核酸序列一般分析课件

生物信息学第六讲核酸序列的一般分析生物信息学1主要内容:基因组DNA简介、序列格式转化、DNA序列分析四、序列翻译、ORF查找五、限制性内切酶分析六、引物设计七、RNA二级结构分析主要内容:2基因组DNA简介·遗传信息存贮在4种字符组成的核酸序列中天书”—用遗传语言书写的人类遗传蓝本包含的信息量巨大更重要的是目前人类对它了解甚少天书中只有4个字符(碱基A、T、G、C)既没有段落,也没有标点符号是一个长度为3×109的一维序列。基因组DNA简介3科学家对这本天书了解最多的部分就是遗传密码或者说掌握了DNA对蛋白质编码的规律关于密码子(1)密码子的使用是非随机的·如果密码子的第一、第二位碱基是A、U,那么第三位将尽可能使用G、C;反之亦然。如果三位都用G、C,则配对容易,分解难;位都用A、U,则相反。一般地说,高表达的基因,要求翻译速度快,要求密码子和反密码子配对快、分开也快。科学家对这本天书了解最多的部分就是遗传密码4(2)密码子的使用有一定的统计规律对同义密码子的使用存在着偏爱不同种属偏爱的密码子不同人类基因组:密码子第三位取A、U的情况占90%而第三位取G、C仅占10%密码子的使用偏性与基因功能、蛋白质结构相关(2)密码子的使用有一定的统计规律5核酸序列一般分析课件6核酸序列一般分析课件7核酸序列一般分析课件8核酸序列一般分析课件9核酸序列一般分析课件10核酸序列一般分析课件11核酸序列一般分析课件12核酸序列一般分析课件13核酸序列一般分析课件14核酸序列一般分析课件15核酸序列一般分析课件16核酸序列一般分析课件17核酸序列一般分析课件18核酸序列一般分析课件19核酸序列一般分析课件20核酸序列一般分析课件21核酸序列一般分析课件22核酸序列一般分析课件23核酸序列一般分析课件24核酸序列一般分析课件25核酸序列一般分析课件26核酸序列一般分析课件27核酸序列一般分析课件28核酸序列一般分析课件29核酸序列一般分析课件30核酸序列一般分析课件31核酸序列一般分析课件32核酸序列一般分析课件33核酸序列一般分析课件34核酸序列一般分析课件35核酸序列一般分析课件36核酸序列一般分析课件37核酸序列一般分析课件38核酸序列一般分析课件39核酸序列一般分析课件40核酸序列一般分析课件41核酸序列一般分析课件42核酸序列一般分析课件43核酸序列一般分析课件44核酸序列一般分析课件45核酸序列一般分析课件46核酸序列一般分析课件47核酸序列一般分析课件48核酸序列一般分析课件49核酸序列一般分析课件50核酸序列一般分析课件51核酸序列一般分析课件52核酸序列一般分析课件53核酸序列一般分析课件54核酸序列一般分析课件55核酸序列一般分析课件56核酸序列一般分析课件57核酸序列一般分析课件58核酸序列一般分析课件59核酸序列一般分析课件60生物信息学第六讲核酸序列的一般分析生物信息学61主要内容:基因组DNA简介、序列格式转化、DNA序列分析四、序列翻译、ORF查找五、限制性内切酶分析六、引物设计七、RNA二级结构分析主要内容:62基因组DNA简介·遗传信息存贮在4种字符组成的核酸序列中天书”—用遗传语言书写的人类遗传蓝本包含的信息量巨大更重要的是目前人类对它了解甚少天书中只有4个字符(碱基A、T、G、C)既没有段落,也没有标点符号是一个长度为3×109的一维序列。基因组DNA简介63科学家对这本天书了解最多的部分就是遗传密码或者说掌握了DNA对蛋白质编码的规律关于密码子(1)密码子的使用是非随机的·如果密码子的第一、第二位碱基是A、U,那么第三位将尽可能使用G、C;反之亦然。如果三位都用G、C,则配对容易,分解难;位都用A、U,则相反。一般地说,高表达的基因,要求翻译速度快,要求密码子和反密码子配对快、分开也快。科学家对这本天书了解最多的部分就是遗传密码64(2)密码子的使用有一定的统计规律对同义密码子的使用存在着偏爱不同种属偏爱的密码子不同人类基因组:密码子第三位取A、U的情况占90%而第三位取G、C仅占10%密码子的使用偏性与基因功能、蛋白质结构相关(2)密码子的使用有一定的统计规律65核酸序列一般分析课件66核酸序列一般分析课件67核酸序列一般分析课件68核酸序列一般分析课件69核酸序列一般分析课件70核酸序列一般分析课件71核酸序列一般分析课件72核酸序列一般分析课件73核酸序列一般分析课件74核酸序列一般分析课件75核酸序列一般分析课件76核酸序列一般分析课件77核酸序列一般分析课件78核酸序列一般分析课件79核酸序列一般分析课件80核酸序列一般分析课件81核酸序列一般分析课件82核酸序列一般分析课件83核酸序列一般分析课件84核酸序列一般分析课件85核酸序列一般分析课件86核酸序列一般分析课件87核酸序列一般分析课件88核酸序列一般分析课件89核酸序列一般分析课件90核酸序列一般分析课件91核酸序列一般分析课件92核酸序列一般分析课件93核酸序列一般分析课件94核酸序列一般分析课件95核酸序列一般分析课件96核酸序列一般分析课件97核酸序列一般分析课件98核酸序列一般分析课件99核酸序列一般分析课件100核酸序列一般分析课件101核酸序列一般分析课件102核酸序列一般分析课件103核酸序列一般分析课件104核酸序列一般分析课件105核酸序列一般分析课件106核酸序列一般分析课件107核酸序列一般分析课件108核酸序列一般分析课件109核酸序列一般分析课件110核酸序列一般分析课件111