医学文献检索—循证实践的基础-BASIC优秀课件

1、1医学文献检索医学文献检索 循证实践的基础循证实践的基础张俊华张俊华 商洪才商洪才2008/04/03天津中医药大学循证医学中心天津中医药大学循证医学中心教育部循证医学网上合作研究中心天津分中心教育部循证医学网上合作研究中心天津分中心天津中医药大学中医药研究院临床疗效评价中心天津中医药大学中医药研究院临床疗效评价中心EB M .TJtcm2天津中医药大学循证医学中心2 主要内容主要内容文献检索的重要性医学文献数据库简介 检索策略的制订循证医学信息检索举例EB M .TJtcm3天津中医药大学循证医学中心3文献的重要性 子曰：子曰：“夏礼，吾能言之，杞不足征也；殷礼，吾能言之， 宋不足征也。文献

2、不足故也。足，则吾能征之矣。”论语八佾EB M .TJtcm4天津中医药大学循证医学中心4 丰富的医学典籍，是中医学的宝藏丰富的医学典籍，是中医学的宝藏EB M .TJtcm5天津中医药大学循证医学中心5信息的重要性 您写过综述吗？填过标书吗？做过实验吗？发您写过综述吗？填过标书吗？做过实验吗？发过文章吗？无论哪一种，都离不开文献过文章吗？无论哪一种，都离不开文献/ /检索检索 文献资料是科学研究的“成炊之米”，无价之宝；是进行科技决策的依据去重、纠错、指导、预测EB M .TJtcm6天津中医药大学循证医学中心6信息资源文献来源：报纸、教科书、杂志、会议文集、学术论文、网络、专业数据库正是在

3、网络技术，数据库技术广泛应用，成为循证医学快速发展的条件。EB M .TJtcm7天津中医药大学循证医学中心7Stand on the shoulders of giantsEB M .TJtcm8EB M .TJtcm9天津中医药大学循证医学中心9医学文献数据库简介EB M .TJtcm10天津中医药大学循证医学中心10EB M .TJtcm11天津中医药大学循证医学中心11医学文献数据库简介印刷版、电子版EB M .TJtcm12天津中医药大学循证医学中心12中文数据库简介中国科技信息所 EB M .TJtcm13天津中医药大学循证医学中心13英文文献数据库EB M .TJtcm14天津中

4、医药大学循证医学中心14CNKIhttp:/ M .TJtcm15天津中医药大学循证医学中心15CNKI简介EB M .TJtcm16天津中医药大学循证医学中心16EB M .TJtcm17天津中医药大学循证医学中心17EB M .TJtcm18天津中医药大学循证医学中心18简单检索EB M .TJtcm19天津中医药大学循证医学中心19EB M .TJtcm20天津中医药大学循证医学中心20EB M .TJtcm21天津中医药大学循证医学中心21EB M .TJtcm22天津中医药大学循证医学中心22EB M .TJtcm23天津中医药大学循证医学中心23EB M .TJtcm24天津中医药

5、大学循证医学中心24CNKI-高级检索EB M .TJtcm25天津中医药大学循证医学中心25EB M .TJtcm26天津中医药大学循证医学中心26EB M .TJtcm27天津中医药大学循证医学中心27PubMedEB M .TJtcm28天津中医药大学循证医学中心28简介简介由美国国立医学图书馆（National Library of Medicine - NLM）国家生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information - NCBI）向因特网用户提供免费MEDLINE检索服务(1997-6-26)检索服务具有收录范围广检索服务具有

6、收录范围广、内容全内容全、检检索途径多索途径多、访问速度快访问速度快等优点。等优点。 EB M .TJtcm29天津中医药大学循证医学中心29 （一）（一）MEDLINE 全世界全世界70多个国家和地区的多个国家和地区的4800余种生物医学期刊余种生物医学期刊 自自1966年至今数据年至今数据1400万余条万余条 内容每周更新一次，内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、内容每周更新一次，内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、 卫生保健和前临床科学等。卫生保健和前临床科学等。 标识标识PubMed - indexed for MEDLINE (二二) OLDMEDLINE 1950 年到年到19

