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文档简介
《信息检索生物工程》(研究生)全册配套完整课件
信息检索
(生物工程硕士)课程大纲复旦图书馆资源介绍与检索导论常用检索数据库(WOS,NCBIPubmed)中英文期刊全文数据库特种文献检索(会议,学位论文,专利)生物学专业数据库使用生物学网上资源科研选题和论文撰写考查方式课堂检索小测验信息检索报告复旦图书馆的资源与服务信息检索复旦图书馆拥有的主要资源印刷图书:480万册(含图书和期刊合订本)其中线装古籍近40万册(含善本6万册)民国时期图书10万册电子图书:126万册
印刷期刊:7,000余种电子期刊:中文电子期刊1万余种外文电子期刊1.9万余种
数据库:250余种
学术资源门户——Metalib/SFX电子资源访问注意事项理科图书馆开放时间印刷图书——借阅规则数量与借期:研究生15册中文借期2个月外文借期1个月续借:每本书只能续借1次续借期限为30天,总借阅时间不超过3个月续借后,延长的时间段从续借当天算起预约:对馆藏状态为“借出”的图书进行预约每位读者最多只能预约2本图书系统向预约者发E-mail通知前来取书还书:到期前7天系统发邮件通知罚金:逾期须交纳滞纳金每册每天0.1元印刷图书——检索方式网上查询:图书馆主页-资料查询-图书-馆藏目录
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或直接输入:1/F注意:请记录图书的索书号根据馆藏地信息到相应阅览室借阅书目查询书目查询书目查询书目查询登陆个人借阅信息直接检索书刊信息印刷图书——随书光盘随书光盘随图书就近存放文科图书的光盘存放在文科馆电子阅览室理科图书的光盘将存放在理科馆外国教材中心医科馆和张江馆的随书光盘分别存放在所在分馆随书光盘不提供外借,可在馆内查阅如有必要,请自带存储设备印刷图书——特色馆藏哈佛和MIT教材理图202(外国教材中心),2.8万余种。/havard/欧盟赠书文图118(文科外文图书引进书库),1600余种图书。/EABC/复旦人著作理图204(复旦人著作陈列室),8000余种。/fdpub/
电子图书超星数字图书馆教学参考书CALIS中国高校教学参考书全文数据库民国时期图书方正Apabi电子图书中国基本古籍库ECCO十八世纪作品在线EEBO-EarlyEnglishBooksOnlineNetLibrary电子图书SpringerLINK电子图书
中文电子书外文电子书电子图书注意馆内访问访问方式电子图书印刷期刊网上查询:图书馆主页-资料查询-期刊-馆藏目录
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或直接输入:1/F注意:检索印刷期刊和图书的方法相同请记录期刊的索书号根据馆藏地信息到相应阅览室借阅
电子期刊——中文电子期刊中国期刊全文数据库:镜像、主站并发用户数均为100
新增世纪期刊1979-
New中文科技期刊数据库万方数字化期刊中文电子期刊按刊名或ISSN检索期刊限定学科及出版商检索期刊中文电子期刊中文电子期刊点击刊名,进入该刊中文电子期刊按字母顺序浏览电子期刊中文电子期刊电子期刊——重要外文电子期刊EBSCO电子期刊(含ASP、BSP等)ElsevierScienceDirect电子期刊JSTOR电子期刊Springer电子期刊(含Kluwer)Blackwell电子期刊(转入Wiley平台)WileyInterScience电子期刊
外文电子期刊按刊名或ISSN检索期刊限定学科及出版商检索期刊详细使用说明外文电子期刊外文电子期刊按字母顺序浏览电子期刊外文电子期刊数据库中文数据库外文数据库试用数据库
点击试用数据库后面“欢迎评价”链接,对该资源进行评价,为图书馆制订订购决策提供重要参考。
