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文档简介
1、-第二位碱基第二位碱基第二位碱基第二位碱基-UCAG第一位碱基UUUU (Phe/F)苯丙氨酸UUC (Phe/F)苯丙氨酸UUA (Leu/L)亮氨酸UUG (Leu/L)亮氨酸UCU (Ser/S)丝氨酸UCC (Ser/S)丝氨酸UCA (Ser/S)丝氨酸UCG (Ser/S)丝氨酸UAU (Tyr/Y)酪氨酸UAC (Tyr/Y)酪氨酸UAA (终止)UAG (终止)UGU (Cys/C)半胱氨酸UGC (Cys/C)半胱氨酸UGA (终止)UGG (Trp/W)色氨酸第一位碱基CCUU (Leu/L)亮氨酸CUC (Leu/L)亮氨酸CUA (Leu/L)亮氨酸CUG (Leu/L
2、)亮氨酸CCU (Pro/P)脯氨酸CCC (Pro/P)脯氨酸CCA (Pro/P)脯氨酸CCG (Pro/P)脯氨酸CAU (His/H)组氨酸CAC (His/H)组氨酸CAA (Gln/Q)谷氨酰胺CAG (Gln/Q)谷氨酰胺CGU (Arg/R)精氨酸CGC (Arg/R)精氨酸CGA (Arg/R)精氨酸CGG (Arg/R)精氨酸第一位碱基AAUU (Ile/I)异亮氨酸AUC (Ile/I)异亮氨酸AUA (Ile/I)异亮氨酸AUG (Met/M)甲硫氨酸(起始)ACU (Thr/T)苏氨酸ACC (Thr/T)苏氨酸ACA (Thr/T)苏氨酸ACG (Thr/T)苏氨酸
3、AAU (Asn/N)天冬酰胺AAC (Asn/N)天冬酰胺AAA (Lys/K)赖氨酸AAG (Lys/K)赖氨酸AGU (Ser/S)丝氨酸AGC (Ser/S)丝氨酸AGA (Arg/R)精氨酸AGG (Arg/R)精氨酸第一位碱基GGUU (Val/V)缬氨酸GUC (Val/V)缬氨酸GUA (Val/V)缬氨酸GUG (Val/V)缬氨酸GCU (Ala/A)丙氨酸GCC (Ala/A)丙氨酸GCA (Ala/A)丙氨酸GCG (Ala/A)丙氨酸GAU (Asp/D)天冬氨酸GAC (Asp/D)天冬氨酸GAA (Glu/E)谷氨酸GAG (Glu/E)谷氨酸GGU (Gly/G
4、)甘氨酸GGC (Gly/G)甘氨酸GGA (Gly/G)甘氨酸GGG (Gly/G)甘氨酸密码子反表AlaAGCU,GCC,GCA,GCGLeuLUUA,UUG,CUU,CUC,CUA,CUGArgRCGU,CGC,CGA,CGG,AGA,AGGLysKAAA,AAGAsnNAAU,AACMetMAUGAspDGAU,GACPheFUUU,UUCCysCUGU,UGCProPCCU,CCC,CCA,CCGGlnQCAA,CAGSerSUCU,UCC,UCA,UCG,AGU,AGCGluEGAA,GAGThrTACU,ACC,ACA,ACGGlyGGGU,GGC,GGA,GGGTrpWUGGH
5、isHCAU,CACTyrYUAU,UACIleIAUU,AUC,AUAValVGUU,GUC,GUA,GUG起始AUG终止UAG,UGA,UAA中文名称英文名称短写缩写缬氨酸ValineVVal酪氨酸TyrosineYTyr色氨酸TryptophanWTrp苏氨酸ThreonineTThr丝氨酸SerineSSer硒半胱氨酸*SelenocysteineUSec吡咯赖氨酸*PyrrolysineOPyl脯氨酸ProlinePPro苯丙氨酸PhenylalanineFPhe蛋氨酸MethionineMMet赖氨酸LysineKLys亮氨酸LeucineLLeu异亮氨酸IsoleucineIIl
6、e组氨酸HistidineHHis甘氨酸GlycineGGly谷氨酰胺GlutamineQGln谷氨酸Glutamic acid / GlutamateEGlu半胱氨酸CysteineCCys天冬氨酸Aspartic acid / AspartateDAsp天冬酰胺AsparagineNAsn精氨酸ArginineRArg丙氨酸AlanineAAla除此之外,还有一些三字母或单字母符号可用来表示未明确定义的缩写:· Asx、B可代表天冬氨酸(Asp、D)或天冬酰胺(Asn、N)。· Glx、Z可代表谷氨酸(Glu、E)或谷氨酰胺(Gln、Q)。· Xle、J可代表
7、亮氨酸(Leu、L)或异亮氨酸(Ile、I)。· Xaa(亦用Unk)、X可代表任意氨基酸或未知氨基酸。结构编辑以下是标准遗传密码所用来直接合成蛋白质的20种氨基酸的结构及表示符号。·L-丙氨酸(Ala / A) ·L-精氨酸(Arg / R) ·L-天冬酰胺(Asn / N) ·L-天冬氨酸(Asp / D) ·L-半胱氨酸(Cys / C) ·L-谷氨酸(Glu
