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1、化学生物学学习指导第1章 蛋白质一、名词解释氨基酸:含有氨基和羧基的一类有机化合物的通称。蛋白质的基本组成单位。必需氨基酸:必需氨基酸指的是人体自身不能合成或合成速度不能满足人体需要,必须从食物中摄取的氨基酸。非必需氨基酸:人体可以自身合成或由其它氨基酸转化而得到,作为营养源不需要必须从外界补充的氨基酸。等电点:在某一PH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势或程度相等,成为兼性离子,呈电中性,此时溶液的pH成为该氨基酸的等电点。肽:肽是介于氨基酸和蛋白质之间的物质。两个或以上的氨基酸脱水缩合形成若干个肽键从而组成一个肽。肽键:一个氨基酸的氨基与另一个氨基酸的羧基之间脱去一个水分子酰胺键称

2、为肽键。多肽:由两个氨基酸组成的肽称为二肽,由多个氨基酸组成的肽则称为多肽。寡肽:含有少于10个氨基酸构成的肽称为寡肽。肽单位:又称为肽基,肽键的所有四个原子和与之相连的两个-碳原子所组成的基团。构型:指在立体异构体中取代原子或基团在空间的取向;构型如果没有共价键的破裂是不能互变的。构象:指取代基团当单键旋转时可能形成的不同立体结构。这空间位置的改变并不涉及共价键的破裂。蛋白质一级结构:组成蛋白质的多肽链数目,多肽链的氨基酸顺序以及多肽链内或链间二硫键的数目和位置。蛋白质二级结构:蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构,即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置,只涉及肽链主链的构象及链内或链间形成的

3、氢键,并不涉及氨基酸残基侧链的构象。蛋白质三级结构:整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中所有原子在三维空间的排布位置。蛋白质四级结构:蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用。-螺旋:蛋白质分子中局部肽链的肽平面通过碳原子旋转,使碳链主链沿中心轴盘曲成稳定的右手螺旋构象;每个螺旋圈含3.6个氨基酸残基,螺距为0.54nm。-折叠:多肽链的局部肽段,以肽键平面为单位折叠成锯齿状的一种较伸展结构。-转角:多肽链中的某局部出现180度回折处形成的特定构象。超二级结构:二级结构与三级结构之间的结构层次,是三级结构的“建筑模块”;有些有特定功能。结构域:多肽链上某些超二级结

4、构相互联系,进一步形成可明显区分的空间结构区域,并具有特定的生物学功能。纤维状蛋白:分子类似纤维或细棒的蛋白质。球状蛋白:外形接近球形或椭圆形,溶解性好,能形成晶体,大部分蛋白质属于这类。疏水相互作用:非极性分子之间的一种弱的、非共价的相互作用。这些非极性分子在水相环境中具有避开水而相互聚集的倾向。二硫键:又称SS键。是2个-SH基被氧化而形成的SS形式的硫原子间的键。在生物化学的领域中,通常系指在肽和蛋白质分子中的半胱氨酸残基中的键。次级键:除了典型的强化学键(共价键、离子键和金属键)等 ,依靠氢键、盐键以及弱的共价键和范德华作用力相结合的各种化学键的总称。血红蛋白:血红蛋白是高等生物体内负

5、责运载氧的一种蛋白质,是使血液呈红色的蛋白。别构效应:蛋白质的空间结构不是固定不变的,当有些蛋白质表现其生物功能时,其构象发生改变,从而改变了整个分子的性质。简单蛋白:只含由-氨基酸组成的肽链,不含其他成分的蛋白质。结合蛋白:由单纯蛋白质与非蛋白质部分结合而成的蛋白质。分子病:由于蛋白质分子的变异或缺失而产生的疾病。二、学习要点1. 氨基酸的基本结构(甘氨酸除外:R为H原子,无手性。)2. 氨基酸的分类按R基和氨基酸性质的不同可将氨基酸分为如下六类,脂肪族氨基酸:甘氨酸(Gly)、丙氨酸(Ala)、缬氨酸(Val)、亮氨酸(Leu)、异亮氨酸(Lle);芳香族氨基酸:苯丙氨酸(Phe)、酪氨酸

