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文档简介
1、葵花宝典致亲爱的师弟师妹:本着不希望你们来到实验面临一些束手无策的窘境,师姐在这里把自己所学和资源略写、来到实验室,无论你喜欢不喜欢,乐不乐意,一定要把实验室的师兄师姐的名字都记住, 以及实验室里有什么仪器! ! !二、关于实验部分1、组织蛋白提取:方法一:(1) 4 C下,先生理盐水洗,再加入蛋白提取液, 剪刀剪碎,匀质器6000,循环六次, 每次都拿下来冰镇,防止蛋白变性,最后 14000转,20min , 4C(2) 跑western之前,需测BCA以保证每个组分上样的蛋白总质量一样(此处为定 量实验,看目标蛋白的表达量,若仅仅定性则无需做BCA)注意事项:匀质器需要用的小管和玻璃球在郝
2、荣华师姐那里,先加玻璃球一般,目测大概三四毫米高度就行(包括管底小尖尖),且溶液必须装满才振荡效果好,因此,加入细胞裂解液多,容易导致蛋白浓度低。方法二:(1) 取冰(东边实验室,最后面有制冰机)(2) 将软骨从-80 C冰箱取出,置于冰面上解冻(3) 去细胞室的液氮罐里,取出少量液氮置于泡沫箱内,(4) 转移至实验室内,取出少量,倒入研钵中,研磨(5) 浆糊状,立即转入 EP管中,(6) 细胞裂解液,2、western blotting(1 )抗体购买1. Antigen,也就是抗原名称,最好是英文全称,许多客户只说简称,要知道不同的抗体其简 称有可能会一样的有中文最好也提供一下2. Rea
3、ctivity,即反应性,也就是实验用于什么特种,是人,大鼠还是小鼠等3. Host,宿主,就是抗体来源,这个主要和二抗有关系。一抗来源必须要和二抗搭配,且不能和样本来源相同。比如,二抗是羊抗小鼠,一抗就要选择小鼠来源的.不少客户常常是先有 二抗,再买一抗,受限制得很,其实应该先订一抗,再买二抗,毕竟一抗贵,为了将就一个100元左右的二抗,而把几千元的一抗的订购弄得很复杂,真是不划算.所以,不要为了二抗伤脑筋4. Conjugate,即缀合物或标记物,如是不是需要 FITC标记,HRP标记等情况,也最好说明5. Applications,就是应用.你买这个抗体用于做什么实验,是IHC还是WB,
4、这点一定要说要知道,抗体开发出来,不是什么实验都能用或都会效果好,抗体公司说明上写着能做的实验是经过验证的,没有写的不是说一定不能做,也可能可以做,但没有验证,厂家不会乱 说的,也是科学,负责的态度.例如,你要是想做IHC-P,就是石蜡切处的免疫组化,如果买不到抗体明确说可以做,你要用就得冒风险,好在现在抗体厂家众多一般都找得到了(2) 3 -actin (内参蛋白)分子质量为43KD,因此,目标蛋白不能和内参蛋白分子质量一 致,内参也叫看家基因, 在组织或细胞中都会表达,且表达量在不同组织或细胞中几乎是相同的,一般有3 -ACTIN, GAPDH等。其作用有二:(1 )、是看提取蛋白质量的好
5、坏。如 果做western的时候,内参照蛋白有条带,而目的蛋白没有,说明蛋白的提取和转膜等 步骤没有问题,是目标蛋白的抗体质量不好或者是稀释倍数不对。(2)、是比较客观的说明目标蛋白的表达情况,消除上样量等的误差。 不同的标本之间由于蛋白提取的量有差别,可能强阳性的表达跑出来的带很弱。因此设立内参照, 比较不同标本之间的表达情况。因此,最好测一下蛋白浓度再上样,这样好点。当然也看你的实验室是定性还是定量了,定性的话,我觉得可以不用测浓度;要是准备定量,还是尽量保证上样量一 致吧。(3) 5倍的上样缓冲液:用样品稀释上样缓冲液至1倍,煮沸5min,离心2min (使粘壁蛋 白脱落至底部),可以放
