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文档简介
1、名词术语解释1、mRNA丰度(Abundance of an mRNA):是指每个细胞平均拥有的某一种特定mRNA的分子数。根据丰度的差异可将 mRNA分为两种不同的等级:其一是富裕型的,每个细胞拥有的平均拷贝 数为100010000,属于此型的 mRNA约有100种;其二是稀少型的,每个细胞拥有的平均拷 贝数仅有110个上下,属于这一类型的mRNA达10000多种。2、富裕型的 mRNAs(Abundant mRNAs):见mRNA 丰度。3、抗体酶(Abzymes):应用单克隆抗体技术生产的兼具抗体及酶催活性的工程蛋白质。也就是说, 其行为如同蛋白酶一样,能够催化化学反应的一类新型的抗体。
2、4、受体拼接位点(Aeceptor splicing site):间隔子的右端和与其相连的表达子的左端之间的接合点。5、获得性免疫缺损综合征 (Acquired immuno deficiency syndrome , AIDS):由人类免疫缺损病毒 (HIV) 引起的一种疾病,它最早于1980年在美国洛杉矶发现。HIV病毒通过血液和精液在人群中传播,感染了这种病毒之后,会使人体出现严重的免疫抑制和淋巴结病(lymphadenopathy),并增加对机会病原体(opportunistic pathogen)的敏感性。这种综合征是由于 HIV病毒的感染以及 CD4类T细胞 功能破坏所致。T细胞表
3、面CD抗原CD4是HIV病毒的受体。HIV病毒的感染使T细胞发生融合 形成大的合胞体(syncytia)并最终裂解。AIDS是致命的,目前尚无法有效治疗也无有效疫苗可用。6、激活物(Activator):能够通过与结合在启动子上的RNA聚合酶发生相互作用,从而促使RNA聚合酶启动操纵子进行转录反应的一种正调节蛋白质。7、激活位点(Activator site):位于启动子上游能同激活蛋白质结合的DNA序列区。8、接头(Adaptor):即DNA接头,是一类人工合成的非自我互补的单链寡核甘酸短片段,当其同衔 接物(linker)自行退火时,就会形成具有一个平末端和一个粘性末端的双链的接头/衔接物
4、结构。 因此,同平端DNA分子连接之后,无需用核酸内切限制酶切割,就会提供符合预先设计要求的粘性末端。9、腺病毒(Adenovirus ): 一种具双链 DNA的动物病毒,大小约为 36kb。此种病毒在分子生物学研 究中占有突出的位置,许多重要的分子生物学事件,诸如 RNA剪辑、DNA复制及转录等,都 是在腺病毒研究中发现的。现在腺病毒已被改造用作分离哺乳动物基因的克隆载体。10、亲和层析(Affinity chromatography): 一种根据配体与特异蛋白质结合作用原理建立的层析技术, 该法主要应用于分离与纯化特异的蛋白质。11、琼脂糖(Agarose):是从红色海藻的琼脂中提取的一种
5、线性多糖聚合物,可用于配制核酸电泳凝 胶。当琼脂糖溶液加点热至沸后冷却凝固,便会形成一种基质,其密度是由琼脂糖浓度决定的。可以被琼脂糖凝胶电泳分离的DNA片段的大小范围为 0.250kb。经过化学上修饰的低熔点琼脂糖在结构上比较脆弱,因此,在较低的温度下便会熔化,可用于 DNA片段的制备电泳。12、根瘤土壤杆菌(Agrobacterium tumefaciens):根瘤土壤杆菌是属于土壤杆菌属(Agrobacterium)的一种格兰氏阴性细菌,它在上壤中的数量十分丰富。根瘤土壤杆菌的致瘤性菌株(Tumorigenicstrains)携带有一种Ti质粒,在感染过程中该质粒的一部分转移到寄主植株的
6、染色体基因组,致 使许多种双子叶植物产生冠瘤瘤。13、变构调节(Allosteric regulation):是指由一种特殊的调节酶引发的催化反应。在这种反应过程中,一种小分子量的效应物分子同调节酶分子上的一个位点结合之后,便会影响到该酶分子另一位 点的活性。此种结合作用是可逆的,会导致调节酶发生构象变化,从而影响到它与第三种分子 间的相互作用,因而这种酶分子特称为变构蛋白质。14、可变剪辑(alternative splicing):系指某些基因的转录本分子,在不同类型的或是处于不同发育 阶段的细胞当中,能够发生不同形式的剪辑作用,结果形成具有不同序列结构特征的、编码不 同蛋白质的 mRNA
7、分子。可变剪辑又叫差异剪辑(differential splicing)。15、Alu序列(Alu sequence): 一种长度为 300bp的DNA序列,因其含有一个 AluI限制位点而得名。它是人类基因组的重要的重复序列,约有100万份拷贝,均匀地分布在整个基因组的各个部位,占人体细胞总 DNA的3%6%之间。Alu序列的5-末端及3-末端都同一种富裕的tRNA ,即7SLRNA ,具有高度的同源性。Alu序列的结构具有一种加工的假基因的特征,这表明它很可能是以一种RNA为中介经过反转录过程重复而成的。16、琥珀突变(Amber mutation):由于某一密码子改变成为链终止信号密码子
