怎样用seqman看测序结果

1、怎样用seqman看测序结果1打开seqman软件，点巾le,点New,点王过2弹出新的对话框，点击fesembleAidSequencesDTrimlEndsnOptidins口找到测序文件所在文件夹，在文件类型中选中文件类率QQtbiTraceFiles(*.abi;*.abl)1,选中四个测序结果AcM_6_©503-93)FF_F04110S001678GAchE_B_©503-94)RF_DD<11050D167BGAchE_9_CD503-93)FF_G04_l1050016T9G配胆目_®5(33-94jRf_EM_1105而187rg,点“打

2、开”，再点done3再点Assemble软件就会自动拼装序列UnlocatedContigsL.jContig129640?力老占，4,加入¥们已知的参考序列（就是NCBI下下来的那个）。点菜单栏的sequence中的AddOne,找到参考序列所在文件夹，单击它（这里我命名的叫Amplificationproduct）/,打开。就谈加了一个参考序列。I5,双击，弹出框框。ConsensusUhE_0_05D3-94)RPJJ0<L10S001W8G.dbl(1>261)JU503-94FP_E1口写口8479G.flibl(13>266*-liClcaEloxLpE

3、aducc.seq(2>293)T1ch£=B=(O5D3-«FP=FD<11D5D01676Gabl(1>25$)thE_S_(0503-53)Fpl&D<LlD50O1679G.abl(15>266*口三口邛4P506PTTCGGOTAATATGGGTCTGm&MTCAGGCTCT&HTCTMGiVT闲iTrCGGCTAATOGGGTCTGTOGGATCAGGCTCT&GCTCTCAGAT闲CTCAg&GJLCMCGC写其GGCITT匚CT&FOJLTjarrGGGTTTGTGGGATrAGG

4、tnTTGGCmTHGjTrGGCTCjLGGCJlCJLlJrGCGGCGGCiTCirrAATmG&TCTCTCGGATCACGCTCT&lrcrCA&ATreCTCAGCCACAACGtC&CGGC>CTO-CT-TA&ATGGCTCAG&GACACGCGCCGGCl&ATGGCTCA.GG<3AC-AC&CGG&5C看到小灰色箭头了吗，每个都单击一下。就会出现以下详细资料idsn303口雷。白。窜口：，i，JI，,L一,，1rrncn；,林中加;门工丁卯汽：1遇704小谑1门"跖尸中不徜时仃匚

5、龈五町和*5”出叶也丁1口拓*寸匚；向测序irA：JlE_g5JD3-=«fliliSJ,_Ea-lLLCi£QD1673G-a&l(££i-Z.E6ti参考序列311式上“pEddlMTt.MeU1口£93U，口UWF白inM-BajiFPriUJ_LCiSC：DlGlSGr4iklf1)T血拗随曲岫扁H一I二ctb二丁工山一工匚匚广一彳：二人jrr?一1一后口二臬心工：日曰二示不二人.u，17175匚后二-1力匚入灯由四U'小W向:T”感K而H点4帧A珈'崛神；曲蜘极岫恤媪州.2.UGLr.l./jr.VtUGc,l

6、-JVJJiGA-febnLAMikUxjUlAbb；LjJ.'.L'tbLJt卢'FELLT：-FT11!：/mF->It-:L>wr-r-门广正向测序的前端A.zhE_9_lOSCS-a_504_LLCi5CDltMkabJflitGLh一玲。海冷用也彼愠M、咏杷ICTG-£T-T-Afik匚BGECjlIKKiiJ-CECGGCGdSCCTKGaLid.二1门.1-bL1C-MM飙M.。9，14LG红色峰代表T,啰变不kb,外色代表A,黑色代表G。大部"蜂是何昕T比如这样而峰。但是有小部分的峰是不清楚的，比如这样的峰。清晰的峰可以判断这个碱基，但是不清晰的峰我们一般不判断，就省略过去，因为不清晰的峰不大可信。这里要提一点的是，华大小规模测序用的是SANGER法，这种方法有个弊端就是靠近引物一端的大约20-50个碱基的峰图是可能不清楚，之后的才很清晰。我说这个话，其实可以通过图里就能反映出来。注意看上面两个，第一个是8号PCR产物的反向测序，第二个是9号PCR产物的反向测序（就是由后引物那边测过来的）。第三、第四个分别是8号、9号个体的壬向洲序。那我们来看看反向测序的情况反向测序的前端参考序列正向测序的后端是否看到，反向测