济南药谷基因检测公共服务平台建设学习资料

1、济南药谷基因检测公共服务平台建设实验室设备招标技术参数序号仪器名称技术参数要求数量（台）产地1基因测序仪1设备用途：未知物种全基因组测序，已知物种再测序，全基因表达组定量分析，全基因组小RNA分析，染色质免疫互沉淀（ChIP）研究，转录组分析，扩增子测序，外显子测序，定向重测序。2技术规格2.1高数据通量：每次反应可生成150亿（15G）碱基数据；22每次运行至少可生成可读25M个片段标签序列；2.3可以在8小时内完成样品制备、测序和数据分析，用于快速鉴定；2.4数据读长：单端读取序列，读长不低于300个碱基；2.5双端读取序列：读长不低于2x300个碱基；2.6样品用量：DNA羊本需1ng；

2、2.7读取精度：当测序长度为2 x150bp时，80%以上的碱基数据质量高于Q30,当测序长度为2 x250bp时，70%以上碱基数据质量高于Q30。2.8 可精确读取12个的连续单个重复碱基（如AAAAAAAAAAAAAAA2.9不同样品并行性：提供稳定成熟的96个样品的混合接头2.10可同时进行96个样品的1536重PCRT物的测序2.11测序结果给出严格的Q30的数据2.12采用SBS（边合成边测序）的测序原理，通过可逆终止子的方法，可以根据应用的需求控制测序片段的长度2.13无需进行emusion PCR反应2.14扩增、测序和数据分析服务器在同一台仪器上完成；1进口2.15提供简单优

3、化的生物信息学支持软件：如新物种拼接，小RNA分析，扩增子分析，重测序，16S宏基因组分析，文库质量QC等。2.16具有RFID （无线电射频识别）技术的耗材，可以追溯2.17需提供生产厂家针对本项目授权。2咼压蒸气火菌器方式：自动咼压蒸汽火菌2使用温度范围：45135C 4580C （预热温度）/4560C （保温工程）/65100C （溶 解工程）/105135 C （灭菌工程）最高使用压力：0.255MPa盖部结构：手动上下开关式，有安全锁结构排气阀：全排气及缓慢排气各1个、辅助排气1个冷却风扇：轴流风机。装备此冷却系统，使温度下降所需的时间仅需要约3分钟，大大提高了工作效率。需要自然冷

4、却的时候，可以关闭冷却系统。温度控制、设定/显示方法：通过电脑进行PID控制，用上下键进行数码设定 /显示定时：0或1分99小时59分，分辨率：1分多种操作模式可供选择：器具灭菌工程、液体灭菌工程、灭菌保温工程、溶解保温工程、 手动操作模式其他功能：按键锁功能、预约功能、记忆功能、预热功能、强制冷却功能、程序锁功能、警报发生记录功能（20件）、时间积算显示、时刻显示、操作音开/关设置安全装置：传感器异常、SSR短路、加热器断线、防止空烧（液胀式温控器），冷却水壶未设置警告、盖锁异常、记忆异常、压力安全阀（0.255MPa），储存有20种故障信息腔体上标准配备两个传感器接口，有GLP/GMP对应

5、配件供选择。前面门内面设置了透明排水塑料桶，便于观察水位，装备大的排水管，便于进行维护。14严格执行国家法令法规，具有中国压力容器制造许可证，中国医疗器械生产许可证,全面保障人身及财产的安全。缸体有效内容积45L感应式电源，200240VAC。 随电压的波动进行调整。1进口1 主要用途准确、快速检测病原菌，该系统全自动在80分钟之内鉴定出各类样本中的目标微生物。2.技术指标2.1基本原理：本系统以实时荧光定量PCR技术为基础用于病原菌检测和食品质量控1进 口3全自动病原微生物 检测系统制，结合了独特的引物和高特异性基因探针，内设阳性质控，目标病原菌独特的基因信号 可以在70-80分钟之内被检测