8、UAG ,结果导致多肽链在成熟前便终止合成的一种突变。17、氨酰-tRNA (Aminoacyl-tRNA ):携带着一个氨基酸的tRNA分子叫做氨酰-tRNA。它是通过氨基酸的NH2基团和tRNA末端碱基的3-或2-0H基团之间的共价连接形成的。18、氨酰-tRNA合成酶(Aminoacyl-tRNA synthetases):负责催化氨基酸 NH2基团同tRNA分子的3- 0H或2-OH基团共价连接的一种核酸酶。19、DNA扩增(DNA amplification):见基因扩增。20、抗体(Antibody):即免疫球蛋白(immunoglobulins),是一类由脊椎动物免疫系统产生的多
9、功能糖 蛋白(glycoproteins),通常存在于血清中。它可以特异性地识别抗原中的抗原决定簇并与其结合。 因此,根据这种特异性反应便可鉴定其存在与否。21、抗体工程(Antibody engineering):应用DNA重组技术或突变的方法改变某种抗体的编码序列, 产生出自然界中原本不存在的蛋白质分子,这种基因工程特称为抗体工程。由单碱基变换引起 的蛋白质分子中单一氨基酸的取代反应,而使蛋白质的功能活性,例如抗原特异性、亲和性以 及引发效应物功能的相互作用位点等发生变化,这样便得到了最简单的工程抗体。动物抗体的 人源化(humanizing)是最复杂的工程抗体。在这种人源化抗体(huma
10、nized antibody)中,是通过所有互补决定区的更换,使动物抗体的特异性被“转变”成为一种人免疫球蛋白。22、反密码子(Anticodon):转移RNA(tRNA)分子中的核甘酸三联体,在转译过程中通过互补碱基的配对,同信使 RNA(mRNA)中的密码子结合起来。反密码子的突变可使密码子-反密码子的配对关系发生变化,但并不影响tRNA分子对氨基酸识别的特异性。23、抗原(Antigen):任何可以被抗体或 T细胞受体特异性识别的物质,统称为抗原分子,简称抗原。24、抗原决定簇(Antigenic determinant):又叫做表位(epitope),特指抗原分子上能够与抗体结合位 点
11、发生特异性结合作用并决定抗原特异性的部位。所谓抗原的价数实质上就是抗原决定簇的数 目。25、反向平行(Antiparallel ):彼此平行但方向相反的双链分子结构,例如 DNA分子中的双链就是 反向平行的。26、反义寡核甘酸(Antisence oligonucleotide ):这是一类长度为1225个核甘酸的人工合成的单链 核酸分子,它可以按照 Watson-Crick碱基配对原则同 mRNA分子上一些有意义的互补区结合, 从而阻断蛋白质的合成。27、反义RNA(Antisense RNA):同某种天然 mRNA反向互补的 RNA分子称为反义 RNA ,它是由双 链DNA中的无意义链转录
12、产生的,可以用来阻止被其转化的细胞中存在的与之互补mRNA的转译活性。现在编码反义RNA的基因已在基因工程中得到应用,此项技术特称为反义技术学(antisense technology)。28、反义链(Antisense strand):双链 DNA 分子中被转录成 RNA 转录本的链叫做模板链 (template strand),又叫做反义链,简称(-)链。见DNA有义链与反义链。29、反义技术学(Antisense technology ):这是指在基因工程中使用编码反义RNA基因的一种生物技术学。见反义 RNA 。30、抗终止因子(Antitermination factor):见抗终止
13、蛋白质。31、抗终止蛋白质(Antitermination proteins): 一种能够促使 RNA聚合酶通过一定的终止位点继续 进行转录的蛋白质,叫做抗终止蛋白质,有时也叫做抗终止因子。32、att位点(att sltes):见附着位点。33、附着位点(Attachment site ,att):系指位于噬菌体和细菌染色体上的一种特定的位点。通过这些2位点间的重组作用,噬菌体DNA可以整合到染色体 DNA上成为原噬菌体,或是在某种因素的作用下,整合的原噬菌体从这个位点重新删除下来。34、弱化作用(Attenuation ):亦叫衰减作用,是指与某些细菌操纵子表达控制有关的一种转录终止 调节
14、事件,其结果是导致操纵子提前终止转录。35、弱化子(Attenuator):位于mRNA分子前导序列中的一段控制蛋白质合成速率的调节区,亦即 发生弱化作用的转录终止信号序列,特称为弱化子。36、亲和素(Avidin): 一种同生物素(biotin)具有高度亲和能力的蛋白质,又称为抗生物素蛋白。它在 亲和素-生物素检测系统中用作生物素酰化探针(biotinylated probes)。37、细菌人工染色体(Biodegradable plastics)寸旨一类以F质粒为基础构建的基因克隆载体,用来在 大肠杆菌中克隆分子量较大的外源DNA片段。38、杆状病毒(Baculovirus):感染昆虫细胞
15、的一类特殊类型的病毒,可在感染的昆虫细胞中产生大量 的包涵体。此类病毒已被用作在昆虫细胞中表达重组蛋白质的克隆载体。39、生物降解塑料(Biodegradable plastics):简称生物塑料(bioplastics),是指利用微生物聚酯为原料 生产的一类可被环境微生物降解的新型塑料。40、生物弹击法 (Biolistics):应用特殊装置将包裹着DNA的微弹,在高压轰击下将外源DNA导入细胞的方法。41、生物防范(Biological containment):用于阻止重组 DNA分子在自然环境中的微生物体内进行复 制的预防标准之一。生物防范措施所涉及的克隆载体和寄主生物,都已经作了必要
