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文档简介

跨膜区分析(TMHMM,2,跨膜区分析(TMHMM,蛋白质含有跨膜区，提示它可能作为膜受体起作用，也可能是定位在膜上的膜蛋白的膜锚定蛋白或离子通道蛋白。 跨膜区常见的分析软件有TMHMM.TMPERD.TMP。TMHMM是一个基于马尔可夫模型预测跨膜螺旋的程序，它综合了跨膜区疏水性、电荷偏倚、螺旋长度和膜蛋白拓扑学限制等性质，可对跨膜区及膜内外区进行整体预测。由于其在区分可溶性蛋白和膜蛋白方面尤为见长，故常用于判定一个蛋白是否为膜蛋白。 http:/www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0,SIB,步骤一： 打开在线工具，http:/www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0,步骤二：提交序列,步骤三：参数设置,参数介绍： Extensive, with graphics（图形化显示） Extensive, no graphics （不以图形化显示） One line per protein（每个蛋白遵行显示,步骤四：显示结果,结果解读,结果显示： P8蛋白的1-405位氨基酸位于细胞膜表面，406-426位氨基酸之间形成一个典型的跨膜螺旋区,结果显示： 与该蛋白的疏水性区域分析结果基本一致

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