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文档简介
第三章蛋白质I:蛋白质的组成第一节蛋白质通论一、蛋白质的化学组成C(~50%)、H(~7%)、O(23%)、N(16%)、S(0-3%)P、Fe、Cu、I、Zn、Mo蛋白质平均含氮量为16%,这是蛋白质元素组成的一个特点,也是凯氏定氮法测定蛋白质含量的计算基础。蛋白质含氮量=蛋白氮6.25二、蛋白质的分类(一)按组成分为两大类简单蛋白质(simple
protein)完全由氨基酸残基组成的蛋白质。胰岛素结合蛋白质(conjugated
protein)除蛋白质部分外,还有非蛋白质成分(辅基)。血红蛋白简单蛋白按溶解度又可分为7类:清蛋白(albumin)球蛋白(globulin)谷蛋白(glu
in)溶于水、稀盐、稀酸碱溶于水或稀盐溶于稀酸、稀碱谷醇溶蛋白(prolamine)
溶于70-80%乙醇组蛋白(histone)
溶于水与稀酸鱼精蛋白(protamine)溶于水和稀酸硬蛋白(scleroprotein)不溶于水、盐、稀酸碱结合蛋白按辅基种类分为:辅基白(nucleoprotein
)
核酸脂蛋白(lipoprotein
)
脂质糖蛋白(glycoprotein)糖磷蛋白(phosphoprotein)
磷酸基血红素蛋白(hemoprotein
)血红素黄素蛋白(flavoprotein
)
FAD金属蛋白(metallaprotein
)金属血红蛋白(转运氧)(二)按分子外形分为两类球状蛋白质(globular
proteins)纤维状蛋白质(fibrous
proteins)(三)按生物功能分为酶(enzyme)调节蛋白(regulatory
protein)转运蛋白(transport
protein)蛋白(nutrient
and
storage
protein)收缩和运动蛋白(contractile
and
motile
protein结构蛋白(structural
protein)防御蛋白(defense
protein)异常蛋白(exotic
protein)A0005801.mov一个过程多重功能蛋白三、蛋白质的水解(一)酸水解回流煮沸20小时蛋白质氨基酸6
mol/L
HCl(二)碱水解回流煮沸10-20小时蛋白质氨基酸5
mol/L
NaOH(三)酶水解不完全水解习题蛋白质有哪些生物功能?有5
g
植物
,经测定含氮0.06
g。问该
蛋白质含量是多少?(%):简单蛋白质、结合蛋白质、球蛋白/球状蛋白质蛋白质的水解产物是什么?第二节氨基酸--蛋白质的构件分子一、氨基酸的分类(一)常见蛋白质氨基酸(standard
amino
acid)-氨基酸结构通式-氨基酸的区别在于侧链R基的不同1
非极性R基氨基酸(Aromatic
R
Groups)
8种吲哚基团非极性R基氨基酸2
不
带
电
荷
的
极
性
R
基
氨
基
酸(Polar,uncharged
R
Group)
7种3
带正电荷的R基氨基酸(Positively
Charged
R
Group)
3种碱性氨基酸,在pH7时携带正净电荷.精氨酸(胍基)组氨酸(咪唑基)赖氨酸(-氨基)4
带负电荷的R基氨基酸(Negatively
Charged
R
Group)
2种酸性氨基酸,含有2个羧基,在pH7时分子带负电荷.谷氨酸天冬氨酸重要AA的特征:含芳香环的氨基酸Phe(F),Trp(W),Tyr(Y)含羟基氨基酸Ser(S),Thr(T),Tyr(Y)含硫的氨基酸Cys(C)(巯基),Met(M)含酰胺基氨基酸Asn(N),Gln(Q)酸性氨基酸:Asp(D),Glu(E)碱性氨基酸:Lys(K),Arg(R),His(H)亚氨基酸:Pro(P)没有旋光性的氨基酸:Gly(G)(二)不常见的蛋白质氨基酸(稀有氨基酸)蛋白质组成中,除常见的20种氨基酸外,还有一些不常见的氨基酸,如4-羟脯氨酸,它们是常见氨基酸衍生来的。又称稀有氨基酸。(三)非蛋白质氨基酸还有300多种氨基酸不参与蛋白质组成,它们以游离状态或结合状态存在于细胞或组织中。多为蛋白质氨基酸的衍生物。常作为代谢物前体或中间产物。习题重要氨基酸的特征AA的三字母、单字母符号:稀有氨基酸、非蛋白质氨基酸第二节氨基酸--蛋白质的构件分子一、氨基酸的分类二、氨基酸的酸碱化学三、氨基酸的重要化学反应四、氨基酸的光学活性和光谱性质二、氨基酸的酸碱化学(一)氨基酸的兼性离子形式中性pH下,氨基酸主要以偶极离子(dipolarion)或兼性离子(zwitterion)形式存在。(二)氨基酸的两性解离氨基酸的解离状态是pH的一个函数氨基酸具有特征滴定曲线从滴定曲线理解:(1)