6、(Tyr)色氨酸(Trp);碱性氨基酸:赖氨酸(Lys)、精氨酸(Arg)、组氨酸(His);含羟基或含硫氨基酸:丝氨酸(Ser)、半胱氨酸(Cys)、苏氨酸(Thr)、甲硫氨酸(Met);环氨基酸:脯氨酸(Pro);酸性氨基酸及其酰胺:天冬氨酸(Asp)、天冬酰胺(Asn);谷氨酸(Glu)、谷酰胺(Gln)。3. 氨基酸的性质(1)氨基酸的光学活性:构成蛋白质20种氨基酸中,除甘氨酸外,均含有一个手性-碳原子,都具有旋光性。(2)氨基酸的光吸收性质:构成蛋白质20种氨基酸在可见光区都没有光吸收,远紫外区(220 nm)均有紫外吸收;在近紫外区220-300nm只有酪氨酸,苯丙氨酸、色氨酸有

7、吸收光能力。(3)两性解离和两性性质:氨基酸在水溶液中或在晶体状态时主要时以两性离子的形式存在。4. 蛋白质一级结构的特点蛋白质的一级结构指多肽链中氨基酸的排列顺序。主要的化学键是肽键,有些蛋白质还包括二硫键;氨基酸的排列顺序由遗传信息 (DNA) 所决定;一级结构是蛋白质的基本结构,决定着蛋白质的空间结构。 5. 蛋白质一级结构测定方法测定蛋白质氨基酸残基组成;测定蛋白质分子中多肽链的数目;二硫健的断裂及多肽链的拆分;多肽链的选择性降解及肽段的氨基酸组成和顺序的测定;利用酶选择性降解和溴化氰选择性降解。6. 蛋白质二级结构特点(结构类型)蛋白质的二级结构是指多肽链主链骨架盘绕折叠而形成的构象

8、,主要有以下几个类型:(1)-螺旋:主链骨架围绕中心轴盘绕形成右手螺旋;每个螺旋圈含3.6个氨基酸残基,螺距为0.54nm;螺旋圈之间通过氢键维持结构稳定;R侧链位于螺旋外侧。(2)-折叠:若干条肽链或肽段平行或反向排列成片;所有肽键的C=O和NH形成链间氢键维系-折叠的稳定;侧链基团分别胶体位于片层上、下方。(3)-转角:肽链180°回折部分,一般由四个氨基酸组成;以氢键维持稳定;赋予蛋白质较大的构象柔性。(4)自由回转:主链骨架无规则盘绕的部分。7. *维持蛋白质结构稳定的力蛋白质的稳定结构是通过蛋白质分子间的共价键与次级键维持的,其中肽键是连接各个氨基酸之间的共价键,很强且稳定

9、,不易受破坏;次级键包括:氢键、范德华力、疏水相互作用力、盐键。氢键、范德华力虽然键能小,但数量大,疏水相互作用力对维持三级结构特别重要,盐键数量小,二硫键对稳定蛋白质构象很重要,二硫键越多,蛋白质分子构象越稳定。8. 三级结构和四级结构的特性和区别。第三章 核酸一、名词解释核苷:碱基和核糖通过糖苷键连接形成的化合物。核苷酸:核苷和磷酸以磷酸酯键连接形成核苷酸。 磷酸二酯键:一分子磷酸与两个醇(羟基)酯化形成的两个酯键。脱氧核糖核酸:携带遗传信息,决定细胞和个体的基因型。核糖核酸:参与细胞内DNA遗传信息的表达。碱基互补配对:在DNA分子结构中,由于碱基之间的氢键具有固定的数目和DNA两条链之

10、间的距离保持不变,使得碱基配对必须遵循一定的规律,这就是A,腺嘌呤一定与T,胸腺嘧啶配对,G,鸟嘌呤一定与C,胞嘧啶配对,反之亦然。DNA的双螺旋:是一种核酸的构象,在该构象中,两条反向平行的多核甘酸链相互缠绕形成一个右手的双螺旋组织。碱基位于双螺旋内侧,磷酸与糖基在外侧,通过磷酸二脂键相连,形成核酸的骨架。碱基立体与假象的中心轴垂直,糖环立体则与轴平行,两条链皆为右手螺旋。双螺旋的直径为2nm,碱基堆积间隔为0.34nm,两核甘酸之间的夹角是36,每对螺旋由10对碱基组成,碱基按A-T,G-C配对互补,相互以氢键相联系。大沟和小沟:大沟和小沟分别指双螺旋表面凹下去的较大沟槽和较小沟槽。小沟位