7、65年全世界生物医学期刊年全世界生物医学期刊 目前数据大约目前数据大约200多万条多万条 标识标识PubMed - OLDMEDLINE for Pre1966（三）（三）In Process Citations 1996年年8月开始增加该数据库，只提供基本的引文信息和文摘，月开始增加该数据库，只提供基本的引文信息和文摘， 每天更新，经过标引以后进入每天更新，经过标引以后进入MEDLINE，并从，并从PreMEDLINE 中删除这些记录。中删除这些记录。 标识标识MEDLINE in process EB M .TJtcm30天津中医药大学循证医学中心30（四）（四）Publisher Sup

8、plied Citation 接受出版商提供的文献数据，这种数据带有接受出版商提供的文献数据，这种数据带有MEDLINE record in process的说明，其标识为的说明，其标识为Record as supplied by publisher。 每天都在不停地向每天都在不停地向In Process Citations数据库中传送，但其数据库中传送，但其 中有些条目由于超出了中有些条目由于超出了MEDLARS数据库的收录范围，将数据库的收录范围，将 永永 远不会被远不会被In Process Citations或或MEDLINE条目所取代条目所取代 (例如例如 在综合性的科学杂志在综合性

9、的科学杂志Science或或Nature上发表的地理学上发表的地理学 文章文章)，其标识符有，其标识符有PubMed - as supplied by publisher 或或 PubMed 。 先于印刷版的文献先于印刷版的文献 ，其标识为，其标识为Epub ahead of print EB M .TJtcm31天津中医药大学循证医学中心31 目前每年增加目前每年增加60余万条文献记录余万条文献记录,每周更新每周更新; 英文资料占英文资料占90，3/4有摘要有摘要; 在全部记录中有在全部记录中有76%的文献为英文；的文献为英文； 在在2000年以来的记录中年以来的记录中90%的文献为英文；的

10、文献为英文； 收录中文刊收录中文刊60余种余种 概况EB M .TJtcm32天津中医药大学循证医学中心32 收录范围广收录范围广：收录MEDLINE未收录的部分生命科学相关的非医学专业期刊（物理、天文、化学等） 收录记录新收录记录新：在MEDLINE数据标引前的最新题录 文献类型全文献类型全：提供电子原文链接 免费开放免费开放EB M .TJtcm33天津中医药大学循证医学中心33 一个或多个检索词，如自由词、主题词、人名等，系统默认空格为AND检索 布尔逻辑运算符（AND，OR或NOT），但布尔逻辑运算符必须大写。 字段标识符紧跟所要限制的检索词，其他检索条件放在 后面 字段限制检索:在字

11、段标识外加 如 anginati 若刊名与MeSH词表中的词相同，则需要用刊名字段标识ta加以限定。如：gene therapy，应输入 gene therapyta 单个词的刊名也要用ta加以限定。如：scanningta 作者名太简单，如jama，输入时用AU限定EB M .TJtcm34天津中医药大学循证医学中心34 （二）截词检索功能（二）截词检索功能 允许使用允许使用“*”号作为通配符进行截词检索。如：键入号作为通配符进行截词检索。如：键入“bacter *”，系统会找到那些前一，系统会找到那些前一部分是部分是bacter的单词（如的单词（如bacteria，bacterium，ba

12、cteriophage等），并对其分别进行检索。等），并对其分别进行检索。 如果这类词少于如果这类词少于150个，个，PubMed会逐词检索，若超过会逐词检索，若超过150个，个，PubMed将显示如下警告信息：将显示如下警告信息：“Wildcard search forterm*used only the first 150 variations.Lengthen the root word to search for all endings”。 截词功能只限于单词，对词组无效。如：截词功能只限于单词，对词组无效。如：“infection*”包括包括“infections”，但不包括，但不包

13、括“infection control”等。等。 使用截词功能时，使用截词功能时，PubMed系统会自动关闭词汇转换功能。系统会自动关闭词汇转换功能。如：heart attack 将不映射到 MeSH 词 Myocardial Infarction （三）强制检索功能（三）强制检索功能 允许使用双引号（允许使用双引号（“”“”）来强制系统进行短语检索。例如）来强制系统进行短语检索。例如“Single cell”，系统会将其作为，系统会将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行检索。一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行检索。 使用双引号检索，会自动关闭词汇转换功能。使用双引号检索，