6、于-20 C隔夜保存(4) 清洗工具:玻璃板,盖玻片,大烧杯和小烧杯,梳子,铸造支架,(5) 根据试剂盒配分离胶。AP (10%过硫酸铵)和TEMED最后加,先混匀之前的溶液(6) 沿着玻璃槽边,注胶,不要有气泡,用水封胶,30mi n(7 )配浓缩胶,同(5)SDS是一种阴离子表面活性剂,能打断蛋白质的氢键和疏水键,并按一定的比例和蛋白质分子结合成复合物, 使蛋白质带负电荷的量远远超过其本身原有的电荷,掩盖了各种蛋白分子间天然的电荷差异。过硫酸铵(AP):提供驱动丙烯酰胺与双丙烯酰胺所必须的自由基。TEMED通过催化过硫酸铵形成自由基而加速丙烯酰胺与双丙烯酰胺的聚合。(8) 倒掉水,用滤纸片
7、吸干,注胶,插上梳子,避免有气泡,30mi n(9) 安装至电泳槽,拔下梳子,加入电泳缓冲液(需要自己配,可查百度知道配方),没过 玻璃板(10) 上样1.5 mm上样量最多可为35微升,0.75mm上样量最多为20微升 红色为正极,黑色为负极。80v 30min, 上样线压平后,120V 2h1.5h 或 200V 1h电泳缓冲液配方:【爼分浓度】配制不冋弹杞斫嘉刍戌井词偉积(ML)或乐号g)woomiboomiD .125M Tris15.1g1 笳話 giycine()94 0g0 5%(W/V)3DSsog【配制方法】馬取 低角T® 94甘氢酸(glydrie) . 5 0y
8、SDS,用BOOM姿摆水或去离子水法網 充丹搅拌溶 解/定容至400卯11空湛保冇.得0 125mol/L Tris-1,25rriol;L甘謎电极餘口港.临用前稀璨5倍.(11)拆开电泳槽,将凝胶放在ph=9.15缓冲溶液。(12 )裁剪略大于凝胶的滤纸片六张,两张滤纸片置于PH=9.15缓冲溶液中,其余放于ph=5.19缓冲溶液中。(13) 裁剪PVDF膜一张,置于甲醇溶液1min (活化PVDF,使膜表面带正电荷),再置于蒸 馏水2min,摇床一会,再置于 PH=9.15缓冲溶液中(14) 转膜:先铺两张滤纸(ph=9.15),再铺凝胶(靠近负极),再铺PVDF膜(靠近正极), 再铺四张
9、滤纸(ph=5.19),记得润湿电转仪的上下面板Buffer 1 ( PH=9.4)配方:Tris 3.03g甘氨酸5.25g甲醇200ml去离子水 1L(15 )膜的面积*4.5=转膜电压,40min200mA,20min ?100mA目标蛋白多大,就多久 转膜效果不太好,时间不够(16)最好用TBST清洗转膜液,再用5%脱脂牛奶(5g脱脂牛奶粉末,100ml PBST( 500ml1*PBS + 1ml Tween-20,调 pH 7.0-7.2,即为 PBST )中浸泡 PVDF膜,1 小时10*TBS tris 12.1gNaCI 88g去离子水 1L浓盐酸调PH至8.0如果配置100
10、0ml的TBST先称量NaCI 40g,倒入烧杯中,加 DDW蒸馏水400ml,再称量NaCI 47.6g,倒入 刚才的那个烧杯中,:由于NaCI的量太多,一次称量不方便,所以分两次称量,且易于溶解)。 往烧杯中加入 Tris HCl缓冲液100ml,最后加吐温20, 5ml,转入1000ml容量瓶中,在定 容,转移即可。(17) 加一抗(5%脱脂牛奶稀释)孵育过夜,4C(18)PBST洗三次,每次 5min(19)加二抗(5%脱脂牛奶稀释)摇床,室温孵育,一小时(夏天半个小时)(20)PBST洗四次,每次 5min(20)显色(全称避光操作):配制ECL溶液,1.5ml左右(一张PVDF膜),显色2min (21 )凝胶成像仪分析2、细胞蛋白:可直接加入蛋白提取液,浸泡30min3、固绿-番红O染色:固绿染色剂极易上色,20s即可,无论你购买的哪个牌子。番红0染色剂极难上色,染色时间为25min (索莱宝),效果仍不太理想。番红O染色剂,两个小时,不理想(染色过程中,切勿放在通风橱中, 染色
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