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1、第六章:细胞内功能区隔与第六章:细胞内功能区隔与蛋白质分选蛋白质分选 与原核细胞物不同的是真核细胞具有复杂的由内膜构成的功能功能区隔区隔。细胞内膜系统细胞内膜系统指在结构,功能或发生上相关的细胞内膜形成的细胞结构,包括核被膜、内质网、高尔基体及其形成的溶酶体和分泌泡等,以及其它细胞器如线粒体,质体和过氧化物酶体等膜包围的细胞器(膜性细胞器) 。 内膜系统形成了一种胞内网络结构,其功能功能主要在于两个方面:其一是扩大膜的总面积,为酶提供附着的支架,如脂肪代谢、氧化磷酸化相关的酶都结合在细胞膜上。其二是将细胞内部区分为不同的功能区域,保证各种生化反应所需的独特的环境。 第一节第一节 蛋白质分选的基

2、本原理蛋白质分选的基本原理 从系统发生来看内膜系统起源于质膜的内陷和内共生(线粒体、叶绿体),从个体发生来看新细胞的内膜系统来源于原有内膜系统的分裂。 细胞不能从无到有产生所有膜性细胞器,新的膜性细胞器来源于已存在细胞器的分裂。 细胞内合成的蛋白质、脂类等物质之所以能够定向的转运到特定的细胞器取决于两个方面两个方面:其一是蛋白质中包含特殊的信号序列(signal sequence or targeting sequence ),其二是细胞器上具特定的信号识别装置(分选受体,sorting receptor),因此内膜系统的发生具有核外遗传(epigenetic)的特性 一、蛋白质分选信号一、蛋

3、白质分选信号细胞类至少存在两类蛋白质分选的信号两类蛋白质分选的信号(图6-1):信号序列(signal sequence):存在于蛋白质一级结构上的线性序列,通常15-60个氨基酸残基,有些信号序列在完成蛋白质的定向转移后被信号肽酶(signal peptidase)切除.信号斑(signal patch):存在于完成折叠的蛋白质中,构成信号斑的信号序列之间可以不相邻,折叠在一起构成蛋白质分选的信号。图6-1 两类分选信号 蛋白质分选信号的作用是:蛋白质分选信号的作用是:引导蛋白质从胞质溶胶进入内质网、线粒体、叶绿体和过氧化物酶体,也可以引导蛋白质从细胞核进入细胞质或从Golgi体进入内质网。

4、 这种分选信号的氨基酸残基有时呈线性排列,有时折叠成信号斑,如引导蛋白质定向运输到溶酶体的信号斑,是溶酶体酸性水解酶被高尔基体选择性加工的标识。功能功能信号序列信号序列输入细胞核输入细胞核-Pro-Pro-Lys-Lys-Lys-Arg-Lys-Val-输出细胞核输出细胞核-Leu-Ala-Leu-Lys-Leu-Ala-Gly-Leu-Asp-Ile-输入线粒体输入线粒体+H3N-Met-Leu-Ser-Leu-Arg-Gln-Ser-Ile-Arg-Phe-Phe-Lys-Pro- Ala-Thr-Arg-Thr-Leu-Cys-Ser-Ser-Arg-Tyr-Leu-Leu-输入质体输入

5、质体+H3N-Met-Val-Ala-Met-Ala-Met-Ala-Ser-Leu-Gln-Ser-Ser-Met- Ser-Ser-Leu-Ser-Leu-Ser-Ser-Asn-Ser-Phe-Leu- Gly-Gln-Pro- Leu-Ser-Pro-Ile-Thr-Leu-Ser-Pro-Phe-Leu- Gln-Gly-输入过氧化物酶体输入过氧化物酶体-Ser-Lys-Leu-COO-输入内质网输入内质网+H3N-Met-Met-Ser-Phe-Val-Ser-Leu-Leu-Leu-Val-Gly-Ile-Leu- Phe-Trp-Ala-Thr-Glu-Ala-Glu-Gln-

6、Leu-Thr-Lys-Cys- Glu-Val- Phe-Gln-返回内质网返回内质网-Lys-Asp-Glu-Leu-COO-(KDEL)由质膜到内体由质膜到内体Tyr-X-X-表表1 一些典型的分选信号一些典型的分选信号 每一种信号序列决定特殊的蛋白质转运方向,如输入内质网的蛋白质通常N端具有一段信号序列,含有6-15个带正电荷的非极性氨基酸。由高尔基体返回内质网的蛋白质,其C端的四个氨基序列,一些已知的分选信号见表1。目前对于信号斑了解较少,主要是因为它存在于复杂的三维结构中,很难将其分离出来研究。二、蛋白质分选运输的途径二、蛋白质分选运输的途径蛋白质的分选运输途径主要有三类:1、门控

7、运输门控运输(gated transport):如核孔可以选择性的主动运输大分子物质和RNP复合体,并且允许小分子物质自由进出细胞核。2、跨膜运输跨膜运输(transmembrane transport):蛋白质通过跨膜通道进入目的地。 3、膜泡运输膜泡运输(vesicular transport):蛋白质被选择性地包装成运输小泡,定向转运到靶细胞器。 这几种运输机制都涉及信号序列的引导和靶细胞器上受体蛋白的识别。第二节第二节 膜泡运输膜泡运输 细胞内部内膜系统各个部分之间的物质传递常常通过膜泡膜泡运输运输方式进行。 膜泡运输是一种高度有组织的定向运输定向运输,各类运输泡之所能够被准确地运到靶

