季节性流感监测中病毒分子变异分析的意义

1、季候性流感监测中病毒分子变异阐发的意义【摘要】目的探究季候性流感监测的同时，针对人群中循环的上风毒株开展基因变异阐发的意义。要领以2022年深圳市流感监测体系累积的数据为底子，按周阐发差异监测病院流感样病例占门诊和急诊就诊者的比例，并对病毒型别举行通例分散判断，对上风毒株扩增ha1区基因片断，并举行基因变异阐发。效果深圳市流感样病例2022年流感样病例(ili)比例为6.67%,以低年事为高发人群;按市、区病院和社区康健办事中央等别离阐发,ili的比例按周漫衍同等，出现显着的夏日岑岭，最活泼季候在57月;ili爆发疫情比散发病例提早2周出现。流感病毒分散率为11.63%,上风株为h3n2亚型(

2、占59.5%)，b型次之(占37.0%)。h3n2亚型流感病毒ha1基因进化阐发分成两支，h当年疫苗株和我国代表株仅与14月毒株靠近，而与5月之后分散株产生了遗传间隔，固然还不克不及确定新的变异株出现，但提示a/sz/9/2022和a/sz122/2022两个分散株值得高度存眷。b型流感病毒ha1基因进化阐发创造，2022年以yaagata系最活泼。结论季候性流感监测中开展病毒分子变异阐发，可以进一步查明人群中所产生的上风毒株的特性，便于盛行病学综合阐发。【关键词】流感;人群监测;基因;变异(遗传学)【keyrds】influenza;ppulatinsurveillane;genes;var

3、iatin(genetis)2022年，笔者在深圳市流感监测体系(shenzheninfluenzasurveillanesyste,siss)季候性通例运转的同时，开展了人群中循环的流感病毒上风毒株的基因序列测定和阐发，并对其盛行病学意义举行了阐发。1质料与要领1.1流感监测体系运行根据国度和广东省疾病防范操纵中央的要求,创立国度和省级监测点,同时,根据深圳地区和生齿等因素,确定市级监测点,各级监测点配合构成siss,根据国度监测方案同一运行。深圳市疾病防范操纵中央(szd)为网络技能方案单元，对各级监测点职员举行技能培训、质量督导和稽核，并按期小结和反响效果，确保网络精良运行和陈诉质量。1

4、.2ili数据网络和统计ili参考h界说,划定为发热38，伴咳嗽或咽痛病症，并缺乏其他病原学诊断根据者。由siss中9所监测病院的内科门诊、儿科门诊、急诊科和发热门诊逐日登记,同时统计上述诊室的就诊病例总数,盘算ili占就诊病例数的百分比(perentagefpatientvisitsfrili,%ili)，每周由病院陈诉szd举行汇总,按周%ili作为流感盛行的阐发指标。1.3ili爆发疫情陈诉siss将爆发疫情界说为：或人群相对会合的单元如学校、幼托机构、敬老院、工场或公司、工地等，1周内出现5例及以上ili，由各区疾病防范操纵中央接报后观察处置惩罚，szd按周完成汇总和阐发。1.4流感病

5、毒分散判断和阐发每所流感监测病院从接诊的ili中拔取未担当抗病毒治疗的病症期病例网罗咽拭子标本，每周10份冷藏运送到szd完成病毒分散：按通例要领同时接种狗肾传代细胞和911日龄鸡胚，举行流感病毒造就;一连传两代，经血凝实行效果为阳性的标本，接纳国度流感中央保举的尺度血清举行血凝按捺实行，完成病毒型别和亚型的判断。并将阳性毒株分装后-70保存，以供日后基因序列测定和阐发。盘算各年度流感病毒的分散率和逐年各亚型流感病毒的构成比作为阐发指标。1.5流感病毒血凝素重链区(ha1)基因片断序列测定和阐发2效果2.1siss的构成2022年siss由7所疾病防范操纵中央(市1所，区6所)、9所病院、3所

