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文档简介

lamps 在终端输入cd(lammps.tar.gz放在/mnt下(cp/tarxvflamps.tarmvlammps-5Dec10 (重命cdlmp/src/STUBSmakecleancdvi 后出#g++=RedHatLinuxbox,g++4,gfortran,noMPI,noS=/bin/sh#compiler/linker#specifyflagsandlibrariesneededforyourCC g++4CCFLAGS= -g-ODEPFLAGS= LINK g++4LINKFLAGS= -g-OLIB=ARCHIVE= ARFLAGS SIZE #然后存档,退出,终端输cd/mnt/lmp/srcmakecle makeserial之后linux开始编译,最后会在/mnt/lmp/src下生成lmp_serial可执行文件mvlmp_serial2计算终端输cdcp/mnt/lmp/src/lmp 即开始lammps的并行安1终端输入cdgunzipfftw-2.1.5.tar.gz (源码fftw-2.1.5.tar.gz/mnt下)tarxvffftw-2.1.5.tarcdfftw- --enable-floatmake (fftw-2.1.5即安装在/opt/fftw下2终端输入cdtarxvfmpich2-1.3.1.tarcd/mpich2- make (mpich即安装在/opt/mpich下 开始编If[-f/etc/bashrc];. 3lammpscd/mnttarxvflammps.tarmvlammps-5Dec10lmpcd/lmp/srcmakeyes-allmakeno-gpumakeno-user-atc(几个特殊的package:meam,poems,reax,gpu,user-atc需要特安装,如下cd/mnt/lmp/lib/meammake–f (cd/mnt/lmp/lib/poemsmake–fMakefile.g++cd/mnt/lmp/lib/reaxmake–f(然后对Makefile.serial文件进行编译cdvi (i可修改#g++=RedHatLinuxbox,g++4,gfortran,MPICH2,S=##compiler/linker#specifyflagsandlibrariesneededforyourCC g++4CCFLAGS= -g-ODEPFLAGS= LINK g++4LINKFLAGS= -g-OLIB=ARCHIVE= ARFLAGS SIZE ##LAMMPS-specific#specifysettingsforLAMMPSfeaturesyouwill#LAMMPSifdefoptions,seeLMP_INC -#MPIlibrary,canbesrc/STUBSdummylib#INC=pathformpi.h,MPIcompilersettings#PATH=pathforMPIlibrary#LIB=nameofMPIMPI_INC - - -MPI_LIB - -lmpich-#FFTlibrary,canbe-DFFT_NONEifnotusingPPPMfromKSPACE#INC=-DFFT_FFTW,-DFFT_IN,-DFFT_NONE,etc,FFTcompilersettings#PATH=pathforFFTlibrary#LIB=nameofFFTFFT_INC FFT_LIB - #additionalsystemlibrariesneededbyLAMMPSpackage#thesesettingsareIGNOREDifthecorrespondingLAMMPSpackage#(e.g.gpu,meam)isNOTincludedintheLAMMPSbuild#SYSLIB=namesoflibraries#SYSPATH=pathsoflibrariesgpu_SYSLIB= meam_SYSLIB= -lmeam–lgfortran -lpoems-reax_SYSLIB= -lreax-lgfortranuser-atc_SYSLIB=-lblas-llapack -meam_SYSPATH= reax_SYSPATH= ##buildrulesanddependencies#noneedtoeditthissection EXTRA_INC=$(LMP_INC)$(PKG_INC)$(MPI_INC)$(FFT_INC)EXTRA_LIB=$(PKG_LIB)$(MPI_LIB)$(FFT_LIB)$(PKG_SYSLIB)#Link $(LINK)$(LINKFLAGS)$(EXTRA_PATH)$(OBJ)$(EXTRA_LIB)$(LIB)-o$(SIZE)#Library $(ARCHIVE)$(ARFLAGS)$(EXE)#Compilation$(CC)$(CCFLAGS)$(EXTRA_INC)-c$(CC)$(CCFLAGS)$(EXTRA_INC)$(DEPFLAGS)$<>#IndividualDEPENDS=include存档退出 exit),终端输入cd/mnt/lmp/srcmakecle make (lammps开始安装,最后可生成lmp_serial的执行文件mvlmp_serial4并行计算一examplecdcp/o

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