注意:欢迎使用数据库导航系统主要中文数据库高校学位论文数据库(CALIS)万方数据库(包括:中外标准,政策法规,会议论文,企业,科技成果,科技文献,学术期刊,学位论文,专利技术)中国优秀博硕士学位论文数据库维普资讯-中文科技期刊数据库中国期刊全文数据库中国生物医学文献数据库
主要外文数据库ProQuestDissertations&Theses(PQDT)WebofKnowledge-WebofScienceWebofKnowledge-ISIproceedingsWebofKnowledge-CurrentContentsConnectWebofKnowledge-JournalCitationReports(JCR)数据库导航代理设置方式详细使用说明联系负责老师数据库导航按关键词查找数据库数据库导航按首字母浏览数据库数据库导航学术资源门户——MetaLib/SFX同时检索多个数据库电子期刊查找、全文获取个性化服务MetaLib/SFX同时检索多个数据库查找电子期刊个性化服务MetaLib/SFXMetaLib/SFXMetaLib/SFXMetaLib/SFX电子资源访问注意事项校园网用户
一般都可直接访问,有特殊说明的资源除外。校外访问
一般需要设置:8080的代理,需要使用校园统一身份认证,用户名为本人学号,如果忘记密码,请使用您的复旦邮箱发送Email到urp@索取,邮件中须注明您的姓名、学号、所在院系。图书馆检索厅
免费检索电子资源。注意:请遵守《复旦大学电子资源使用管理办法(试行)》如何设置代理?如何设置代理?复旦图书馆提供的主要服务文献传递馆际互借读者培训学科服务科技查新参考咨询文献传递
服务范围服务内容服务方式1.CALIS馆际互借系统请求:5/gateway/2.柜台请求:文科图书馆三楼报刊部3.Email请求:libill@4.电话或传真请求:021-65643176021-65649814
工作人员在1个工作日内,处理该文献传递请求。工作人员获得该文献后,在1个工作日内向读者发出通知,读者凭本人证件取件并结算费用。文献传递收费标准文献传递费=手续费+传递费
手续费:CALIS文献传递服务网内服务馆收藏的文献:2.00元
国内图书馆收藏的文献:5.00元
国外图书馆收藏的文献:10.00元
传递费:按被请求馆传递费实收研究生:每人每年免费文献传递100页New注意:Science文献免费传递馆际互借如果您所需要的图书复旦大学图书馆未收藏,而其它和我馆有馆际互借协作关系的图书馆有收藏,可利用馆际互借服务,借阅到您需要的图书服务对象:本校教师、研究生办理地点:文科图书馆二楼书库借阅处(210室)联系方式:65643044libhumr@读者培训定期培训
图书馆主页-读者服务-读者培训可以查看本学期的培训计划,下载培训讲义。预约培训
图书馆主页-读者服务-预约培训
如果同一资源同一时间预约人数超过10人,即可开设培训。
培训信息可以通过图书馆主页读者培训栏目、公告板、BBS图书馆版、资源相关专业BBS版面、系资料室公告获得。读者培训培训PPT陆续上网读者培训科技查新教育部科技查新站(综合类)地址:文图104电话:65643168科技查新为科研立项、成果鉴定、专利申请、技术咨询等工作提供可靠的文献依据,证明其课题是否具有前瞻性和研究价值,并出具查新证明查收查引提供SCI、EI、ISTP、SSCI、A&HCI的收录和引用检索,及通过JCR检索发表期刊的影响因子,并出具检索证明,该证明被复旦大学及其它高校和科研机构所认可科技查新参考咨询现场咨询:文科图书馆103室(咨询台)电话咨询:55664282实时咨询:图书馆主页-咨询台-实时咨询邮件咨询:libref@BBS咨询:日月光华图书馆版留言咨询:图书馆主页-留言簿实时咨询:MSN,QQ充分利用复旦图书馆的资源与服务!随堂测验(1)通过馆藏目录OPAC系统中的高级检索途径查找洪国藩所著的《水稻基因组工程》,并了解其馆藏情况,包括馆藏地点、索书号、借阅信息等。通过电子期刊查询系统了解期刊《Biomaterials》被哪个全文数据库收录?