8、细胞器,主要是因为细胞器的胞质面具有特殊的膜标志蛋白。许多膜标志蛋白存在于不止一种细胞器,可见不同的膜标志蛋白组合,决定膜的表面识别特征。 大多数运输小泡是在膜的特定区域以出芽的方式产生的。其表面具有一个笼子状的由蛋白质构成的衣被衣被(coat)。 衣被具有两个主要作用两个主要作用:选择性的将特定蛋白聚集在一起,形成运输小泡;如同模具一样决定运输小泡的外部特征,相同性质的运输小泡之所以具有相同的形状和体积,与衣被蛋白的组成有关。 胞内膜泡运输沿微管或微丝运行,动力来自马达蛋白马达蛋白(motor proteins)。与膜泡运输有关的马达蛋白有马达蛋白有3类类:一类是动力蛋白(dynein),可

9、向微管负端移动;另一类为驱动蛋白(kinesin),可牵引物质向微管的正端移动;第三类是肌球蛋白(myosin),可向微丝的正极运动。在马达蛋白的作用下,可将膜泡转运到特定的区域。一、衣被类型一、衣被类型 已知三类具有代表性的衣被蛋白,即:笼形蛋白笼形蛋白(clathrin)、COPI和COPII,各介导不同的运输途径(表2)。衣被类型GTP酶组成与衔接蛋白运输方向clathrinArfClathrin重链与轻链,AP2质膜内体Clathrin重链与轻链,AP1高尔基体内体Clathrin重链与轻链,AP3高尔基体溶酶体高尔基体植物液泡COP IArfCOP高尔基体内质网COP IISar 1

10、Sec23/Sec24复合体,Sec 13/31复合体, Sec 16,Sec 12内质网高尔基体表表2 衣被小泡的类型与功能衣被小泡的类型与功能(一)笼形蛋白衣被小泡(一)笼形蛋白衣被小泡 笼形蛋白衣被小泡是最早发现的衣被小泡,介导高尔基体到内体、溶酶体、植物液泡的运输,以及质膜到内膜区隔的膜泡运输。 笼形蛋白分子由3个重链和3个轻链组成(图6-2),形成一个具有3个曲臂的形状(triskelion)。许多笼形蛋白的曲臂部分交织在一起,形成一个具有5边形网孔的笼子(图6-3)。图6-2 笼形蛋白的结构,A电镜照片,B分子模型,C衣被模型 图6-3 笼形蛋白衣被小泡的形态 笼形蛋白形成的衣被中

11、还有衔接蛋白衔接蛋白(adaptin)。它介于笼形蛋白与配体受体复合物之间,起连接作用(图6-4)。目前至少发现4种不同类型的衔接蛋白,可分别结合不同类型的受体,形成不同性质的转运小泡,如AP1参与高尔基体内体的运输、AP2参与质膜内体的运输、AP3参与高尔基体溶酶体的运输。图6-4 笼形衣被小泡的组成 当笼形蛋白衣被小泡形成时,可溶性蛋白动力素(dynamin)聚集成一圈围绕在芽的颈部(图6-5),将小泡柄部的膜尽可能地拉近(小于1.5nm),从而导致膜融合,掐断掐断(pinch off)衣被小泡。当衣被小泡从膜上释放后,衣被很快就解体 。图6-5 Clathrin衣被小泡的掐断过程 (二)

12、(二) COP I 衣被小泡衣被小泡 负责回收、转运内质网逃逸蛋白(负责回收、转运内质网逃逸蛋白(escaped proteins)返回内)返回内质网质网(图6-6、7)。起初发现于高尔基体碎片,在含有ATP的溶液中温育时,能形成非笼形蛋白包被的小泡。进一步的研究发现这种衣被蛋白复合体包含多达7种肽链。图6-6 COP I 衣被小泡的形态内质网向高尔基体输送运输小泡时,一部分自身的蛋白质也不可避免的被运送到了高尔基体,如不进行回收则内质网因为磷脂和某些蛋白质的匮乏而停止工作。内质网通过两种机制维持蛋白质的平衡 :一是转运泡将应被保留的驻留蛋白排斥在外,二是通过对逃逸蛋白的回收机制,使之返回它们

13、正常驻留的部位。 内质网的正常驻留蛋白,不管在腔中还是在膜上,它们在C端含有一段回收信号序列回收信号序列(retrieval signals),如果它们被意外地逃逸进入转运泡从内质网运至高尔基体cis面,则cis面的膜结合受体蛋白将识别并结合逃逸蛋白的回收信号,形成COPI衣被小泡将它们返回内质网。内质网腔中的蛋白,如蛋白二硫键异构酶和协助折叠的分子伴侣,均具有典型的回收信号Lys-Asp-Glu-Leu(KDEL,图6-8)。内质网的膜蛋白(如SRP受体)在C端有一个不同的回收信号,通常是Lys-Lys-X-X(KKXX,X:任意氨基酸),同样可保证它们的回收。 COP I衣被小泡还可以介导

14、高尔基体不同区域间的蛋白质运输。图6-7 COPI和COPII衣被小泡 图6-8 KDEL序列 (三)(三)COP衣被小泡衣被小泡 介导从内质网到高尔基体的物质运输。介导从内质网到高尔基体的物质运输。 COP II衣被由多种蛋白质构成(参见表2),其中Sar1GTP酶与Sec23/Sec24复合体结合在一起,形成紧紧包围着膜的一层衣被,Sec13/Sec31复合体形成覆盖在外围的一层衣被,Sec16推测可能是一种骨架蛋白,Sec12是Sar1的鸟苷酸交换因子。 真核生物的COP II衣被蛋白亚单位具有一些横向同横向同源物源物(Paralog)这些同源物可能介导不同的蛋白质转运,具有不同的调节机

15、制。 COP II衣被小泡形成与内质网的特殊部位,称为内内质网出口质网出口(exit sites),这些部位没有核糖体,由交织在一起的管道和囊泡组成网络结构 。 由内质网到高尔基体的蛋白转运中,大多数跨膜蛋白是直接结合在COP II衣被上,但是少数跨膜蛋白和多数可溶性蛋白通过受体与COP II衣被结合,这些受体在完成转运后,通过COP I衣被小泡返回内质网。 COP II衣被所识别的分选信号位于跨膜蛋白胞质面的结构域,形式多样,有些包含双酸性基序DEXDE(D为Asp,E为Glu,X为任何一种氨基酸),如Asp-X-Glu序列,其他一些具有短的疏水基序,如FF,YYM,FY,LL,IL等等(其

