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文档简介
1、Western-Blot操作流程1. 试剂配制1.1母液 1.0mol/L Tris·HCl Tris (MW121.14) 30.29g蒸馏水 200ml溶解后,用浓盐酸调pH至所需点(见下所示),最后用蒸馏水定容至250ml,高温灭菌后室温下保存。 PH HCl7.4 约17ml7.5 约16m7.6 约15ml8.0 约10ml1.1.2 1.74mg/ml (10mmol/L)PMSF PMSF 0.174g异丙醇 100ml溶解后,分装于1.5ml离心管中,-20保存。1.1.3 0.2mol/L NaH2PO4 NaH2PO4(MW119.98) 12g蒸馏水至 500m
2、l溶解后,高压灭菌,室温保存。1.1.4 0.2mol/LNa2HPO4 Na2HPO ·12H2O(MW 358.14) 71.6g蒸馏水至 1000ml溶解后,高压灭菌,室温保存。1.1.5 10SDS SDS 10g蒸馏水至 100ml50水浴下溶解,室温保存。如在长期保存中出现沉淀,水浴溶化后,仍可使用。1.1.6 10过硫酸胺(AP) 过硫酸胺 0.1g超纯水 1.0ml溶解后,4保存,保存时间为1周。(可先将过硫酸胺干粉称好分量后放在EP管中,一次性多装几管,使用时加入超纯水即可)1.1.7 1.5mol/L Tris·HCl(pH8.8) Tris (MW12
3、1.14) 45.43g超纯水 200ml溶解后,用浓盐酸调pH至8.8,最后用超纯水定容至250ml,室温下保存。1.1.8 0.5mol/L Tris·HCl(pH6.8) Tris (MW121.14) 15.14g超纯水 200ml溶解后,用浓盐酸调pH至6.8,最后用超纯水定容至250ml,室温下保存。1.1.9 40Acr/Bic(37.5:1) 丙稀酰胺(Acr) 37.5g甲叉双丙稀酰胺(Bic) 1g超纯水至 100ml溶解后4保存。使用时恢复至室温且无沉淀。1.1.10 30Acr/Bic(29:1) 丙稀酰胺(Acr) 29g甲叉双丙稀酰胺(Bic) 1g超纯水
4、至 100ml溶解后4保存。使用时恢复至室温且无沉淀。1.1.11 20Tween20 Tween20 20ml蒸馏水至 100ml混匀后4保存。1.2 使用液配制 单去污剂裂解液(PMSF): 1mol/L Tris·HCl(pH8.0) 2.5mlNaCl 0.438g TritonX-100 0.5ml蒸馏水至 50ml混匀后4保存。使用时,加入PMSF至终浓度为100g/ml(0.87ml裂解液加入1.74mg/ml PMSF50l)。一般实际用的比较多的其实是RIPA-Radio Immunoprecipitation Assay裂解配方:50 mM Tris-HCl pH
5、 7.4、150 mM NaCl、1 mM PMSF、1 mM EDTA、1% Triton X-100、1%脱氧胆酸钠、0.1% SDS。l 裂解得到的蛋白样品,由于含有较高的蛋白去垢剂干扰,不能用Brandford法测定蛋白浓度,要用BCA蛋白定量试剂盒测定蛋白浓度。l RIPA裂解液的配方有很多种,根据其裂解液的强度大致可以分为强、中、弱三类。对于某些特殊蛋白的IP,如果发现Western及IP细胞裂解液(弱)效果不是非常理想,可以尝试用RIPA裂解液(强、中或弱)。如果发现IP的时候背景很高,即非特异的蛋白也被IP下来,则需要选用裂解强度较高的裂解液,例如RIPA裂解液(强或中)。如果
6、发现目的蛋白无法被IP下来,则说明裂解液的强度过强,可以使用较为温和的裂解液例如RIPA裂解液(弱)或NP-40裂解液。 对于某些难溶解蛋白的Western,如果发现Western及IP细胞裂解液(弱)效果不是非常理想,可以尝试使用裂解强度更高的裂解液例如RIPA裂解液(强、中)或SDS裂解液。 0.01mol/L PBS( pH 7.2-7.4)0.2 mol/L NaH2PO4 19ml0.2 mol/L Na2HPO4 81mlNaCl 17g蒸馏水至 2000ml1.2.3 G250考马斯亮蓝溶液(蛋白定量专用) 考马斯亮蓝G250 100mg95乙醇 50ml磷酸 100m