16、的修饰成为 遗传上的缺陷型。因而无法在实验室以外的环境中存活.从而减少了工程生物向自然界扩散的 危险性。42、生物量(Biomass):生物原材料叫做生物量或生物质,它通常用作工业生产的原材料。43、生物塑料(Bioplastics):见生物降解塑料。44、生物技术(Biotechnology):任何一种开发利用生命有机体白生物化学活性或其产物(例如蛋白酶)的技术,统称为生物技术,亦称为生物工艺学或生物工程学。20世纪70年代以来,由于分子生物学特别是DNA重组技术的发展与参人,生物技术获得前所未有的蓬勃发展,形成了包括基因工程、细胞工程、酶工程和发酵工程在内的综合性的科学技术。为与传统的生物
17、技术相区别, 人们称这些新兴的生物技术为现代生物技术。45、生物素(Bintin):过去叫做维生素 H,它的分子能够同 dUTP结合形成三磷酸核甘,后者又可通 过缺口平移参入到 DNA分子上,形成非同位素标记的 DNA探针。因此,生物素作为一种非同 位素标记,已在 DNA分子杂交中得到广泛的应用。46、平末端(Blunt end or flush end):其双链是在同一核甘酸对位置终止,因而不具单链延伸末端的 DNA分子之末端,叫做平末端。47、5-末端帽(Cap):有时简称帽,是在许多真核生物mRNA5-末端发现的一种由 7-甲基-鸟喋吟核昔-5-ppp-末端核昔构成的特殊结构。它是在转录
18、后不久经酶催反应加入到TATA(Hogness)序列的附近。具有保护 mRNA分子稳定性的功能。在原核生物的mRNA分子中不存在5-末端帽结构。48、CAP:这个略语在不同场合 有不同的含义。(i)指分解代谢物激活蛋白质 (catabolite activitor protein); (ii)指环腺甘酸(cyclic AMP)激活的正调节蛋白质。要注意不能把CAP同帽(cap)混淆。见分解代谢物激活蛋白质。49、病毒壳体(Capsid):病毒子或病毒颗粒的蛋白质外壳。它包裹着病毒的核酸.并决定着病毒颗粒的外形。有的地方也译为“衣壳”。50、盒(Cassette):亦译为“弹夹”或“组件盒”,专
19、指由特定类型表达载体所携带的DNA序列组件,包括启动子、核糖体结合位点、唯一的限制位点及终止子(在真核寄主细胞则是:启动子、唯一的限制位点、多聚腺甘酸序列 )。当外源基因插入到此唯一限制位点之后,就将置于表达载体的 表达信号控制之下。51、盒式诱变(Cassette mutagenesis) 一种定点突变技术,其办法是将靶子基因中的一段DNA删除掉,并用人工化学合成的具有所需突变核甘酸的双链寡核昔片段取代之。52、CAT基因(CAT gene ):编码氯霉素乙酰转移酶 (chloramphenicol acetyl transferase)的大肠杆菌基 因,可使寄主细胞获得对氯霉素抗性的表型特
20、征。它常被用作报告基因,但不如另外两个常用的 报告基因3 -葡萄糖醛酸糖甘酶基因及荧光素酶基因敏感。53、分解代谢操纵子(Catabolic operon):其组成基因的编码产物,具有降解大分子量有机化合物能 力的操纵子叫做分解代谢操纵子。54、分解代谢(Catabolism):见分解代谢物。55、分解代谢物(Catabolite):由大分子量的有机化合物(例如糖类物质)降解形成的小分子量化合物, 称为分解代谢物。与此同时,会伴随发生能量的释放。这种代谢变化过程叫做分解代谢。56、分解代谢物激活蛋白质 (Catabolite activator protein):有时也叫做分解代谢物基因激活蛋
21、白质, 简称CAP,是DNA和cAMP的结合蛋白质。它在细菌的细胞内通过同启动区的结合反应,从 而调节对分解代谢物作用敏感的操纵子的表达活性。57、分解代谢物阻遏(Catabolite repression):在细胞内存在着高水平的分解代谢物的情况下.某些 操纵子的表达活性便会下降。此种分解代谢物对操纵子表达的抑制作用,称为分解代谢物阻遏。58、花椰菜花叶病毒(Cauliflower mosaic virus ):简称CaMV ,是研究最为详尽的一种双链DNA病毒。其寄主范围相当狭窄,不能感染豆科植物及单子叶植物。已较为深入地研究了用此类病毒 作为某些高等植物基因克隆载体的可能性。59、花椰菜
22、花叶病毒组(Caulimoviruses):是唯一的一群以双链 DNA为遗传物质的植物病毒。其中 某些成员具有发展为植物基因克隆载体的潜力。见花椰菜花叶病毒。60、cDNA克隆(cDNA cloning):先将纯化的 mRNA经反转录等步骤转变成双链DNA之后,再插入到载体中去,并进一步转化寄主菌株构成cDNA文库。如此的克隆技术叫做cDNA克隆。61、细胞提取物(Cell extract):经物理或化学方法处理之后获得的,含有大量破损细胞及其释放的内含物的制剂,叫彳细胞提取物(或称细胞抽提物)。62、厘摩(Centimorgan,cM):遗传图距(map distance)或是染色体上的基因