14、会自动关闭词汇转换功能。 EB M .TJtcm35天津中医药大学循证医学中心35字段标识符一览表EB M .TJtcm36天津中医药大学循证医学中心36/sites/entrez/Nucleotide(DNA序列序列)数据库数据库Protein氨基酸（蛋氨基酸（蛋白质）序列白质）序列数据库数据库Genome(基因组序列基因组序列)数据库，数据库，提供所有基因与染色体纪录与提供所有基因与染色体纪录与图片的查询服务，这个库中数图片的查询服务，这个库中数以百万的基因序列是由庞大的以百万的基因序列是由庞大的基因排序工作得来的基因排序工作得来的Str

15、ucture（分子结构模（分子结构模型）数据库，这个数据型）数据库，这个数据库保存的是由库保存的是由X线晶体成线晶体成像、像、NMR分光光度法建分光光度法建立的三维分子结构。立的三维分子结构。OMIM(人类孟德尔人类孟德尔遗传学遗传学)在线数据库在线数据库Books(相关相关图书图书)可链可链接到相关参接到相关参考书籍的文考书籍的文摘页摘页Journals(期期刊刊)数据库数据库选择数选择数据库据库输入检索词输入检索词点击开始检索点击开始检索PMC（PubMed Central）特征栏特征栏主页主页EB M .TJtcm37天津中医药大学循证医学中心37可免费提供全文的可免费提供全文的生命科学

16、文献生命科学文献对公众提供临床科对公众提供临床科研的当前信息研的当前信息毒理学数据库毒理学数据库连接到连接到NLM提提供的其他服务供的其他服务购买原文购买原文（大约（大约$5/$5/篇）篇）为注册用户（免费注册）提供的检索为注册用户（免费注册）提供的检索策略存储空间，可以生成检索历史信策略存储空间，可以生成检索历史信息，并可以及时更新息，并可以及时更新为临床医生准备，关注于四个领域：为临床医生准备，关注于四个领域：疗法，诊断，病因，和预后疗法，诊断，病因，和预后Citation Matcher-是一是一个填空式的表格，允许个填空式的表格，允许用户通过输入刊物的引用户通过输入刊物的引文信息来定位

17、特定文章，文信息来定位特定文章，特定一期内容，或者整特定一期内容，或者整个刊物的内容个刊物的内容。通过标题，关键词，标题通过标题，关键词，标题缩写，或者缩写，或者ISSN号，在号，在PubMed和其他和其他Entrez数据数据库中检索期刊标题，还可库中检索期刊标题，还可以察看提供全文的刊物的以察看提供全文的刊物的列表。列表。可以在分层结构中浏览可以在分层结构中浏览MeSH的词汇表的词汇表PubMed数据库的覆盖数据库的覆盖范围和刊物信息范围和刊物信息关于关于PubMed系统更系统更新和未来发展新和未来发展EB M .TJtcm38天津中医药大学循证医学中心38作者作者AU题名题名TI来源来源S

18、OPubMed中文献中文献的类型（状态）的类型（状态）收录情况收录情况EB M .TJtcm39天津中医药大学循证医学中心39链接图标EB M .TJtcm40天津中医药大学循证医学中心40简单检索EB M .TJtcm41天津中医药大学循证医学中心41Limits限定检索 作者（Author）：系统有提示 期刊（Journal） 全文（Full Text 或 Free Full Text ） 日期（Dates） 人类或动物研究（Humans or Animals ） 文献类型（Type of Article ） 性别（Gender ）、语种（Languages ）、年龄（Ages ）、文献子

19、集限定（Subsets ） 自由词可以结合以上各种限定进行。EB M .TJtcm42天津中医药大学循证医学中心42EB M .TJtcm43天津中医药大学循证医学中心43限定检索窗口全貌EB M .TJtcm44天津中医药大学循证医学中心44添加作者检索添加作者检索添加期刊检索添加期刊检索限定记录有全文、免费全文或限定记录有全文、免费全文或摘要摘要EB M .TJtcm45天津中医药大学循证医学中心45限定记录有全文、免费全文或限定记录有全文、免费全文或摘要摘要文献发表时间限定文献发表时间限定记录添加到记录添加到PubMed时间限定时间限定EB M .TJtcm46天津中医药大学循证医学中心

