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文档简介
1、2021-2021 年深圳市诺如病毒的分子流行病学研究研究目的: 诺如病毒是常见的腹泻病毒, 广泛存在于环境中, 是引起非细菌 性急性肠胃炎的主要病原之一。 诺如病毒流行范围广, 传播方式多样, 遗传信息 变化大。本研究将 2021-2021 年收集的腹泻样品进行检测, 并结合前期的资料, 从诺 如病毒的感染情况及分子流行病学两方面进行判断分析, 为诺如病毒的检测及预 防提供根底资料。 研究方法: 将 2021-2021 年收集的样品经过前处理后, 提取核 酸。一局部核酸用作Real-time PCR勺模板,并结合调查的资料从时间月份、 年龄和性别等方面对这两年诺如病毒的感染情况进行分析。另一
2、局部采用 RT-PCF的方法,分别用NVG1和NVQ特异性引物对其进行扩增,从分子水平分 析近两年诺如GI和诺如GU基因组的流行趋势,并着重分析 GH .4型的流行状 况。研究结果 :1 、 2021年收集的 925 份标本中,有 506份标本来自男性, 419 份标本来自女性, 三岁及三岁以下的有 480份,所占比例达 52%。经过 Real-time PCR检测,共鉴定出阳性标本186份,阳性率为20.10%,其中有96份来自男性, 90 份标本来自女性,三岁及三岁以下儿童感染诺如病毒的阳性数为 104 份,所 占比例高达 56%104/186;2021 年收集的 983 份样品中, 有
3、573 份标本来自男 性, 410份标本来自女性,其中 571 名患者的年龄小于 3 岁,所占比例达 58%。经 Real-time PCR 检测,共鉴定出阳性标本 210 份,阳性率为 21.36%,其 中有 121 份来自男性, 89 份来自女性, 三岁及三岁以下儿童的阳性数为 130 份, 所占比例高达62%130/210。2、经过RT-PCF扩增后,将有阳性条带的样品测序后进行比对分型2021年共有85份样品成功测序,其中有78份样品属于NVQ型,分属4 种不同的基因型别,7份样品属于NVQ型,分属3种不同的基因型别。在 GH 基因组中比例最高的是GH .4/2006b,共检测55份标
4、本,占所有成功测序标本 的64.5% (55/85 ),其次是GH .4/2006variant ,共检测出17份阳性样品,占所 有型别比的20% 2021年共有60份样品成功测序,其中有 55份属于NVQ型, 分属7种不同的基因型,5份属于NVG型,分属4种不同的基因型。在所测的GH基因组中,比例最高是GH .4/2006b,共检测出28份,占所有 基因型别比的 46.7%。其次是 GH.4/2006b variant, 共有10份阳性标本,占所 有基因型别比的 16.7%。研究结论: 1从这两年的数据来看,诺如病毒引起的腹泻在任何时节均可 发生。但检出率较高的月份主要集中在 3-7 月份。
5、在所有的腹泻人群中, 以三岁以下儿童居多。 将这两年诺如病毒在性别感染上的差异,通过SPSS软件分析,得到2021年卡方检验的P值=0.344>0.05 , 2021年卡方检验的P值=0.824>0.05,这两年的检测结果均无统计学差异。2.无论2021年还是2021年,NVQ基因组所占比例都非常高,分别到达 91.7%(78/85) 和91.6%(55/60) 。相对于 2021年, 2021年诺如病毒的基因型别更 趋向多元化。2021年,GH .4/2021开始出现,在所有检测出的基因型别中,比值高达20.0% (17/85)。 GH.4/2006b variant基因型是 2021年新发现的基因亚型。2021年检测出的基因型别中,有 10份属于 GH.4/2006b vari
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