16、中F为Phe,Y为Tyr,M为Met,L为Leu,I为Ile)。二、衣被的形成二、衣被的形成 衣被是在一类叫作衣被召集衣被召集GTP酶酶(coat-recruitment GTPase)作用下形成的。衣被召集GTP酶通常为单体GTP酶(monomeric GTPase),也叫G蛋白蛋白,起分子开关的作用,结合GDP的形式没有活性,位于细胞质中,结合GTP而活化,转位至膜上,能与衣被蛋白结合,促进核化和组装。 G蛋白具有两类重要的调节蛋白,即:鸟苷酸交换因子鸟苷酸交换因子(guanine-nucleotide exchange factor, GEF)和GTP酶激活蛋白酶激活蛋白(GTPase

17、activating protein, GAP)。GEF的作用是使G蛋白释放GDP,结合GTP而激活。GAP的作用是激活G蛋白的酶活性,使GTP水解,G蛋白失活,G蛋白本身的GTP酶活性不高。除单体G蛋白以外,三聚体G蛋白也起分子开关的作用,控制衣被小泡的形成。 衣被召集GTP酶包括Arf蛋白和Sar 1蛋白(图6-9),Arf参与高尔基体上笼形蛋白衣被与COP I衣被的形成,Sar 1参与内质网上COP II衣被的形成,两者的作用方式大体相似。 图6-9 COP II衣被小泡的组装 衣被召集GTP酶大量存在于细胞质中,但处于结合GDP的失活状态。当内质网上要形成COPII衣被小泡时,Sar

18、1释放GDP结合GTP而激活,激活的Sar 1暴露出一条脂肪酸的尾巴,插入内质网膜,然后开始召集衣被蛋白,以衣被蛋白为模型形成运输小泡。活化的衣被召集GTP酶还可以激活磷脂酶D(phospholipase D),将一些磷脂水解,使形成衣被的蛋白质牢固地结合在膜上。衣被召集GTP酶对衣被的形成起动态调节作用,当多数衣被召集GTP酶处于结合GTP的状态时,它催化衣被的形成;反之当多数衣被召集GTP酶处于结合GDP的状态时,它催化衣被的解体。因此衣被的形成过程是边形成便解体的动态过程,只有在组装速率大于解体速率时,才能形成衣被小泡。三、膜泡运输的定向机制三、膜泡运输的定向机制 衣被小泡沿着细胞内的微

19、管被运输到靶细胞器,马达蛋白水解ATP提供运输的动力。各类运输小泡之所以能够被准确地和靶膜融合,是因为运输小泡表面的标志蛋白能被靶膜上的受体识别,其中涉及识别过程的两类关键性的蛋白质是SNAREs(soluble NSF attachment protein receptor)和Rabs(targeting GTPase)。其中SNARE介导运输小泡特异性停泊和融合,Rab的作用是使运输小泡靠近靶膜。(一)(一)SNAREsSNAREs SNAREs的作用是保证识别的特异性和介导运输小泡与目标膜的融合,动物细胞中已发现20多种SNAREs,分别分布于特定的膜上,位于运输小泡上的叫作v-SNAR

20、Es,位于靶膜上的叫作t-SNAREs(图6-10)。v-SNAREs和 t-SNAREs都具有一个螺旋结构域,能相互缠绕形成跨SNAREs复合体(trans-SNAREs complexes,图6-11),并通过这个结构将运输小泡的膜与靶膜拉在一起,实现运输小泡特异性停泊和融合。实验证明包含了SNARE的脂质体和包含匹配SNARE的脂质体间可发生融合,尽管速度较慢。这说明除了SNARE之外,还有其他的蛋白参与运输泡与目的膜的融合。 图6-10 t-和v-SNARE引自Molecular Biology of the Cell. 4th ed. 2002 图6-11 SNARE复合体 引自Mo

21、lecular Biology of the Cell. 4th ed. 2002 在SNAREs接到新一轮的运输小泡停泊之前,SNAREs必须以分离的状态存在,NSF(N-ethylmaleimide-sensitive fusion protein, NSF)催化 SNAREs的分离,它是一种类似分子伴娘的ATP酶,能够利用ATP作为能量通过插入几个适配蛋白(adaptor protein)将SNAREs复合体的螺旋缠绕分开(图6-12)。 图6-12 SNARE复合体的解离 引自Molecular Biology of the Cell. 4th ed. 2002 在神经细胞中SNARE

22、s负责突触小泡的停泊和融合,破伤风毒素和肉毒素等细菌分泌的神经性毒素实际上是一类特殊的蛋白酶,能够选择性地降解SNAREs,从而阻断神经传导。精卵的融合、成肌细胞的融合均涉及SNAREs,另外病毒融合蛋白的工作原理与SNAREs相似,介导病毒与宿主质膜的融合(图6-13)。 图6-13 病毒融合蛋白的工作原理 引自Molecular Biology of the Cell. 4th ed. 2002 (二)(二)RabsRabs Rab也叫targeting GTPase,属于单体GTP酶,结构类似于Ras,已知30余种。不同膜上具有不同的Rab,每一种细胞器至少含有一种以上的Rab。Rabs

23、的作用是促进和调节运输小泡的停泊和融合。与衣被召集GTP酶相似的是,起分子开关作用,结合GDP失活,位于细胞质中,结合GTP激活,位于细胞膜、内膜和运输小泡膜上,调节SNAREs复合体的形成。Rabs的调节蛋白与其它G蛋白的相似。Rabs还有许多效应因子(effector),其作用是帮助运输小泡聚集和靠近靶膜,触发SNAREs释放它的抑制因子(图6-14)。许多运输小泡只有在包含了特定的Rabs和SNAREs之后才能形成。 图6-14 Rab的作用 引自Molecular Biology of the Cell. 4th ed. 2002 四、细胞的内吞与外排四、细胞的内吞与外排 (一)受体介