20、46人类与动物限定人类与动物限定性别限定性别限定EB M .TJtcm47天津中医药大学循证医学中心47文献语种限定文献语种限定文献子集限定文献子集限定文献类型限定文献类型限定研究对象年龄组限定研究对象年龄组限定检索字段限定检索字段限定EB M .TJtcm48天津中医药大学循证医学中心48EB M .TJtcm49天津中医药大学循证医学中心49EB M .TJtcm50天津中医药大学循证医学中心50？EB M .TJtcm51天津中医药大学循证医学中心51主题词那么为什么要使用医学主题词呢？那么为什么要使用医学主题词呢？ 我们先来看个比喻，如果有人问你感冒了吗？你会不会回答“没有啦，我只是有

21、点着凉发烧而已”呢？当然不会，因为你知道感冒就是着凉发烧。但一个检索系统，如果你不告诉它的话，它就有可能不知道这一点。在期刊中，对于同一个概念往往可能有不同的描述形式，如Tumor和cancer都是指肿瘤。当一个查询者希望查阅肿瘤和diet(饮食)相关的文献时，他可能会输入Tumor，也可能输入cancer作为关键字，但其实这两者之间是没有区别的。一个愚蠢的检索系统可能就认识不到这点，而像PubMed这样的“智能化”检索系统就能够准确的意识到这点，从而不会造成检索结果的遗漏。 EB M .TJtcm52天津中医药大学循证医学中心52主题词 何为何为MeSH？ MeSH其实是Medical Su

22、bject Headings的缩略词，即医学主题词医学主题词，是用规范化的医学术语来描述生物医学概念。NIH的工作人员按MeSH词表规定，浏览生物医学期刊全文后标引出每篇文献中的MeSH主题词，其中论述文献中心的主题词称主要主题词（major topic headings），论述主题某一方面的内容的词称为副主题词。 主题词检索法虽然稍嫌繁琐，但其检索结果的准确性高，遗漏率低，是最佳的检索方法，一旦熟练掌握，将使得我们的检索工作事半功倍。 EB M .TJtcm53天津中医药大学循证医学中心53EB M .TJtcm54天津中医药大学循证医学中心54EB M .TJtcm55天津中医药大学循证医

23、学中心55EB M .TJtcm56天津中医药大学循证医学中心56EB M .TJtcm57天津中医药大学循证医学中心57EB M .TJtcm58天津中医药大学循证医学中心58EB M .TJtcm59天津中医药大学循证医学中心59EB M .TJtcm60天津中医药大学循证医学中心60EB M .TJtcm61天津中医药大学循证医学中心61EB M .TJtcm62天津中医药大学循证医学中心62EB M .TJtcm63天津中医药大学循证医学中心63EB M .TJtcm64天津中医药大学循证医学中心64EB M .TJtcm65天津中医药大学循证医学中心65EB M .TJtcm66天津

24、中医药大学循证医学中心66Details：显示计算机响应的本次检索式。：显示计算机响应的本次检索式。点击点击“URL”Details功能介绍EB M .TJtcm67天津中医药大学循证医学中心67/sites/entrez?Db=pubmed&Cmd=DetailsSearch&Term=(%22salvia+miltiorrhiza%22%5BTIAB%5D+NOT+Medline%5BSB%5D)+OR+%22salvia+miltiorrhiza%22%5BMeSH+Terms%5D+OR+danshen%5BText+Word%5DE

25、B M .TJtcm68天津中医药大学循证医学中心68保存该检索式至收藏夹EB M .TJtcm69天津中医药大学循证医学中心69检索策略的制订EB M .TJtcm70天津中医药大学循证医学中心70 检索策略制订的目的检索策略制订的目的 保证检索的规范、可靠、可重复 检索策略制订的原则检索策略制订的原则 以问题为基础，以目的为导向； 中西有别，病证有异； 检索策略制订的内容检索策略制订的内容 关键词/主题词的初定； 数据库/出版商的选择（如MEDLINE-OVID）； 检索时限（包括年份范围和执检时间） 检索式的表述和保存检索策略的制订EB M .TJtcm71天津中医药大学循证医学中心71