7、l蒸馏水至 1000ml配制时,先用乙醇溶解考马斯亮蓝染料,再加入磷酸和水,混匀后,用滤纸过滤,4保存。1.2.4 0.15 mol/L NaCl NaCl(MW58.44) 0.877g蒸馏水至 100 ml高温灭菌后,室温保存。 100mg/ml 牛血清白蛋白(BSA) BSA 0.1g0.15 mol/L NaCl 1ml溶解后-20保存。制作蛋白标准曲线时,用0.15 mol/L NaCl进行100倍稀释成1mg/ml,-20保存。 还原型5 X SDS上样缓冲液 0.5 mol/L Tris·HCl(pH6.8) 2.5ml二硫叔糖醇(DTT,MW154.5) 0.39gS
8、DS 0.5g溴酚蓝 0.025甘油 2.5ml混匀后,分装于1.5ml离心管中,4保存。1.2.7 电泳液缓冲液 Tris(MW121.14) 3.03g甘氨酸(MW75.07) 18.77gSDS 1g蒸馏水至 1000ml溶解后室温保存,次溶液可重复使用35次。(电泳液可以回收重复利用,一般将回收的电泳液加入垂直电泳槽的下半部分,上半部分最好使用新鲜的电泳缓冲液)1.2.8 转移缓冲液 甘氨酸(MW75.07) 2.9gTris(MW121.14) 5.8gSDS 0.37g甲醇 200ml蒸馏水至 1000ml溶解后室温保存,次溶液可重复使用35次(次溶液最好保存在4度冰箱,最多使用5
9、次左右,不然影响转移效率)。(先用蒸馏水溶解甘氨酸、Tris和SDS,然后再加入甲醇,最后补足液体。如果先加入甲醇,溶解甘氨酸、Tris和SDS等比较困难)1.2.9 10X丽春红染液 丽春红S 2g三氯乙酸 30g磺基水杨酸 30g蒸馏水至 100ml使用时将其稀释10倍。 TBS缓冲液 1 mol/L Tris·HCl(pH7.5) 10mlNaCl 8.8g蒸馏水至 1000ml(可以配制成10×TBS缓冲液进行保存,稀释10倍使用)1.2.10 TBST缓冲液 20Tween20 1.65mlTBS 700ml混匀后即可使用,最好现用现配。1.2.11 封闭液 (最
10、好现配现用)脱脂奶粉(国产,光明牌) 5gTBST 100ml 洗脱抗体缓冲液(可用可不用)14.4 mol/L 2- Mercaptoethanol(-巯基乙醇) 700 l(通风厨里加)SDS 2g0.5mol/L Tris·HCl(pH6.8) 12.5ml超纯水至 100ml配制时,在通风厨内进行。4保存。可重复使用1次。1.2.12 显色液PCA22l-Lum50l-1M Tris-Hcl(pH8.5)500l500lH2O2-5lH2O4.428 ml4.5 ml4显影液(5X) 自来水(加热至50) 375ml (以下药品加到温水中)米吐尔 1.55g亚硫酸钠(无水)
11、22.5g碳酸钠(无水) 33.75g溴化钾 20.95g补水至 500ml配制时,上述药品应逐一加入,待一种试剂溶解后,再加入后一种试剂。4保存。使用时用自来水稀释至1倍。(不需要自己配制,有钱的直接买柯达的显影液,上千;没钱的到专业的照相器材市场购买即可,很便宜,一包5毛钱左右)5 定影液 自来水(5060) 700ml (以下药品按顺序加入前者溶解后再加后者)硫代硫酸钠 240g亚硫酸钠(无水) 15g冰乙酸 12.6ml硼酸 7.5g钾明矾 15g(水温冷至30以下时再加入)加水定容至 1000ml,室温保存。6 抗体 用TBST稀释至一定浓度使用,建议使用杂交袋(小商品市场购买,很便
12、宜,可以多买一点,但是务必注意质量,千万不能漏,不然抗体就浪费了,在使用之前先检查一下杂交袋的完整性)。7 化学发光试剂 分A和B两种试剂,有钱可以购买Amersham、Pierce或者Santa Cruz的,没钱的话碧云天的ECL也能凑合。8 40%聚丙烯酰胺的浓缩胶和分离胶配制组 分 10分离胶(两块胶,10ml) 4浓缩胶(两块胶,5ml)超纯水 4.85ml 3.16ml40Acr/Bic(37.5:1) 2.5ml 0.5ml1.5 mol/L Tris·HCl(pH8.8) 2.5ml 0.5 mol/L Tris·HCl(pH6.8) 1.26ml10SDS
