硕士开题报告 生物学 ppt课件

1、开题报告开题报告指点教师：谭钟扬教授学生：吴晓龙2019:研讨课题：研讨课题： 简单反复序列在疱疹病毒基因组中的分布简单反复序列在疱疹病毒基因组中的分布 及其对基因组进化的影响及其对基因组进化的影响:报告内容u简单反复序列引见u研讨内容u已完成的任务u下一步展望:一、简单反复序列一、简单反复序列4: SSRs5简单反复序列(Simple Sequence Repeats，SSRs)也称微卫星序列(Microsatellites)或短串联反复序列(Short Tandem Repeats，STRs)，是由1-6个碱基对组成的串联反复DNA片段。SSRs在真核和原核生物的基因组中分布广泛、数量丰富

2、, 并具有较高的突变频率。 如: (A)n、 (ACG)n、(ATCG)n、(ACCCTT)n :Important characteristics of SSRs6:SSRs的突变机制 SSRs普遍存在于基因序列中，且曾经一度被以为是基因中“junk，不具有生物功能。然而，随着近几十年的研讨发现，简单反复序列在序列中的分布不是随机的，且有重要的生物功能。同时发现许多神经方面的疾病的发生与简单反复序列的突变有关，但对于简单反复序列的在序列中的突变机制，研讨者们还不是很清楚。在最近几十年中，随着对简单反复序列认识的不断的深化，研讨者提出了以下多种主要的用于提示SSRs突变机制的假设： 1、滑动突

3、变机制; 2、重组机制；3、不对等交换机制；3、逆转录机制；。在这四种突变实际中，滑动突变实际被以为是简单反复序列突变的最主要的机制。7:Replication slippageEllegren H. 2019. Microsatellites: simple sequences with complex evolution. NAT REV GENET. 5:435-445.8:RecombinationGemayel, R., Vinces, M., Legendre, M., Verstrepen, J. 2019. Variable Tandem Repeats Accelerate

4、Evolution of Coding and Regulatory Sequences. Annu. Rev. Genet. 44:44577.:The distribution of SSRs in a gene10:The function of SSRsLi, Y., Korol, A.B., Fahima, T., Nevo, E. 2019. Microsatellites Within Genes: Structure, Function, and Evolution. Mol. Biol. Evol. 21, 9911007.11:The relationship betwee

5、n SSRs and human disease12:SSRs作用 常用的一种分子标志。在多数情况下，微卫星标志没有任何表型效应，因此不存在对个体的有害或次级效应。 遗传图谱构建。 微卫星标志还可运用于疾病的基因诊断、性别控制、维护遗传学等方面。 置信随着人们对微卫星标志认识的不断深化与完善，它必将成为遗传育种研讨领域的一种强有力的工具,发扬其独特的优势。:一、背景引见及选材一、背景引见及选材OrderFamilySubfamily SpeciesHerpesviralesAlloherpesviridae7/12HerpesviridaeAlphaherpesvirinae22/37Beta

6、herpesvirinae14/18Gammaherpesvirinae12/32 Malacoherpesviridae1/2:形状学特征形状学特征 G：genome或core，是一条线状双链DNA。 C： capsid，衣壳是病毒粒的主要支架构造和抗原成分，有维护核酸等作用。 T： tegument，内膜是出如今疱疹病毒衣壳和包膜之间无特定形状的蛋白质。 E： envelope，中心壳外还被一层含蛋白质或糖蛋白的类脂双层膜覆盖着，这层膜称为包膜。包膜中的类脂来自宿主细胞膜。与该病毒的宿主专注性和侵入等功能有关。:基因组 基因组大小： 125 295 kbp. G+C 含量： 32 75%. 由于基因组中存在很多反复序列正向反复、反向反复，存在于基因组的末端或中间 ，因此有很多不同的基因组构造。 : 在疱疹病毒科里，大约有40个编码蛋白的基因是保守的，他们存在6个基因区。这6个保守的基因区在不同的亚科中有不同的顺序和方向。保守的基因普通编码： capsid proteins, components of the DNA replication and packaging machinery, nu