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文档简介
1、肺炎支原体肺炎流行病学、临床特征与诊疗规范化研究潘长旺 发展简史2主要内容345DNA复制、转录和翻译DNA重组与基因工程重组与基因工程基因与疾病基因与疾病1第1页/共77页发展简史发展简史准备和酝酿准备和酝酿建立和发展建立和发展蛋白质是生命的主要基础物质DNA是遗传的物质基础遗传中心法则的建立蛋白质翻译合成的基本过程1953年 第2页/共77页第3页/共77页主要内容主要内容基因工程技术基因表达的调控生物大分子的结构和功能生物信息学第4页/共77页第5页/共77页中心法则( central dogmacentral dogma)遗传信息传递方向的规律第6页/共77页 DNA通过复制将遗传信息
2、由亲代传递给子代;通过转录和翻译,将遗传信息传递给蛋白质分子,从而决定生物的表现型。DNA的复制、转录和翻译过程就构成了遗传学的中心法则。第7页/共77页 在RNA病毒中,其遗传信息贮存在RNA分子中。遗传信息的流向是RNA通过复制,将遗传信息由亲代传递给子代,通过反转录将遗传信息传递给DNA,再由DNA通过转录和翻译传递给蛋白质,这种遗传信息的流向就称为反中心法则。第8页/共77页染色体结构与DNA复制基因的转录与加工蛋白质的翻译 蛋白质合成后的修饰加工 蛋白质合成后的靶向输送第9页/共77页一、染色体结构与DNA复制(一)复制的基本规律(一)复制的基本规律(二)(二)DNADNA复制的条件
3、复制的条件(三)(三)DNADNA生物合成过程生物合成过程(四)真核生物端粒(四)真核生物端粒(五)逆转录(五)逆转录第10页/共77页染色体:染色体:染色体DNA基因 基因和染色体,基因和染色体,DNADNA和脱氧核苷酸的关系:和脱氧核苷酸的关系:每一条染色体只含有一个每一条染色体只含有一个DNADNA分子,每个分子,每个DNADNA分子上有分子上有很多基因,基因是很多基因,基因是DNADNA片段,片段,在染色体上呈线性排列,每在染色体上呈线性排列,每个基因中又有成百上千个脱个基因中又有成百上千个脱氧核苷酸。氧核苷酸。每个基因有特定每个基因有特定的脱氧核苷酸排列顺序,它的脱氧核苷酸排列顺序,
4、它代表着遗传信息代表着遗传信息是基因的载体。是基因的载体。第11页/共77页 DNA在复制时,以亲代DNA的每一股作模板,合成完全相同的两个双链子代DNA,每个子代DNA中都含有一股亲代DNA链,这种现象称为DNA的半保留复制(semi-conservative replication)。 1、半保留复制、半保留复制(一)复制的基本规律第12页/共77页复制复制亲代亲代DNA子代子代DNADNADNA半保留复制示意图半保留复制示意图第13页/共77页DNADNA半保留复制研究实验结果示意图半保留复制研究实验结果示意图第14页/共77页按半保留复制方式,子代DNA与亲代DNA的碱基序列一致,即子
5、代保留了亲代的全部遗传信息,体现了遗传的保守性。遗传的保守性,是物种稳定性的分子基础,但不是绝对的。半保留复制的意义半保留复制的意义第15页/共77页 DNA在复制时,需在特定的位点起始,这是一些具有特定核苷酸排列顺序的片段,即复制起始点(origin) 。 在原核生物中,复制起始点通常为一个,而在真核生物中则为多个。2、有一定的复制起始点、有一定的复制起始点第16页/共77页53oriorioriori535533553复制子复制子3复制起始点与复制子示意图复制起始点与复制子示意图第17页/共77页 习惯上把两个相邻DNA复制起始点之间的距离 ( 或 D N A 片 段 ) 定 为 一 个
6、复 制 子(replicon) 。 复制子是独立完成复制的功能单位。 DNA复制时,局部双螺旋解开形成两条单链,这种叉状结构称为复制叉。第18页/共77页复制起始点、复制子与复制叉(动画演示)复制起始点、复制子与复制叉(动画演示)第19页/共77页 参与DNA复制的DNA聚合酶,必须以一段具有3端自由羟基(3-OH)的RNA作为引物(primer) ,才能开始聚合子代DNA链。 RNA引物的大小,在原核生物中通常为50 100个核苷酸,而在真核生物中约为10个核苷酸。RNA引物的碱基顺序,与其模板DNA的碱基顺序相配对。 3、需要引物、需要引物第20页/共77页 DNA复制时,以复制起始点(o
