眼科遗传病基因检测简介

眼科遗传病基因检测1主要内容检测介绍病例分享背景介绍2世界和中国的视力残疾情况据WHO2010报告估算：全世界有盲人0.39亿，视力低下患者2.64亿，视力障碍病人2.85亿；其中，我国有825万盲人，占全世界盲人数的20.9%;据2006年我国残疾人调查显示：我国视力残疾人数为1223万人，占残疾人口的14.86%；

6-14岁学龄残疾儿童中，视力残疾儿童为13万人，占残疾儿童的5.28%。3全球各地失明、视力低下和视力障碍发病率数据来源：WHO--GLOBALDATAONVISUALIMPAIRMENTS20102006年残疾人口分布数据来源：2006年4月1日我国残疾人调查结果眼病的致盲原因4数据来源：WHO--GLOBALDATAONVISUALIMPAIRMENTS2010白内障、青光眼、黄斑变性、角膜病、儿童眼病等是致盲主要原因，基因遗传是重要因素。眼科遗传病5遗传性眼病单基因遗传性眼病常染色体显性遗传常染色体隐性遗传性连锁遗传多基因遗传性眼病染色体遗传性眼病体细胞遗传性眼病线粒体遗传性眼病已发现约600多种遗传性眼病，其中相当部分为单基因遗传病（200多种），占遗传性眼病的1/3。

我国单基因眼病总体发病率4%。遗传性眼病分类单基因眼科疾病的特点

高度异质性；–临床异质性（已知就达200多种）–遗传异质性(如RP已知致病基因达50多个)遗传方式多样性；–AD、AR、X-link–线粒体遗传诊断难、治疗更难6眼结构及视冲动传导途径7角膜虹膜黄斑眼睛各部位的缺损都有可能致盲RP、LCA、色盲、夜盲角膜营养不良先天无虹膜黄斑病变视神经萎缩视锥视杆细胞营养不良基因检测全方位解决方案1.单一眼科疾病基因检测、2.一类眼科疾病基因检测---遗传眼科疾病Panel检测3.线粒体遗传眼病---线粒体遗传眼科基因检测4.复杂疾病、多器官系统---全外显子组基因检测全方位解决方案8单基因眼科遗传病检测内容9包括三大类产品，涵盖35种眼科疾病，涉及215个基因，外显子覆盖度95%以上。常见非综合症型眼科遗传病基因检测常见综合症型眼科遗传病基因检测眼科遗传病基因筛查视网膜病:如RP、先天黑蒙、先天性静止性夜盲、色盲、黄斑变性等视神经病：视神经萎缩玻璃体病：玻璃体视网膜病变、视网膜劈裂症角膜病：角膜营养不良葡萄膜病：先天无虹膜眼球病：眼球震颤、小眼畸形等6大综合症：如巴-比综合征、Senior-Loken综合征、尤塞氏综合征、Joubert综合征等疾病易感基因筛查:年龄相关性黄斑变性基因检测（目标区域测序）

年龄相关性黄斑病变风险基因筛查（飞行时间质谱）检测内容检测人群及意义10辅助诊断指导治疗风险评估遗传咨询确定致病突变，精确诊断对患者指导基因或干细胞治疗，指导护理，降低复发风险；对无临床症状表现者，了解基因携带情况，及早干预为患者家庭提供指导，指导优生优育评估患病的风险，采取必要措施降低发病风险；适用人群:有临床表型的疑似患者有眼病家族史的人群生育过眼病患儿的夫妇眼科遗传病高发地区及近亲婚配人群普通人群(如年龄相关性黄斑变性基因筛查针对40岁以上人群)11视网膜色素变性眼底扫描发病率：1/3500，全球至少有150万人患有此病。特点：视锥细胞、视杆细胞退化，并同时出现不正常的色素凝块。因中央和周围的视觉退化，只能看见前方如管状范围的“管状视野”。检测基因：RP1，RP2，RPGR，RHO，PRPH2，ROM1，RP9等57个基因。正常视力所见患者所见正常视力所见患者所见视网膜色素变性先天性黑蒙（LCA）12发病率：1/80000，占遗传性视网膜病变5%以上，是导致婴幼儿先天性盲的主要疾病（占10%-20%）。特点：发生最早、最严重的遗传性视网膜病变。遗传机制：多呈常染色体隐性遗传，研究发现数种相关的致病基因。预防及治疗：检查血液中氨基己糖苷酶A活性。少数临床案例通过基因治疗取得成效。检测基因：包括RPE65，GUCY2D，CRX,，RPGRIP1，CRB1，AIPL1等19个相关基因年龄相关性黄斑变性发病率：一般从40岁开始发病，随着年龄的增长发病率增加。据统计，60至74岁的老年人患病率在10%左右，而75至85岁的老年人患病率上升至30%。该病在美国已成为50岁以上人群致盲的首要因素。在我国，其致盲率仅次于白内障。该疾病的发生具有较明显的家族遗传性，其中50%的患病者家族中都曾出现过该病患者。发病机理：可由遗传性病变、老年性改变、炎症性病变所引起，也可受其他眼底病变的累及。预防：停止吸烟、适当补充叶黄素可以预防黄斑变性的发生，或控制病情恶化。检测基因：

