常用生物信息学数据库和分析工具网址

1、数据库因特网网址网上生物信息学教 程EBI自修课程自修课程自修课程生物信息学常问的 问题faq/生物信息学机构NCBINucleotide Sequence Database Collaboration.Centre北京大学生物信息 学中心数据库信息发布及 其它GenBank ReleaseNotessummary reportrelease notesmanemblDDBJ release notesEukaryotic promoter database release notesrelease notesmanswissprotPIR release notesmanpirPRF rel

2、ease notesmanprfPDBSTR release notesmanpdbstrProsite release notesmanprositePDB release notesmanpdbKEGG release notesmanpathway核甘酸数据库GenBank(NCBI)核甘酸数据库(EBI)向EMB散据库提交 序列R gene database启动子数据库Eukaryoticpromoter database转录因子数据库FRANSFAC基因注释数据库RAP-DB基因分类数据库Gene Ontology (GO)蛋白质数据库SWISS-PROTTrEMBL结构数据库PDB

3、Protein DatabaseNucleic AcidsDatabasePlus Database3Dimage酶、代谢和调控路径 数据库KEGGNomenclatureDatabaseKinase Resource (PKR)多种代谢路径数据 库基因调控路径数据 库(TRANSPATH)基因组数据库禾本科比较基因组Data日本水稻基因组（RGP）水稻物理图谱华大水稻基因组框 架图欧洲水稻测序（第12 染色体）（水稻插入突艾体）genomegenomegrasses genomesgenomesgenomegenomegenomemax genomeelegans genome藻类(Chla

4、mydomonas基因组粘菌(Dictyostelium )基因组genomes (ArkDB)GenomeInformaticsGenome Database多种基因组数据库Mutant Database文献数据库PubMedGeneticsNewsletterof the National Academy of Sciences USA (PNAS)关键词为基础的数 据库检索EntrezNucleotideSequence SearchProtein SequenceSearchEntrezRetrieval System, IndiaRetrieval System, Singapore

5、Retrieval System, USRetrieval System, UKNucleotide &Protein SequenceSearchSearch with KeyWords序列为基础的数据 库检索BLASTPCRanalysisalignment多序列分析Clustal multiple sequence alignmentClustalWmultiple sequence alignment修饰对序列对位排 列结果的格式(Boxshade)系谱分析PAUPClustalW analysispackageanalysis基因结构预测分析GENSCANFindingFeature

6、 SearchesRepeats Finder基因分类GO Annotator蛋白质结构预测分 析Expasyprotein secondary structureprotein 3DStructuresprotein structures其它分析工具和软 件BioEdit（PCFgl物设计）DNA SequencingErrors CheckSignal ScanSearch LauncherDNA to proteinmotifs:Pfam多种数据库、分析工 具和生物信息学机 构多种数据库和分析 工具sequence analysis功能基因组分析Transcription profiling technologiesfor cDNA array technologymanagement and analysis of gene expression arraysof commercially availa