甲基化与多组学研究专题09DNA甲基化与精神类疾病研究

®DNA甲基化与精神类疾病研究解螺旋

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知识金牌解

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牌010203精神障碍分类PubMed检索基于Illumina甲基化芯片的精神疾病相关文献及国自然检索文献解读CONTENTS课

程

目

录04精神障碍分类01知

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牌什么是“精神疾病”解

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长精神疾病更准确的说法是精神障碍躯体疾病称为“疾病”，精神疾病称为“障碍”病因复杂，未知较多知

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牌精神障碍分类系统解

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长ICD系统：国际疾病分类系统DSM系统：美国精神障碍诊断与统计手册系统知

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牌ICD-10

(v2016)WHO编制精神疾病占1大章分11小类分类依据：病因学+症状学解

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牌DMS-5

（2013）由美国精神医学协会（APA）编撰分类依据：基于症状学主要分类：神经发育障碍、精神分裂症谱系障碍与其他精神病性障碍、双相障碍与其他相关障碍、抑郁障碍、焦虑障碍、强迫障碍与其他相关障碍、创伤和应激相关障碍、分离性障碍、躯体症状障碍及相关障碍、喂养和进食障碍、排泄障碍、睡眠觉醒障碍、性功能障碍、性别焦虑、破坏性、冲动控制和品行障碍、物质相关障碍与成瘾障碍、认知神经障碍、人格障碍、性欲倒错障碍、其他精神障碍、药物所致的运动障碍及其他药物的不良反应；另外包括其他可能成为临床关注焦点的问题解

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长PubMed检索02知

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牌检索条件解

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长检索条件：选定若干大类、细分类关键词“DNA

Methylation”

AND

“关键词”只检索≤10年内的文献其中关键词整理了47项，有检索结果的16项知

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牌节标题解

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长中文名英文名论文数量精神病学psychiatry1149精神分裂症schizophrenia361自闭症/孤独症autism232精神障碍mental

disorders183精神发育迟滞/智力缺陷mental

retardation152抑郁障碍/抑郁症depressive

disorder138孤独谱系障碍autism

spectrumdisorder61精神疾病mental

illness41注意缺陷多动障碍/多动症attention

deficit

hyperactivity

disorder30厌食症anorexia21神经性厌食症anorexianervosa13撤药综合征withdrawal

syndrome13儿童学习障碍learning

disabilities6癫痫epilepsia6躁狂症Mania4社交焦虑症social

anxiety

disorder2基于Illumina甲基化芯片的精神疾病相关文献及国自然检索03知

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牌基于Illumina甲基化芯片的文献检索查找GEO内Illumina甲基化芯片平台条目平台AccessionTitleSeriesSamplesPubDateGPL23976IlluminaInfinium

HumanMethylation850

BeadChip4672017850kGPL21145Infinium

MethylationEPIC397122015450kGPL13534Illumina

HumanMethylation450

BeadChip

(HumanMethylation450_15017482)105976702201127kGPL8490IlluminaHumanMethylation27

BeadChip

(HumanMethylation27_270596_v.1.2)335187852009解

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牌节标题解

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牌后续工作补充完整文章信息杂志、发表年份、IF……选择代表性文章进一步阅读重要疾病套路：机制、发育、EWAS……多组学数据的文章解

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牌近三年国自然相关项目检索解

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长文献解读04知

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牌文献介绍胎儿酒精谱系障碍的DNA甲基化模式研究2016年发表，IF=5.19样本类型：口腔上皮细胞检测平台：450k、SNP芯片、焦磷酸测序样本数量：206（110+96）解

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牌样本及芯片分析概览解

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牌样本及数据的过滤与校正解

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长Discard

outlier

samplesDiscard

probes

(sex

chr、SNPs、baddata……)Compared

withblood

samples

（GSE42861）Ethnic

background

correction

（via

SNP

genotyping）知

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牌结果PCALeft:

blood

samples

Right:

BECs解

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长Ethnic

samples

SNP

genotyping136

samples解

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牌节标题658

diff

CpG

site5

CpG

site

comparison知

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牌Diff-methylation

loci

enrichment解

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长差异甲基化位点与印记基因、原钙粘连素编码基因的关系

知

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牌解

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牌节标题GO&DiseaseEnrichmentUp-methylatedGenes

Co-expression

Network解