23、间的距离以摩尔根单位 (Morgan unit )表示,等于100%的重组率(交换值),1分摩图距(dM)等于10%的重组率,1厘摩 (cM)图距等于l%的重组率。在人类基因组中,lcM的图距大约相当于 1000kb的DNA长度,在 基因组较小的拟南芥菜中,1cM则相当于290kb。63、中心法则(Central dogma):这是F.Crick于1958年提出的描述 DNA、RNA和蛋白质三者关系 的一种遗传信息传递的一般路线。根据这个法则,遗传信息、是从 DNA流向RNA,再由RNA流向蛋白质。1970年,H.M.Temin和D.Baltimore发现在特定的情况下,遗传信息可以从RNA反
24、向传递到DNA ,这是对中心法则的一种重要补充。64、凯伦载体(Charon vector ):这是一类在入噬菌体的基础上发展出来的特殊的噬菌体载体系列, 包括插入型的和替换型的两种,在基因工程中有广泛的用途。凯伦(Charon)是古希腊神话中的一 位老摆渡工,专司在斯蒂克斯河(River Styx)上运送亡灵到阴间。所以F.R.Blattner等人将他们自己构建噬菌体载体形象地叫做凯伦载体。65、嵌合体(Chimaera或Chimera) : Chimaera这个词原意是古希腊神话中的一种具有狮子头、母羊身和蛇尾巴的怪物。目前生物学中使用的嵌合体有三种不同的具体含义(1)在动物学中,系指含有
25、两种或数种具有不同基因型的细胞或组织的混合型胚胎(composite embryo); (2)在植物学中,如若一个植株是由具有不同基因型的两个部分构成的,则称之为嵌合体。它有可能是由两 个生长在一块的不同基因型的合子融合形成,也有可能是由人工嫁接产生的,(3)在分子生物学中,则是指由两种以上不同生物有机体之DNA片段形成的重组 DNA分子。66、染色体步测(Chromosome walking):染色体步测是一种用来鉴定一系列彼此重叠的DNA限制片段的分子生物学技术,它通常被用来测定在DNA大分子中各个基因的相关位置。67、cI基因(cI gene):入噬菌体基因组中编码 cI阻遏蛋白质的基因
26、。见cl阻遏蛋白质。68、cI阻遏蛋白质(cI repressor):由入噬菌体cl基因编码的一种阻遏蛋白质,分子量为27kD。它可以同入噬菌体基因组中的 Ol启动区及Or启动区结合,以控制涉及溶菌生长的入噬菌体基因的转录作用。缺失了 Cl阻遏物的入噬菌体无法维持溶源状态。69、顺式作用元件(Cis-acting element):能够影响同一条 DNA序列或相连DNA序列活性的特定的 DNA片段,叫做顺式作用元件。例如,启动子中与转录因子结合的 DNA序列,便叫做顺式作 用元件,它可影响该基因或同一染色体上另一个基因的表达活性。70、顺反子(Cistron):这个术语是由S.Benzer首先
27、用来表示根据顺-反互补试验(cis-trans complementation test)确定的一种遗传单位,或者说是编码一条特殊多肽链的DNA片段或DNA分子的一部分。从本质上讲,顺反子等同基因,但人们更喜欢使用基因这一术语。71、克隆(Clone):有三种不同的具体含义:在胚胎学、免疫学及细胞生物学等学科中,克隆一词 是指从一个共同的祖细胞(progenitor cell)衍生而来的一群遗传上同一的细胞群体。具有同样基因型的同物种的两个或数个个体。例如,同卵双生子即属于克隆关系。因为它们是从同一受精 卵分裂而来的两个个体。在分子生物学中,带有一段DNA插入序列的一个寄主/载体单位(例 如细
28、苗寄主中的重组质粒载体),亦叫做克隆。72、克隆载体(Cloning vector):能够用来将外源的 DNA片段转移到活细胞内部,经过人工改造的质粒、噬菌体或动物病毒分子等,统称为克隆载体。克隆载体可以在细胞内复制,因此插入在此 种载体上的外源DNA片段亦可随之一道复制。73、关联tRNA(Cognate tRNA):被同一种特定的氨酰 -tRNA合成酶识另J的那些tRNA ,称为关联t-RNA。74、粘性末端(Cohesive ends或sticky ends):线性双链 DNA分子中的一种特殊的单链延伸末端,它可以与同一 DNA分子另一端相反链的单链延伸末端具有等长的互补序列,也可以同另
29、一DNA片段的单链延伸末端具有等长的互补序列。粘性末端之间的结合作用,可使DNA分子重新环化起来,或是使2条DNA片段连接起来形成重组分子。75、共合体(Cointegrant ):由一种具有一个转位子的复制子,同另一种不具转位子的复制子融合而 成的结构,在其两个复制子结合部位具有一对同向重复排列的转位子拷贝。76、共整合质粒(Cointegrating plasmid):是由标准的大肠杆菌质粒(如pBR322)和土壤农杆菌 Ti质 粒的T-DNA区段重组改造而成的,按照共整合方法将外源基因转移到寄主植物的一类专用载 体。插入着外源基因的井整合质粒,通过接合作用或转化过程被导入携带有完整Ti质
30、粒的土壤农杆菌。在此,这两种不同质粒之间通过T-DNA序列的同源性发生重组作用,从而产生出一种带有外源基因的新型的 Ti质粒。然后用这种转化的上壤农杆菌感染寄主植株,最终导致外源基 因进入到寄主植株的染色体基因组上。77、冷敏感突变(Cold sensitive mutation):导致基因在允许的高温下能够发挥功能作用,而在限制 性低温下则失去活性的一种突变。因此,这种突变型比野生型具有较高的最低生长温度。见温度敏感突变。78、Col质粒(Col plasmid): 一类编码细菌素的细菌质粒,例如,编码大肠杆菌素 日的ColE1质粒 便是其中的一个典型代表。Col质粒分为两群:I群是属于非接
