Pubmed数据库检索与利用

PubMed数据库检索与利用江西中医药大学图书馆查青林2015.11.27主要内容PubMed概述PubMed检索途径与使用方法检索结果导入NoteExpressPubMed元数据利用2主要内容PubMed概述PubMed检索途径与使用方法检索结果导入NoteExpressPubMed元数据利用3PubMed简介PubMed是由美国国立医学图书馆(NationalLibraryofMedicine,NLM)下属美国生物技术信息中心(NationalCenterforBiotechnologyInformation,NCBI)研制的基于Web的文献数据库收录全世界包括美国在内80多个国家的5000余种生物医学期刊的文摘及题录数据，内容涉及护理学、牙科学、兽医学、药理学、保健系统等医学各个领域现有文献2200万余条，收录文献时间起自20世纪50年代PubMed提供部分免费全文，包括①NLM开发的免费生物医学数字化期刊全文数据库PubMedCentral(PMC)；

②开放获取(OpenAccess,OA)期刊的文献；③部分出版商提供的免费期刊文献。PubMed每条记录均有惟一的识别号PMID(PubMedUniqueIdentifier)

。MEDLINE:PubMed主体部分，记录均标有[PubMed-indexedforMEDLINE]

InProcessCitation:又称PreMEDLINE,记录均标有[PubMed-inprocess]Publisher-SuppliedCitation:记录均标有[PubMed-assuppliedbypublisher][PubMed-indexedforMEDLINE][PubMed-assuppliedbypublisher][PubMed-inprocess]NLM早在1879年即开始编译医学文献的检索刊物《医学索引》(IndexMedicus,IM)从1964年起，采用计算机进行电子编辑和排版，在此基础上开发了“医学文献分析与检索系统”(MedicalLiteratureAnalysis&RetrievalSystem)，即著名的MEDLARS系统1971年正式建立了该系统的联机系统，称为“MEDLARS联机检索系统”(MEDLARSonline)，即MEDLINE系统随着网络技术的发展，开发人员致力于将MEDLINE数据库的信息放到网上，供广大医务人员免费使用。从1997年6月起，PubMed开始在网上免费向读者提供服务发展历程收录范围广、内容齐全、回溯时间长免费提供题录、文摘检索功能完善、使用方便提供检索词自动转换匹配功能、MeSH主题词检索可直接下载全部元数据，便于利用各种工具进行分析提供相关文献链接:Relatedcitations,Linkout更新速度快:数据实时更新个性化服务(MyNCBI)PubMed特点

PubMed提供检索词自动转换匹配功能(AutomaticTermMapping,ATM)。

PubMed对键入的检索词自动进行分析、匹配、转换并检索，是一种智能化的检索过程。MeSH转换表

Vitaminh→

"biotin"[MeSHTerms]OR"biotin"[AllFields]OR"vitaminh"[AllFields]期刊转换表

newenglandjournalofmedicine→

"NEnglJMed"[Journal]OR"newenglandjournalofmedicine"[AllFields]作者索引

SmithJA→SmithJA[Author]主要内容PubMed概述PubMed检索途径与使用方法检索结果导入NoteExpressPubMed元数据利用10二、PubMed检索途径与使用方法基本检索高级检索主题词检索题录检索期刊检索基本检索框高级检索题录检索主题词检索期刊检索临床查询临床试验网址13输入检索式例：类风湿关节炎（rheumatoidarthritis）应用雷公藤（triperygiumwilfordii）方面的文献。点击“Search”显示设置检索结果标题含有检索词文献标题含有检索词文献点击“Seemore”在PubMed注册自己的账户点击篇名点击出版物类型相关文献点击“LinkOut”点击数据库名称时间限定文献类型限定语种限定限定结果点击高级检索检索式显示框构建检索式检索历史输入检索词显示索引例：检索2009年以来发表的有关肿瘤护理方面的英文综述性文献输入检索词选择检索字段点击“Search”完整检索式检索结果点击主题词检索输入检索词点击“Search”例：通过主题词途径，检索有关心肌梗塞（myocardialinfarction）方面的文献添加到检索框检索勾选主题词检索结果输入检索词点击“Search”例：通过主题词途径，检索有关心肌梗塞（myocardialinfarction）预防（preventionandcontrol)方面的文献确定主题词选择副主题词添加到检索框检索主题词加权检索选项检索结果例：通过主题词途径，检索有关心肌梗塞（myocardialinfarction）预防（preventionandcontrol)方面的文献。要求主题词加权、不扩展检索勾选加权检索、不扩展检索选项添加到检索框检索检索结果题录检索例：检索《病毒杂志》（archivesofvirology）2009年发表的《基因稳定性与连续性分析》（geneticstabilityandlinkageanalysis）这篇文献输入检索信息点击“Search”点击期刊检索检索框输入刊名点击“Search”例：查找《新英格兰医学杂志》（nejm）

PubMed基本检索规则布尔运算符AND，OR，NOT必须大写例如：vitaminORzincPubMed从左至右进行布尔运算，可以通过加圆括符改变运算顺序例如：commoncoldAND(vitaminORzinc)指定文献记录字段名称检索

例如：DNA［mh］ANDcrick［au］AND1993［dp］

常用字段名称缩写：

DP——出版日期如1998［dp］；输入日期范围则用冒号连接，如1996：1998［dp］

AD——第一作者机构名称、地址、资助号如tianjin［ad］

AU——作者姓名如woods［au］

TA——期刊名称包括期刊名全称、简称、ISSN如science［ta］或0021-9258［ta］

LA——文献出版语言如Chinese［la］

MH——Mesh主题词如neoplasm［mh］

PT——出版类型如review［pt］

TW——自由词

TI——文献标题内自由词如leiomyosarcoma［ti］

作者姓名[字段标识]Woods[au]输入检索词详细检索过程输入检索词详细检索过程刊名[字段标识]Science[ta]输入检索词详细检索过程输入检索词详细检索过程词组检索例如：“singlecell”截词检索：*例如：输入infect*，可检出infection，infectious，infective，infectivity，infector等截词检索只限于单词，对词组无效

双引号，系统进行强制检索注意：检索词自动转换匹配功能关闭输入检索词检索结果详细检索过程词组检索输入检索词检索结果详细检索过程*通配符，可同时检索含有infection，infected，infections等词的文献注意：检索词自动转换匹配功能关闭输入检索词详细检索过程主要内容PubMed概述PubMed检索途径与使用方法检索结果导入NoteExpressPubMed元数据利用65从图书馆网站下载NoteExpress66检索结果保存为Medline格式文件67从