6、完成2.2光学检测系统：2.2.1光源：五个LED,各LED激发波长不冋，保证每个通道的荧光素由最佳的激发光激 发探测器：CCD确保整板同时检测，数据间可比性强激发波长范围：475nm - 640nm发射波长范围：520nm - 740nm2.2.5五个检测通道：最多同时能做四色检测线性范围：11个数量级灵敏度：可检测到单拷贝2.3 PCR仪部分：2.3.1半导体模块加热制冷样品容量：24孔升温速率5 C /秒，降温速率 4.5 C /秒2.3.4温度精度：土 0.2 C2.3.5温度均一性：温度均一性：W 0.3 C2.3.6 温控范围：4C - 99.9 C2.3.7熔解曲线检测时，升降温

7、速率可精确到0.01 C/sec可调热盖温度：30C- 110 C可调2.4检测量：一台电脑可控制5台荧光定量PCR 一次最多可运行120个样品，在冋一块PCR板上可同时对多个项目进行检测，实验室环境：常规微生物实验室。2.5检测项目（致病菌筛选项目）：沙门氏菌、治贺氏菌、金黄色葡萄球菌、副溶血菌、 大肠杆菌O157:H7、单增李斯特氏菌、李斯特属、以上项目检测过程全自动，无需离心机、核酸提取仪等仪器或相关等同操作步骤、无需专门的核酸提取试剂盒，所有的项目都是同一个检测流程，同时出结果2.6全自动封闭操作系统，上机后一指键完成全部实验2.7配套试剂：除 DNA模板外所有试剂呈药片状预装在开盖即

8、用的PCR反应管中，每个PCR反应管带有质控，无需单独阳性和阴性对照2.8全封闭药片化试剂（预装引物和试剂），无需冷冻保存。2.9 所有检测项目仅需一步增菌，无需二步增菌或重新生长，省时省力。 2.10软件自动比较目标扩增和内部扩增质控（IAC）用于结果的确认。2.11需提供生产厂家针对本项目授权。记忆功能：可储存 100个方法（包括 PCR前处理，PCR循环，PCR后处理）显示屏：A7*40字节可显示倒计时时间和已完成循环数，闪烁图形提示温度变化当前状态。可编程序：可任意修改预设的程序（包括前处理，后处理和25个循环）；设定好的程序可以储存并可以加密保护防止无意改写软件功能：循环时间和温度自

9、动延伸/自动下降，可停程序；有时间日期显示，自动断电保护，恢复供电后自动执行未完成循环，保证扩增过程安全运行计算Tm值，温度验证功能4PCR仪用户自检：用户可常规运行多种诊断程序以检测仪器升降温速度和升降温精度温度范围：4.0-99.9 C温度显示：仪器显示经计算机计算的实际样品温度，精确到0.1 C实际样品的平均升/降温速度：1C /秒样品基座升降温速度：2.7 C/秒静态样品基座温度均匀性：土0.5 C, 95C计时后30秒温度准确性：土 0.5 C, 35 - 100 C范围热盖：维持105 C温度，满足无油操作 PCR扩增重现性：达到设定温度的时间误差小于5秒1中国5荧光定量PCR仪整

10、机独立3个32孔模块控温并兼容 96X 0.2ml样品槽；温度范围：0 C- 100 C；温度显示：显示经计算机计算的样品实际温度，精确到0.1 C；最高升降温速率可达4 C/秒，并且升降温速率可以调节，样品实际平均温度变化速度3 C /秒；温度精确度：土 0.25 C （35-99.9 C）6.三重温度区域用于条件优化，可冋时运行三个不冋试验，区域间温度差异最大可以达到5 C,整板温差可以达到 15 C,控温精确，重现性好；重现性：任意温度达到时间误差小于5秒；8英寸彩色TFT LCD彩色触摸屏，编程快速简便直观显示屏显示倒计时时间和已完成循环数，闪烁图形提示温度变化当前状态存储能力：主机可

11、储存PCR程序800个，若使用U盘存储则无限制1进口自动断电保护，恢复供电后自动执行未完成循环软件功能：循环时间和温度自动延伸/自动下降；有时间日期显示；用户自检程序：用户可常规运行多种诊断程序以检测仪器升降温速度和升降温精度；软件具有自动计算 Tm值功能，温度验证功能6组织细胞破碎仪可以同时处理 24个2ml提取管，12个5ml提取管。提取管：有2ml和5ml两种规格，提供空管及各种碾磨珠组合预装提取管。样本量：最低10mg最大根据提取管配置。碾磨珠：有0.1mm5ml直径范围，氧化锆材质。破碎原理：将样品放入已装有碾磨珠的提取管中，仪器产生高频震荡，使得碾磨珠进 行高速运动，撞击撕裂细胞壁