31、合型的质粒,分子量约为(58)X106dal; II群是接合型的质粒,其分子量比I群的大10倍左右,约为(5080)x 106dal。79、ColE1质粒(ColE1 plasmid):编码大肠杆菌素 E1的一种大肠杆菌的质粒,是 Col质粒类群中的 一种典型代表。ColEl质粒可能是迄今为止作了最详尽研究的Col类质粒,其分子长度为6646bp,已广泛地应用于构建大肠杆菌的克隆载体(例如pBR322) o在正常的情况下.这种质粒的拷贝数是平均每条染色体有15个左右,但当培养基中加有氯霉素时,在生长细胞中的拷贝数便会得到扩增。ColEl质粒的复制似乎是完全依赖于大肠杆菌寄主功能。除了编码大肠杆
32、菌 日之外,ColEl质粒还编码一种决定寄主对ColEl免疫性的蛋白质,和一种调节自身在大肠杆菌细胞内复制活性的小分子量蛋白质。80、大肠杆菌素(Colicin):由Col质粒编码的抗细菌蛋白质。携带着一种Col质粒的细胞通常对大肠杆菌素是不敏感的,因为这些质粒不仅编码一种大肠杆菌素,而且还编码有一种免疫决定簇。在正常情况下,细胞合成大肠杆菌素的活性是被抑制的,然而有各种各样的药剂以及紫外线等,都能够诱导细胞合成大肠杆菌素。大肠杆菌素是通过同细胞壁结合而发挥其抑菌效应的,但是 不同的大肠杆菌素却具有完全不同的作用模式。例如,大肠杆菌素E3是在E.coli核糖体大亚基上切割大分于量的rRNA(1
33、6S rRNA),从而起到抑菌作用的;而大肠杆菌素E1则似乎是通过同大肠杆菌细胞膜之的相互作用(一种解偶联的需要能量的过程间)起到抑菌作用的。81、菌落(Colony):生长在固体培养基表面(或其内部)的细菌集落。如果一个菌落中的所有的细胞都 是从同一个亲代细胞分裂而来,这样的菌落则认为是一个克隆,它的所有成员都是同一的。一 个菌落一般含有数百万个细胞。82、菌落杂交(Colony hybridization):这是根据重组体 DNA分子的核酸杂交技术原理,重新设计的 用于检测含有克隆基因的阳性菌落的一种方法。它是把生长在培养基平板上的菌落原位转移到硝酸纤维素滤膜(或尼龙滤膜)上.并使之在原位
34、发生溶菌、DNA变性以及同标记的 DNA或RNA 探针杂交,然后经放射自显影,检测出含有克隆基因的阳性菌落。 由于此项技术是由 M.Grunstein 和D.Hogness于1975年发展出来,故又称之为 Grunstein-Hogness杂交鉴定技术。 见格伦斯坦 -霍格内斯鉴定。83、组合文库(combinatorial library):应用噬菌体载体在大肠杆菌中表达抗体的重链与轻链的一种 特殊的DNA文库,也称为组合抗体文库 (combinatorial antibody library)。应用小鼠脾或人外周血 淋巴细胞的mRNA作模板,体外反转录合成 cDNA,井应用PCR扩增重链及
35、轻链的 Fd(VH+CH1) 组分;接着将这些组分克隆到入噬菌体载体上,分别获得重链及轻链的文库;然后将从这两种文库中分离的DNA经选择性切割和再连接之后,便可构建得到一种在同一种大肠杆菌细胞中共 表达抗体的重链及轻链的组合文库。84、相容性(Compatibility):指的是两种不同类型的质粒,在没有选择压力的情况下,能够共存在同一个细胞中的能力。质粒的相容性亦叫做质粒的亲和性。85、cDNA(Complementary DNA):与一种RNA分子互补的单链 DNA ,它是由反转录酶催化合成的, 所以又叫做反向转录 DNA。在核酸分子杂交中, 带有放射性标记的cDNA可作为一种十分敏感 的
36、特异性分于杂交探针,用以检测特定的RNA或DNA分子。86、接合作用(conjugation):最早是在大肠杆菌中观察到的一种通过两个不同交配型细胞(如F+细胞和F-细胞)之同的形体接触。而使 F+质粒DNA从F+细胞转移到F-细胞的过程。87、共有序列(Consensus sequence)亦译成一致序列或保守序列。这是用来描述大量相关的但并非 相同的核甘酸序列的一种术语。在共有序列中的每一个位置的核甘酸,都是相关相同位置中最 为常见的代表性核甘酸。88、保留型转位(Conservative transposition):指大分子量的转位因子的移动。这些大分子量的转位 因子早期称为转位子,现
37、在认为是附加体( episomes),其移动机理与 入噬菌体的类似。89、控制因子(Controlling elements):见跳跃基因。90、辅阻遏物(Co-repressors): 一类小分子量的代谢物分子,它能通过同调节蛋白质的结合作用阻止转录反应。91、COS细胞系(COS cell line):应用因DNA复制起点缺失6bp而丧失复制功能的 SV40衍生株, 转化猿猴受体细胞 CV- l所获得的能够持续合成 T抗原的细胞系,叫做COS细胞系。它可为SV40 早期区段取代载体提供辅助体系。略语 COS是取CV-l、Origin和SV40三个英语单诃或略语的 第一个字母组成的。92、柯
38、斯质粒(Cosmids):是一类人工构建的含有 入噬菌体DNA的COS序列,和质粒复制子的特殊 类型的质粒载体,其DNA可以在体外被包装到噬菌体的外壳内。柯斯质粒的基本特点是,既具有入噬苗体的特性,也具有质粒载体的特性,此外还具有高容量的克隆能力。93、柯斯克隆(Cosmid cloning):系指应用柯斯质粒作载体,在大肠杆菌细胞中克隆大片段的真核基 因组DNA的过程。这是一种基因工程中常用的克隆技术,它具有克隆效率高, 能容纳较大片段外源DNA插入等优点。94、cos位点(cos site):在入噬菌体线性双链 DNA分子的两端,各有一条由12个核甘酸组成的彼此完全互补的5单链突出序列,即
