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文档简介
1、第十一章 DNA的生物合成,基因信息的传递,基因:为生物活性产物编码的DNA功能片段,中心法则(The central dogma):,一、DNA复制(replication) 是指遗传物质的传代,以母链DNA为模板合成子链DNA的过程。,DNA生物合成方式 复制、修饰、逆转录,(要求掌握),复制的方式 半保留复制(semi-conservative replication) 复制的高保真性(high fidelity) 半不连续复制(semi-discontinuous replication) 有特定的起点 双向复制(bidirectional replication),(一)DNA复制的
2、基本规律(特征)(要求掌握) Basic Rules of DNA Replication,DNA生物合成时,母链DNA解开为两股单链,各自作为模板(template)按碱基配对规律,合成与模板互补的子链。子代细胞的DNA,一股单链从亲代完整地接受过来,另一股单链则完全从新合成。两个子细胞的DNA都和亲代DNA碱基序列一致。这种复制方式称为半保留复制。,1.半保留复制的概念,(要求掌握),A G G T A C T G C C A C T G G,T C C A T G A C G G T G A C C,C C A C T G G,G G T G A C C,A G G T A C T G,
3、T C C A T G A C,T C C A T G A C,A G G T A C T G,A G G T A C T G C C A C T G G,T C C A T G A C G G T G A C C,A G G T A C T G C C A C T G G,T C C A T G A C G G T G A C C,+,母链DNA,复制过程中形成的复制叉,子代DNA,目 录,子链继承母链遗传信息的几种可能方式,全保留式 半保留式 混合式,设想,(一般了解),密度梯度实验,实验结果支持半保留复制的设想。,含重氮-DNA的细菌,第一代,第二代,梯度离心结果,按半保留复制方式,子代
4、DNA与亲代DNA的碱基序列一致,即子代保留了亲代的全部遗传信息,体现了遗传的保守性。,半保留复制的意义,遗传的保守性,是物种稳定性的分子基础,但不是绝对的。,2.半不连续性复制,领头链 (leading strand),随从链 (lagging strand),(要求掌握),顺着解链方向生成的子链,复制是连续进行的,这股链称为领头链。 另一股链因为复制的方向与解链方向相反,不能顺着解链方向连续延长,这股不连续复制的链称为随从链。复制中的不连续片段称为岡崎片段(okazaki fragment)。 领头链连续复制而随从链不连续复制,就是复制的半不连续性。,(要求掌握),A. 环状双链DNA及复
5、制起始点 B. 复制中的两个复制叉 C. 复制接近终止点(termination, ter),3.有特定的起始点,(一般了解),真核生物每个染色体有多个复制起始点,是多复制子的复制。 习惯上把两个相邻起始点之间的距离定为一个复制子(replicon) 。复制子是独立完成复制的功能单位。而原核核生物只有一个复制起始点。,(一般了解),原核生物复制时,DNA从起始点(origin)向 两个方向解链,形成两个延伸方向相反的 复制叉,称为双向复制。,4.双向复制,(二)参与DNA复制的物质,底物(substrate): dATP, dGTP, dCTP, dTTP 聚合酶(polymerase): 依
6、赖DNA的DNA聚合酶, 简写 为 DNA-pol 模板(template) : 解开成单链的DNA母链 引物(primer): 提供3-OH末端使dNTP可以依次聚合 其他的酶和蛋白质因子,聚合反应的特点,DNA 新链生成需引物和模板(模板链的方向 ( 是3 5 ); 新链的延长只可沿5 3方向进行 。,(要求掌握),复制的化学反应,(dNMP)n + dNTP (dNMP)n+1 + PPi,目 录,DNA聚合酶,全称:依赖DNA的DNA聚合酶 (DNA-dependent DNA polymerase) 简称:DNA-pol,活性:1. 53 的聚合活性 2. 核酸外切酶活性,3 5外切
