南方医医学信息取与管理

1、医学信息获取与管理什么是信息（information）？ 是生物体通过感觉同外界交换内容的总称，是物质的一种基本属性，是物质存在方式及其运动规律特点的外在表现。 信息有多种类型：自然信息、生物信息、社会信息等。春天来了？什么是知识（knowledge）？ 是人们通过信息对自然界，人类社会以及思维活动规律的认识与掌握，是人脑通过思维重新组合的系统化信息的集合。 know-what know-why know-how know-who什么是情报（information）? 是解决特定问题所需要的知识 （知识性、传递性、效益性） 情报（信息）意识:即“意识情报的能力”，是人们对大量客观存在的情报的自

2、觉反应。情报意识也指人们获取情报的积极性和主动性。情报的属性 知识性：经过加工并为用户所需要的特定知识或信息。 传递性：动态接受与利用。 效用性：启迪思维、增进见识、改变知识结构、提高认识能力，发挥实用的、社会的、经济的价值。什么是文献（literature, document）? 用一定的方式（文字、图象、声音）记录在一定的载体（纸张、磁盘、光盘）上的知识都成为文献。 是知识的外在表现形式。信息与知识、情报、文献的相互关系 信息知识情报 文献知识情报信息文献信息检索（information retrieval） 广义概念是指将信息按一定的方式组织和存贮起来，并根据信息用户的需要找出有关的信息

3、过程，故全称：“信息的存贮与检索(information storage and retrieval ) 。 狭义概念仅指上述过程的后半部分，即从信息集合中找出所需要的信息的过程，相当于人们通常所说的信息查寻（information search)。计算机检索的基本原理 检索技术及其实现。 检索技术包括基本布尔逻辑组配、截词、词位限制、检域限制等。 布尔逻辑组配是现行计算机检索的基本技术，主要通过“和(and,*)”、“或(or,+)”、“非(not,-)”等将检索词联结起来。 如：信息检索 and 计算机 （信息检索 or 文献检索） and 计算机 文献检索 not 文献检索课 布尔逻辑运

4、算符orandnotinfluenza and vaccination vaccination or vaccine influenza not vaccination “with” 表示“同字段与” 检索式a with b，表示限定检索词a和b在同一字段范围内出现的文献为命中文献。例：stomach with ache位置检索“near(n)” 表示“同句与” 检索式a near b，限定检索词在同一自然句中，即在同一句话中包含检索词a和b的文献为命中文献。n为一个数字，表示检索词之间间隔的词数。 例：stomach near4 ache位置检索截词 包括后截（最常用）、中截、前截等。 不同

5、检索系统截词符各有规定，常用有：?、*、！、$ *无限截断，可代替词尾的0-n个字母, 如: vaccin*,可以查出所有含有vaccin词根的文献,如： vaccina ; vaccine; vaccines; vaccination; vaccinium ; vaccinated ; post-vaccinal ; post-vaccination; vaccine-naive ？有限截断，可代替词中的1个字符。 例:白介素?2,可以查出白介素-2的文献；环孢?素可以查出含有环孢霉素、环孢菌素的文献；leukemi?可以查出含有leukemia、leukemic、leukemid的文献检索

6、技术及其实现检域限制 检域限制也称字段限制，包括前缀限制符和后缀限制符。如对dialog系统而言，前缀限制符有： au= 限查特定作者 jn= 限查特定刊名 la= 限查特定语种 pn= 限查特定专利号 py= 限查特定年代 后缀限制符例如： /ti 限在题目中查 /ab 限在文摘中查 /de 限在叙词标引中查 目前大多数检索系统提供菜单式检索，只需选择字段，不需要记住及输入字段代码。 加权检索是某些检索系统中提供的一种定量检索技术。加权检索同布尔检索、截词检索等一样，也是文献检索的一个基本检索手段，但与它们不同的是，加权检索的侧重点不在于判定检索词或字符串是不是在数据库中存在、与别的检索词或

7、字符串是什么关系，而是在于判定检索词或字符串在满足检索逻辑后对文献命中与否的影响程度。加权检索的基本方法是：在每个提问词后面给定一个数值表示其重要程度，这个数值称为权，在检索时，先查找这些检索词在数据库记录中是否存在，然后计算存在的检索词的权值总和。权值之和达到或超过预先给定的阈值，该记录即为命中记录。 运用加权检索可以命中核心概念文献，因此它是一种缩小检索范围提高检准率的有效方法。但并不是所有系统都能提供加权检索这种检索技术，而能提供加权检索的系统，对权的定义、加权方式、权值计算和检索结果的判定等方面，又有不同的技术规范。主要文献类型的著录格式 专著: 作者. 书名. 出版地:出版者,出版年

8、如: borko h, bernier c l. indexing concepts and methods. new york：academic press,1978 期刊: 作者(多作者用逗号分开,超过3个者用et al). 文章题目.刊物名称,年代,卷数(期数):页数如: porter mf, zhang j. an algorithm for suffix stripping. program, 1980, 14(3):130137 学位论文:作者.题名学位论文. 保存地点:保存单位,年份如:cairns r b. infrared spectroscopic studies on s

