在克罗恩病病因学中一项关于nod2基因易感性变异和吸烟之间的基因环境的相互作用的单纯病例研究课件

在克罗恩病病因学中一项关于 NOD2基因易感性变异和吸烟之间 的基因环境的相互作用的单纯病 例研究 分子遗传学 第三讨论组 文章结构框架 摘要 背景 结果 讨论 结论 方法 实验材料 作者资料 作者贡献 参考文献 出版前历史 摘要 背景：NOD2的遗传变异性和吸烟是CD发病危险因素，但它们之间的是否潜在相互作用 尚不清楚。 方法：根据NOD2三个变异体（R702W，G908R，1007fs）进行基因分型；问卷调查获得 吸烟史，使用单纯病例研究的设计，统计学上进行回归分析。 结果：检测到NOD2危险等位基因与吸烟史之间存在显著负相关，尤其适用于变异体 1007fs。 结论：观察到基因与环境相互作用的显著负负相关可能是由于某个生物相互作用并值 得进一步研究 背景 CD是常见的消化道炎症，目 前公认具有遗传易感性，而 最相关的基因为NDO2变异体 环境因素对其也有影响，而 影响最大的是吸烟。 这两个因素之间是否存在相 互作用尚不清楚。 两个亮点 最具代表性 单纯病例研究 OR值 OR=1 没有相互作用 OR协同作用 OR拮抗作用 结 果（1） 结果（研究样本特征） 表1提供了1636名患者的人口统计学和风险 因素特征，对照组来自opgen生物样本库。 曾经吸烟的参与者诊断年龄和参与研究时 的年龄均大于没有吸烟史的患者，同样确 诊是吸烟者的年龄略大于非吸烟者。 至少一个相关等位基因者的确诊年龄比野 生型基因患者要略年轻。 1007fs等位基因是唯一与较早的诊断年龄相 关的基因,R702W，G908R，性别，纳入研 究年龄，以及家族IBD病史都没有相关性。 结果（基因-环境交互作用分析） 我们观察到三个风险变异体基因中的至少 一个载体与吸烟史之间的关系是显著背离 我们建议的乘积函数模型的。这种背离表 现在CD诊断是吸烟者中更明显。 发现在CD发病中，仅1007fs风险等位基因与 吸烟史之间存在显著的负相关，而 在 R702W和G908R风险等位基因不存在。 结 论 在克罗恩病人中吸烟和1007fs 呈显著的统计 学负相关. 这一结果值得在流行病学功能研究方面进 一步调查。它不仅更好地理解CD发病的生 物学机制，也可以有助于为CD高发病率个 体制定适当的建议。 方 法 研究设计 数据采集 人口分析 吸烟行为 基因分型 统计学分析 研究设计 CD患者的个体是1995至2010年连续招募的正在 进行的研究的一部分，以此来确定遗传因素在 炎症性肠病中的作用。 建立影像学和内窥镜的诊断标准来确定CD。 在参与者招募时从每个参与者获得一个外周静 脉血样本。 从所有的研究参与者获得知情同意书。 所有患者都是通过popgen生物资料库被招募的 。 人口研究 共有2430德国个人与克罗恩病有资格参与 目前的研究。经过两个筛选条件，1、在多 重家庭中，最后的研究样本只包括索引患 者，(指应用推荐治疗方案的特殊类型患者 或者流行病学可追溯的第一例患者）。2.与 者被包括在分析中仅当基因型数据对所有 三个CD-相关NOD2多态性可用。排除有关联 的和缺失基因型的参与者后，共1636个参 与者可用于分析。 吸烟行为 在研究中通过给予参与者书面问卷调查获 得的人口统计特征信息，疾病的具体信息 ，一般病史，家族病史，以及主动吸烟 史。参与者被要求说明他们曾经是否主动 吸烟者，并且被指定根据 “不吸烟”或者 “曾经吸烟者”的回复给出问卷答复。参 与者被进一步问，他们CD诊断期间是否吸 烟。参与者指定为“曾经吸烟者”进一步 细分为“确诊时吸烟”或“确诊时不吸烟” 。 基因分型 DNA是从每个使用标准方法的参与者的外周 血淋巴细胞中提取的。