12、和细胞膜，释放细胞内物质，从而达到破碎目的。仪器操作：触摸液晶显示屏进行操作，方便直观。运行速度：仪器本身可以达到 2000 6000rpm的转速，带动提取管达到1.0 12.0m/s 的运动速度。运行频率：0100Hz的频率，0999秒的设定范围。温度显示：温度传感器实时显示电机及主腔体温度，随时掌握样品环境温度。降温：增加干冰盘设计，可在破碎过程中加入干冰，保证样品低温破碎。加速：能在2秒内达到最大速度。减速：能在2秒内完全停止运行。碾磨方式：可适用于湿磨、干磨、低温碾磨。增加助力器设计，在使用过程中省时省力。运行稳定性：自主研发防震体系，仪器运行过程中避免大幅运动及位移。运行噪音：65d

13、b，独有的隔音设计，使噪音大幅降低。安全：增加紧急停止按钮设计，异常情况随时停止运行。仪器运行环境温度：10C 30C需提供生产厂家针对本项目授权。2中国7双人生物安全柜(全排放)1、安全柜基本参数：分类：B2型，100%外排， 外部尺寸(LX DX H) 1500mm 760mnX 2250mm 内部尺寸(LX DX H) 1350mmX 600mnX 660mm。 台面距离地面高度：770m m (尺寸可根据要求订制修改)2中国 风速：平均下降风速：0.33 0.025m/s ； 平均吸入口风速 0.53 0.025m/s 系统排风总量：1270 m3/h额定功率：1800W(包含操作区插

14、座负载 500W噪音等级：w 65dB (A)照明：1000IX过滤效率：送风和排风过滤器均采用世界知名品牌的硼硅酸盐玻璃纤维材质的HEPA( ULPA 高效过滤器，对 0.3卩m( 0.12 )颗粒过滤效率99.999% (99.9995%) 2、生物安全性： 人员安全性：用碘化钾(KI)法测试，前窗操作口的保护因子应不小于1X 105产品安全性：菌落数w 5CFU/次 交叉污染安全性：菌落数w2CFU/次8单人生物安全柜1、安全柜基本参数：分类：A2型，30%外排，70%循环外部尺寸(LX DX H) 1100mm0.5I/min(带终端精制器)1进口T0C（无 185/254nm紫外灯）

15、10ppbT0C（有 185/254nm紫外灯）5ppb微粒（粒径）0.22 m）*1particulate/ml细菌 0.1cfu/ml内毒素（热源）0.001 EU/mlRNases0.01ng/mlDNases4pg/ i l纯水（III 级）产水水质离子截留率96%MW有机物截留率20099%细菌和微粒99%需提供生产厂家针对本项目授权。序号仪器名称技术参数要求数量（台）产地1病毒载量测疋装置原理和功能1.1原理：通过将反应体系进行微滴化处理，使含有目标核酸分子的反应 体系分成若干个液化微滴，形成的每个微滴都作为一个独立的PCR反应体系，经PCR扩增后，利用微滴检测仪逐个对每个微滴进行

16、扫描检测，利用 分析软件计算出目标靶分子的绝对起始拷贝数及绝对浓度，从而实现对核 酸的绝对疋量。1.2用途：适用于依靠Ct值（通过荧光定量实时 PCR技术得到）不能很好 达到分辨效果的应用领域：微量微生物检测、真假食品检定、转基因检测、 拷贝数变异、稀有核酸序列检测、基因相对表达研究（如等位基因不平衡 表达）、二代测序结果验证、miRNA表达分析、单细胞基因表达分析等。性能与技术要求2.1主要性能1进口2.1.1 样本类型：能对 DNA与RNA分子进行直接的绝对定量。2.1.2适用方法：适用于Taqmarl探针法和染料法两种检测方法，无须Rox校正。2.1.3样本处理要求：样品无需前处理，对于