以学号+名字为题发邮件到xueyanyang78@
计算机检索基础信息检索网络环境下信息获取的特点资源更丰富、类型更多样功能更全面、协同能力更强劲
(跨库检索、无缝链接)连接更广泛、共享更深入(跨地域、跨学科共享资源、Anybody,Anywhere,Anytime)网络环境下学习信息检索的意义提高信息获取结果的精度提高信息获取的效率数字图书馆——数字化知识资源电子文献的代表对非数字化知识(传统文献)数字化处理数字化知识(原生数字形态)数字化处理“全球信息高速公路上信息资源的基本组织形式”“存储电子格式的资料,并对这些资料进行有效的操作”数字图书馆特点信息存取多媒体化信息组织有序化操作电脑化传输远程网络化资源共享化一站式服务(跨库连接无缝化)数字图书馆环境下必需的信息技能识别信息需求的能力;表达信息需求的能力;建构合适的信息策略的能力;定位和存取合适信息的能力;比较和评估不同来源获取信息的能力;在解决问题、完成任务或决策制定中组织、交流和应用信息的能力;在现有条件下产生新信息的能力。文献——按出版类型划分图书连续出版物特种文献教科书工具书报纸期刊科技报告专利文献学位论文标准规范政府出版物产品资料会议文献专著文献——按加工深度划分一次文献(原始文献)
二次文献(书目文献、索引)
三次文献(教科书、参考工具书、综述)零次文献(私人笔记、试验记录、设计草图、口头交流的信息等)用户输入检索需求分析转换处理需求数据库概念词典控制词表信息源筛选录入分类索引文档预处理匹配运算检索结果信息检索的原理检索语言1.描述文献外表特征的检索语言书刊名、著者、著者机构、出版机构等
2.描述文献内容特征的检索语言分类检索语言主题检索语言关键词:著者表达文献中具有特征意义的实义词,一般可出现在标题、文摘、文章前置关键词、全文等内容字段中,也可称自由词。主题词:系统表达文献中具有特征意义的实义词有规范词表系统(如MEDLINE),也称规范词或控制词。规范词出现在相应的字段中
索引词:关键词和主题词混合词表中的词检索途径1.自由词检索2.主题词检索3.分类检索4.著者检索5.引文检索6.机构检索7.刊名检索8.默认检索9.其它检索途径其它检索途径有:专利号(patentnumber)检索,国际标准连续出版物编号(ISSN)检索,化学物质登记号(CASregistrynumber)检索,分子式(formula)检索,记录顺序号(accessionnumber),化合物结构图检索(structuresearch)检索等。信息检索步骤分析检索课题,明确检索要求选择检索工具,确定检索途径确定检索标识,确定检索运算构筑检索提问,获取初步结果调整检索策略,获取所需信息分析检索课题,明确检索要求了解某一理论、方法、设备、过程等具体
的片断的信息,以解决研究中的具体问题,要求以“准”为主。申请发明、申报成果奖励、鉴定科研成果以及立项查新时,往往需要全面地收集某一主题范围的文献信息,这类课题具有普查追溯的特点,应着眼于“全”。选择检索工具核心检索系统能够系统、全面地获取检索课题相关的重要学术文献信息,并能链向全文数据库。【例】NCBIPubMedWebofKnowledge
中国生物医学文献数据库选择检索工具全文数据库能够检索学术论文或综述的全文【例】ELSEVIEREBSCOPQDD(学位论文数据库)
选择检索工具网络检索引擎、事实、数值数据库能够检索具体数值、特征、事实信息(如名词解释、统计数据等)或广泛的信息概况。【例】GooglePDQ
百度确定检索途径分类途径信息需求:浏览学科、专业信息,了解专业背景如:了解分子生物学研究的相关文献
1.关键词检索课题:序列分析研究工具和方法的相关文献检索标识:关键词序列分析(sequenceanalysis)
工具(instrument,tool)
方法(method,plan,technique,way)主题检索途径——查找专指概念的文献常见限制字段:TI,AB,FULLTEXT无系统规范词表情况下使用:
(计算机,电脑,微机)查最新的文献时使用:(禽流感)课题:序列分析研究工具和方法的相关文献检索标识:规范词序列分析
sequenceanalysis[MH]
方法,工具
methods,instrumentation[SubHeading]副主题词(subheading):限定规范主题词某一方面内容的规范词: MEDLINE数据库82个():如:诊断:diagnosis,radiography,radionuclideimaging,ultrasonography治疗:drugtherapy,radiotherapy,surgery,therapy病因:etiology,pathology,chemicallyinduced药物作用:therapeuticuse,adverseeffects著者检索途径——某人发表的文章检索标识:著者姓名常见限制字段:au著者姓名的转换:姓在前,名首字母在后。
JasonSmithSmithJHenryG.WilliamWilliamHGClinton,JaffersonB.ClintonJB
卢大儒LuDR,LuD刊名检索——检索指定刊物上的文献检索标识:刊名缩写或全称常见限制字段:SO,SOURCE刊名全称
NewEnglandJournalofMedicine刊名缩写
