微生物分类和鉴定ppt课件

1、定义：按微生物的亲缘把它们安排成定义：按微生物的亲缘把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分条理清楚的各种分类单元或分类群的科学。类群的科学。义务：分类、鉴定、命名义务：分类、鉴定、命名种以上的系统分类单元种以上的系统分类单元界界 Kingdom门门 Phylum或或Division亚门亚门纲纲 Class 亚纲亚纲超目超目目目 Order 亚目亚目 科科 Family 亚科亚科 族族 亚族亚族 属属 Genus 种种 Speciesv定义：种是一个根本分类单位，是一大群定义：种是一个根本分类单位，是一大群表型特征高度类似、亲缘关系极其接近、表型特征高度类似、亲缘关系极其接近、与同属内其他种有明

2、显差别的菌株的总称。与同属内其他种有明显差别的菌株的总称。在微生物中，一个种只能用该种内的一个在微生物中，一个种只能用该种内的一个典型菌株作为详细标本，它就是该种的方典型菌株作为详细标本，它就是该种的方式种。式种。v新种：新种： sp.nov.或或nov. sp.，新被鉴定的种，新被鉴定的种发表时应在其学名后标上发表时应在其学名后标上sp.nov.的符号，的符号，新种发表前应将其方式菌株的培育物存放新种发表前应将其方式菌株的培育物存放在一个永久性的保藏机构，并应允许人们在一个永久性的保藏机构，并应允许人们从中获得。从中获得。&命名：菌种的科学称号。菌种的学名是按照命名：菌种的科学称号。

3、菌种的学名是按照?国际细菌命名法规国际细菌命名法规?命名的国际学术界公认，命名的国际学术界公认，并通用的称号。并通用的称号。&命名原那么：命名原那么：& 学名学名=属名属名+种的加词种的加词+初次定名人初次定名人+现现名定名人和鲜明定名年份名定名人和鲜明定名年份&规定与常识：属名应大写首字母、单数、可以规定与常识：属名应大写首字母、单数、可以组合外而成。种的加词代表一个种的次要特征，组合外而成。种的加词代表一个种的次要特征，首字小写首字小写v亚种亚种subspeciers：种的进一步细分，普通指其某一：种的进一步细分，普通指其某一民而稳定的特征与方式中不同的种常在种名、

4、署名的加民而稳定的特征与方式中不同的种常在种名、署名的加词后写上词后写上subsp.然后再写详细亚种的加词；然后再写详细亚种的加词；v变种变种 variety：容易引起混乱；：容易引起混乱；v型型 form：运用中用型作为后缀；表示细菌菌株，现：运用中用型作为后缀；表示细菌菌株，现已作废；已作废；v类群类群group：没有分类位置非正式地指定一组具有某：没有分类位置非正式地指定一组具有某些共同性状的生物；些共同性状的生物；v菌株菌株strain：表示任何由一个独立分别的单细胞繁衍：表示任何由一个独立分别的单细胞繁衍而成的纯种群体极其一切后代；实践上是一个微生物到而成的纯种群体极其一切后代；实践

5、上是一个微生物到达遗传性纯的标志。达遗传性纯的标志。v小种小种race：涵义较乱，在不同分支学科中由不同涵：涵义较乱，在不同分支学科中由不同涵义；义；v相相phase：自然界存在的微生物交互变异的一定阶段；：自然界存在的微生物交互变异的一定阶段；v态态state：通常指微生物的菌落变异形状。：通常指微生物的菌落变异形状。界、门、纲、目、科、属、种 种是最根本的分类单位 每一分类单位之后可有亚门、亚纲、亚目、亚科.以啤酒酵母为例，它在分类学上的位置是： 界Kindom：真菌界 门Phyllum：真菌门 纲Class：子囊菌纲 目Order：内孢霉目 科Family：内孢霉科 属Genus：酵母属

6、 种Species：啤酒酵母1. 种种species：是一个根本分类单位；是一大群表型特征高：是一个根本分类单位；是一大群表型特征高度类似、亲缘关系极其接近，与同属内其他种有明显差别的菌度类似、亲缘关系极其接近，与同属内其他种有明显差别的菌株的总称。株的总称。菌株菌株strain: 表示任何由一个独立分别的单细胞繁衍而成表示任何由一个独立分别的单细胞繁衍而成的纯种群体及其一切后代来源于共同祖先并坚持祖先特性的的纯种群体及其一切后代来源于共同祖先并坚持祖先特性的一组纯种后代菌群。因此，一种微生物的不同来源的纯培育一组纯种后代菌群。因此，一种微生物的不同来源的纯培育物均可称为该菌种的一个菌株。菌株

7、强调的是遗传型纯的谱系。物均可称为该菌种的一个菌株。菌株强调的是遗传型纯的谱系。例如：大肠埃希氏杆菌的两个菌株：例如：大肠埃希氏杆菌的两个菌株：Escherichia coli B 和和Escherichia coli K12菌株的表示法：菌株的表示法：假设说种是分类学上的根本单位，那末菌株实践上是运用的根本假设说种是分类学上的根本单位，那末菌株实践上是运用的根本单位，由于同一菌种的不同菌株在产酶上种类或代谢物产量上会单位，由于同一菌种的不同菌株在产酶上种类或代谢物产量上会有很大的不同和差别！有很大的不同和差别！ 亚种亚种subspecies或变种或变种variety：为种内的再分类。为种内的