39、粘性末端。在体内由此粘性末端结台形成的双链区段称为cos位点。cos系英语cohesive end s让e的缩写略语,即粘性末端位点之意。95、共价闭合环形 DNA(Covalently closed-circular DNA):系指完全双链的、 没有缺口或裂口的环形 DNA分子,它通常具有超盘旋的构型。这类 DNA简称cccDNA。96、CpG二核甘酸对(CpG dinucleotides):纯化的真核染色体 DNA直接分析发现,除了常见的 G、 A、T、C四种碱基之外,还含有种少量的修饰的5-甲基胞喀咤碱基(5-methyl-C)。在染色体DNA中,这种修饰碱基的位置不是随机的,它主要是直
40、接位于一个G残基之前,形成一个 CG对。这种CG对通常被写成 CpG,表示在DNA序列中进两个核甘酸是毗邻的,而c是位于G的5端。在真核染色体 DNA序列的CG对中,大约70%的c是甲基化的。这种核甘酸排列结构特 称为CpG二核甘酸对,或称为 CpG岛。97、CpG岛(CpG islands):见CpG二核甘酸对。98、切口 (Cut):在双螺旋的多聚核甘酸链上发生的双链裂开,它不同于DNA分子单链上发生的 “缺口”。见缺口。99、变性作用(Denaturation):通常有如下两种不同的含义: DNA的变性作用是指从双链形式转 变为单链状态,过种链的分离往往是由于加热作用所致;蛋白质变性作用
41、则是指从生理构象 转变为某种其它失活的构象。100、基因差别表达(Differential expression):在生物个体发育的不同阶段,或在不同组织或细胞中 发生的不同基囚按时间、空问进行有序表达的方式,叫做基因的差别表达。101、差异剪辑(Differential splicing):见可变剪辑。102、DNA接头(DNA adaptor):见接头。103、DNA结合蛋白(DNA-binding proteins):专门与DNA分子某种专有序列区特异性结合的蛋白 质,包括基因调节蛋白质,参与 DNA复制、重组、修复、转录、降解作用的核酸酶,以及维持 染色体结构的蛋白质等,统称为DNA结
42、合蛋白质。104、DNA印迹杂交(DNA blottmg):将通过凝胶电泳分离并作了变性处理的DNA片段,转移给硝酸纤维素滤膜或尼龙膜,然后应用标记的DNA或RNA探针进行杂交来显示这些DNA分于,这种实验技术叫做 DNA印迹。由于最初它是由 E.M.Southern发明的,因此又叫做 Southem印 迹,现在已逐步被更加快速的电印迹(eletroblotting)和真空印迹 vaccum blotting)所取代。105、DNA克隆(DNA cloning):通过将外源DNA片段插入到克隆载体形成重组DNA群体,并转化到寄主细菌中进行复制繁殖,以便从大分子的 DNA或DNA片段混合物中.纯
43、化并分离出特定 的DNA片段的实验过程叫做 DNA克隆。106、DNA文库(DNA library ): DNA文库即基因文库, 它是由来自染色体基因组DNA的全部DNA片段组成的。基因文库这个名词在基因工程诞生的早期就被使用,已经习惯且通俗易懂。DNA文库这个名词是近年来才出现的一种更加科学更加符合实际的称呼,已被科学工作者广泛接受 (见基因文库)。107、DNA连接酶(DNA ligase):利用ATP分子中的丫-磷酸基团为能量,催化在两条并排 DNA链的 5-磷酸基团和 3-羟基之间、或是在双链 DNA单链断裂位置形成一个磷酸二酯键,而使两个 DNA片段共价连接起来的特异核酸酶。108、
44、DNA 显微注射(DNA microinjection):应用显微操作将DNA(基因)直接注射到细胞的前核(pronuclei)或细胞核的一种基因转移技术。外源DNA通常是在随机的位点整合到受体细胞的核基因组上。DNA显微注射是最常用的种培育转基因动物的方法。109、DNA聚合酶(DNA polymerase):能够根据 DNA模板合成互补链 DNA的核酸酶叫做 DNA聚 合酶。从细菌中纯化出来的完整的DNA聚合酶叫做全酶(holoenzyme),具有合成与编辑两方面的功能。110、DNA 酶足迹法(DNase footprinting):也叫做足迹试验(foot-printing assay
45、),是一种用来检测被 特定蛋白质特异性结合的DNA序列的位置及其核甘酸序列结构特征的实验方法。其基本原理是,当DNA分子中的某一区段同特异蛋白质结合之后.便会得到保护而免受DNasel酶的切割作用,结果不会产生出相应长度的切割分子,于是在凝腔电泳放射自显影图片上便会出现一个 空白区,俗称“足迹”。通过与没有蛋白质保护的对照DNA的序列作比较,便可得知相应于足迹部位的核甘酸序列结构。111、DNA有义链与反义链(DNA sense strand and antisense strand):关于双链分子中有意义链与反 义链的划分,文献中有两种不同的意见。在早期的文献中,将双链 DNA分子中车t录成
