白菜型油菜叶绿体SSRC基因组论文.doc

白菜型油菜叶绿体SSRC基因组论文【提示】本文仅提供摘要、关键词、篇名、目录等题录内容。为中国学术资源库知识代理，不涉版权。作者如有疑义，请联系版权单位或学校。【摘要】芸薹属油菜是世界四大油料作物之一,全世界每年油菜产量有数千万吨,对全世界的经济和人们的生活具有重要意义。白菜型油菜是油菜三大类型之一,白菜型油菜不仅可以生产菜籽油,还有种类繁多的蔬用白菜型油菜。甘蓝型油菜是世界上种植面积最大的油菜类型,在甘蓝型油菜的育种过程中,我们需要不断引进新的变异来拓宽其遗传基础。本实验运用叶绿体SSR技术研究了油菜三大类型之一的190份白菜型油菜的亲缘关系；而后利用C基因组特异SSR引物又对甘蓝型油菜,甘蓝和埃塞俄比亚芥三者之间的遗传变异情况做了分析,目的是找到的对甘蓝型油菜育种有用的变异。本研究主要结果如下：1.本实验利用cpSSR技术,对190份白菜型油菜的叶绿体基因组DNA多态性进行研究,结果发现：在遗传距离0.62上190份实验材料分为,两个类群。类群包含179份材料,该类群囊括了全部的蔬用白菜型油菜和绝大多数油用白菜型油菜,ATC95373除外。类群在遗传距离0.92上分出18个亚群,其中有一个很大的亚群包括了65.8%的油用白菜型油菜和72.9%的蔬用白菜型油菜。单倍型分析显示蔬用白菜型油菜绝大多数集中于H1中。结果说明叶绿体在进化过程中确实比较保守,但是在一定的群体基础上仍能表现出丰富的多态性。2.利用C基因组特异SSR引物对主要由甘蓝型油菜,甘蓝和埃塞俄比亚芥组成的群体的遗传多样性和不同种群间的等位变异进行研究。经过UPGMA聚类分析,群体主成分分析和等位变异的互补性分析。实验结果表明这几大群体在C基因组上表现出丰富的多态性,其中甘蓝的多态性最为丰富它对于甘蓝型油菜来说所具有的特有等位变异最多,能为甘蓝型油菜育种提供最为丰富的补充等位变异。3.利用叶绿体SSR引物对白菜型油菜的遗传变异分析结果证明叶绿体SSR对于植物进化过程中的亲缘关系研究以及等不同种群的群体遗传变异分析有很好的应用价值。【关键词】芸薹属；白菜型油菜；叶绿体SSR；C基因组；【篇名】芸薹属油菜核质基因组多态性研究【目录】芸薹属油菜核质基因组多态性研究摘要6-7Abstract7-8縮略语表9-101 前言10-221.1 芸薹属重要物种的起源和进化10-131.2 白菜型油菜的遗传分化和遗传资源13-141.2.1 白菜型油菜的遗传分化13-141.2.2 白菜型油菜的遗传资源141.3 分子标记技术在作物遗传进化研究中的应用14-171.3.1 RFLP14-151.3.2 RAPD151.3.3 AFLP15-161.3.4 SRAP161.3.5 SNP161.3.6 SSR16-171.4 油菜叶绿体基因组DNA多态性研究进展17-201.4.1 油菜线粒体基因组17-191.4.2 油菜叶绿体基因组19-201.5 油菜C基因遗传关系研究20-211.6 目的和意义21-222 白菜型油菜叶绿体DNA多态性研究22-502.1 实验材料22-312.2 实验仪器及试剂312.3 实验方法31-332.3.1 DNA提取31-322.3.2 PCR扩增32-332.3.3 聚丙烯酰胺凝胶电泳检测332.3.4 显影332.4 实验数据统计方法33-342.5 DNA片段精确大小的测定和真实性的确定34-372.5.1 ABI310型测序仪对片段基因扫描34-352.5.2 DNA测序35-372.6 结果与分析37-412.6.1 190份白菜cpSSR多态性统计372.6.2 7对有多态性的引物PCR产物测序结果及其序列比对结果37-412.7 cpSSR聚类结果与分析41-492.7.1 190份白菜和一份黑芥聚类结果分析42-442.7.2 191份实验材料单倍型分析44-492.8 结果讨论49-503 甘蓝型油菜、埃塞俄比亚芥和甘蓝C基因组遗传变异分析50-683.1 实验材料50-543.2 实验仪器及试剂543.3 实验方法54-573.3.1 DNA的提取54-553.3.2 PCR扩增55-563.3.3 聚丙烯酰胺凝胶电泳检测563.3.4 显影56-573.4 实验数据统计与分析方法573.4.1 数据统计573.4.2 数据分析573.5 实验结果与分析57-673.5.1 96份实验材料SSR多态性统计57-583.5.2 96份实验材料聚类分析58-603.5.3 甘蓝型油菜和白菜型油菜聚类分析60-613.5.4 野生甘蓝和白菜型油菜聚类分析61-623.5.5 埃塞俄比亚芥和白菜型油菜聚类分析62-633.5.6 甘蓝型油菜,埃塞俄比亚芥,甘蓝和白菜型油菜PCA分析63-643.5.7 甘蓝型油菜,埃塞俄比亚芥,野生甘蓝,栽培甘蓝和白菜型油菜群体遗传结构之血缘分析64-663.5.8 甘蓝型油菜,白菜型油菜,野生甘蓝,栽培甘蓝和埃塞俄比亚芥的遗传多样性分析66-673.6 讨论67-684 全文总结68-