7、rigin)为中心,向两个方向进行解链,形成两个延伸方向相反的复制叉,称为双向复制(bidirectional replication)。 但在低等生物中,也可进行单向复制(如滚环复制)。4、双向复制、双向复制第21页/共77页 DNA聚合酶只能以53方向聚合子代DNA链,即模板DNA链的方向必须是35。 由于DNA分子中两条链的走向相反,因此当分别以两条亲代DNA链作为模板聚合子代DNA链时,子代链的聚合方向也是不同的。5、半不连续复制、半不连续复制第22页/共77页3 5 3 5 3 53 5 解链方向解链方向领头链领头链(leading strand)随从链随从链(lagging str
8、and)DNADNA的半不连续复制的半不连续复制35 第23页/共77页 以35方向的亲代DNA链作模板的子代链在复制时基本上是连续进行的,其子代链的聚合方向为53,这一条链被称为领头链(leading strand)。 以53方向的亲代DNA链为模板的子代链在复制时则是不连续的,其链的聚合方向也是53,这条链被称为随从链(lagging strand)。 领头链连续复制而随从链不连续复制,就是复制的半不连续性。 第24页/共77页 由于亲代DNA双链在复制时是逐步解开的,因此,随从链的合成也是一段一段的。DNA在复制时,由随从链所形成的一些子代DNA短链称为冈崎片段(Okazaki frag
9、ment)。 冈崎片段的大小,在原核生物中约为10002000个核苷酸,而在真核生物中约为100个核苷酸。 第25页/共77页 以四种脱氧核糖核酸(deoxynucleotide triphosphate)为底物,即dATP,dGTP,dCTP,dTTP。1 1、底物、底物( (substratesubstrate) ) (dNMP)n + dNTP (dNMP)n+1 +PPi(二)DNA复制的条件第26页/共77页DNADNA复制过程中脱氧核糖核苷酸的聚合反应复制过程中脱氧核糖核苷酸的聚合反应第27页/共77页 DNA复制是模板依赖性的,必须要以亲代DNA链作为模板。亲代DNA的两股链解开
10、后,可分别作为模板进行复制。 2 2、模板、模板(template)(template)第28页/共77页 引物酶(primerase)本质上是一种依赖DNA的RNA聚合酶(DDRP),该酶以DNA为模板,聚合一段RNA短链引物(primer),以提供自由的3-OH,使子代DNA链能够开始聚合。 引物酶需组装成引发体才能催化RNA引物的合成。3 3、引发体和、引发体和RNARNA引物引物第29页/共77页3 HO53 5 3 5 引物酶催化合成短链引物酶催化合成短链RNARNA引物分子引物分子 引物引物引物酶酶第30页/共77页4 4、DNADNA聚合酶聚合酶全称:依赖DNA的DNA聚合酶 (
11、 DNA-dependent DNA polymerase, DDDP )简称:DNA-pol活性:1. 53 的聚合酶活性 2. 核酸外切酶活性第31页/共77页 DNA连接酶(DNA ligase)可催化两段DNA片段之间磷酸二酯键的形成,从而把两段相邻的DNA链连接成一条完整的链。5 5、DNADNA连接酶连接酶第32页/共77页DNA连接酶连接酶ATP(NAD+)ADP+Pi(NMN+AMP)HO5POO-O-O353POO-O-O3553DNADNA连接酶的连接作用连接酶的连接作用第33页/共77页DNA复制过程简图复制过程简图第34页/共77页DNA连接酶在复制中起最后接合缺口的作
12、用。连接酶在复制中起最后接合缺口的作用。在在DNA修复、重组及剪接中也起缝合缺口作用。修复、重组及剪接中也起缝合缺口作用。是基因工程的重要工具酶之是基因工程的重要工具酶之一。一。DNA连接酶的作用连接酶的作用第35页/共77页 解螺旋酶(helicase) ,又称解链酶或rep蛋白,是用于解开DNA双链的酶蛋白。 每解开一对碱基,需消耗2分子ATP。6、解螺旋酶、解螺旋酶第36页/共77页 单链DNA结合蛋白(single strand binding protein, SSB),又称螺旋反稳蛋白(HDP),是一些能够与单链DNA结合的蛋白质因子。7 7、单链、单链DNADNA结合蛋白结合蛋白