6、学校、6个社区康健办事中央和4所禽类豢养和贩卖市场构成，共有29个单元，覆盖了6个行政区。2.2ili按年事漫衍2022年siss共陈诉ili为151890例，占就诊病例总数(2278884)的比例为6.67%;在全部ili中,04岁占47.44%、514岁占25.33%、1524岁占8.40%、2559岁占17.41%、60岁以上占1.23%，即ili重要会合在014岁组儿童和青少年。图1表现了深圳市全部监测点%ili按周漫衍，固然各周%ili有所颠簸，但曲线的总体走势呈单峰型，%ili从第2324周开始上升，至第27周到达岑岭，随后渐渐落落，第3031周回落到一样平常程度;即67月份为深圳

7、市流感盛行期，形成较显着的夏日盛行岑岭。2.6流感病毒ha1基因进化阐发图3表现，2022年深圳占上风的h3n2亚型流感病毒分散株的演化生长可归纳综合为2个分支，从sz/19/07到sz/101/07共计19株为一个分支，它们绝大多数为2022年14月分散，与h一连3个年度即2022/2022和2022/2022的疫苗保举株以及我国当年的代表株聚拢一起，遗传间隔靠近。而2022年5月以后(重要是57月)分散的52株病毒聚拢在另一分支，与疫苗株及我国代表株遗传间隔较远。系、26株b(vitria)系毒株ha1区举行测序，拔取差异时间、差异所在分散的株b(yaagata)系19株、b(vitria

8、)系7株，构建ha1区基因进化树，与2022年深圳毒株、h疫苗株及我国代表株举行比拟(图4)。由图4可见，2022年毒株聚拢成2个分支，从sz/3/07到sz/230/07为一个分支，属于b(vitria)系;2022年深圳分散到的大多数毒株，以及20222022年疫苗株b/alaysia/2506/2022、国度代表株b/sz/155/2022在一个分支上。而2022年深圳分散的绝大多数毒株即从sz/72/07到sz/320/07共19株构成另一个分支，属b(yaagata)系;与疫苗株b/shanghai/361/2002和b/flrida/4/2022间隔较远，和国度代表株b/fjxl/

9、54/2022同属一个分支。各分支内部没有创造显着的时间进化差异。2.7ha1核苷酸同源性h3n2亚型流感病毒2022年14月分散株与a/jxdh/312/2022的同源性最高，为99.4%100%;2022年512月分散株与2022/2022年度疫苗株(a/brisbane/10/2022)的同源性较高，为98.7%99.2%。b型流感2022年分散株与b(yaagata)系h疫苗株的同源性为97.1%97.9%，与国度代表株的同源性为99.0%99.6%。而在b(vitria)系中，与参照株同源性比力创造，2022年分散株的同源性均高于2022年毒株。2.8ha1区氨基酸变异阐发全部h3n

10、2亚型和b型流感毒株ha1基因长度和编码氨基酸均未见缺失或插入，受体结合和二硫键位点氨基酸也显守旧。与h保举的2022/2022年度疫苗株(a/isnsin/67/2022)比拟，2022年h3n2亚型毒株险些均产生i223v氨基酸更换,此中14月分散的毒株产生r142g、n144d氨基酸更换，5月份以后分散的毒株产生g50e、k140i氨基酸更换;2022年分散到的个体毒株还产生了d53n、k158r、r261q和s45n氨基酸置换。上述氨基酸更换的影响是，d122n和s45n氨基酸变异增长一个糖基化位点，而n144d置换导致一个糖基化位点丧失;别的，140、142、144、195位点别离位