17、分析样品的DNAt段大小没有 限制。2.1.4微滴生成方式：无需外接氮气等其他装置，能将每个样品的反应体 系分为不少于20,000个油包水微滴，以避免芯片法对液滴分割的不均匀。可同时处理8个样品，完成时间不超过 3分钟，即在45分钟内完成96个样品 的制备。2.1.5反应体系稳定性：保证微滴在50个 PCR循环后仍然保持稳定而不会彼 此融合。2.1.6微滴检测方式：可进行 FAM/HEX(VIC)双荧光通路冋时检测。无需 人工干预情况下，可冋时一次性自动检测 96个样品(每个样品20000次独立 反应)，以便于做复孔检测和阴/阳性对照；可任意设置对照样品，确保实验结果的准确性，并保证检测的灵敏

18、性。主要技术要求2.2.1每个微滴的体积约为 0.9nL ,直径约为120um反应体系：20卩12.2.3检测器：采用硅光子计数器2.2.4 单孔数字per检测动态范围：5个数量级，1100,0002.2.5精确度：10%(单孔反应可分辨出10个原始模板和11个原始模板的 区别)2.2.6检测微滴总数：150万/96孔板；支持微滴内PCR产物回收功能。2.2.7软件功能：数据不采用远端服务器分析处理，操作人员可单机直接 操作，可编辑报告模式、格式，显示每个微滴FAMI道(或EvaGreen)和HEX(VIC)通道的荧光信号、计算给出每个样品中含有靶分子的起始拷贝数 或浓度(eopies/ul)

19、、拷贝数变异分析功能、结果可直接打印输出或导入Excel表格。2.2.8拥有原厂数字PCR平台的突变检测试剂、NGS测序文库质控试剂盒、 拷贝数变异分析、KRAS多重筛选试剂盒、宿主细胞残留DNA佥测预混液等。229需提供生产厂家针对本项目授权。2凝胶成像系统1.功能：1.1核酸凝胶成像1.2蛋白凝胶成像1.3蛋白免染成2性能指标：2.1图像分辨率：120万2.2 CCD动态范围：3 OD2.3曝光时间：最短0.001s，每0.001s步进2.4样品盘种类：紫外、白光、免染一键成像功能：放入样品后，不需要手动调整对焦、光圈、曝光时 间等参数，只需要点击主机按钮即可得到成像结果。2.6软件可控制

20、曝光时间以看到微弱信号2.7显示过饱和像素保证精确定量2.8具有免染技术：不需要对蛋白凝胶进行染色、脱色，可直接在5分钟内对凝胶进行成像，成像效果与考染相当。2.9分隔EB污染区：EB所对应的紫外托盘与主机与其他托盘分开，避 免对主机及其他样品托盘的污染。3.软件功能：3.1中/英文软件，无安装次数限制，免费升级；冋时具备采集图像，及 数据处理功能。3.2全自动专业成像及分析软件对系统进行自动控制，包括采集、优化、 疋里、分析图像及报告输出。3.3软件可自动检测泳道和条带，并自动进行分子量和浓度的分析，分 析结果可 输出为Excel或数据库格式。3.4自动条带检测，自动分子量测算，自动条带浓度

21、测算。3.5添加各种格式的文字注释。3D图像观察及输出。3.7可选DPI输出，300、600及自定义DPI，满足期刊对图片质量要求。3.8 图像输出格式：.tif 、.bmp、.png、.jpg。1进 口3.9报告输出：包括图像仪名称、仪器序列号、使用者姓名、成像时间、 光源名称、滤光片名称、泳道图示、条带标注等。3.10需提供生产厂家针对本项目授权。3超低温冰箱一、技术指标温度：微电脑控制，温度调节单位 1C,箱内温度-40 C-86 C可调， 可设定开停温差；显示：采用微电脑微处理控制系统，键盘式数据输入。有效容积330L 材料:箱壳采用冷轧钢板；内胆采用全防腐特殊耐低温材料，保温层采 用

22、咼隔热VIP航空隔热真空保温材料； 样式/外观：立式冰箱。保温箱层数：3层4个间室。 压缩机：国际知名斯科普压缩机， 双压缩机复叠制冷，功率1HP*2;噪 音w 52.0 dB。风机：采用德国高端 EBM冷凝风机，智能开停，节能环保。 女全系统多种故障报警（咼低温报警、传感器报警、咼低电压报警、冷凝器散热差报警、环温超标报警、断电报警、电池电量低报警、）。两 种报警方式（声音蜂鸣报警、灯光闪烁报警。多重保护功能（开机延时保护、超低电压补偿保护、超高电压补偿保护、密码保护功能）。&门/锁：外门1个，内发泡门2个；双重锁定，且带挂锁锁孔和一体式门锁手把设计。密封：2个发泡内门，都具有密封条，单独密