13、100 l 50 l10%AP 50 l 25lTEMED 5 l 5 l*加TEMED后,立即混匀即可灌胶。(为了加快凝胶,可以将过硫酸胺和TEMED量加大,一般加至原来的2-3倍,根据实验当时的温度适当调整)组 分 15分离胶(两块胶,10ml) 7.8浓缩胶(两块胶,5ml)超纯水 2.34ml 2.065ml40Acr/Bic(37.5:1) 3.75ml 0.975ml1.5 mol/L Tris·HCl(pH8.8) 3.75ml 0.5 mol/L Tris·HCl(pH6.8) 1.875ml10SDS 100 l 50 l10%AP 50 l 25lTEM
14、ED 10l 5 l9 30%聚丙烯酰胺的浓缩胶和分离胶配制l SDS聚丙烯酰胺凝胶的有效分离范围*丙烯酰胺浓度(%) 线性分离范围(kD)15 124310 16687.5 36945.0 57212*双丙烯酰胺丙烯酰胺摩尔比为 1:29。l 配制Tris-甘氨酸SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳分离胶溶液溶液成分总体积 5ml总体积 10ml总体积 15ml总体积 20ml总体积 25ml总体积 30ml6% 水2.6ml5.3ml7.9ml10.6ml13.2ml15.9ml30%丙烯酰胺1.0ml2.0ml3.0ml4.0ml5.0ml6.0ml1.5M Tris(pH 8.8)1.3
15、ml2.5ml3.8ml5.0ml6.3ml7.5ml10% SDS50l100l150l200l250l300l10%过硫酸胺50l100l150l200l250l300lTEMED4l8l12l16l20l24l8%水2.3ml4.6ml6.9ml9.3ml11.5ml13.9ml30%丙烯酰胺1.3ml2.7ml4.0ml5.3ml6.7ml8.0ml1.5M Tris(pH 8.8)1.3ml2.5ml3.8ml5.0ml6.3ml7.5ml10% SDS50l100l150l200l250l300l10%过硫酸胺50l100l150l200l250l300lTEMED3l6l9l12
16、l15l18l10%水1.9ml4.0ml5.9ml7.9ml9.9ml11.9ml30%丙烯酰胺1.7ml3.3ml5.0ml6.7ml8.3ml10.0ml1.5M Tris(pH 8.8)1.3ml2.5ml3.8ml5.0ml6.3ml7.5ml10% SDS50l100l150l200l250l300l10%过硫酸胺50l100l150l200l250l300lTEMED2l4l6l8l10l12l12%水1.6ml3.3ml4.9ml6.6ml8.2ml9.9ml30%丙烯酰胺2.0ml4.0ml6.0ml8.0ml10.0ml12.0ml1.5M Tris(pH 8.8)1.3m
17、l2.5ml3.8ml5.0ml6.3ml7.5ml10% SDS50l100l150l200l250l300l10%过硫酸胺50l100l150l200l250l300lTEMED2l4l6l8l10l12l15%水1.1ml2.3ml3.4ml4.6ml5.7ml6.9ml30%丙烯酰胺2.5ml5.0ml7.5ml10.0ml12.5ml15.0ml1.5M Tris(pH 8.8)1.3ml2.5ml3.8ml5.0ml6.3ml7.5ml10% SDS50l100l150l200l250l300l10%过硫酸胺50l100l150l200l250l300lTEMED2l4l6l8l1