24、导的内吞(一)受体介导的内吞细胞的内吞可分为两类,批量内吞(Bulk-phase endocytosis)和受体介导的内吞(Receptor mediated endocytosis, RME),批量内吞是非特异性的摄入细胞外物质,如培养细胞摄入辣根过氧化物酶。细胞表面的内陷(caveolae)是发生非特异性内吞的部位。受体介导的内吞作用是一种选择浓缩机制,既可保证细胞大量地摄入特定的大分子,同时又避免了吸入细胞外大量的液体。低密脂蛋白、运铁蛋白、生长因子、胰岛素等蛋白类激素、糖蛋白等,都是通过受体介导的内吞作用进行的。衣被小窝(coated pits)是质膜向内凹陷的部位,约占肝细胞和成纤维

25、细胞膜表面积的2%。受体大量集中于此处,凹陷的胞质侧具有大量的笼形蛋白和衔接蛋白,类似的结构也存在于高尔基体的TGN区。受体在衣被小窝处的集中与是否结合配体无关。衣被小窝就相当一个分子过滤器(molecular filter),帮助细胞获取所需要的大分子物质。 运输小泡的衣被中,除笼形蛋白外,还有衔接蛋白(adaptin)。它介于笼形蛋白与配体受体复合物之间,起连接作用。衔接蛋白存在有不同的种类,可分别结合不同类型的受体。跨膜受体蛋白的胞质端有一个由4个氨基酸残基组成的序列(Tyr-X-X-),此序列是发生内吞作用的信号,X表示任何一种氨基酸,为分子较大的疏水氨基酸,如Phe、Leu、Met等

26、,衔接蛋白对此序列有识别能力。受体同配体结合后启动内化作用,笼形蛋白开始组装。在dynamin的作用下掐断后形成衣被小泡(coated vesicles)。衣被小泡进入胞质后,衣被蛋白随即脱去,分子返回到质膜下方,重又参与形成新的衣被小泡。其过程和高尔基体的TGN区形成溶酶体小泡的过程相似。胆固醇主要在肝细胞中合成,随后与磷脂和蛋白质形成低密脂蛋白(low-density lipoproteins,LDL),释放到血液中。LDL颗粒的质量为3X106Da,直径2030nm,芯部含有大约1500个胆固醇分子,这些胆固醇分子被酯化成长链脂肪酸。芯部周围由一脂单层包围,脂单层包含磷脂分子和未酯化的胆

27、固醇以及一个非常大的单链糖蛋白质 (apolipoprotein B-100),这个蛋白质分子可以和靶膜上的受体结合(图6-15)。 图6-15 LDL的结构 当细胞进行膜合成需要胆固醇时,细胞即合成LDL跨膜受体蛋白,并将其嵌插到质膜中。受体与LDL颗粒结合后,形成衣被小泡;进入细胞质的衣被小泡随即脱掉笼形蛋白衣被,成为平滑小泡,同早期内体融合,内体中PH值低,使受体与LDL颗粒分离;再经晚期内体将LDL送人溶酶体。在溶酶体中,LDL颗粒中的胆固醇酯被水解成游离的胆固醇而被利用(图6-16、17A、18)。细胞对胆固醇的利用具有调节能力,当细胞中的胆固醇积累过多时,细胞即停止合成自身的胆固醇

28、,同时也关闭了LDL受体蛋白的合成途径,暂停吸收外来的胆固醇。有的人因为LDL受体蛋白编码的基因有遗传缺陷,造成血液中胆固醇含量过高(图6-17B),因而会过早地患动脉粥样硬化症(atherosclerosis),这种人往往因易患冠心病而英年早逝。 图6-16 LDL的内吞 图6-17 clathrin 衣被的组装,异常的受体不能形成包含货物的运输小泡 引自Molecular Biology of the Cell. 4th ed. 2002图6-18 受体介导的内吞 引自Molecular Biology of the Cell. 4th ed. 2002 在受体介导的内吞作用过程中,不同类

29、型的受体具有不同的胞内体分选途径:大部分受体返回它们原来的质膜结构域,如LDL受体又循环到质膜再利用;有些受体不能再循环而是最后进入溶酶体,在那里被消化,如与表皮生长因子(epidermal growth factor,EGF)结合的细胞表面受体,大部分在溶酶体被降解,从而导致细胞表面EGF受体浓度降低,称为受体下行调节(receptor down-regulation);有些受体被运至质膜不同的结构域,该过程称作穿胞运输(transcytosis,图6-19)。在具有极性的上皮细胞,这是一种将内吞作用与外排作用相结合的物质跨膜转运方式,即转运的物质通过内吞作用从上皮细胞的一侧被摄人细胞,再通

30、过外排作用从细胞的另一侧输出。如母鼠的抗体从血液通过上皮细胞进入母乳中,乳鼠肠上皮细胞将抗体摄人体内,都是通过跨细胞的转运完成的。 图6-19 穿胞运输 引自Molecular Biology of the Cell. 4th ed. 2002 (二)外排作用(二)外排作用与细胞的内吞作用相反,外排作用是将细胞内的分泌泡或其他某些膜泡中的物质通过细胞质膜运出细胞的过程。组成型的外排途径(constitutive exocytosis pathway):所有真核细胞都有从高尔基体TGN区分泌囊泡向质膜运输的过程,其作用在于更新膜蛋白和膜脂、形成质膜外周蛋白、细胞外基质、或作为营养成分和信号分子。

31、调节型外排途径(regulated exocytosis pathway):分泌细胞产生的分泌物(如激素、粘液或消化酶)储存在分泌泡内,当细胞在受到胞外信号刺激时,分泌泡与质膜融合并将内含物释放出去。调节型的外排途径存在于特化的分泌细胞。其蛋白分选信号存在于蛋白本身,由高尔基体TGN上特殊的受体选择性地包装为运输小泡。组成型的外排途径通过default pathway完成蛋白质的转运过程。在粗面内质网中合成的蛋白质除了某些有特殊标志的蛋白驻留在ER或高尔基体中或选择性地进入溶酶体和调节性分泌泡外,其余的蛋白均沿着粗面内质网高尔基体分泌泡细胞表面这一途径完成其转运过程。 第三节 内质网 由KR.