11、于双螺旋的互补链之间,而大沟位于相毗邻的双股之间。 DNA退火或DNA复性:DNA的复性指变性DNA 在适当条件下,二条互补链全部或部分恢复到天然双螺旋结构的现象,它是变性的一种逆转过程。热变性DNA一般经缓慢冷却后即可复性,此过程称之为" 退火"。DNA熔解温度:DNA的变性过程是突变性的,变性是在一个相当窄的温度范围内完成,在这一范围内,紫外光吸收值达到最大值的50%时的温度称为DNA的解链温度,又称融解温度(Tm)。增色效应:变性后DNA 溶液的紫外吸收作用增强的效应。DNA变性后DNA双螺旋解开,于是碱基外露,碱基中电子的相互作用更有利于紫外吸收,故而产生增色效应。

12、减色效应:若变性DNA复性形成双螺旋结构后,其260nm紫外吸收会降低,这种现象叫减色效应。核酸杂交:互补的核苷酸序列(DNA与DNA、DNA与RNA、RNA与RNA等)通过碱基配对形成非共价键,从而形成稳定的同源或异源双链分子的过程,称为核酸分子杂交技术,又称核酸杂交。DNA变性:核酸双螺旋碱基对的氢键断裂,双链变成单链,从而使核酸的天然构象和性质发生改变。变性时维持双螺旋稳定性的氢键断裂,碱基间的堆积力遭到破坏,但不涉及到其一级结构的改变。基因:是遗传的基本单元,是DNA或RNA分子上具有遗传信息的特定核苷酸序列。核酶:具有催化功能的RNA分子,是生物催化剂,可降解特异的mRNA序列。2、

13、 学习要点1. 核酸分类、分布与功能分类:核酸可分为核糖核酸(简称RNA)和脱氧核糖核酸(简称DNA)。分布:DNA主要位于细胞核中,线粒体和叶绿体内也有少量DNA(原核生物的DNA主要位于拟核);RNA主要位于细胞质中。功能:DNA是储存、复制和传递遗传信息的主要物质基础(即DNA是遗传信息的载体);RNA在蛋白质合成过程中起着重要作用,其中转运RNA,简称tRNA,起着携带和转移活化氨基酸的作用;信使RNA,简称mRNA,是合成(翻译)蛋白质的模板;核糖体RNA,简称rRNA,是细胞合成蛋白质的主要场所。2. 核酸的基本结构核酸是一种高分子化合物,它的基本结构单位是单核苷酸。DAN是由脱氧

14、核糖核苷酸通过3',5',磷酸二酯键连起来的高聚物。DNA与RNA的最大区别是核糖第2位上氧原子的有无。脱氧核糖使DNA的主链的磷酸二酯键更为稳定,然而却降低了糖苷键的稳定性。这样,几乎所有生物的DNA都是以碱基互补的双链形式存在的。核酸有2种:RNA和DNARNA由碱基(A腺嘌呤,G鸟嘌呤,C胞嘧啶,U尿嘧啶)磷酸,核糖组成。DNA由碱基(A腺嘌呤,G鸟嘌呤,C胞嘧啶,T胸腺嘧啶),磷酸,脱氧核糖组成。3. DNA双螺旋结构特点由脱氧核糖和磷酸基通过酯键交替连接而成。主链有二条,它们似“麻花状”绕一共同轴心以右手方向盘旋, 相互平行而走向相反形成双螺旋构型。碱基位于螺旋的内则

15、,它们以垂直于螺旋轴的取向通过糖苷键与主链糖基相连。同一平面的碱基在二条主链间形成碱基对。配对碱基总是A与T和G与C。碱基对以氢键维系,A与T 间形成两个氢键,G与C间形成三个氢键。大沟和小沟分别指双螺旋表面凹下去的较大沟槽和较小沟槽。螺旋直径2nm;螺旋周期包含10对碱基;螺距3.4nm;相邻碱基对平面的间距0.34nm。4. RNA的种类与功能 tRNA的结构特点 mRNA的结构特点mRNA,成熟的mRNA的结构特点是含有5-端帽子结构和3-末端的多聚A尾,其功能是把核内DNA的碱基顺序,按照碱基互补的原则,抄录并转送至胞质,在蛋白质合成中用以指导蛋白质中的氨基酸排序。tRNA,以含有较多