46、 mRNA 分子的模板链称为有意义链,而与有义链互补的 DNA链则叫做反义链。至今仍有作者沿用这样的定义。现在一般认为,双链 DNA分子中被转录成 RNA转录本的链叫做模板链,又叫做反义 链,简称(-)链。而双链 DNA分子中的编码链除了以 T取彳弋U之外,与RNA转录本具有同 样的序列。编码链又叫做有意义链,简称 (+)链。112、DNA改组(DNA shuffling):这是一种改造基因和蛋白质的有效实验进化技术,它是在体外进行基因随机片段的重组,从而增加基因的多样性,促使有利变异与不利变异分离,通过选择使有 利变异得到优化组合。 DNA改组包括三个步骤:基因的随机片段化;自身引发PCR和
47、重组合PCR。113、结构域(Domain)泛指存在于蛋白质分子或 DNA序列中,在结构或功能上分立的部分。通常则 是指具有特定功能的蛋白质区段,是蛋白质结构的一种基本单位。114、斑点印迹杂交(Dot blotting):斑点印迹杂交和狭线印迹杂交(Slot biltting),是在Southern印迹杂交的基础上,经改良发展的两种类似的检测特异核酸分子(DNA或RNA)的核酸杂交技术。由于在实验的加样操作中,使用了特殊设计的加样装置,使众多待测的核酸样品能够一次同步转 移到杂交滤膜上,并有规律地排列成点阵或线阵。故分别称之为斑点印迹杂交和狭线印迹杂交。115、EcoRI*活性(EcoRI*
48、activity):所谓EcoRI*活性,是指在一些特定的体外环境中,比如高盐或 含镒离子的溶液中,EcoRI的正常动力学特性受到了干扰,此时它不需要5-GAATTC-3 -这段完整的识别序列,而只需要其中的4个核甘酸,即5-AATT-3-核心序列,就能进行切割。116、效应物分子(Effector molecular):亦叫效应物(effector),是指诸如氨基酸和糖类等小分子量 的代谢物。它们是通过与阻遏物结合 (或是与阻遏物形成复合物 )的方式,使后者的性质发生改变 来发挥作用的。在诱导型操纵子中,这些效应物分子叫做诱导物;而在阻遏型操纵子中,则叫 做辅阻遏物。117、末端标记(End
49、 labeling):将一种放射性标记基团加到DNA链的3-或5-末端,使DNA分子带上同位素记号。此种标记技术叫做末端标记,它包括3-末端标记和5-末端标记两种。118、增强子(Enhancer):又叫做增强子序列(enhancer sequence或增强子元件(enhancer element), 是真核基因中发现的一种特异序列,能够在距离目标基因 50kb以上的位置,从上游或下游的不同位置及方向增强该基因的转录活性。由于增强子是以顺式作用方式发生效应的,因此它必定 是与所操纵的进行转录的基因位于同一DNA分子上。119、胚胎干细胞(Embryonic stem cell):简称ES细胞,
50、是指哺乳动物囊胚期胚泡内细胞团中的一种 未分化的细胞。它具有类似癌细胞无限繁殖和多潜能发育的能力,在体外培养条件下,可长期 保持未分化的状态。当将经遗传操作的 ES细胞重新转移到胚泡内后,可发育成嵌合动物。在这样的嵌合动物体中,具有由ES细胞发育分化成的各种类型的细胞,包括种系细胞在内。120、胚胎干细胞转移(Embryonic stem cell transfer):将经过遗传操作的多潜能胚胎干细胞(ES细胞)通过显微注射转移到胚泡中,或是通过与早期发育阶段的卵细胞共培养的方法转移到胚泡中, 这两种过程均叫胚胎干细胞转移。由此产生的转基因动物个体中,含有一定比例的来自ES细胞谱系的细胞群体。
51、在哺乳动物中,应用胚胎干细胞转移法培养转基因动物种系,已在小鼠BS细胞获得了成功。121、澳化乙锭(Ethidium bromide):是一种具扁平分子的核酸荧光染料,可以插入到DNA或RNA分子的相邻碱基之间,从而使其密度下降。澳化乙锭简称EtBr或EB,在核酸凝胶电泳及纯化中很有用处。122、真核基因(Eukaryotic gene): 一般是指由真核细胞的核基因组及其感染的DNA病毒基因组和反转录病毒基因组所编码的全部基因。而由线粒体和叶绿体细胞器基因组编码的基因,则不属 于真核基因的范畴。123、表达子(Exon):断裂基因中的任何编码成熟mRNA分子的相应的 DNA区段都叫做表达子,
52、或称为外显子。124、表达载体(Expression vector):系指一类按特殊要求设计构建的,具有调节外源基因正确表达的转录及转译控制信号的,并能使克隆基因在转化的寄主细胞中得到有效表达的专门载体。以 哺乳动物细胞的表达载体为例,它是由一个强启动子、增强子、克隆位点、多聚腺甘酸化信号 以及选择基因等组分构成的。大肠杆菌的表达载体可区分为表达型质粒载体和表达型噬菌体载 体两种类型。125、F因子(Fertility factor):即致育因子,是在大肠杆菌中发现的一种可自主转移的质粒分子。具 有F因子的大肠杆菌细胞叫雄性细胞(F+细胞),而不具有F因子的大肠杆菌细胞叫雌性细胞(F-细胞)。
53、126、足迹法(Fertility factor):又叫做保护实验(protection experiment)。它是通过检测因受保护而免 受DNasel酶切割作用的磷酸二酯键区域,从而鉴定出DNA分于中特定蛋白质的结合区位置及其核甘酸序列的一种分子生物学实验技术。见(DNA酶足迹法)。127、融合基因(Fusion gene):是指由来自两个或两个以上不同基因的核甘酸序列组成的一类新型的 基因。它有两种不同的来源,一种是由自发突变事件,例如两个连锁基因间发生的不等交换形 成的,另一种是通过 DNA体外重组技术构建的。128、融合蛋白配偶体(Fusion partners):简称配偶体,专指用