32、 Porter、A. Claude 和 EF. Fullam等人于1945年发现,他们在观察培养的小鼠成纤维细胞时,发现细胞质内部具有网状结构,建议叫做内质网endoplasmic reticulum,ER,后来发现内质网不仅仅存在于细胞的“内质”部,通常还有质膜和核膜相连,并且与高尔基体关系密切,并且常伴有许多线粒体。 一、形态与组成一、形态与组成内质网膜约占细胞总膜面积的一半,是真核细胞中最多的膜。内质网是内膜构成的封闭的网状管道系统。具有高度的多型性。可分为粗面型内质网(rough endoplasimic reticulum,RER,图6-20)和光面型内质网(smooth endop

33、lasimic reticulum,SER,图6-21)两类。RER呈扁平囊状,排列整齐,膜围成的空间称为ER腔(lumen),膜外有核糖体附着。SER呈分支管状或小泡状,无核糖体附着。肌肉细胞中的肌质网是一种特化的SER,称为肌质网,可贮存Ca2+,引起肌肉收缩。细胞不含纯粹的RER或SER,它们分别是ER连续结构的一部分。 图6-20 RER的形态 图6-21 SER的形态 引自http:/www.uni-mainz.de 二、二、RER的功能的功能 (一)蛋白质合成(一)蛋白质合成 蛋白质都是在核糖体上合成的,并且起始于细胞质基质,但是有些蛋白质在合成开始不久后便转在内质网上合成,这些蛋

34、白质主要有:向细胞外分泌的蛋白、如抗体、激素;跨膜蛋白,并且决定膜蛋白在膜中的排列方式;需要与其它细胞组合严格分开的酶,如溶酶体的各种水解酶;需要进行修饰的蛋白,如糖蛋白。 C. Milstein(1972)发现从骨髓瘤细胞提取的免疫球蛋白分子N端要比分泌到细胞外的N端多出一段。G. Blobel和D. Sabatini等根据进一步的实验,提出了信号假说(Signal hypothesis),认为蛋白质上的信号肽,指导蛋白质转至内质网上合成。Blobel因此项发现获1999年诺贝尔生理医学奖。 1999年,美国科学家古特布洛伯尔(Gnter Blobel)“因发现蛋白质具有控制其在细胞内转运和

35、定位的内在信号(for the discovery that proteins have intrinsic signals that govern their transport and localization in the cell)”而获得诺贝尔生理学或医学奖。1999年诺贝尔生理学奖年诺贝尔生理学奖蛋白质转入内质网合成至少涉及5种成分:信号肽(signal peptide),是引导新合成肽链转移到内质网上的一段多肽,位于新合成肽链的N端,一般1630个氨基酸残基,含有6-15个带正电荷的非极性氨基酸,由于信号肽又是引导肽链进入内质网腔的一段序列,又称开始转移序列(start tran

36、sfer sequence)。信号识别颗粒(signal recognition particle,SRP),由6种结构不同的多肽组成,结合一个7S RNA,分子量325KD,属于一种核糖核蛋白(ribonucleoprotein)。SRP与信号序列结合,导致蛋白质合成暂停。 SRP受体(SPR receptor),是膜的整合蛋白,为异二聚体蛋白,存在于内质网上,可与SRP特异结合。停止转移序列(stop transfer sequence),肽链上的一段特殊序列,与内质网膜的亲合力很高,能阻止肽链继续进入内质网腔,使其成为跨膜蛋白质。转位因子(translocator),由3-4个Sec61

37、蛋白复合体构成的一个类似炸面圈的结构,每个Sec61蛋白由三条肽链组成。 蛋白质转入内质网合成的过程:信号肽与SRP结合肽链延伸终止SRP与受体结合SRP脱离信号肽肽链在内质网上继续合成,同时信号肽引导新生肽链进入内质网腔信号肽切除肽链延伸至终止翻译体系解散。这种肽链边合成边向内质网腔转移的方式,称为co-translation(图6-22)。 图6-22 蛋白质转移到内质网上合成的过程 表3 一些信号肽序列 蛋白质蛋白质信号序列信号序列Preproalbumin Met-Lys-Trp-Val-Thr-Phe-Leu-Leu-Leu-Leu-Phe-Ile-Ser- Gly-Ser-Ala-

38、Phe-SerArg Pre-IgG light chain Met-Asp-Met-Arg-Ala-Pro-Ala-Gln-Ile-Phe-Gly-Phe-Leu- Leu-Leu-Leu-Phe-Pro-Gly- Thr-Arg-CysAsp Prelysozyme Met-Arg-Ser-Leu-Leu-Ile-Leu-Val-Leu-Cys-Phe-Leu- Pro-Leu-Ala-Ala-Leu-GlyLys (二)蛋白质的修饰与加工(二)蛋白质的修饰与加工 包括糖基化、羟基化、酰基化、二硫键形成等,其中最主要的是糖基化,几乎所有内质网上合成的蛋白质最终被糖基化。糖基化的作用是: 使