16、的稀有碱基为特点,具有三叶草型二级结构和倒L型的三级结构。tRNA的功能是运载氨基酸。5. 核酸的酶水解:是以核酸为底物,催化磷酸二酯键水解的一类酶。6. 核酸的紫外吸收:核酸的碱基具有共轭双键,因而有紫外吸收的性质;各种碱基、核苷和核苷酸的吸收光谱略有区别;核酸的紫外吸收峰在260nm附近,可用于测定核酸;根据260nm与280nm的吸收光度(A260)可判断核酸纯度。5. DNA的变性与复性、核酸的杂交在一定物化因素(热、酸、碱、变性试剂如尿素、酰胺以及某些有机溶剂如乙醇、丙酮等作用下),DNA分子内的氢键断裂,双螺旋结构解开,发生变性;在变性过程中,核酸的空间构象被破坏,理化性质发生改变

17、,由于双螺旋分子内部的碱基暴露,其A260值会大大增加。变性DNA在适当条件下,可使两条分开的单链重新形成双螺旋DNA的过程称为复性。当热变性的DNA经缓慢冷却后复性称为退火。具有互补序列的不同来源的单链核酸分子,按碱基配对原则结合在一起称为杂交。6. DNA碱基顺序测定的方法。(1) DNA 片断的制备:DNA分子酶解(将相对分子量质量大的片断用限制性内切酶技术完成,使切割成能够用于测定的小片段);PCR技术扩增DNA片段;(2) DNA碱基顺序测定:经典方法:化学降解法(碱基选择性水解;对水解产物DNA小片段进行电泳分析和碱基顺序的推断);双脱氧链终止法(末端终止法合成不同长度DNA小片段

18、;DNA小片段电泳图谱解析);新技术方法:杂交测序法、质谱法、单分子测序法、原子探针显微镜测序法、DNA、芯片法;第4章 糖一、名词解释聚糖:同聚多糖:同聚多糖由一种单糖组成,水解后生成同种单糖。糖胺聚糖:糖胺聚糖是由特定二糖单位多次重复构成的杂聚多糖,因其二糖单位中都含有己糖胺而得名。蛋白聚糖:,蛋白质和糖胺聚糖通过共价键连接而成的成大分子复合物。糖蛋白:蛋白质通过共价键与糖类结合的复合物,其中的糖基少则只有一个,多则可达数百个。糖脂:单糖羟基与酸作用生成酯。*糖苷键:一条寡糖链与蛋白质中氨基酸残基可通过多种方式共价连接,从而构成糖蛋白的糖肽连接键。N-连接糖苷键:寡糖链与多肽上的Asn(天

19、冬酰胺)的氨基相连。O-连接糖苷键:寡糖链与多肽链上的Ser(丝氨酸)或Thr(苏氨酸)的羟基相连,或与膜脂的羟基相连。二、学习要点1. *糖类物质的多样性糖类具有多个羟基,糖苷键又有、构型之分,单糖的连接可能产生数目很大的异构体,如由4个己糖组成的寡糖链,可能的序列则多达3万多种。如葡萄糖的二糖异构体有11种。2. 多糖的结构及其特点多糖的结构是其生物活性的基础,作为一类生物大分子,层次的分类沿用了蛋白质的分类法,也可分为一级、二级、三级和四级结构。 第六章至第九章一、名词解释可逆沉淀:在温和条件下,通过改变溶液的pH或电荷状况,使蛋白质从胶体溶液中沉淀分离。蛋白质在沉淀过程中结构和性质都没

20、有发生变化,在适当的条件下,可以重新溶解形成溶液,又称为非变性沉淀。不可逆沉淀:在强烈沉淀条件下,不仅破坏了蛋白质胶体溶液的稳定性,而且破坏了蛋白质的结构和性质,产生的蛋白质沉淀不可能再重新溶解于水。抗体和抗原沉淀:抗体与抗原通过相互识别和结合而发生的沉淀现象。盐溶:低浓度的中性盐可以增加蛋白质的溶解度,此现象叫盐溶。盐析:向蛋白质溶液中加入大量的中性盐使蛋白质沉淀析出的现象叫盐析。等电点沉淀:在低的离子强度下,用无机盐或有机酸碱调PH值到等电点,使蛋白质所带的净电荷为零,能大大降低其溶解度。蛋白质变性与复性:指蛋白质在某些物理和化学因素作用下其特定的空间构象被改变,从而导致其理化性质的改变和