54、来与目标蛋白质连接构成融合蛋白质 的特定的蛋白质组分。常见的配偶体有葡萄球菌蛋白质A、链球菌蛋白质G以及谷胱甘肽-S-转移酶等。129、融合蛋白质(Fusion protein):由融合基因编码的蛋白质特称为融合蛋白质。在大肠杆菌细胞中, 以融合蛋白质产物的形式表达的外源克隆基因,可以获得稳定的产物。但其先决条件是当其编 码序列插入靶子序列之后,应仍能保持固有的正确的读码结构。有不少融合蛋白质在体外可以 被切割成天然的蛋白质。见融合基因 。130、融合截体(Fusion vector): 一类专门设计的具有寄主细胞(例如大肠杆菌)特定启动子、并能使克 隆的外源基因以融合蛋白质形式表达的载体,特
55、称为融合载体,它本质上是一类表达载体。131、裂口920:即DNA裂口。是指在双链 DNA分子的某一条链上,失去一个或连续数个核甘酸 时所出现的DNA单链断裂。132、凝胶阻滞试验(Gel retardation assay):又叫做 DNA 迁移率变动试验(DNA mobility shift assay), 或条带阻滞试验(band retardation assay)。它是根据裸露的 DNA与结合有某种蛋白质的相同大小 的DNA ,在电泳中具有不同的迁移率 (DNA蛋白质复合物由于具有较高的分子量,困此通过凝 胶的速度要比棵露的 DNA缓慢)这一原理,在20世纪80年代初期设计出来的用于
56、检测与特定 蛋白质结合的DNA片段的一种实验技术。133、基因(Gene):通常又叫顺反子,是遗传的基本单位,携带着某种蛋白质或 RNA分子的遗传信息。 从化学的本质看,基因乃是一段具有特定功能的连续的脱氧核糖核甘酸,是构成巨大遗传单位 染色体的组成部分。生物体中的基因数量是十分庞大的,即便是最简单的单细胞生物,如细菌, 也起码有数千种不同的基因及其相应的编码产物。而复杂的多细胞生物,如我们人类本身,则 大约有3000040000种左右不同的基因。134、基因增加(Gene addition):它是通过将一种或一群外源新基因导入受体,使基因种类或数目增 力口,用以观察并研究其功能作用的一种基因
57、工程策略。135、基因扩增(Gene amplification):特指基因拷贝数增加的过程,包括如下五种不同的情况1、在体外,应用聚合酶链式反应(PCR)技术和适当的引物,可使特定基因的拷贝数得到成功的扩增。2、将基因插入到高拷贝数的质粒分子上,于是在体内情况下该基因的拷贝数也变得相应富裕起来。3、一些外界环境的压力因素可以使真核细胞产生适应性反应,从而导致相应的保卫基因 (protective gene)发生明显的扩增。这种情况可以在染色体上也可以在染色体外发生。例如, 使用高剂量的氨甲蝶吟这种药物,便可导致二氢叶酸还原酶(DHFR)基因发生扩增,因为这些基因的产物是氨甲蝶吟作用的靶子。4
58、、程序基因扩增(programmed gene amplification),例如在非洲爪蟾卵子发生过程中的rRNA基因的扩增,有时被真核细胞用来作为在特定发育阶段产生高水平基因产物的一种手段。5、在生物的进化过程中发生基因的加倍和扩增,结果使相关的基因在基因组上聚集成丛 (clusters)。136、基因克隆(Gene cloning ):应用类似DNA克隆的技术,纯化分离含有目的基因的DNA片段的实验操作叫做基因克隆。DNA克隆。137、基因表达(Gene expression):基因通过DNA的转录和RNA的转译等过程,将其所携带的遗传 信息转变成蛋白质的过程叫做表达。对于有些基因,例如
59、 tRNA和rRNA分子的编码基因,表 达的最终产物是RNA转录本,这些分于本身就具有重要的生物学功能;而对于大部分的其它基因,它们的转录本还要被转译成各种蛋白质,才能体现出相应的功能作用。138、基因家族(Gene family):系指同种生物中,从同一祖先基因经过复制、突变而来的一组具有相 似结构、相似产物厦及相似功能的基因群体。139、基因剔除实验(Gene knockout experiment ):建立在同源重组技术的基础上,专门用来定点打 断或纠正哺乳动物基因组中的特定基因的实验操作,称为基因剔除实验。它要求在体外构建一 种具有失活基因或纠正基因的DNA片段,由于其两端存在着适当的
60、侧翼序列因而能够点射到我们期望研究的遗传座位上,于是这个内源基因便可以被取代或纠正。这种实验方法包括:把外 源基因(失活基因或纠正基因)引入胚胎干细胞系; 选择已成功地发生了同源重组事件的ES细胞亚克隆,把这ES亚克隆导入发育胚胎的胚泡中。由此所诞生的嵌合体动物中,新导入的外源基因成为该种系的一部分,它能够生育出纯合状态的子代动物。应用这些技术,研究工作者们便 能够检测出与某一特定遗传疾病相关的遗传座位,断定特定细胞因子或生长因子的重要性,构 建用于研究人类疾病的模式体系。140、基因文库(Gene library):也叫做 DNA文库(DNA library)包括基因组文库和 cDNA文库两
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