39、蛋白质能够抵抗消化酶的作用;赋予蛋白质传导信号的功能;某些蛋白只有在糖基化之后才能正确折叠。 糖基一般连接在4种氨基酸上,分为2种:O-连接的糖基化(O-linked glycosylation):与Ser、Thr和Hyp的OH连接,连接的糖为半乳糖或N-乙酰半乳糖胺,在高尔基体上进行O-连接的糖基化。 N-连接的糖基化(N-linked glycosylation):与天冬酰胺残基的NH2连接,糖为N-乙酰葡糖胺(图6-23)。 图6-23 N-连接的糖基化 引自Molecular Biology of the Cell. 4th ed. 2002 (三)新生肽链的折叠、组装和运输(三)新生

40、肽链的折叠、组装和运输 COP II介导由内质网输出的膜泡运输,这种膜泡由内质网的排出位点(exit sites)以出芽的方式排出,内质网的排出位点没有结合核糖体,随机分布在内质网上。不同的蛋白质在内质网腔中停留的时间不同,主要取决于蛋白质完成正确折叠和组装的时间,这一过程是在属于hsp70家族的ATP酶的作用下完成的,需要消耗能量。有些无法完成正确折叠的蛋白质被输出内质网,转入溶酶体中降解掉,大约90%的新合成的T细胞受体亚单位和乙酰胆碱受体都被降解掉,而从未到达靶细胞膜。 三、三、ER的其它功能的其它功能 合成膜脂: 解毒作用: 甾体类激素的合成: 调节血糖浓度: 形成一些特殊结构: 支撑

41、作用: 第四节 高尔基体 一、形态与组成一、形态与组成 是由数个扁平囊泡堆在一起形成的高度有极性的细胞器。常分布于内质网与细胞膜之间,呈弓形或半球形,凸出的一面对着内质网称为形成面(forming face)或顺面(cis face)。凹进的一面对着质膜称为成熟面(mature face)或反面(trans face)。顺面和反面都有一些或大或小的运输小泡(图6-24),在具有极性的细胞中,高尔基体常大量分布于分泌端的细胞质中 图6-24 高尔基体各部分的名称 图6-25 培养的上皮细胞中高尔基体的分布(高尔基体为红色,核为绿色) 引自/ 二、功能区

42、隔二、功能区隔 高尔基体顺面的网络结构(cis Golgi network,CGN),是高尔基体的入口区域,接受由内质网合成的物质并分类后转入中间膜囊。 高尔基体中间膜囊(medial Gdgi),多数糖基修饰,糖脂的形成以及与高尔基体有关的糖合成均发生此处。 高尔基体反面的网络结构(trans Golgi network,TGN),由反面一侧的囊泡和网管组成,是高尔基体的出口区域,功能是参与蛋白质的分类与包装,最后输出。 图6-26 高尔基体的三个功能区域 高尔基体各部分膜囊具有不同的细胞化学反应:嗜锇反应,经锇酸浸染后,高尔基体的cis面膜囊被特异地染色;焦磷酸硫胺素酶(TPP酶)的细胞化

43、学反应,可特异地显示高尔基体的trans面的12层膜囊;烟酰胺腺嘌呤二核苷磷酸酶(NADP酶)的细胞化学反应,是高尔基体中间几层扁平囊的标志反应;胞嘧啶单核苷酸酶(CMP酶)的细胞化学反应,常常可显示靠近trans面上的一些膜囊状和管状结构,CMP酶也是溶酶体的标志酶,溶酶体就是在此处分泌产生的。 三、主要功能三、主要功能 高尔基体的主要功能将内质网合成的蛋白质进行加工、分类、与包装,然后分门别类地送到细胞特定的部位或分泌到细胞外。 1、蛋白质的糖基化 N-连接的糖链合成起始于内质网,完成与高尔基体。 O-连接的糖基化在高尔基体中进行,通常的一个连接上去的糖单元是N-乙酰半乳糖,连接的部位为S

44、er、Thr和Hyp的OH基团,然后逐次将糖基转移到上去形成寡糖链,糖的供体同样为核苷糖,如UDP-半乳糖。糖基化的结果使不同的蛋白质打上不同的标记,改变多肽的构象和增加蛋白质的稳定性。 2、参与细胞分泌活动参与细胞分泌活动 负责对细胞合成的蛋白质进行加工,分类,并运出,其过程是SER上合成蛋白质进入ER腔以出芽形成囊泡进入CGN在medial Gdgi中加工在TGN形成囊泡囊泡与质膜融合、排出。 高尔基体对蛋白质的分类,依据的是蛋白质上的信号肽或信号斑。 3、进行膜的转化功能进行膜的转化功能 高尔基体的膜无论是厚度还是在化学组成上都处于内质网和质膜之间,因此高尔基体在进行着膜转化的功能,在内

45、质网上合成的新膜转移至高尔基体后,经过修饰和加工,形成运输泡与质膜融合,使新形成的膜整合到质膜上。 4、将蛋白水解为活性物质将蛋白水解为活性物质 如将蛋白质N端或C端切除,成为有活性的物质(胰岛素C端)或将含有多个相同氨基序列的前体水解为有活性的多肽,如神经肽。 5、参与形成溶酶体。参与形成溶酶体。 6、参与植物细胞壁的形成参与植物细胞壁的形成。 7、合成植物细胞壁中的纤维素和果胶质合成植物细胞壁中的纤维素和果胶质。 第五节 溶酶体与过氧化物酶体 一、溶酶体的结构一、溶酶体的结构 1955年de Duve与Novikoff首次发现溶酶体(lysosome)。它是单层膜围绕、内含多种酸性水解酶类

46、的囊泡状细胞器,其主要功能是进行细胞内消化。 具有异质性,形态大小及内含的水解酶种类都可能有很大的不同,标志酶为酸性磷酸酶。根据完成其生理功能的不同阶段可分为初级溶酶体(primary lysosome),次级溶酶体(secondary lysosome)和残体(residual body)。 1、初级溶酶体 直径约0.20.5um膜厚7.5nm,内含物均一,无明显颗粒,是高尔基体分泌形成的 图6-27 初级溶酶体 引自http:/www.uni-mainz.de 2、次级溶酶体 这些都是消化泡(图6-28),正在进行或完成消化作用的溶酶体,内含水解酶和相应的底物,可分为异噬溶酶体(phago