11、于抗原决定簇a和b区。固然根据的原那么，尚不克不及判断为新毒株，但a/sz/9/2022和a/sz122/2022两个分散株值得存眷。b型流感病毒2022年分散株中，b(vitria)系5个糖基化位点均守旧;但在b(yaagata)系中，全部分散株产生r48k，大多数产生p108a、l131p、t199i和d197n置换，并由于d197n而增长一个糖基化位点;b/sz320/2022毒株值得器重。3讨论季候性流感监测中不竭引入当代盛行病学和分子生物学等实行检测技能，是进步通例监测质量的有用本领。siss近3年得到进一步的增强，监测点构造试图满意生齿漫衍和地区相干机构设置必要，技能操纵根据我国流

12、感监测方案同一运作，职员技能培训和质量督导等方法确保了监测数据的可靠性和实行室检测的不变性，先前的研究业已表白这一点5。只管h提出并同一了ili的界说，鞭策该指标的应用，但在流感监测中，人们更器重病毒的分散造就，ili的陈诉和阐发轻易被忽略。以质量操纵为条件，以近3年ili数据为底子，2022年笔者开展了人群流感防范操纵预警6，结合本研究效果，市、区病院和社康中央、学校等ili的走势同等，表白siss积聚的数据不变可信，为进一步探究与病毒分子变异的干系奠基了基矗固然ili不但由流感病毒引起，也包罗其他病原体，但ili可以作为人群流感盛行的指标。本研究创造，固然深圳市2022年整年都有ili运动

13、，但最活泼季候在57月;流感病毒分散率最高的月份也在67月，表白流感在深圳出现夏日岑岭，切合亚热带地区流感产生和盛行特点。由ili的年事漫衍和ili爆发特性看，流感急性发病重要累及的人群为儿童和少年，而且在该人群中，流感产生较早。ili比例和趋势在各级病院和社康中央没有太显着的差异，提示现阶段市级病院监测点的设置是需要的。但学校中ili的统计阐发可由ili爆发疫情陈诉取代，由于爆发疫情比散发ili提早2周出现，作为监测指标更敏感。2022年在深圳人群中循环的上风株为h3n2亚型流感病毒(占59.5%)，b型次之占37.0%;而h1n2亚型流感病毒仅占3.5%。2022年27月h3n2亚型非常活

14、泼，尤其是47月分散率较高;而b型流感病毒中，以yaagata系比力活泼，重要在610月份。本研究创造,深圳地区2022年流感病毒分散率为11.63%,以67月分散率最高,比ili的岑岭期推延1个月;2022年流感操纵的理论证实,ili比病毒分散效果更具有早期预警意义。香港的研究7也得到同样的效果，他们创造，流感样病例就诊率与摇摆不定的实行室监测比拟，至少可以提早2周创造流感的盛行，因此，在香港地区可以作为猜测流感盛行的指标。本研究根据流感病毒分散效果所表示的深圳人群中病毒循环映像，进一步被病毒分子变异阐发所明白。h3n2亚型流感病毒ha1基因进化阐发创造，2022年已分成两支，h当年疫苗株和

15、我国代表株仅与14月毒株靠近，而与5月之后分散株产生了遗传间隔，提示深圳大概是h3n2亚型流感病毒变异较快的地区或都会之一。h3n2亚型流感病毒ha1基因的氨基酸置换阐发，固然还不克不及确定新的变异株出现，但提示a/sz/9/2022和a/sz122/2022两个分散株值得高度存眷。b型流感病毒ha1基因进化阐发创造，2022年以yaagata系最活泼，值得器重的毒株为b/sz320/2022。由此可见，病毒分子变异阐发，可以进一步查明人群中所产生的上风毒株的特性。盛行病学事情者已经也留意到外洋的新近研究，特殊留意大样本、跨地区、差异年度一连地病毒分子阐发效果810，而且综合地睁开阐发11。我国台湾12和香港7，13地区业已见诸报道，更由于分子生物学技能的普及，在季候性流感监测中，开展流感分子变异阐发的可行性精良。盼望海内更多偕行跟踪希望，进一步进步季候性流感监测的应用程度。【参考文献】7yangl,ng,laueh,etal.synhrnyflinialandlabratrysurveillanefrinfluenzainhngkngj.plsne，202