S12CMo17*黄早四3S21C48-2*黄早四3S14C48-2*4783S13C48-2*Mo173S15C黄早四*4783SC黄早四*48-23S17C黄早四*Mo173S18CMo173S19C4783S20C黄早四3S22Mo173S234783S24黄早四3S2518白3S26自3303S27C黄早四*A6193S2848-2*18白3S29CMo17*自3303S30C478*自3303S31C黄早四*自3303S32C48-2*自3303S33选取所提取的局部DNA对其浓度进展测定和1%的琼脂糖电泳检测,结果如下:
图五DNA检测结果
2RNA提取
RNA的提取和DNase处理
试验前预备:为防止RNA降解,金属、玻璃器皿180℃高温处理6h以上,塑料制品用0.1%的DEPC水浸泡处理,高温灭菌后烘干使用,所用试剂溶解液需用0.1%的DEPC水溶解,试验过程中需带灭菌的手套进展。RNA的提取使用Trizol法,步骤严格根据说明书要求进展。
(1)取0.1g的叶片于液氮预冷的研钵中,参加液氮,快速研磨,参加1ml的Trizol掩盖,待液体完全溶化后,连续研磨直至液体透亮清亮。将液体转入1.5ml离心管,室温放置5min,使其充分裂解,4℃下1201*rpm离心5min;
(2)取上清于另一1.5ml的离心管中,参加0.2ml氯仿,充分振荡混匀30~40s,室温放置5min,4℃下1201*rpm离心10min;
(3)弃沉淀,取上清于另一1.5ml的离心管中,参加等体积的异丙醇,混匀后室温放置5~10min,4℃下1201*rpm离心10min;
(4)弃上清,RNA沉于管底,用75%乙醇洗涤RNA沉淀,温柔振荡离心管,悬浮沉淀,4℃下1201*rpm离心3min;
(5)尽量弃上清,室温晾干或真空枯燥5~10min,枯燥后参加40μlDEPC水溶解RNA;
(6)RNA的DNase处理。反响体系如表4:
表4.PCR反响体系Table4PCRreactionsystem
药品
RNA
DNaseI(5U/μl)RNase-FreeH20RNasin(40U/μl)10×DNaseI缓冲液
用量10-20μg
2μl
加至50μl0.5μl5μl
以上成分37℃温浴30min后,适量的RNase-Free水溶解,并于-70℃保存。且用核酸蛋白仪测定RNA样品的OD260/OD280值,测定其纯度和浓度。用1.0%琼脂糖凝胶电泳,更换新的0.5%TBE缓冲液,电压140V,快速检测RNA。结果如下列图:
从图中可以看出RNA提取结果不好,RNA发生降解,主要缘由可能是操作的缘由,也可能是试验前预备工作没做好,以后肯定要花大力气改良,争取提取出可用的RNA。三文献阅读
本月由于田间劳动的缘由,只读了三篇中文文献,两篇英文文献,中文文献
1基因表达调控与选择性剪接机制讨论
这篇文章是201*年发表在电子学报上的文章,由于当时还没有高通量测序技术,所以是以cds序列通过EST来讨论RNA可变剪接的机制以及影响因素,这篇文章的两点就是建立了AsMaIndb并进展了多序列比对算法ASALIGN,没有进展任何试验验证,所以是一片生物信息学文章。由于距现在时间较远,所以试验方法不具备参考价值。
2拟南芥SDIR1基因转录的选择性剪接
这篇文章是201*年发表在云南植物讨论上的一篇文章,他采纳PCR及RT-PCR法分别克隆了拟南芥SDIR1基因的DNA和CDNA,并通过序列比照发觉了三种转录本,并对已报道的SDRI1基因的序列进展比照,发觉三个转录本编码产物不同,并用RT-PCR讨论了SDRI1基因的表达量。这篇文章对我讨论RNA可变剪接作用很大,我可以参考他的试验方法以及思路,用我们测序的结果和玉米B73的序列设计引物扩增出目的基因,并反转录成cDNA后通过转化测序和B73序列比照,证明发生了可变剪接和发生可变剪接后的编码产物的变化。3小麦光周期基因PPd-B1的选择性剪接分析这篇文章是201*年发表在作物学报上的文章,是我们学校小麦所做的。他们也是通过提取RNA后反转录成cDNA,并通过序列比照讨论可变剪接的,试验方法没有公开,不能借鉴,但他们发觉同一个基因可以存在多种可变剪接方式,并且将剪接位点详细到第几外显子,还是对我的讨论有很大帮忙的。英文文献