47、lysosome)和自噬溶酶体(autophagolysosome),前者消化的物质来自外源,后者消化的物质来自细胞本身的各种组分。 图6-28 次级溶酶体 引自http:/www.uni-mainz.de 3、残体 又称后溶酶体(post-lysosome)已失去酶活性,仅留未消化的残渣故名,残体可通过外排作用排出细胞,也可能留在细胞内逐年增多,如肝细胞中的脂褐质(图6-29)。 图6-29 肝细胞中的脂褐质 引自细胞生物学超微结构图谱1989 二、溶酶体的功能二、溶酶体的功能 溶酶体的主要作用消化作用,是细胞内的消化器官,细胞自溶,防御以及对某些物质的利用均与溶酶体的消化作用有关。1 细胞

48、内消化:对高等动物而言细胞的营养物质主要来源于血液中的水分子物质,而一些大分子物质通过内吞作用进入细胞,如内吞低密脂蛋白获得胆固醇,对一些单细胞真核生物,溶酶体的消化作用就更为重要了。2 细胞凋亡:个体发生过程中往往涉及组织或器官的改造或重建,如昆虫和蛙类的变态发育等等。这一过程是在基因控制下实现的,称为程序性细胞死亡,注定要消除的细胞以出芽的形式形成凋亡小体,被巨噬细胞吞噬并消化。3 自体吞噬:清除细胞中无用的生物大分子,衰老的细胞器等,如许多生物大分子的半衰期只有几小时至几天,肝细胞中线粒体的平均寿命约10天左右。4 防御作用:如巨噬细胞可吞入病原体,在溶酶体中将病原体杀死和降解。5 参与

49、分泌过程的调节,如将甲状腺球蛋白降解成有活性的甲状腺素。 6 形成精子的顶体:顶体相当于一个化学钻,可溶穿卵子的皮层,使精子进入卵子。 三、溶酶体的发生三、溶酶体的发生 初级溶酶体是在高尔基体的trans面以出芽的形式形成的,其形成过程如下。 内质网上核糖体合成溶酶体蛋白进入内质网腔进行N-连接的糖基化修饰进入高尔基体Cis面膜囊N-乙酰葡糖胺磷酸转移酶识别溶酶体水解酶的信号斑将N-乙酰葡糖胺磷酸转移在12个甘露糖残基上在中间膜囊切去N-乙酰葡糖胺形成M6P配体与trans膜囊上的受体结合选择性地包装成初级溶酶体。 四、溶酶体与疾病四、溶酶体与疾病 1矽肺 2肺结核 3各类贮积症 贮积症(st

50、orage disease)是由于遗传缺陷引起的,由于溶酶体的酶发生变异,功能丧失,导致底物在溶酶体中大量贮积,进而影响细胞功能,常见的贮积症主要有以下几类。 (1)台-萨氏综合征(Tay-Sachs diesease):要叫黑蒙性家族痴呆症,溶酶体缺少氨基已糖酯酶A(-N-hexosaminidase),导致神经节甘脂GM2积累(图6-30),影响细胞功能,造成精神痴呆,26岁死亡。患者表现为渐进性失明、病呆和瘫痪,该病主要出现在犹太人群中。 图6-30 台-萨氏综合征神经元中同心圆状的溶酶体 引自细胞生物学超微结构图谱1989 (2) II型糖原累积病(Pompe病):溶酶体缺乏-1,4-

51、葡萄糖苷酶,糖原在溶酶体中积累,导致心、肝、舌肿大和骨骼肌无力。 (3) Gaucher病:又称脑苷脂沉积病,是巨噬细胞和脑神经细胞的溶酶体缺乏- 葡萄糖苷酶造成的。大量的葡萄糖脑苷脂沉积在这些细胞溶酶体内,巨噬细胞变成Gaucher 细胞,患者的肝、脾、淋巴结等肿大,中枢神经系统发生退行性变化。 (4) 细胞内含物病(inclusion-cell disease,I-cell disease):一种更严重的贮积症,是N-乙酰葡糖胺磷酸转移酶单基因突变引起的。由于基因突变,高尔基体中加工的溶酶体前酶上不能形成M6P分选信号,酶被运出细胞(default pathway)。这类病人成纤维细胞的溶

52、酶体中没有水解酶,导致底物在溶酶体中大量贮积,形成所谓的“包涵体(inclusion)”。另外这类病人肝细胞中有正常的溶酶体,说明溶酶体形成还具有M6P之外的途径。 4类风湿性关节炎 溶酶体膜很易脆裂,其释放的酶导致关节组织损伤和发炎 。 五、过氧化物酶体 过氧化物酶体(peroxisome)又称微体(microbody),由J. Rhodin(1954)首次在鼠肾小管上皮细胞中发现。 图6-31 人肝细胞过氧化物酶体(Ps,没有尿酸氧化酶结晶) 引自细胞生物学超微结构图谱1989 图6-32 烟草叶肉细胞的过氧化物酶体(中央具有尿酸氧化酶形成的晶体状核心) 各类氧化酶的共性是将底物氧化后,生

53、成过氧化氢。 RH2+O2R+H2O2 过氧化氢酶又可以利用过氧化氢,将其它底物(如醛、醇、酚)氧化。 RH2+H2O2R+2H2O 此外当细胞中的过剩时,过氧化氢酶亦可催化以下反应: 2H2O2 2H2O + O2 在植物中过氧化物酶体主要有:参与光呼吸作用,将光合作用的副产物乙醇酸氧化为乙醛酸和过氧化氢,在萌发的种子中,进行脂肪的-氧化,产生乙酰辅酶A,经乙醛酸循环,由异柠檬酸裂解为乙醛酸和琥珀酸,加入三羧酸循环,因涉及乙醛酸循环,又称乙醛酸循环体(glyoxysome)。 从系统发生的角度来看,过氧化物酶体可能是一种古老的细胞器,在光合生物出现后,大气中的氧含量逐渐提高,而细胞内的氧对早