年龄相关性黄斑变性基因检测：ABCA1，ABCA4，ACE，ADIPOR1等57个基因；

年龄相关性黄斑变性风险基因筛查：选取三个基因位点，利用飞行时间质谱技术检测；13为什么健康人群有必要参加黄斑变性风险基因筛查？年龄相关性黄斑变性早期不易被察觉；发病率高，尽早筛查，可以有效预防；致盲具有不可逆转性。如果受检者感觉视力受影响后再检查，往往到了中晚期，错过了预防和治疗的最佳时期。14基因检测的策略及流程15医生进行报告解读和遗传咨询及后期临床处理在找到患者的致病突变或了解了患者亲属的突变携带情况后，患者及其亲属怀孕后，可到妇产科采集绒毛或羊水进行胎儿突变位点的验证，检测胎儿是否遗传到致病突变患者结果验证医生根据报告结果和临床需求建议家系成员进行突变位点验证对患者进行相关疾病目前已知致病基因检测对患者进行已知遗传方式的相关疾病及基因检测筛查出已知致病突变遗传方式不明已知家族遗传方式确诊患者家族有患者的表型正常人群已生育过患者患儿的父母高通量测序技术方法161.目标序列捕获+新一代高通量测序技术（主要）液相捕获

技术流程：1基因组DNA打断；2文库制备；3液相杂交；4磁珠捕获；5洗涤；6洗脱目的片段PCR扩增；7QC检测富集度；8测序分析。2.飞行时间质谱（只针对“年龄相关性黄斑变性风险基因筛查”项目）ddATPddCTPddGTPddTTP单碱基延伸技术（iPLEX™）服务流程及样品要求17华大流程受检者医院眼科检查医生推荐进行基因检测医生指导知情同意收费样本采集、运输临检中心收样检测出具报告并发放医生负责报告解读样本类型体积/总量运输/保存新鲜全血5mL婴幼儿3mL保存于EDTA抗凝采血管中，充分颠倒混匀，避免凝固，冰袋/干冰运输。室温放置不超过3天。冻存全血5mL保存于EDTA抗凝采血管中，-20℃保存不超过2年，反复冻融不超过5次。DNA≥6ug溶液：-20℃保存不超过2年，尽量避免反复冻融。干粉：-20℃保存，较溶液稳定，建议采用此形式。干血片3个血斑常温运输(干血片仅针对年龄相关性黄斑变性风险基因筛查)服务流程样本要求Gavin的故事

——全外显子组寻找致病突变筛查LCA17个已知相关基因，未见致病突变18LCA:先天性利伯氏黑蒙全外显子组基因检测2460未经报道的变异10个无义突变改变了蛋白质的表达5个突变表达在视网膜上NMNAT1,LCA9,1p36.22769G>Ap.Glu257Lys/507G>Ap.Trp169*+/+c.769G>A,p.Glu257Lysc.507G>A,p.Trp169*用Sanger法验证TheNMNAT1mutationinother10casesfrom9unrelatedfamilies错义突变无义突变ChiangPWetal.,2012验证9个家庭的10个病例均发现了NMNAT1突变19检测机构检测内容周期价格检测方法Baylor20+种病（亚型）AlleleSpecificTesting,NGS,

microarrayAPEX(arrayedprimerextension)Emory9种病8wksgenedx35种病（亚型）6-10wkscarverlab29种病4-14wks$121-1377NIH(EyeInstitute)eyeGENE®34种病ShileyEyeCenter18种病12-16wks$850-2500俄国Oftalmic55种病4-10wks8000-95000RURSanger,NGSsequencing,MLPA德国CeGaT11panels-126genesSureSelectEnrichmentandSOLiDTMSystem华康基因眼科PAN