pKa1解离常数Ka1代表氨基酸羧基解离情况。pKa1等于羧基解离一半时的pH值。解离常数Ka2代表氨基酸氨基解离情况。pKa2等于氨基解离一半时的pH值。(2)氨基酸等电点氨基酸所带正电荷数与负电荷数相等时(净电荷为零时)的溶液pH
值,称为等电点(isoelectric
point,pI)。pI=1/2
(pKa1+pKa2)酸性AA:pI=1/2
(pKa1+pKR)碱性AA:pI=1/2
(pKa2+pKR)组氨酸的滴定曲线3
氨基酸的带电状况与溶液pH有关pHpI时,AA带负电,电场中向正极移动pHpI时,带正电, 向负移动pHpI时,不带电, 不移动(三)氨基酸的
滴定加入
,氨基酸的滴定终点降低2-3个pH单位。与氨基酸中的氨基作用生成羟甲基衍生物,增加了氨基的酸性解离。三、氨基酸的重要化学反应Sanger反应艾德曼(Edman)反应茚三酮反应(一)桑格反应(sanger
reaction)-氨基参加的反应(烃基化反应)桑格试剂:2,4-二硝基氟苯2,4-dinitrofluorobenzene(DNFB,FDNB))Sanger反应*
应用:
鉴定多肽链的氨基末端氨基酸在弱碱性溶液中,
DNFB
将-氨基酸转变成黄色的2,4-二
基氨基酸.(二)艾德曼反应(Edman
reaction)试剂:苯异硫 酸酯(Phenylisothiocyanate,
PITC)-氨基参加的反应(烃基化反应)艾德曼反应用途:鉴定多肽链氨基末端AA;蛋白质(三)茚三酮反应(Ninhydrin
reaction)-氨基和-羧基同时参加的反应茚三酮反应弱酸性溶液中-氨基酸与茚三酮共同加热,引起氨基酸氧化脱氨﹑脱羧反应,最后还原茚三酮和氨发生反应,生成蓝紫色产物.*
用途:定性或定量氨基酸•氨基酸应茚三酮反(四)巯基的反应巯基不稳定,易被氧化成二硫键2半胱氨酸胱氨酸
2
-SH-S-S-与重金属反应AA-SH
+Ag+AA-SAg3二硫键的打开氧化:Cys-S-S-Cys+HCOOOH2AA-SO
-3(磺基丙氨酸)还原:Cys-S-S-Cys+-巯基乙醇2Cys-SH4巯基的保护巯基的烷基化试剂:碘乙酸、碘乙酰胺-SH+ICH2COOH-SCH2COOH+HI四、氨基酸的光学活性和光谱性质1
旋光性除Gly外,都含C*,对映体,光学异构体几乎所有天然存在的蛋白质氨基酸都为L-型氨基酸的构型指-碳的构型2
光吸收Tyr,
Phe,
Trp
因苯环上含共轭双键,在近紫外区吸收光,其吸收
在280nm左右。A=CL紫外法测定蛋白质浓度的原理。第三节氨基酸的分析分离一、分配柱层析(Partition
Chromatography)层析系统:固定相(stationary
phase)流动相(mobile
phase)分配系数Kd有效分配系数Keff二、滤纸层析(Filter-paper
Chromatography)Rf值:从原点到氨基酸停留点的距离/原点到溶剂前沿的距离三、薄层层析(Thin-layer
Chromatography)四、离子交换柱层析(Ion-exchange
ColumnChromatography)离子交换树脂带酸性基团、能解离出质子,与溶液中阳离子发生交换的叫阳离子交换树脂。-SO3H(强酸型)、-COOH(弱酸型)带正电荷的AA与阳离子交换树脂结合力强。带碱性基团、能解离出OH-、可与溶液中阴离子发生交换的叫阴离子交换树脂。-N(CH3)OH(强碱型)、-NH3OH(弱碱型)带负电荷的AA与阴离子交换树脂结合力强。五、气相色谱
(gas-liquid
chromatography流动相为气体,基于分配原理。优点:微量、快速六、高效液相色谱(HPLC)high
performance
liquid
chromatography溶剂系统为高压优点:快速、灵敏、高效习题为什么用紫外法能测定蛋白质含量?阳离子交换柱,pH=3时,中性AA、酸性
AA、碱性AA,哪一种先被洗脱下来。为什么?:氨基酸pI
桑格反应艾德曼反应HPLC
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