NEnglJMed机构检索——查找机构学者发表的文献检索标识:机构名缩写或全称常见限制字段:AD,address,addressword,institution,organization,affiliation如:FudanUniversityFudanUniv引文检索途径引文回溯:是指通过文献原文后附有的参考文献(被引用文献)来查找文献的一种方法。作用:以比较少的文献引出较多的文献,研究科学文献的前期工作基础、相关文献、经典著者、重要期刊等,了解某一课题研究的发展脉络。引文检索:是指通过被引用文献,来检索文献的相互引证关系的情况,包括:某一著者的文献被什么人、什么文章引用?引用的频率?某些期刊被文献引用的频率?某些文献的主题被引用的频率等。常见限制字段:引文,Referencecited引文检索的作用在研究课题早期、经典文献的基础上,获得后人最近的研究文献。在引文检索的基础上检验文献,评价文献、著者和期刊的权威性。加菲尔德(Eugene
Garfield
1925--
)的引文索引检验文献的观点著者的文献被人引用的频率,为评价著者及其文献的质量,提供参考数据期刊被人引用的频率,为评价期刊的权威性提供参考数据主题被人引用的频率,为评价研究热点和趋势提供参考数据机构和实验室的文献被人引用的频率,为评价机构的资质提供参考数据引文检索工具Webofscience中国引文数据库全文数据库、文摘数据库中的引文(参考文献)字段检索专业引文数据库了解数据库中的各种检索方式分类浏览
Categorybrowse简单/基本检索
Simplesearch,Basicsearch高级检索
Advancedsearch/Detailedsearch/ Focussearch专家检索
Expertsearch分类浏览简单检索高级检索高级检索2024/9/4复旦大学图书馆文献检索教研室94专家检索(输入结构提问式)sequenceanalysisand(instrument*ortool*ormethod*)默认检索
默认检索又称缺省检索、隐含检索,在检索系统预先设定的多个字段中进行检索。
Medline――默认在标题、著者、出处、文摘、主题词等字段中检索。
CNKI――默认主题检索,即在标题、关键词、文摘字段中检索。确定检索运算符(operator)布尔算符:and,*(逻辑与)
or,+(逻辑或)
not,-(逻辑非)位置算符:有near,N,W,adj等形式字段限定符:常用的有in.=截词符:*,?(左,右,任意)布尔算符ABAandBBAorBABAnotB运算次序:not→and→orA
电脑and病毒电脑or微机or计算机电脑not综述布尔算符应用举例
课题:序列分析的工具和方法
序列分析and(工具or方法)sequenceanalysisand(instrument*ortool*ormethod*)
截词符检索举例
右截:用compute*可检索到含有以下词的记录compute,computers,computed等左截:*ters可检索到:computers,testers,等任意截:‘tal’可检索到:costal,talk,metallic
位置算符应用举例序列分析更具体的概念词检索:Sequencenear3analysisNear:检索词出现在同一句子中,near3表示两个检索词中间最多允许插2个词。SequenceAminoAcidAnalysis;SequenceProteinAnalysis;SequenceDNAAnalysis;SequencePeptideAnalysis;SequenceRNAAnalysis;字段限定检索举例
hepatoma[TI]――标题中检索smith-b[AU]――著者字段检索anemia[TI,MESH]――标题或MeSH字段检索nature[SO]――检索期刊Nature上的文章review[PT]――检索综述文献综述[PT]――同上English[LA]――检索语种为英语的记录构筑检索提问(式)检索式又称检索提问式,是情报用户向检索系统表达文献需求的句式。简单检索式--含一个检索词复合检索式--含有布尔算符和至少两个检索词
检索式举例:
课题1:人类序列分析的方法自由词检索:
(Sequencenear3analysis)intiand(method*ortool*orinstrument*)andhuman自由词检索限在ti字段中,可提高提高检索准确度规范词检索:
sequenceanalysis/methods,instrumentationandhumanExplode为规范词检索的系统扩展指令,可检索所有Sequenceanalysis的下位概念。
信息检索的一般思路和调整审题寻找合适的检索词,组织检索策略分解到最小的检索点不同的检索点选择合适的检索方法逻辑清楚初步检索,并根据结果反馈和调整内容偏差数量偏差扩大检索缩小检索完成检索不同的检索点选择不同的检索方法明确外部特征的基本检索(特定字段)检索如著者、刊名、专有名词、特有名词、新名词自由词检索明确主题概念或明确某一个方面规范化主题词检索学科分类体系明确分类检索不同方法相结合检索结果数量太多
限定检索:核心期刊、文献类型、时间、年代、国家、地区加权:主要主题词检索meshmajortopics
文章主要描述的内容,数据库作标记“*”为主要主题词。2024/9/4复旦大学图书馆文献检索教研室108限定检索2024/9/4复旦大学图书馆文献检索教研室109PubMedCoreclinicaljournals加权检索
