化学生物学专业博士研究生课程

化学生物学专业博士研究生课程教学大纲课程名称：蛋白质组学及应用课程编号：0703201F08学分：2总学时数：40开课学期：第2学期考试方式：笔试课程说明：（课程性质、地位及要求的描述）随着人类基因测序的基本完成，人类基因组计划开始进入后基因组时代。蛋白质组学(Proteomics)已成为功能基因组学的重要研究领域，是当今生命科学研究的热点与前沿领域。本课程主要从蛋白质组与蛋白质组学的基本概念入手，重点介绍这一崭新领域的诞生与发展，并以具体的研究成果，详细介绍蛋白质组学研究的相关技术及应用进展。通过本课程的学习，使学生了解和掌握蛋白质的结构、功能基因组和蛋白质组、蛋白质组学研究的方法及相关分离、分析、检测、鉴定技术，蛋白质组学研究中的生物信息学及蛋白质组学的应用等，如肿瘤发生与发展的比较蛋白质组学、细胞凋亡的蛋白质组学、蛋白质组学与新药开发等方面的知识。本课程主要适用于化学、化工、生物、医学等学科领域的研究生选修。教学内容、要求及学时分配：功能基因组与蛋白质组(2学时) 1.基因组、蛋白质组研究中的基本概念、相互关系2.蛋白质组学研究的内容和意义3.蛋白质组学的特点和难点及蛋白质组学发展趋势本章要求：了解基因组、蛋白质组研究中的基本概念、相互关系，蛋白质组学研究的内容和意义。蛋白质组学的特点和难点及蛋白质组学发展趋势。蛋白质的结构与表征(2学时) 1.蛋白质的组成、分类2.蛋白质的一级、二及、三级结构等基本概念3.蛋白质结构与功能的关系4.蛋白质结构分析的方法和技术本章要求：了解蛋白质的组成、分类、一级、二及、三级结构等基本概念，蛋白质结构与功能的关系，蛋白质结构分析的方法和技术等。蛋白质组学研究方法(3学时) 1.蛋白质组学研究的方法和技术2.二维凝胶电泳技术3.多维色谱分离技术4.生物质谱鉴定技术本章要求：了解蛋白质组学研究的方法和技术，如二维凝胶电泳技术、多维色谱分离技术、生物质谱鉴定技术等。蛋白质提取与样品制备(3学时) 1.蛋白质组学研究中各种细胞、组织、体液2.蛋白质的提取与样品的制备技术本章要求：了解蛋白质组学研究中各种细胞、组织、体液等中蛋白质的提取与样品的制备技术等。二维电泳与细胞蛋白质的分离(3学时)1.二维凝胶电泳技术2.胶上蛋白质的检测以及存在问题本章要求：了解二维凝胶电泳技术、胶上蛋白质的检测以及存在问题。图象分析与细胞蛋白谱的建立(3学时)1.蛋白电泳图象分析系统2.二维电泳蛋白谱数据库本章要求： 了解蛋白电泳图象分析系统及二维电泳蛋白谱数据库。生物质谱技术与蛋白质鉴定(3学时)1.基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱2.液相色谱-电喷雾-串联质谱3.肽质量指纹鉴定蛋白质技术4.串联质谱数据鉴定蛋白质技术本章要求：了解基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱、液相色谱-电喷雾-串联质谱、肽质量指纹鉴定蛋白质技术及串联质谱数据鉴定蛋白质技术等。蛋白质翻译后修饰的鉴定(3学时)1.磷酸化蛋白质的鉴定2.糖基化蛋白质的鉴定本章要求：了解磷酸化蛋白质的鉴定及糖基化蛋白质的鉴定。亚细胞蛋白质组学(3学时)1.亚细胞蛋白质组学的内涵、意义、技术基础2.亚细胞蛋白质组学的研究进展3.细胞膜蛋白质组学4.核孔复合体蛋白质组学5.核仁蛋白质组学6.线粒体蛋白质组学方面的研究本章要求：了解亚细胞蛋白质组学的内涵、意义、技术基础及研究进展。了解细胞膜蛋白质组学、核孔复合体蛋白质组学、核仁蛋白质组学、线粒体蛋白质组学方面的研究进展。蛋白质组学研究中的非凝胶技术(3学时)1.蛋白质组学研究中的非凝胶技术2.多维色谱及其质谱联用技术3.液相等电聚焦4.毛细管电泳技术5.毛细管电色谱技术6.蛋白质组学研究的应用和进展本章要求：了解蛋白质组学研究中的非凝胶技术，如多维色谱及其质谱联用技术、液相等电聚焦、毛细管电泳技术、毛细管电色谱技术及其在蛋白质组学研究中的应用和进展。蛋白质相互作用和蛋白质芯片(3学时)1.蛋白质相互作用及其研究策略和方法2.蛋白质芯片及其分类3.蛋白质芯片检测方法和研究进展本章要求：了解蛋白质相互作用及其研究策略和方法，了解蛋白质芯片及其分类、检测方法和研究进展。定量蛋白质组学技术(3学时)1.利用荧光染料进行定量的蛋白质组分析技术2.运用质谱进行定量的蛋白质组分析技术3.蛋白质芯片技术本章要求： 了解利用荧光染料进行定量的蛋白质组分析技术、运用质谱进行定量的蛋白质组分析技术和蛋白质芯片技术。蛋白质组学中的生物信息技术(3学时)1.生物信息学2.数据库的建立3.蛋白质组学研究中常用的网站和数据库。本章要求：了解生物信息学、数据库的建立和蛋白质组学研究中常用的网站和数据库。蛋白质组学在各领域中的应用(3学时)1.蛋白质组学在微生物研究中的应用及进展2.蛋白质组学在肿瘤研究中应用及进展3.蛋白质组学在神经系统研究中应用及进展4.蛋白质组学在体液研究中应用及进展5.蛋白质组学在植物和药物开发中应用及进展本章要求：了解蛋白质组学在微生物研究、肿瘤研究、神经系统研究、体液研究、植物和药物开发方面研究的应用及进