23、封，可分别存取；有效降 低箱内温度波动，创新设计的四层密封结构，最大程度保护样本安全。门 体独特的四道密封结构加隔热系统专利设计，有效消除结霜现象。 电压调节宽带电压（185V260V设计，同时拥有自动调压功能功率:900W.4中国4咼速冷冻离心机无刷直流电机，免维护电机：咼效电机最大转速17,000rpm最大离心力23,005 X g最大容量 24 X 1.5/2.0ml 或 0.2ml X 4PCRstrips （32hole ）1进口温度范围-10C+ 40C加速时间15sec减速时间15sec开机预冷，快速制冷时间控制 99min59sec/ 短时离心/连续液晶显示,疋速计时加速曲线5

24、个，减速曲线5个无阻尼刹车转速离心力转换转子自动识别程序存储10个电磁自动锁+机械锁（紧急开盖） 具备快速制冷功能：室温情况下下降到4C仅需3min ;19具备瞬时离心功能：可实现瞬时离心功能；20.自动报警系统：在不平衡、盖子未关好、电机过热情况下能自动报警， 并有紧急开盖功能；5台式咼速离心机最大转速4000rpm最大容量4X 85ml加速时间20sec减速时间20sec工作时间099min，连续工作，瞬时离心模式1中国1、主要用途：单重常规PCR佥测；低分辨率多重 PCR分析；质粒 DNA佥查STR/微卫星（SSR）分析；AFLP/RFLP/RAPD分析；高分辨率多重PCF分析高分辨率基

25、因分型基因组DNA和大片段DNA分析病毒核酸纯化总RNA cRNA片段化 RNA micro-RNA质控分析HLA SSP 分型二代测序建库过程中的产物片段大小和浓度质控6咼效毛细管电泳仪2、技术指标2.1毛细管电泳分析技术；2.2高灵敏度PMT检测方式进行检测2.3使用将凝胶，毛细管通道和检测通道已整合组装好的预制胶卡夹2.4无需人工制备凝胶染料混合物。2.5运行一次可平行分析处理12个样本2.6可自动连续运行分析多至96个样品而无须包括更换卡夹等任何人工干预.2.7采用全自动化的灌胶方式2.8每轮分析后，仪器自动清洗毛细管，无须人工清洗2.9采用毛细管从PCR产物孔板/孔管中直接全自动化上

26、样的上样方式2.10兼容0.2ml PCRt上样、12联管上样、8连管上样、96孔PCR板上样2.11直接兼容3.14 运行时间：最快3分钟可分析12个核酸样本；检测灵敏度：DNA分析，0.15ng/卩l检测灵敏度：RNA分析，6 ng/卩l2.14分辨率： 对500bp的DNA片段，分辨率可达到3bp样本消耗量小于0.2卩l，上样后原样品不受影响，可直接用于下游 应用安全性：凝胶内核酸染色剂含量极低，且封闭灌装，运行前、后均 对操作人员和实验环境不产生污染，可以直接废弃处理；软件自动识别并显示预制胶种类及效期等信息2.18样品运行结束后，软件将自动处理、分析采集到的数据2.19结果可以用电泳

27、峰型图或胶图格式对分析结果进行显示2.20 RNA质控分析时提供 RNA完整性得分 RIS值2.21自动对被分析样品中所需片段的大小、浓度和相对丰度出具报告1进口2.22软件可自动判定样品中是否有特定的条带并出具报告2.23实验结果可以各种形式导出，可导出多种图像格式文件、excel表格等软件具备专门用于基因组DNA质控的运行方式。软件具备专门用于多重PCR产物分析的分析谱，可自动判定特定条带组合是否存在。2.26 软件具备专门用于 NGS文库质控分析的分析谱。需提供生产厂家针对本项目授权配主流品牌电脑1台、打印机1台7核酸提取纯化系统基于离心柱法的全自动样品制备工作站。可实现样品裂解、裂解液