54、期的生物具有毒害作用,过氧化物酶体的功能就是消除细胞内的氧,并产生细胞所需要的某些代谢物。虽然在过氧化物酶体中黄素蛋白、氧化酶和过氧化氢酶之间可以形成一个简单的呼吸链,但不起能量转换的作用。后来线粒体产生后就取代了过氧化物酶体的这种功能,并且其电子传递与ATP合成相偶联。 第六节 线粒体 1890年R. Altaman首次发现线粒体,命名为bioblast,以为它可能是共生于细胞内独立生活的细菌。 1898年Benda首次将这种颗命名为mitochondrion。 1900年L. Michaelis用Janus Green B对线粒体进行染色,发现线粒体具有氧化作用。 Green(1948)证

55、实线粒体含所有三羧酸循环的酶,Kennedy和Lehninger(1949)发现脂肪酸氧化为CO2的过程是在线粒体内完成的,Hatefi等(1976)纯化了呼吸链四个独立的复合体。Mitchell(19611980)提出了氧化磷酸化的化学偶联学说。 一、结构一、结构 (一)形态与分布(一)形态与分布 线粒体一般呈粒状或杆状,但因生物种类和生理状态而异,可呈环形,哑铃形、线状、分杈状或其它形状。主要化学成分是蛋白质和脂类,其中蛋白质占线粒体干重的65-70%,脂类占25-30%。 一般直径0.51m,长1.53.0m,在胰脏外分泌细胞中可长达1020m,称巨线粒体。 (二)超微结构(二)超微结构

56、 线粒体由内外两层膜封闭,包括外膜、内膜、膜间隙和基质四个功能区隔(图7-1、7-2)。在肝细胞线粒体中各功能区隔蛋白质的含量依次为:基质67%,内膜21%,外8%膜,膜间隙4%。 图7-1线粒体的TEM照片 图7-2线粒体结构模型 1、外膜 (out membrane) 含40%的脂类和60%的蛋白质,具有孔蛋白(porin)构成的亲水通道,允许分子量为5KD以下的分子通过,1KD以下的分子可自由通过。标志酶为单胺氧化酶。 2、内膜 (inner membrane) 含100种以上的多肽,蛋白质和脂类的比例高于3:1。心磷脂含量高(达20%)、缺乏胆固醇,类似于细菌。通透性很低,仅允许不带电

57、荷的小分子物质通过,大分子和离子通过内膜时需要特殊的转运系统。如:丙酮酸和焦磷酸是利用H+梯度协同运输。 线粒体氧化磷酸化的电子传递链位于内膜,因此从能量转换角度来说,内膜起主要的作用。内膜的标志酶为细胞色素C氧化酶。 内膜向线粒体基质褶入形成嵴(cristae),嵴能显著扩大内膜表面积(达510倍),嵴有两种类型:板层状(图7-1)、管状(图7-3),但多呈板层状。 图7-3 管状嵴线粒体 嵴上覆有基粒(elementary particle),基粒由头部(F1偶联因子)和基部(F0偶联因子)构成,F0嵌入线粒体内膜。 3、膜间隙(intermembrane space) 是内外膜之间的腔隙

58、,延伸至嵴的轴心部,腔隙宽约6-8nm。由于外膜具有大量亲水孔道与细胞质相通,因此膜间隙的pH值与细胞质的相似。标志酶为腺苷酸激酶。 4、基质(matrix) 为内膜和嵴包围的空间。除糖酵解在细胞质中进行外,其他的生物氧化过程都在线粒体中进行。催化三羧酸循环,脂肪酸和丙酮酸氧化的酶类均位于基质中,其标志酶为苹果酸脱氢酶。 基质具有一套完整的转录和翻译体系。包括线粒体DNA(mtDNA),70S型核糖体,tRNAs 、rRNA、DNA聚合酶、氨基酸活化酶等。 二、氧化磷酸化的分子基础二、氧化磷酸化的分子基础 (一)电子载体(一)电子载体 呼吸链电子载体主要有:黄素蛋白、细胞色素、铜原子、铁硫蛋白

59、、辅酶Q等。 1. NAD 即烟酰胺嘌呤二核苷酸(nicotinamide adenine dinucleotide,图7-4),是体内很多脱氢酶的辅酶,连接三羧酸循环和呼吸链,其功能是将代谢过程中脱下来的氢交给黄素蛋白。 2. 黄素蛋白:含FMN(图7-5)或FAD(图7-6)的蛋白质,每个FMN或FAD可接受2个电子2个质子。呼吸链上具有FMN为辅基的NADH脱氢酶,以FAD为辅基的琥珀酸脱氢酶。 图7-4 NAD的结构和功能(NAD:RH,NADP:RPO3H2) 图7-5 FMN (flavin mononucleotide) 的分子结构 图7-6 FAD ( flavin adeni

60、ne dinucleotide)的分子结构 3. 细胞色素:分子中含有血红素铁(图7-7),以共价形式与蛋白结合,通Fe3+、Fe2+形式变化传递电子,呼吸链中有5类,即:细胞色素a、a3、b、c、c1,其中a、a3含有铜原子。 图7-7 血红素c的结构 4.三个铜原子:位于线粒体内膜的一个蛋白质上,形成类似于铁硫蛋白的结构,通过Cu2+、Cu+的变化传递电子。 5.铁硫蛋白:在其分子结构中每个铁原子和4个硫原子结合,通过Fe2+、Fe3+互变进行电子传递,有2Fe-2S和4Fe-4S两种类型(图7-8)。 图7-8 铁硫蛋白的结构(引自Lodish等1999) 6. 辅酶Q:是脂溶性小分子量

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