9、olid oxygen dissertation. berkeley： univ. of california,1986 主要文献类型的著录格式 报纸文章: 作者. 题名. 报纸名, 出版日期(版次)如: amy harmon. un summit on internet copyright. the seattle times, dec. 2, 1996 论文集: 作者. 题名. 见(in): 编者. 论文集名. 出版地:出版者, 出版年,起止页码如: hunninghaks gw,gadek jb, szapiel sv et al. the human alveolar macropha

10、ge. in:harris cc ed. cultured human cells and issues in biomedical research, new york: academic press, 1980, 5456题录的含义 篇名/著者(单位)/期刊名(出版单位）.年.卷(期).页码出处文献的级别 零次文献：是指未经过任何加工的原始文献，如实验记录、手稿、原始录音、原始录像、谈话记录等。零次文献在原始文献的保存、原始数据的核对、原始构思的核定（权利人）等方面有着重要的作用，其特点是信息来源直接真实, 内容新颖。 一次文献：是指作者以本人的研究成果为基本素材而创作或撰写的文献，如阅读

11、性图书、期刊论文、科技报告、专利文献、会议文献、学位论文、技术档案等都是一次文献。 文献的级别 二次文献：是指文献工作者对分散的无组织的一次文献进行搜集、提炼、浓缩、加工、整理,并按一定的科学方法组织编排、编辑出版的文献，是为了更有效地管理和利用一次文献而编辑的工具性文献。如各种目录、题录、文摘及机读型书目数据库、网上检索引擎等都属于二次文献。 文献的级别 三次文献：是指对有关的一次文献和二次文献进行广泛深入的分析、研究、对比、综合、评述、概括而撰写的文献，如综述、述评、年度进展报告、百科全书、手册、年鉴、辞典等。其特点是文字精炼、叙述简明扼要，具有系统性、综合性、知识性和工具性等特点。中国图

12、书馆图书分类法 a马克思, 列宁主义, 毛泽东思想 n 自然科学 r 医学 z 综合性图书分类目次r 医药、卫生. r1 预防医学、卫生学r59 全身性疾病 592 老年病学 593 免疫性疾病 .22 类风湿性关节炎 .24 红斑狼疮 医学主题词表 （mesh） 概述 结构 前言和介绍 （副主题词） 主题词字顺表 (包括主题词,副主题词,款目词） 树状结构表(仅主题词，分15个大类） a anatomy 解剖学 b organisms 生物体 c diseases 疾病 d chemicals&drugs 化学物质与药物 e analytical 诊断治疗技术与设备 f psychi

13、atry 精神病与心理学 作用：规范主题词主题途径的检索标识 自由词： liver cancer , liver tumor, liver carcinoma 规范词： 医学主题词表 mesh liver cancer see liver neoplasms pubmed检索特点检索运算符检索运算符and、not、or必须大写。必须大写。(vitamin c or zinc) and common cold支持截词检索（支持截词检索（*），但对词组无效。），但对词组无效。 如如bacter*, 可以检出以可以检出以bacter为词干的单为词干的单词词bacteria、bacterium等最多等

14、最多600个单词。个单词。 截词检索时，系统的自动词语匹配功能和截词检索时，系统的自动词语匹配功能和mesh自动扩展功能将不再被执行，如：自动扩展功能将不再被执行，如：heart attack* 将不映射到将不映射到 mesh 词词 myocardial infarction。pubmed检索特点强制检索：双引号强制检索：双引号“ ”或限定检索字段或限定检索字段 “gene silencing” gene silencing注意：所有的注意：所有的 、*、 ( )、- 都必须是英都必须是英文状态下输入。文状态下输入。缩写缩写全称全称缩写缩写全称全称ababstractlalanguageada

15、ffiliation（机（机构）构）mh mesh termsauauthor（作（作者）者） ptpublication typedppublication datesosourcecppublication countrytajournal title（刊名）（刊名）tiab title/abstracttititle（篇名）（篇名）isissn tw text words常用字段常用字段（检索时大小写都可以检索时大小写都可以）检索举例 查找钟世镇院士发表的显微外科学查找钟世镇院士发表的显微外科学(microsurgery)论文论文 zhong szau and microsurgery

16、检索姚开泰院士发表的鼻咽癌检索姚开泰院士发表的鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,npc)论论文文 yao ktau and (nasopharyngeal carcinoma or npc) 输入期刊全名，如：输入期刊全名，如：molecular biology molecular biology of the cellmol biol cell” journal of the cellmol biol cell” journal namename），系统自动转换；），系统自动转换；键入期刊标准缩写形式如：键入期刊标准缩写形式如：mol biol cellmol bio

17、l cell，或，或期刊的期刊的issnissn（国际标准出版物代码）如：（国际标准出版物代码）如：1059-1059-15241524进行检索；进行检索； 如果期刊名恰好是如果期刊名恰好是meshmesh词表中的词或一个单词，词表中的词或一个单词，如：如：gene therapygene therapy，sciencescience，cellcell等，加等，加tata（杂志名称）（杂志名称） 。刊名检索如果杂志全名中包括括弧或方括号，键入如果杂志全名中包括括弧或方括号，键入时应该予以取消，例如杂志名为：时应该予以取消，例如杂志名为：j hand j hand surg amsurg am，检索时应转成：，检索时应转成：j hand surg j hand surg am.am.语种为中文的期刊直接用汉语拼音语种为中文的期刊