软件系统激光共聚焦显微镜

1、1.5软件系统和计算机系统系统简介01图像采集02图像文件的保存和输出03系统的维护04Ta b l e o f C o n t e n t s目录开始操作：打开软件后，默认在Acquire面板的acquisition中，acquisition mode为xyz，Format扫描像素为512x512，average line and frame average 为1。根据需要选择扫描模式，常用的有以下几种：xyz 层面扫描；xyt 时间扫描；xy光谱扫描。扫描像素 一般选10241024设置平均 一般选择line average 2-3次注意：一般在扫描结束后统一保存，为免数据丢失，可以从获注

2、意：一般在扫描结束后统一保存，为免数据丢失，可以从获取第一张图片后就要开始保存，以后每获取一张图片保存一次。取第一张图片后就要开始保存，以后每获取一张图片保存一次。1、保存、保存Leica .lif 文件文件进入进入Acquire 面板的面板的Experiment 中，右键点击中，右键点击Experiment，从，从弹出菜单中选中弹出菜单中选中“Save Experiment “Experiment” as”，保存保存lif文件到自己的文件夹中并取名。文件到自己的文件夹中并取名。2、导出、导出lif文件文件右键点击右键点击Experiment，从弹出菜单中选中，从弹出菜单中选中“Export

3、Experiment as tiff”，选择目标文件夹，选中，选择目标文件夹，选中rawdata导出单通道图片。导出单通道图片。如需导出如需导出overlay 图片，则再次右键点击图片，则再次右键点击Experiment，从弹出，从弹出菜单中选中菜单中选中“Export Experiment as tiff”，选择目标文件夹，选择目标文件夹，选中选中overlay 导出多通道合成图片。导出多通道合成图片。1 1、点击、点击seq seq ，出现，出现sequential scansequential scan面板。面板。2 2、在、在sequential scansequential scan

4、面板中点击面板中点击scan 1scan 1，在，在beam path setting beam path setting 中选择所标中选择所标记的一种荧光的光路设置方法。记的一种荧光的光路设置方法。点击点击livelive开始连续扫描，优化图像质量。开始连续扫描，优化图像质量。调节调节z positionz position选择需扫描层面，调节选择需扫描层面，调节gaingain和和offset offset 使图像亮度和背景到达使图像亮度和背景到达到合适的状态，到合适的状态，ZoomZoom调节电子放大倍率。调节电子放大倍率。点击点击stopstop，停止扫描。，停止扫描。在在sequen

5、tial scansequential scan面板中点击面板中点击“+”“+”，点击，点击scan 2scan 2，在，在beam path setting beam path setting 中中选择所标记的另一种荧光的光路设置方法，点击选择所标记的另一种荧光的光路设置方法，点击livelive开始连续扫描，优化图像开始连续扫描，优化图像质量。质量。标记了几种荧光就添加几种方法。标记了几种荧光就添加几种方法。选择选择“between frames ”“between frames ”模式。模式。3 3、选择像素、选择像素1024102410241024，点击，点击StartStart获取图

6、像。获取图像。4 4、保存图像。、保存图像。1 1、在、在beam path setting beam path setting 中选择所标记荧光的光路设置方法。中选择所标记荧光的光路设置方法。2 2、打开、打开Z-stack Z-stack 面板。面板。3 3、点击、点击livelive开始连续扫描，优化图像质量。开始连续扫描，优化图像质量。调节调节z positionz position选择需扫描层面，设置选择需扫描层面，设置beginbegin和和end end ，调节，调节gaingain和和offset offset 使图像亮度和背景到达到合适的状态，使图像亮度和背景到达到合适的状态

7、，ZoomZoom调节电子放大倍率。调节电子放大倍率。点击点击stopstop，停止扫描。，停止扫描。在在Z-stack Z-stack 面板中确定面板中确定Nr. Of steps Nr. Of steps （在选择层面中确定需扫描张数）（在选择层面中确定需扫描张数）4 4、点击、点击startstart获取图像。获取图像。5 5、如需将扫描图像叠加，选择、如需将扫描图像叠加，选择Process Process 面板，选择面板，选择visualization 3D visualization 3D projection projection ，点击，点击apply apply ，即可生成叠加

8、图像。，即可生成叠加图像。6 6、 保存图像。保存图像。1 1、Acquisition mode Acquisition mode 改为改为xytxyt。2 2、根据需要拍摄图像的时间间隔和图像质量调整、根据需要拍摄图像的时间间隔和图像质量调整fomat fomat 和和line averageline average值。值。3 3、在、在beam path setting beam path setting 中的中的load/save single setting load/save single setting 中中选择所标记荧光的光路设置方法。选择所标记荧光的光路设置方法。 如是多种荧光则选择点击如是多种荧光则选择点击seqseq，设置序列扫描。，设置序列扫描。4 4、点击、点击livelive开始连续扫描，优化图像质量。开始连续扫描，优化图像质量。调节调节z positionz position选择需扫描层面，调节选择需扫描层面，调节gaingain和和offset offset 使图像使