8、/ E) ·L-谷氨酰胺(Gln / Q) ·甘氨酸(Gly / G) ·L-组氨酸(His / H) ·L-异亮氨酸(Ile / I) ·L-亮氨酸(Leu / L) ·L-赖氨酸(Lys / K) ·L-蛋氨酸(Met / M) ·L-苯丙氨酸(Phe / F)
9、160;·L-脯氨酸(Pro / P) ·L-丝氨酸(Ser / S) ·L-苏氨酸(Thr / T) ·L-色氨酸(Trp / W) ·L-酪氨酸(Tyr / Y) ·L-缬氨酸(Val / V) ·L-硒半胱氨酸(Sec / U) ·L-吡咯赖氨酸(Pyl / O)主要化学性质编辑以下
10、的分子量是根据各元素的同位素在自然界的丰度所做的平均值。此外由于形成肽键时,会减少一个水分子,因此蛋白质中单一氨基酸的分子量,比下表数值少了18.01524 Da。氨基酸分子量(Da)pIpK1(-COOH)pK2(-+NH3)丙氨酸89.094046.012.359.87半胱氨酸121.154045.051.9210.70硒半胱氨酸169.06天冬氨酸133.103842.851.999.90谷氨酸147.130743.152.109.47苯丙氨酸165.191845.492.209.31甘氨酸75.067146.062.359.78组氨酸155.156347.601.809.33异亮氨酸1
11、31.174646.052.329.76赖氨酸146.189349.602.169.06吡咯赖氨酸255.31亮氨酸131.174646.012.339.74蛋氨酸149.207845.742.139.28天冬酰胺132.119045.412.148.72脯氨酸115.131946.301.9510.64谷氨酰胺146.145945.652.179.13精氨酸174.2027410.761.828.99丝氨酸105.093445.682.199.21苏氨酸119.120345.602.099.10缬氨酸117.147846.002.399.74色氨酸204.228445.892.469.41酪
12、氨酸181.191245.642.209.21支链性质编辑以下列表中的pKa值,可能与这些氨基酸在蛋白质内部时有所不同。氨基酸支链疏水性pKa极性电荷芳香族或脂肪族范德瓦尔斯半径丙氨酸-CH3X-67半胱氨酸-CH2SHX8.18-酸性-86硒半胱氨酸-CH2SeHX5.73-天冬氨酸-CH2COOH-3.90X酸性-91谷氨酸-CH2CH2COOH-4.07X酸性-109苯丙氨酸-CH2C6H5X-芳香性135甘氨酸-H-48组氨酸-CH2-C3H3N2-6.04X弱碱性芳香性118异亮氨酸-CH(CH3)CH2CH3X-脂肪性124赖氨酸-(CH2)4NH2-10.54X碱性-135吡咯赖
13、氨酸-C12H21N3O3亮氨酸-CH2CH(CH3)2X-脂肪性124蛋氨酸-CH2CH2SCH3X-124天冬酰胺-CH2CONH2-X-96脯氨酸-CH2CH2CH2-X-90谷氨酰胺-CH2CH2CONH2-X-114精氨酸-(CH2)3NH-C(NH)NH2-12.48X碱性-148丝氨酸-CH2OH-X-73苏氨酸-CH(OH)CH3-X弱酸性-93缬氨酸-CH(CH3)2X-脂肪性105色氨酸-CH2-C8H6NX-芳香性163酪氨酸-CH2-C6H4OHX10.46X-芳香性141基因表达与生物化学编辑氨基酸短写缩写密码子在蛋白质中出现频率(%)对人类的必需性丙氨酸AAlaGC
14、U, GCC, GCA, GCG7.8-半胱氨酸CCysUGU, UGC1.9-硒半胱氨酸USecUGA-天冬氨酸DAspGAU, GAC5.3-谷氨酸EGluGAA, GAG6.3-苯丙氨酸FPheUUU, UUC3.9X甘氨酸GGlyGGU, GGC, GGA, GGG7.2-组氨酸HHisCAU, CAC2.3-异亮氨酸IIleAUU, AUC, AUA5.3X赖氨酸KLysAAA, AAG5.9X吡咯赖氨酸OPylUAG亮氨酸LLeuUUA, UUG, CUU, CUC, CUA, CUG9.1X蛋氨酸MMetAUG2.3X天冬酰胺NAsnAAU, AAC4.3-脯氨酸PProCCU, CCC, CCA
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