21、生物活性的丧失,这种现象称为蛋白质变性。在适当条件下变性蛋白质可恢复其天然构象和生物活性,这种现象称为蛋白质的复性。共价修饰在其他酶的催化作用下,某些酶蛋白肽链上的一些基团可与某种化学基团发生可逆的共价结合,从而改变酶的活性,此过程称为共价修饰。竞争性抑制作用:有些抑制剂和酶底物结构相似,可与底物竞争酶活性中心,从而抑制酶和底物结合成中间产物。非竞争性抑制作用:抑制剂既可以与游离酶结合,也可以与ES复合物结合,使酶的催化活性降低,称为非竞争性抑制。反竞争性抑制作用:抑制剂只能与酶和底物的中间复合物结合,抑制酶活性。碱基置换:碱基置换是某一碱基配对性能改变或脱落而引起的突变。移码:移码是DNA中

22、增加或减少了一对或几对不等于3的倍数的碱基对所造成的突变。DNA大段损伤:大段损伤是DNA链大段缺失或插入。静电作用:带有阳离子电荷的小分子化合物与DNA发生静电相互作用,可以改变DNA分子的构象。沟区结合:小分子通过氢键、范德华力等作用,非嵌入性地与DNA在沟区结合。嵌插作用:一个平面芳香稠环结构的分子能以嵌插方式与DNA相结合。二、学习要点1. *蛋白质沉淀剂作用的特点(无机物、等电点、有机物聚合物)。(1)无机物沉淀:含高价阴离子的盐,效果比1价的盐好但高价阳离子的效果不如低价阳离子。(2)等电点沉淀:在等电点时,蛋白质的溶解度最小。其主要优点是很多蛋白质的等电点都在偏酸性范围内,而无机

23、酸通常价较廉;主要缺点是酸化时,易使蛋白质失活,这是由于蛋白质对低pH比较敏感。(3)有机物沉淀:其优点是溶剂容易蒸发除去,不会残留在成品中,因此适用于制备食品蛋白质。而且有机溶剂密度低,与沉淀物密度差大,便于离心分离。有机溶剂沉淀法的缺点是容易使蛋白质变性失活,且有机溶剂易燃、易爆、安全要求较高。2. 蛋白质不可逆失活的化学因素(强酸和强碱,氧化剂,表面活性剂,变性剂,重金属离子)1) 强酸和强碱:强的酸碱可以改变蛋白质溶液的pH引起蛋白质表面必需基团的电离,使蛋白质的空间结构发生变化,造成蛋白质分子聚集,导致变性。2) 氧化剂:氧化剂甲硫氨酸、半胱氨酸和胱氨酸残基。酪氨酸侧链的酚羟基可以被

24、氧化成醌再与巯基、氨基发生迈克尔加成反应形成交联产物。 3) 表面活性剂:去污剂与蛋白质表面的疏水区域结合,导致蛋白质伸展,分子内部的疏水性氨基酸残基暴露从而使蛋白质发生不可逆变性。 4) 变性剂:脲或盐酸胍与蛋白质多肽链作用,破坏了蛋白质分子内维持其二级结构和高级结构的氢键。有机溶剂也会引起蛋白质变性失活;5) 重金属离子:Hg2+、Cd2+、Pb2+能与蛋白质分子中的半胱氨酸的巯基、组氨酸的咪唑基以及色氨酸的吲哚基反应,使蛋白质不可逆沉淀而变性失活。 3. 化学物质对蛋白质的稳定因素(共溶剂,抗氧化剂,底物和辅酶,金属离子,化学交联剂)1) 共溶剂:糖类,醇氨基酸及其衍生物无机盐,甘油,聚

25、乙二醇等常用1-4M浓度共溶剂来稳定蛋白质和细胞器;2) 抗氧化剂:半胱氨酸,2-巯基乙醇还原谷胱甘肽,二巯基赤藓醇等巯基试剂可防止巯基氧化植物抗氧化剂如儿茶酚黄酮等也具有保护作用;3) 底物和辅酶:酶可被底物辅酶、竞争性抑制剂及反应产物等所稳定;4) 金属离子:金属离子不仅可以影响酶的活性,还可以影响酶的稳定性如Ca2+多位点结合使得蛋白质分子成为紧密的活性形式;5) 化学交联剂:交联剂可在相隔较近的两个氨基酸残基之间,或蛋白质与其他分子之间(如固定化载体)发生交联反应使蛋白质的构象稳定。4. 光谱探针的条件(1)探针分子与蛋白质分子的某一微区必需有特异性的结合,并且结合比较牢固;(2)探针