如先前所描述的， 在所有使用的TaqManSNP测定法基因分型 的患者中，对R702W，G908R和1007fs多态 性进行基因分型。 统计学分析 人口和风险因素变量在受试者中的选取和排除，通过x2检验分 类变量和独立样本t检验连续变量 将基因和环境作为两个独立因素，在单纯病例研究中建立基因- 环境乘积函数模型。 在初始组合等位基因分析，三个等位基因中至少携带一个的参 加者单独成组并与携带三个等位基因的野生型进行比较。为了 确定哪个多态性被促进的信号上检测在结合变异分析，我们再 进行后续分别分析各多态性 进一步分析诊断时正在吸烟的患者对乘积函数模型的偏差是否 更大。为了评估NOD2多态性的存在和吸烟状态之间偏离积性函 数,我们应用R版本2.10.1表现逻辑回归分析 功率计算对联合等位基因分析。统计分析有吸烟史的交互作用 ，目前的研究中80%统计功效是去研究相互作用OR值为0.73（ 联合等位基因分析），0.67（R702W）,0.41(G908R),和0.7（ 1007fs）.我们的研究有80%的统计功效是研究相互作用OR值为 0.7（联合等位基因分析），0.64（R702W）,0.35(G908R),和0.67 （1007fs）。 所有的分析对于潜在的混杂影响进行了调整。 讨 论（1） 吸烟和CD-相关NOD2多态之间的统计互动调 查中我们发现了一个显著负相关的互动。 我们没有观察到R702W或G908R多态性有这 种相互作用的。吸烟与1007fs等位基因之间 的交互OR值低于预期值。这些结果表明因 吸烟和1007fs等位基因而增加的疾病风险显 著低于积性函数模型给出的期待值。相应 地，在那些既携带患病相关危险等位基因 又吸烟的个体中这个低于期待值的患病率 表明两个因素之间存在负相关的交互作 用。 讨论（2） 病的诊断时期和IBD家族史可能混淆这些结果，特别 是1007fs变异相关疾病确诊的早期。然而，我们的 最终模式是针对诊断时期和家族史调整过的，它可 以控制潜在的混杂影响。 疾病的诊断时期和IBD家族史可能混淆这些结果，特 别是1007fs变异相关疾病确诊的早期。然而，我们 的最终模式是针对诊断时期和家族史调整过的，它 可以控制潜在的混杂影响。 总之，这些数据提示，吸烟改变疾病与1007fs变异 体相关联风险，并且增加携带这种易感性等位基因 的吸烟者的患疾病风险比非吸烟者携带这种等位基 因的患病风险显著小于预期。 讨论（3） 据我们所知，迄今为止，目前的研究代表了在CD病因方面统计学基因-环境相 互作用的最大分析，并且第一次采用单纯病例研究。相比于传统的病例对照 时，单纯病例设计提供了大幅增长的统计学力量以及更精确的估算相互作 用。 目前研究确实有局限性。主要的限制是单纯病例设计只允许评估根据乘法模 型计算的统计学相互作用，这被许多流行病学家认为添加剂规模有意义33。 此外，单纯病例设计在一般人群对遗传和环境的风险因素独立性假设是特别 敏感的 34。 目前研究确实有局限性。主要的限制是单纯病例设计只允许评估根据乘法模 型计算的统计学相互作用，这被许多流行病学家认为添加剂规模有意义33。 此外，单纯病例设计在一般人群对遗传和环境的风险因素独立性假设是特别 敏感的 34。 我们的研究进一步受吸烟状态的定义的限制。在给参与者的调查问卷中，没 有定义被指定的主动吸烟。参与者被要求只有当他们曾经吸烟，这可能导致 其中一些参与者对环境变量的误判。但是，如果吸烟状况与基因型的错误分 类的比率是无差别的，也就是说，如果吸烟状况的分类是独立于基因型的分 类，正如人们所预计，误判将推动互动OR走向统一，而不是产生一个夸大的 估计相互作用的33。 讨论（4） 吸烟可能改变与既定的遗传相关风险的变 异体的整体疾病的风险。因此，它是