1Genome-wideDetectionandAnalysisofAlternativeSplicingforNucleotideBindingSite-Leucine-RichRepeatsSequencesinRice
这篇文章是201*年发表在JournalofGeneticsandGenomics上的,这是一篇生物信息学分析的文章,其中涉及到几个软件,Sim4,AIR,Spidey,BLAT,EST_GENOME,EXALIN,GeneSeqer,MGAlignIt可以识别可变剪接和内含子多态性。他们是从生物信息学角度动身通过不同的数据库建立了HMM(隐马尔科夫模
型)然后通过不同软件分析可变剪接。这些软件对我讨论可变剪接还是很有意义的。
2SurveyofthetranscriptomeofAspergillusoryzaeviamassivelyparallelmRNAsequencing
这篇文章是201*年发表在NucleicAcidsResearch上的一篇文章,这篇文章和我们的测序报告完全一样,他们也是201*年华大基因测序,测序后依据测序报告对差异表达、可变剪接、新转录本、新外显子、新基因进展了验证,他们设计引物随机选取一个验证胜利后即可确定测序报告的正确性,里面有验证的试验方法,值得借鉴。
6月份工作规划已经提取出遗传差异试验所需的大局部DNA,并已经合成了AC204515.3-10CGTGTCGTGTGCAATTTCTTGGGTGGGATTGTTTAAGCCTBAC-SSR这个引物,所以要在最快的时间内提取剩余五个组合的DNA,争取在六月份完成遗传差异试验。
扩展阅读:生产部5月份工作总结及6月份工作规划
生产部5月份工作总结及6月份工作规划
一、5月份工作总结
1.生产部对厂部值班、周检进展跟踪、催促,对存在的问题进展指出、批判。对车间的故障台帐等各种台帐进展检查、考核。完成生产部制度的初次汇编。2.调度初步做好了全厂水、电、煤的消耗、甲醇产量的统计台帐,为我们的本钱核算供应了初步数据。
3.和区域销售部相关领导沟通,完成销售前期预备局部工作,胜利打通销售流程,进展了液氧和甲醇的充装和销售演练。完成了空分灌区充装安全条件的落实。
4.给排水:完成了新增外排污水管的改造;对生产用水,污水排放、浓盐水等排放进展合理掌握,保证了生产正常运行。
5.燃料动力:两台锅炉根本实现较长周期运行,保障了生产稳定运行。人员离职较多,准时做了思想工作及聘请、培训。
6.空分实现了较长周期的稳定运行;氩系统调试合格,产出了合格的氩气;完成产品销售的各项安全工作,实现了液氧、液氮的销售。完成氧泵联锁的调试及投用。
7.气化:单台气化炉实现了较长周期运行,两台气化炉也初步实现了满负荷运行(20小时左右)。准时停车处理了705两个蒸汽发生器E1503、E1504漏点。8.合成:产出了合格的甲醇,系统初步实现了稳定运行;504灌装站投用正常;精馏加压塔再沸器、常压塔水冷器漏点准时进展了检修处理。对精馏常压塔进口管高度进展了改造。正在对804装置进展调试。
9.质检中心协作全系统开车做好了分析工作;协作人力加紧人员聘请的工作;督促备品配件和化学试剂到货,但此工作进展不顺当,已影响到正常生产。二、6月份工作规划
1.生产部连续抓好工艺纪律、生产记录、工艺指标、交接班检查、考核工作;对厂部值班、周检进展跟踪、催促。汇总生产部车间台帐名目,对格式、名称等进展标准。
2.完成生产部制度的汇编审核。完成迷你操作手册的定稿工作,并报选购规划。3.打通甲醇销售流程,完成甲醇销售任务。4.调度做好生产的组织和协调、调度工作;做好两台气化炉满负荷运行,全系统考核工作;做好6月份停电1天的开停车规划工作。做好全厂水、电、煤的消耗、甲醇产量的统计工作,积存出比拟有代表性的数据。
5.给排水:做好节能降耗工作,保证脱盐水质及水量、保证循环水压力、温度正常,保证消防水正常。污水调试正常,合格排放,同时做好应急预案。6.燃料动力:保证2台锅正常稳定运行,降低消耗;完成成品磅协调投运;做好新进员工的安全教育及上岗培训工作。改善现场环境卫生。
7.空分:保证系统安全稳定运行,产品合格;保证产品销售安全准时。提高负荷,保证气化两台炉满负荷运行。
8.气化:做好2台气化炉满负荷运行的各项工作,实
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