26、的荧光必须对环境条件敏感;(3)蛋白质分子与探针结合后不影响其原来的结构和特性。5. 酶的抑制作用、激活作用、不可逆作用、可逆作用的概念和特点6. 基因突变的类型、原理1) 碱基置换:某一碱基配对性能改变或脱落而引起的突变。此时首先在DNA复制时会使互补链的相应位点配上一个错误的碱基,即发生错误配对。这一错误配上的碱基在下一次DNA复制时却能按正常规律配对,于是一对错误的碱基置换了原来的碱基对,最终产生碱基对置换。 2) 移码是DNA中增加或减少了一对或几对不等于3的倍数的碱基对所造成的突变。其结果是从原始损伤的密码子开始一直到信息末端的氨基酸序列完全改变;也可能使读码框架改变其中某一点形成无

27、义密码,于是产生一个无功能的肽链片段,移码较易成为致死性突变。 3) 大段损伤是DNA链大段缺失或插入。这种损伤有时可跨越两个或数个基因,涉及数以千计的核苷酸。它往往是DNA断裂的结果,有时在减数分裂过程中发生错误联合和不等交换也可造成小缺失。小缺失游离出来的DNA片段可整合到另一染色体某一位置而形成插入引起突变。7. 化学诱变剂及其对DNA作用方式、原理能够提高生物体突变频率的物质即为诱变剂。可分为四种1) 烷化剂类作用方式:与一个或几个核酸碱基起化学反应,从而引起DNA复制时碱基配对的转换而发生遗传变异的化学物质。诱变原理:由于这些诱变剂分子中有一个或多个活性烷基,它们能够转移到DNA分子

28、中电子云密度极高的化点上去置换氢原子进行烷化反应。2) 碱基类似物诱变剂 作用方式:错误渗透和错误复制。诱变原理:这类化合物与天然碱基化学结构十分接近的类似物,它能掺入到DNA分子中而引起遗传变异。3) 移码诱变剂 作用方式:有些大分子能以静电吸附形式嵌入DNA单链的碱基之间或DNA双螺旋结构的相邻多核苷酸链之间引起变异。诱变原理:如果嵌入到新合成的互补链上,就会使之缺少一个碱基,如果嵌入到模板链的两碱基之间就会使互补链插入一个多余的碱基。无论多或少1个碱基都会造成移码。4) 脱氨基诱变剂:对碱基产生氧化作用,改变或破坏碱基的化学结构,有时引起链断裂。8. 化学致癌物特点及其作用机制能引起癌症

29、的化学物质称为化学致癌物。化学致癌物可分为直接致癌物、间接致癌物和促癌物三大类。直接致癌物是指进入机体后不需经体内代谢转化,直接作用于细胞中的大分子化合物(RNA、DNA、蛋白质等)而引起癌症的物质,如某些烷化剂、亚硝酰胺类物质。间接致癌物是指在体内需经代谢活化才与大分子化合物结合的致癌物,如多环芳烃类、亚硝胺类、芳香胺等。促癌物是指本身并不致癌,但当它与致癌物同时作用时,能明显地强化致癌的一类物质,如巴豆油、丙酮、酚、氧化铁粉尘和咖啡因等。9. 小分子药物与DNA作用方式(共价结合,非共价结合,外部静电作用,沟区结合,嵌入作用,剪切作用)共价结合:小分子药物首先与DNA形成非共价复合物,然后

30、再与之共价结合。大多数抗癌药物与DNA的作用都是非共价结合,其包括静电结合:核酸是一个高度带电的聚合电解质,它的阴离子磷酸根部分强烈地影响DNA的构象及其反应,带有阳离子电荷的小分子化合物与DNA发生静电相互作用,可以改变DNA分子的构象。沟区结合:沟区结合的药物分子能选择性地作用于DNA双螺旋结构中AT碱基较为丰富的片段,通过氢键、范德华力等作用,非嵌入性地与DNA结合,从而阻止DNA的模板复制,起到抗病毒、抗肿瘤的作用。嵌插结合:小分子药物嵌插造成了DNA双螺旋的解链和伸长,令DNA构象发生改变,使其不能或不易复制,而显现出抗肿瘤、抗病毒的活性。剪切作用 :小分子携带的特殊官能团的切断DN