18、0l12l配制Tris-甘氨酸 SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳5% 浓缩胶溶液溶液成分总体积3ml总体积4ml总体积5ml总体积6ml总体积8ml水2.1ml2.7ml3.4ml4.1ml5.5ml30%丙烯酰胺0.5ml0.67ml0.83ml1.0ml1.3ml1M Tris(pH 6.8)0.38ml0.5ml0.63ml0.75ml1.0ml10% SDS30l40l50l60l80l10%过硫酸胺30l40l50l60l80lTEMED3l4l5l6l8l操作步骤一、蛋白样品制备(一) 单层贴壁细胞总蛋白的提取:1、倒掉培养液,并将瓶倒扣在吸水纸上使吸水纸吸干培养液(或将瓶直立放置一会儿使
19、残余培养液流到瓶底然后再用移液器将其吸走)。2、每瓶细胞加3ml 4预冷的PBS(0.01M pH7.27.3)。平放轻轻摇动1min洗涤细胞,然后弃去洗液。重复以上操作两次,共洗细胞三次以洗去培养液。将PBS弃净后把培养瓶置于冰上。3、按1ml裂解液加10l PMSF(100mM),摇匀置于冰上。(PMSF要摇匀至无结晶时才可与裂解液混合。)4、每瓶细胞加400l含PMSF的裂解液,于冰上裂解30min,为使细胞充分裂解培养瓶要经常来回摇动。5、裂解完后,用干净的刮棒将细胞刮于培养瓶的一侧(动作要快),然后用枪将细胞碎片和裂解液移至1.5ml离心管中。(整个操作尽量在冰上进行。)6、于4下1
20、2000rpm离心5min。(提前开离心机预冷)7、将离心后的上清分装转移倒0.5min的离心管中放于-20保存。(个人感觉上述方法可操作性有待加强,细胞中蛋白本来就很少,一瓶50ml的细胞有时按照实验要求只能加100-200l的裂解液,按照上述操作,直接用200l裂解液进行裂解,根本就不够瓶壁上沾的。本人是先用预冷的PBS(一般数毫升)加入后,用细胞刮刀刮下细胞,转移至试管中,如果数瓶细胞是收集同一蛋白的,可以放在同一试管,离心后再将蛋白转移到EP管中,这样可操作性就比较强)(二) 组织中总蛋白的提取:1、将少量组织块置于12ml匀浆器中球状部位,用干净的剪刀将组织块尽量剪碎。2、加400l
21、 单去污剂裂解液裂(含PMSF)于匀浆器中进行匀浆。然后置于冰上。3、几分钟后再碾一会儿再置于冰上,要重复碾几次使组织尽量碾碎。4、裂解30min后,即可用移液器将裂解液移至1.5ml离心管中,然后在4下12000rpm离心5min,取上清分装于0.5ml离心管中并置于-20保存。(三) 加药物处理的贴壁细胞总蛋白的提取:由于受药物的影响,一些细胞脱落下来,所以除按(一)操作外还应收集培养液中的细胞。以下是培养液中细胞总蛋白的提取:1、将培养液倒至15ml离心管中,于2500rpm离心5min。2、弃上清,加入4ml PBS并用枪轻轻吹打洗涤,然后2500rpm离心5min。弃上清后用PBS重
22、复洗涤一次。3、用枪吸干上清后,加100l裂解液(含PMSF)冰上裂解30min,裂解过程中要经常弹一弹以使细胞充分裂解。4、将裂解液与培养瓶中裂解液混在一起4、12000rpm离心5min,取上清分装于0.5ml离心管中并置于-20保存。二、蛋白含量的测定(一) 制作标准曲线1、从-20取出1mg/ml BSA,室温融化后,备用。2、取18个1.5ml离心管,3个一组,分别标记为0g,2.5g,5.0g ,10.0g ,20.0g ,40.0g。3、按下表在各管中加入各种试剂。0g2.5g5.0g10.0g20.0g40.0g1mg/ml BSA2.5l5.0l10.0l20.0l40.0l
23、0.15mol/L NaCl100l97.5l95.0l90.0l80.0l60.0lG250考马斯亮蓝溶液1ml1ml1ml1ml1ml1ml4、混匀后,室温放置2min。在生物分光光度计上比色分析。(二) 检测样品蛋白含量1、取足量的1.5ml离心管,每管加入4储存的考马斯亮蓝溶液1ml。室温放置30min后即可用于测蛋白。2、取一管考马斯亮蓝加0.15mol/L NaCl溶液100l,混匀放置2分钟可做为空白样品,将空白倒入比色杯中在做好标准曲线的程序下按blank测空白样品。3、弃空白样品,用无水乙醇清洗比色杯2次(每次0.5ml),再用无菌水洗一次。4、取一管考马斯亮蓝加95l 0.