7、酶活性,5 3外切酶活性,?,能切除突变的 DNA片段。,能辨认错配的碱基对,并将其水解。,核酸外切酶活性,目 录,原核生物的DNA聚合酶,DNA-pol DNA-pol DNA-pol ,原核生物的DNA聚合酶,E. Coli中的DNA聚合酶,功能:对复制中的错误进行校读,对复制和修复中出现的空隙进行填补。,DNA-pol (109kD),DNA-pol (120kD),DNA-pol II基因发生突变,细菌依然能存活。 它参与DNA损伤的应急状态修复。,功能 是原核生物复制延长中真正起催化 作用的酶。,DNA-pol (250kD),真核生物的DNA聚合酶 (一般了解),DNA-pol ,
8、起始引发,有引物酶活性。,延长子链的主要酶,有解螺旋酶活性。,参与低保真度的复制 。,在复制过程中起校读、修复和填补缺口的作用。,在线粒体DNA复制中起催化作用。,DNA-pol ,DNA-pol ,DNA-pol ,DNA-pol ,真核生物的DNA聚合酶,(一般了解),1. 遵守严格的碱基配对规律; 2. 聚合酶在复制延长时对碱基的选择功能; 3. 复制出错时DNA-pol 的及时校读功能。,DNA复制的保真性至少要依赖三种机制,复制中的DNA分子解链,DNA分子的碱基埋在双螺旋内部,只有 把DNA解成单链,它才能起模板作用。,解螺旋酶、引物酶和单链DNA结合蛋白,解螺旋酶(helicas
9、e) ( 要求掌握) 利用ATP供能,作用于氢键,使DNA双链 解开成为两条单链 引物酶(primase) 复制起始时催化生成RNA引物的酶 单链DNA结合蛋白(single stranded DNA binding protein, SSB) 在复制中维持模板处于单链状态并保护 单链的完整,DNA拓扑异构酶(DNA topoisomerase),拓扑一词是指物体或图像作弹性移位而又保持物体不变的性质,(一般了解),解链过程中正超螺旋的形成,目 录,拓扑异构酶作用特点 既能水解 、又能连接磷酸二酯键,拓扑异构酶 拓扑异构酶,分 类,拓扑异构酶,切断DNA双链中一股链,使DNA解链旋转不致打结;
10、适当时候封闭切口,DNA变为松弛状态。 反应不需ATP。,拓扑异构酶,切断DNA分子两股链,断端通过切口旋转使超螺旋松弛。 利用ATP供能,连接断端, DNA分子进入负超螺旋状态。,作用机制,DNA连接酶,连接DNA链3-OH末端和相邻DNA链5-P末端,使二者生成磷酸二酯键,从而把两段相邻的DNA链连接成一条完整的链。,DNA连接酶(DNA ligase)作用方式,HO,5,3,3,5,DNA连接酶,ATP,ADP,5,3,5,3,目 录,DNA连接酶在复制中起最后接合缺口的作用。 在DNA修复、重组及剪接中也起缝合缺口的 作用。也是基因工程的重要工具酶之一。,功能,1.复制的起始,需要解决
11、两个问题:,(1) DNA解开成单链,提供模板。,(2)合成引物,提供3-OH末端。,原核生物的DNA生物合成,(三)DNA复制过程,Dna A,Dna B、 Dna C,DNA拓扑异构酶,引物酶,SSB,3,5,3,5,引发体和引物 (一般了解),含有解螺旋酶、DnaC蛋白、引物酶和DNA复制 起始区域的复合结构称为引发体。,3,5,3,5,引物是由引物酶催化合成的短链RNA分子。,引物,引物酶,(一般了解),2.复制的延长,复制的延长指在DNA-pol催化下,dNTP以dNMP 的方式逐个加入引物或延长中的子链上,其 化学本质是磷酸二酯键的不断生成。,OH 3,3,目 录,(一般了解),示