31、A链,进而有效地调控基因表达。10. 无机物质与酶的相互作用(方式,抑制作用,激活作用)11. 无机物质与核酸的相互作用(共价配位作用,嵌插作用,静电作用,断裂作用)12. RNA作为药靶的优越性基因组测序揭示了编码蛋白质的mRNA信息,而所有的蛋白质都是mRNA翻译获得的,通过干扰mRNA的翻译,可以更有效地抑制蛋白质发挥作用。因此,结合RNA的小分子药物还可以产生结合蛋白质的小分子药物所达不到的作用。除了抑制蛋白质的产生,还可以诱导提高蛋白质的量。根据核糖核酸(RNA)的结构,同DNA相比,RNA更适合作为药物的靶点。第二章 酶一、名词解释酶:酶是一种生物催化剂,是有催化功能的蛋白质。全酶

32、:由蛋白质组分和非蛋白质组分组成的一种结合酶,全酶=酶蛋白+辅助成分(辅酶及金属离子)。辅基:与酶蛋白通过共价键紧密结合,不能用透析等简单方法与酶蛋白分离的有机小分子 。酶活力单位:在特定条件下,1分钟内转化1微摩尔底物所需的酶量为一个活力单位(U)。活化能:活化分子具有的高于平均水平的能量.活性中心:指酶分子中直接与底物结合,并和催化作用直接有关的空间部位。必需基团:酶表现活性不可缺少的基团。米氏方程:表示一个酶促反应的起始速度与底物浓度关系的速度方程。,值称为米氏常数,是酶被底物饱和时的反应速度,为底物浓度。米氏常数:它的数值等于酶促反应达到其最大速度Vmax一半时的底物浓度S。km可表示

33、酶与底物之间的亲和力,km值大表示亲和程度小,酶的催化活性低; km值小表示亲和程度大,酶的催化活性高。中间产物学说:在酶催化的反应中,第一步是酶与底物形成酶底物中间复合物。当底物分子在酶作用下发生化学变化后,分解成产物和酶。诱导契合学说:认为酶表面并没有一种与底物互补的固定形状,而只是由于底物的诱导才形成了互补形状。锁钥学说:认为整个酶分子的天然构象是具有刚性结构的,酶表面具有特定的形状。酶与底物的结合如同一把钥匙对一把锁一样酶原:有些酶在生物体内首先合成出来的是它的无活性前体称为酶原,经过蛋白水解酶专一作用后,构象发生变化,形成活性中心或使活性中心暴露,变成有活性的酶。别构酶:当某些化合物

34、与酶分子中的别构部位可逆地结合后,酶分子的构象发生改变,使酶活性部位对底物的结合与催化作用受到影响,从而调节酶促反应速度及代谢过程,这种效应称为别构效应。具有别构效应的酶称为别构酶。单纯酶:只由蛋白质组成,不包含辅因子的酶。结合酶:除含蛋白成分外,还含其它对热稳定的小分子物质的酶。单体酶:仅只有一条多肽链组成,具有三级结构的酶。寡聚酶:由多个相同或不同亚基以非共价键连接组成的酶。同工酶:同一生物催化同一反应的不同的酶分子。二、学习要点1. 酶的特性及酶的分类特性:高效性、选择专一性、酶的活性可调节和控制、易失活、反应条件温和等分类:氧化还原酶、移换酶、水解酶、裂合酶、异构酶、合成酶。2. 全酶的组成及各部分功能3. 酶的催化机制、高效性和专一性的作用机制4. 酶促反应动力学(米氏方程、米氏常数)5. 影响酶促反应的因素6. .酶的别构效应7. *酶的专一性类型及其特点酶只催化某一类底物发生特定的反应,产生一定的产物,这种特性称为酶的专一性。包括结构专一性和立体专一性两大类, 结构专一性又有绝对专一性和相对专一性之分。 绝对专一性指酶只催化一种底物, 生成确定的产物。 相对专一性指酶催化一类底物或化学键的

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