24、15mol/L NaCl NaCl溶液和5l待测蛋白样品,混匀后静置2min,倒入扣干的比色杯中按sample键测样品。注意:每测一个样品都要将比色杯用无水乙醇洗2次,无菌水洗一次。可同时混合好多个样品再一起测,这样对测定大量的蛋白样品可节省很多时间。测得的结果是5l样品含的蛋白量。三、SDSPAGE电泳1 清洗玻璃板:一只手扣紧玻璃板,另一只手蘸点洗衣粉轻轻擦洗。两面都擦洗过后用自来水冲,再用蒸馏水冲洗干净后立在筐里晾干。2 灌胶与上样(1)、玻璃板对齐后放入夹中卡紧。然后垂直卡在架子上准备灌胶。(可以用1%琼脂糖在垂直电泳槽的左、右和下部封边,五分钟后重复一次,这样可以保证基本不漏胶,但现
25、在的灌胶模具都不用了)(2)、按前面方法配10分离胶,加入TEMED后立即摇匀即可灌胶。灌胶时,可用10ml枪吸取5ml胶沿玻璃放出,待胶面升到绿带中间线高度时即可。然后胶上加一层水,液封后的胶凝的更快。(灌胶时开始可快一些,胶面快到所需高度时要放慢速度。操作时胶一定要沿玻璃板流下,这样胶中才不会有气泡。加水液封时要慢,否则胶会被冲变型。)(3)、当水和胶之间有一条折射线时,说明胶已凝了。再等3min使胶充分凝固就可倒去胶上层水并用吸水纸将水吸干。(4)、按前面方法配4的浓缩胶,加入TEMED后立即摇匀即可灌胶。将剩余空间灌满浓缩胶然后将梳子插入浓缩胶中。灌胶时也要使胶沿玻璃板流下以免胶中有气
26、泡产生。插梳子时要使梳子保持水平。由于胶凝固时体积会收缩减小,从而使加样孔的上样体积减小,所以在浓缩胶凝固的过程中要经常在两边补胶(其实说经常有点过了,补1-2次就行了,不补胶问题也不大)。待到浓缩胶凝固后,两手分别捏住梳子的两边竖直向上轻轻将其拔出。(5)、用水冲洗一下浓缩胶,将其放入电泳槽中(冲洗的话个人感觉可以使用5ml的针筒,当然操作不能太粗暴了)。(6)、测完蛋白含量后,计算含20-50g 蛋白(根据自己的实验需要进行选择,没有固定的量)的溶液体积即为上样量。取出上样样品至200l的EP管中,加入5×SDS 上样缓冲液至终浓度为1×。(上样总体积一般不超过15l,
27、加样孔的最大限度可加20l样品)(其实大一点的垂直电泳槽每孔最大上样量可以达到40l,胶做得很好的话50l也是问题不大的)上样前要将样品于金属浴中煮5-10min使蛋白变性(本人心得:煮完样品后,样品会蒸发到EP 管的顶部,一定用离心机把所有样品离到管底)。(7)、加足够的电泳液后开始准备上样。(电泳液至少要漫过内测的小玻璃板。)用微量进样器贴壁吸取样品,将样品吸出不要吸进气泡。将加样器针头插至加样孔中缓慢加入样品。(加样太快可使样品冲出加样孔,若有气泡也可能使样品溢出。加入下一个样品时,进样器需在外槽电泳缓冲液中洗涤数次,以免交叉污染)3 电泳:电泳时间一般100min(Bio-Rad),浓