13、第37页/共77页SSB的生理作用的生理作用 使解开双螺旋后的DNA单链能够稳定存在,即稳定单链DNA,便于其作为模板复制子代DNA; 保护单链DNA,避免核酸酶的降解。第38页/共77页8、DNA拓扑异构酶人类拓扑异构酶人类拓扑异构酶的分子结构的分子结构能够松解DNA超螺旋结构的酶。第39页/共77页1010 8 8 局部解链后局部解链后DNADNA复制过程中正超螺旋的形成复制过程中正超螺旋的形成第40页/共77页解链过程中正超螺旋的形成解链过程中正超螺旋的形成第41页/共77页拓扑异构酶的作用特点拓扑异构酶的作用特点既能水解既能水解 、又能连接磷酸二酯键、又能连接磷酸二酯键 拓扑异构酶拓扑
14、异构酶拓扑异构酶拓扑异构酶分分 类类第42页/共77页拓扑异拓扑异构酶构酶切断DNA双链中一股链,使DNA解链旋转不致打结;适当时候封闭切口,DNA变为松弛状态。反应不需ATP。拓扑异拓扑异构酶构酶切断DNA分子两股链,断端通过切口旋转使超螺旋松弛。利用ATP供能,连接断端, DNA分子进入负超螺旋状态。DNA拓扑异构酶的作用机制拓扑异构酶的作用机制 第43页/共77页1、复制的起始、复制的起始(三) DNA生物合成过程解旋解链,形成复制叉解旋解链,形成复制叉引发体组装和引物合成引发体组装和引物合成2、复制的延长、复制的延长DNA聚合酶第44页/共77页 5 5 3 35 5dATPdGTPd
15、TTPdCTPdTTPdGTPdATPdCTPOH 33 3DNA-polDNADNA复制的延长过程复制的延长过程第45页/共77页3 3、复制的终止、复制的终止 去除引物,填补缺口去除引物,填补缺口连接冈崎片段连接冈崎片段第46页/共77页 端粒(telomere)是指真核生物染色体线性DNA分子末端的结构部分,通常膨大成粒状。(四)真核生物端粒第47页/共77页功能 维持染色体的稳定性维持染色体的稳定性 保证保证DNA复制的完整性复制的完整性端粒的结构特点端粒的结构特点 由末端单链由末端单链DNA序列和蛋白质构成。序列和蛋白质构成。 末端末端DNA序列是多次重复的富含序列是多次重复的富含G
16、、T碱基碱基的短的短 序列。序列。TTTTGGGGTTTTGGGG第48页/共77页 线性线性DNA在复制完成后,其末端由于引物在复制完成后,其末端由于引物RNA的水解而可能出现缩短。故需要在端粒的水解而可能出现缩短。故需要在端粒酶(酶(telomerase)的催化下,进行延长反应。)的催化下,进行延长反应。5 3 3 5 5 3 3 5 第49页/共77页端粒酶端粒酶(telomerase)端粒酶是一种RNA-蛋白质复合体,它可以其RNA为模板,通过逆转录过程对末端DNA链进行延长。端粒酶的分子结构端粒酶的分子结构第50页/共77页端粒酶的爬行模型(动画演示)端粒酶的爬行模型(动画演示)第5
17、1页/共77页(五) 逆转录第52页/共77页1、逆转录病毒和逆转录酶、逆转录病毒和逆转录酶逆转录病毒细胞内的逆转录现象:RNA 模板模板逆转录酶逆转录酶DNA-RNA 杂杂化双链化双链RNA酶酶单链单链DNA逆转录酶逆转录酶双链双链DNA第53页/共77页2 2、逆转录研究的意义、逆转录研究的意义 逆转录酶和逆转录现象,是分子生物学研究中的重大发现。 逆转录现象说明:至少在某些生物,RNA同样兼有遗传信息传代与表达功能。对逆转录病毒的研究,拓宽了20世纪初已注意到的病毒致癌理论。 第54页/共77页 (一)(一)RNARNA的转录过程的转录过程:(略)(略) 转录起始转录起始 链的延伸链的延
18、伸 转录终止转录终止二、基因的转录与加工第55页/共77页(二)(二)RNARNA的转录后加工的转录后加工 在细胞内,由在细胞内,由RNARNA聚合酶合成的原初转录物(聚合酶合成的原初转录物(primary transcriptprimary transcript)往往需要一系列)往往需要一系列的变化,才转变为成熟的的变化,才转变为成熟的RNARNA分子。此过程总称为分子。此过程总称为RNARNA的成熟的成熟或称为或称为RNARNA的转录后加工。的转录后加工。第56页/共77页1 1、mRNAmRNA前体的加工前体的加工: 原核生物原核生物的的mRNAmRNA转录后转录后一般一般不需要加工,转