26、检索策略制订的步骤拟定检索词将问题分解为若干要素选择覆盖问题的数据库确定拟弄清的问题制订检索式修订检索策略病因/诊断/治疗/预后MeSH/Text WordEBM/文摘/全文AND/OR/NOT保存检索策略和检索结果保存检索策略和检索结果P: 问题/对象 I: 干预措施C: 对照措施 O: 结局/结果T: 研究类型EB M .TJtcm72天津中医药大学循证医学中心72Boolean Operator 布尔逻辑算符EB M .TJtcm73天津中医药大学循证医学中心73检索的方向性StudiesSynthesesSynopsisSummariesSystemsStudiesSynthesesS

27、ynopsisSummariesSystems临床循证实践证据生产过程卫生保健研究证据的结构“5S”模型EB M .TJtcm74天津中医药大学循证医学中心74循证医学信息检索实例查证用证查证用证系统评价系统评价EB M .TJtcm75天津中医药大学循证医学中心75临床证据的获取FOR EBCP 全世界每年有200多万篇有关生物医学的文章发表在2万多种医学刊物上，一个内科临床医师需要每天阅读19篇本专业的文献才能基本掌握本学科的进展11.Davidoff F. Evidence-based medicine:a new journal to help doctors identify the

28、 information they need. BMJ 1995Whats the truth?Guideline 1Article 1Article 2Guideline 2CMEExpert Textbook 医学文献数量浩若烟海，但其质量良莠不齐 有限的时间和无限的医学知识EB M .TJtcm76天津中医药大学循证医学中心76临床证据的获取FOR EBCP有没有一种既实用，又靠谱，有没有一种既实用，又靠谱，还不伤脑筋的证据呢？还不伤脑筋的证据呢？EB M .TJtcm77天津中医药大学循证医学中心77临床证据的获取FOR EBCP 鉴于此，循证医学的倡导者开始联合出版公司研发“循证的专

29、家意见”，推出值得信赖又便于临床医生使用的新型循证医学资源，这类资源具有以下共同特点：1根据PICO原则清楚表述临床问题；2纳入标准明确，文献检索全面；3严格评价临床研究的质量和可靠性；4针对临床问题，分级给出推荐处理意见；5. 电子版形式（网络、光盘、PDA）推出， 检索方便，层次分明，即时更新。 EB M .TJtcm78天津中医药大学循证医学中心78综述（系统评价）计算机辅助决策系统摘要原始临床研究StudiesSynthesesSynopsisSummariesSystems总结（手册/指南）EB M .TJtcm79天津中医药大学循证医学中心79EB M .TJtcm80天津中医药大

30、学循证医学中心80 对发展中国家免费Turning Research Into PracticeEB M .TJtcm81天津中医药大学循证医学中心81EB M .TJtcm82天津中医药大学循证医学中心82EB M .TJtcm83天津中医药大学循证医学中心83EB M .TJtcm84天津中医药大学循证医学中心84InfoPOEMs EB M .TJtcm85天津中医药大学循证医学中心85EB M .TJtcm86天津中医药大学循证医学中心86EB M .TJtcm87天津中医药大学循证医学中心87EB M .TJtcm88天津中医药大学循证医学中心88 SREB M .TJtcm89天津

31、中医药大学循证医学中心89循证信息检索 Systematic review 系统评价（Systematic review）是一种按照严格的纳入标准广泛收集关于某一医疗卫生问题的所有研究，对纳入研究进行全面的质量评价，并进行定性分析和/或定量合并，以对该问题进行系统总结的研究方法 检索要求：此前所有此前所有 EB M .TJtcm90天津中医药大学循证医学中心90 检索方式检索方式 电子数据库检索 手工检索 在研、灰色文献检索 安全性文献检索循证信息检索Systematic reviewEB M .TJtcm91天津中医药大学循证医学中心91EB M .TJtcm92天津中医药大学循证医学中心92EB M .TJtcm93天津中医药大学循证医学中心93EB M .TJtcm94天津中医药大学循证医学中心94SR数据库的选择MEDLINE偏重临床医学