28、缩胶电压为80V较好,到分离胶以后用120跑(新鲜的电泳缓冲液当然跑得更快一些)。电泳至溴酚兰刚跑出即可终止电泳,进行转膜(如果目的条带比较大的话,最好使用可视的蛋白marker,Fermentas的0441和0671比较好,就是有点贵。一般要让目的条带跑过分离胶的1/3比较好,不要局限于此说明)。四、转膜1 转一张膜需准备6张7.08.3cm的滤纸和1张7.38.6cm的硝酸纤维素膜。切滤纸和膜时一定要戴手套,因为手上的蛋白会污染膜。将切好的硝酸纤维素膜置于水上浸2 h才可使用(其实用无水甲醇完全浸湿,然后放到转移缓冲液中浸泡后使用,效果也不错)。(用镊子捏住膜的一边轻轻置于有超纯水的平皿里
29、,要使膜浮于水上,只有下层才与水接触。这样由于毛细管作用可使整个膜浸湿。若膜沉入水里,膜与水之间形成一层空气膜,这样会阻止膜吸水)(个人感觉其实转膜之前浸湿一下就ok了,没有多大问题,可能按照上述操作结果会更好)2 在加有转移液的搪瓷盘里放入转膜用的夹子、两块海绵垫、一支玻棒、滤纸和浸过的膜。3 将夹子打开使黑的一面保持水平。在上面垫一张海绵垫,用玻棒来回擀几遍以擀走里面的气泡。(一手擀另一手要压住垫子使其不能随便移动。)在垫子上垫三层滤纸(可三张纸先叠在一起在垫于垫子上,注:个人感觉就垫1张滤纸也没问题呀),一手固定滤纸一手用玻棒擀去其中的气泡。4 要先将玻璃板撬掉才可剥胶,撬的时候动作要轻
30、,要在两个边上轻轻的反复撬(应该边撬边用流水缓缓冲洗)。撬一会儿玻璃板便开始松动,直到撬去玻板。(撬时一定要小心,胶很易裂,要用巧劲)除去小玻璃板后,将浓缩胶轻轻刮去(浓缩胶影响操作),要避免把分离胶刮破。小心剥下分离胶盖于滤纸上,用手调整使其与滤纸对齐,轻轻用玻棒擀去气泡。将膜盖于胶上,要盖满整个胶(膜盖下后不可再移动)并除气泡。在膜上盖3张滤纸并除去气泡。最后盖上l 另一个海绵垫,擀几下就可合起夹子。整个操作在转移液中进行,要不断的擀去气泡。膜两边的滤纸不能相互接触,接触后会发生短路(转移液含甲醇,操作时要戴手套,实验室要开门以使空气流通)(最后做成的“三明治”千万不能形成短路,不然有可能
31、会短路烧坏转膜装置(价格不菲,尤其是进口的),第一次做的应请老手指教)。5 将夹子放入转移槽槽中,要使夹的黑面对槽的黑面,夹的白面对槽的红面。电转移时会产热,在槽的一边放一块冰来降温。一般用60V转移2 h或40V转移3 h。(1.实际上应该根据蛋白分子量的大小确定转膜时间,对于小分子量的蛋白,转膜时最好垫两块硝纤膜,以免转膜过头,因为如果第一张膜上蛋白质已经转过了,第二张膜上还有蛋白质可以进行检测;对于大分子量的蛋白,转膜时电压要高一点,一般80-100V,时间也要延长一点,开始最好也用两块膜,特别是务必注意加强降温措施。当然转膜是要摸条件的,最好刚开始做的时候摸个转膜的时间梯度。如果由于时间原因来不及做下面实验,可以在4度下12V转膜过夜)(2.硝纤膜建议使用0.22 的小孔径膜,不容易转膜过头)(
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