19、录的同时即进行翻译(半寿期短)。不需要加工,转录的同时即进行翻译(半寿期短)。亦有少数多顺反子的亦有少数多顺反子的mRNAmRNA需要核酸酶切成小单位,然后再翻译。需要核酸酶切成小单位,然后再翻译。 第57页/共77页 真核生物真核生物mRNAmRNA(半寿期较长)转录物很大,在加(半寿期较长)转录物很大,在加工过程中形成许多分子大小不等的中间物,它们工过程中形成许多分子大小不等的中间物,它们被称为被称为核内不均一核内不均一RNARNA(heterogeneous nuclear heterogeneous nuclear RNA, hnRNA)RNA, hnRNA),需要进一步进行加工修饰转
20、化为,需要进一步进行加工修饰转化为mRNAmRNA。加工包括:。加工包括: (1 1)hnRNAhnRNA被剪接,把内含子(被剪接,把内含子(DNADNA上非编码序列)上非编码序列)转录序列剪掉,把转录序列剪掉,把外显子外显子(DNADNA上的编码序列)转上的编码序列)转录序列录序列拼接拼接上上( (真核生物一般为不连续基因真核生物一般为不连续基因) )。 (2 2)3 3端添加端添加polyA polyA “尾巴尾巴”; (3 3)5 5端连接端连接“帽子帽子”结构(结构(m m7 7G G5 5 pppppp5 5 NmpNp-NmpNp-);); (4 4)分子内部的核苷酸甲基化修饰。)
21、分子内部的核苷酸甲基化修饰。第58页/共77页 2 2、tRNAtRNA前体的加工:原核与真核生物的原核与真核生物的tRNAtRNA转录后都需转录后都需要加工。要加工。3 3、 rRNArRNA前体的加工: 原核与真核生物的原核与真核生物的rRNArRNA转录后也都需要进行加工。转录后也都需要进行加工。原核:刚转录的原核:刚转录的rRNArRNA为为30S30S,先在特定的碱基上进行,先在特定的碱基上进行甲基化(核糖甲基化(核糖2 2 - -羟基)修饰,后逐步裂解。羟基)修饰,后逐步裂解。真核:真核:45S45S(哺乳动物)、(哺乳动物)、38S38S(果蝇)、(果蝇)、37S37S(酵母)(
22、酵母)第59页/共77页tRNAs are cleaved from transcripts of rRNA operons第60页/共77页三、蛋白质的翻译第61页/共77页1、遗传密码、遗传密码 (genetic code): DNA(或(或mRNA)中核苷酸序列与蛋白质中氨基酸序列之间的对应关系。)中核苷酸序列与蛋白质中氨基酸序列之间的对应关系。2、密码子、密码子(codon): mRNA上每上每3个相邻核苷酸编码多肽链中一个氨基酸,这三个核苷酸称一个密码子或个相邻核苷酸编码多肽链中一个氨基酸,这三个核苷酸称一个密码子或三联体密码。三联体密码。(一)遗传密码两个概念第62页/共77页3、
23、 遗传密码字典遗传密码字典第63页/共77页mRNA:蛋白质的蛋白质的DNA序列信息的中间体。序列信息的中间体。tRNA:运送特定氨基酸到核糖体上合成蛋白质。运送特定氨基酸到核糖体上合成蛋白质。rRNA:核糖体的组成元件。核糖体的组成元件。(二)蛋白质合成中使用的RNA第64页/共77页1、mRNA 是蛋白质合成的模板第65页/共77页原核生物mRNA与真核生物mRNA结构比较 核糖体可以不从核糖体可以不从mRNAmRNA上解离连续合成三个蛋白质上解离连续合成三个蛋白质Eukaryotic mRNAProkaryotic mRNA第66页/共77页2、 tRNA转运活化的氨基酸至mRNA模板上
24、 有有20种分子转换器,每种氨基酸一个种分子转换器,每种氨基酸一个3、 rRNA核糖体是蛋白质合成的工厂 核糖体得到分离后,发现含有核糖体得到分离后,发现含有RNA,即称即称rRNA。第67页/共77页(三)核糖体大小亚基的生物学功能小亚基: 通过密码子与反密码子的配对,识别并通过密码子与反密码子的配对,识别并结合模板结合模板mRNAmRNA,蛋白质合成中,蛋白质合成中A A位、位、P P位、位、E E位的一部分等。位的一部分等。大亚基: 结合多肽链结合多肽链,催化肽键形成、蛋白质合成中,催化肽键形成、蛋白质合成中A A位、位、P P位、位、E E位的一部分等。位的一部分等。第68页/共77页 mRNA结合部位;结合部位; 结合结合AA-tRNA部位(部位(A位);位); 结合肽基结合肽基 tRNA部位(部位(P位);位); 空载空载tRNA移出部位(移出部位(E位);位); 形成肽键的部位。形成肽键的部位。 此外,还有用于
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