12、意图,领头链的合成,目 录,随从链的合成,目 录,目 录,复制过程简图,目 录,复 制 过 程 动 画,原核生物基因是环状DNA,双向复制的复制片段在复制的终止点(ter)处汇合。,3.复制的终止,随从链上不连续性片段的连接,目 录,哺乳动物的细胞周期,DNA合成期,G1,G2,S,M,真核生物的DNA生物合成, 细胞能否分裂,决定于进入S期及M期这两个关键点。G1S及G2M的调节,与蛋白激酶活性有关。 蛋白激酶通过磷酸化激活或抑制各种复制因子而实施调控作用。,(一般了解), 真核生物每个染色体有多个起始点,是多复制子复制。复制有时序性,即复制子以分组方式激活而不是同步起动。 复制的起始需要D
13、NA-pol(引物酶活性)和pol(解螺旋酶活性)参与。还需拓扑酶和复制因子(replication factor, RF)。 增殖细胞核抗原(proliferation cell nuclear antigen, PCNA)在复制起始和延长中起关键作用。,1.复制的起始,(一般了解),3,5,5,3,领头链,3,5,3,5,亲代DNA,随从链,引物,核小体,2.复制的延长,染色体DNA呈线状,复制在末端停止。 复制中岡崎片段的连接,复制子之间的连接。 染色体两端DNA子链上最后复制的RNA引物,去 除后留下空隙。,3.复制的终止,(一般了解),5,3,3,5,5,3,3,5,+,5,3,3,
14、3,3,5,5,目 录,(一般了解),逆转录酶(reverse transcriptase),逆转录(reverse transcription),三、逆转录病毒和逆转录酶,RNA DNA,逆转录酶,遗传物质的结构改变而引起的遗传信息改变,均可称为突变。,在复制过程中发生的DNA突变称为DNA损伤(DNA damage)。,从分子水平来看,突变就是DNA分子上碱基的改变。,四、DNA损伤(突变)与修复 DNA Damage (Mutation) and Repair,突变的意义,突变是生物进化、分化的分子基础 突变导致基因型改变 突变导致死亡 突变是某些疾病的发病基础,(一)引发突变的因素,物
15、理因素 紫外线(ultra violet, UV)、各种辐射,化学因素,目 录,(二)突变的分子改变类型,错配 (mismatch) 缺失 (deletion) 插入 (insertion) 重排 (rearrangement),DNA分子上的碱基错配称点突变(point mutation)。,1.错配,镰形红细胞贫血病人Hb (HbS) 亚基,正常成人Hb (HbA)亚基,2.缺失、插入和框移,缺失:一个碱基或一段核苷酸链从DNA大分子上消失。,插入:原来没有的一个碱基或一段核苷酸链插入到DNA大分子中间。,框移突变是指三联体密码的阅读方式改变,造成蛋白质氨基酸排列顺序发生改变。,缺失或插入
16、都可导致框移突变 。,缺失引起框移突变,3.重排,DNA分子内较大片段的交换,称为重组或重排。,由基因重排引起的两种地中海贫血基因型,目 录,(三)DNA损伤的修复,修复(repairing) 是对已发生分子改变的补偿措施,使其回复为原有的天然状态。,光修复(light repairing) 切除修复(excision repairing) 重组修复(recombination repairing) SOS修复,修复的主要类型,( 要求掌握),1.光修复,光修复酶(photolyase),UV,2.切除修复,是细胞内最重要和有效的修复机制,主要由DNA-pol和连接酶完成。,E.coli的切除
17、修复机制,目 录,切 除 修 复 动 画,3.重组修复,4.SOS修复,当DNA损伤广泛难以继续复制时,由此而诱发出一系列复杂的反应。 在E. coli,各种与修复有关的基因,组成一个称为调节子(regulon)的网络式调控系统。 这种修复特异性低,对碱基的识别、选择能力差。通过SOS修复,复制如能继续,细胞是可存活的。然而DNA保留的错误较多,导致较广泛、长期的突变。,逆转录病毒细胞内的逆转录现象,逆转录研究的意义,逆转录酶和逆转录现象,是分子生物学研究中的重大发现。 逆转录现象说明:至少在某些生物,RNA同样兼有遗传信息传代与表达功能。 对逆转录病毒的研究,拓宽了20世纪初已注意到的病毒致癌理论。,三、端粒
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