8、再分类。当某一个种内的不同菌株存在少数明显而稳定的变异特征或遗当某一个种内的不同菌株存在少数明显而稳定的变异特征或遗传外形，而又缺乏以区分成新种时，可以将这些菌株细分成两传外形，而又缺乏以区分成新种时，可以将这些菌株细分成两个或更多的小的分类单元个或更多的小的分类单元亚种。亚种。变种是亚种的同义词，因变种是亚种的同义词，因“变种一词易引起词义上的混淆，变种一词易引起词义上的混淆，从从1976年后，不在运用变种一词。通常把实验室中所获得的变年后，不在运用变种一词。通常把实验室中所获得的变异型菌株，称之为亚种。异型菌株，称之为亚种。如：如：E.coli k12野生型是不需求特殊野生型是不需求特殊a

9、a的，而实验室变异后，的，而实验室变异后，可从可从k12获得某获得某aa的缺陷型，此即称为的缺陷型，此即称为E.coli k12的亚种。的亚种。 型型form:常指亚种以下的细分。当同种或同亚种内不同菌株之间的性常指亚种以下的细分。当同种或同亚种内不同菌株之间的性状差别缺乏以分为新的亚种时，可以细分为不同的型。状差别缺乏以分为新的亚种时，可以细分为不同的型。例如：按抗原特征的差别分为不同的血清型；例如：按抗原特征的差别分为不同的血清型；微生物的名字有俗名和学名两种。如： 红色面包霉粗糙脉孢霉 绿脓杆菌铜绿假单胞菌学名是微生物的科学称号，它是按照有关微生物分类国际委员会拟定的法那么命名的。学名由

10、拉丁词、或拉丁化的外来词组成。学名的命名有双名法和三名法两种。双名法： 学名=属名+种名+初次定名人+现定名人+定名年份 必要，用斜体表示 可省略，用正体字属名：拉丁文的名词或用作名词的描画词，单数，首字母大写，表示微生物的主要特征，由微生物构造，外形或由科学家命名。 种名：拉丁文描画词，字首小写，为微生物次要特征， 如微生物色素、外形、来源或科学家姓名等。例：大肠埃希氏杆菌 Escherichia coli MigulaCastellani et Chalmers 1919 金黄色葡萄球菌 Staphylococcus aureus Rosenbach 1884v 当泛指某一属微生物，而不特

11、指该属中某一种或未定种名时，可在属名后加sp.或ssp.分别代表species 缩写的单数和复数方式v 例如：Saccharomyces sp.v 表示酵母菌属中的一个种。v菌株称号在种名后面自行加上数字、地名或符号等，如：v Bacillus subtilis AS1.389 AS=Academia Sinicav Bacillus subtilis BF7658 BF=北纺v Clostridium acetobutylicum ATCC824 丙酮丁醇梭菌vATCC American Type Culture Collection美国方式菌种保藏中心 v当文章中前面已出现过某学名时，后面

12、的可将其属名缩写成13个字母。v 如：Escherichia coli 可缩写成 E. coliv Staphylococcus aureus可缩写成 S. aureusv三名法：用于对亚种的命名，这时在属和种名后加写一个subsp.，然后再附上亚种称号斜排体。 如：v Bacillus thuringiensis subsp. galleria v 苏云金芽孢杆菌腊螟亚种 v生物的界级分类学说：是在认识开展过程中存在的对生物分类的不同阶段的不同观念。v如：二界系统、三界系统、四界系统、五界系统、六界系统和三原界系统v三原界系统是1978年由R.H.Whittaker和L.Margulis提出

13、的。v一切生物存在一个共同祖先，由它分三条进化道路，就构成了三个原界：古细菌原界Archaebacter、真细菌原界、真核生物原界v提出了内共生学说，主要是Margulis的奉献v原核生物分类系统纲要伯杰氏系统细菌学手册v真菌界分类系统很多，各国采用不同的系统，比较混乱。近年来为较多人接受的是Ainsworth的纲要。v 主要步骤：纯化、测定一系列必要的目的、主要步骤：纯化、测定一系列必要的目的、查找权威性鉴定手册查找权威性鉴定手册v 鉴定技术的不同程度：鉴定技术的不同程度：v 细胞的形状和习性：形状特征、运动、酶反细胞的形状和习性：形状特征、运动、酶反响、营养要求及生长条件等响、营养要求及生

14、长条件等v 细胞组分程度：细胞壁成分、氨基酸库、脂细胞组分程度：细胞壁成分、氨基酸库、脂类、醌类、光合色素等的分析类、醌类、光合色素等的分析v 蛋白质程度：氨基酸序列分析、凝胶电泳和蛋白质程度：氨基酸序列分析、凝胶电泳和血清学反响等血清学反响等v 基因或基因或DNA程度：核酸分子杂交、程度：核酸分子杂交、G+Cmol%、转化和转导、转化和转导、16SrRNA寡核苷酸族分寡核苷酸族分分析、分析、DNA或或RNA核苷酸序列分析等核苷酸序列分析等v即统计分类法：在即统计分类法：在200年前年前M. Adanson17271806，法国植物学家发表的分类原理，法国植物学家发表的分类原理根底上结合现代计算机技术开展而来的。根底上结合现代计算机技术开展而来的。v主要观念：主要观念：v在一个分类群中，其所含信息量越大，即分类在一个分类群中，其所含信息量越大，即分类所根据的性状越多，其分类效果也越好；所根据的性状越多，其分类效果也越好；v顺序建立自然分类单元时，每个性状都是等权顺序建立自然分类单元时，每个性状都是等权的；的；v任何两分类实体间的整体类似性，都是由每一任何两分类实体间的整体类似性，都是由每一对的类似性计算而来的；可以由类群间类似性对的类似性计算而来的；可以由类群间类似性的差别识别不同的分类实体；的差别识别不同