关键词在文中出现的百分比称为权重,文中出现的频率高,权重就高,数据库做加标处理,称加权,表示其在文中的重要程度,运用加权检索可以命中核心概念文献。文中描述的一般主题,数据库未加标权重sequenceanalysis[MAJR]
限定只检索主要主题词字段,即该主题词必须是文献的核心主题sequenceanalysis[mesh]包含了非核心主题文献的检索检索结果数量太少
用上位词扩展检索选全部副主题词减少检索and用词专有名词或药物名称的多种写法用上位词扩展检索Explodesequenceanalysis可检出:SequenceAminoAcidAnalysis;SequenceProteinAnalysis;SequenceDNAAnalysis;SequencePeptideAnalysis;SequenceRNAAnalysis选全部副主题词原检索式:
Magneticresonanceimagingandbrainneoplasms/radiography,diagnosis扩大检索结果:
Magneticresonanceimaging[Mesh]andbrainneoplasms[Mesh]减少检索and用词Sequenceanalysisandtool*andhepatitisBvirusSequenceanalysisandhepatitisBvirus强调某一具体研究对象而非研究工具Sequenceanalysisandtool*强调研究工具而非具体对象专有名词或药物名称的多种写法Aspirin商品名Benzoicacid,2-(acetyloxy)系统化学名Salicylicacidacetate一般化学名检索课题的确立确定课题方向浏览课题相关专业分类概览专业文献、综述调整课题具体内容 细化或放宽中文综述》》英文综述》》研究论文谢谢!信息检索(二)杨雪艳核心检索数据库信息检索常用核心数据库WebofKnowledgeNCBI-PUBMED1、WebofKnowledge1.1概况2001年5月美国科学信息研究所(ISI)采用新的技术,通过统一的检索平台,建立了具有跨库检索功能的ISIWebofKnowledge学术信息资源体系。有效地整合了学术期刊、技术专利、会议录、化学反应、研究基金和Internet资源等各种信息资源。1.2收录内容1.2.1数据库:WebofScience科学引文数据库CurrentContentsConnect现刊目次数据库DerwentInnovationIndex德温特创新索引BIOSISPreviews生物学文摘MEDLINE美国医学索引JournalCitationReports期刊影响因子WebofScience收录6300多种世界领先的科技期刊周更新,每周加入18700条新记录数据回溯至1898年世界领先的自然科学、社会科学、艺术和人文领域的权威学术文献数据库;研究和分析国际会议、专题讨论会、研讨会、座谈会、研习会和代表会议的会议文集。DerwentInnovationsIndexDII是集成了DerwentWorldpatentsIndex和DerwentPatentCitationIndex的一个基于互联网Web的专利信息资源,它收录来自40多个专利机构授权的1000多万项基本发明、3000多万个专利,每周更新并回溯至1963年,为研究人员提供世界范围内的化学、电子与电气以及工程技术领域内综合全面的发明信息。一般来说,全世界每年发明成果的90-95%在专利文献中可以查到,而在其他文献中只反映5-10%,因此专利文献是查找技术应用的最重要文献源。辅助资源AnalyticalTools:JournalCitationReports(JCR)(期刊引用报告数据库)与科学计量学工具结合的具有分析功能的数据库
JournalCitationReports
是对世界权威期刊进行系统客观评价的有效工具,包含自然科学领域的5600种权威期刊涉及26个专业研究领域的期刊,其中包括:农业、生物化学和分子生物学、生物物理、生物学、化学、工程学、环境科学、免疫学、材料科学、数学、物理学、动物学等。对于每一份被收录的期刊提供:引文和论文数量、影响因子、立即指数、被引半衰期、引用半衰期、源数据列表、引用期刊列表、被引期刊列表、主题分类、出版社信息、期刊标题变化等。作者可以用它找到最适合自己又最具影响力的期刊,确定投稿方向和核心期刊;1.2收录内容1.2.2.辅助资源:
WebSearchTools:ThomsonScientificWebPlus科学研究网络资源搜索工具
WebSites:
高被引文献网ISIHighlyCSM
生物学浏览器BiologyBrowser
有机体名称索引IndextoOrganismNames
重要科研、热点研究观察网in-cites
特殊专题报告SpecialTopics®
1.3WOK的应用利用SCI/SSCI了解研究现况并进行课题创新利用管理功能,跟踪课题的最新进展利用数据库选择投稿期刊,更快更好地发表SCI/SSCI论文利用Endnote
Web高效率写作研究论文利用数据库洞悉科研产出以及国际影响力2、WebofScience2.1SCI概况美国科学情报研究所(ISI)编辑出版数据库组成:1.引文数据库ScienceCitationIndexExpanded(收录5700多种科技期刊)SocialScienceCitationIndex(收录1700多种社会科学类期刊)Arts&HumanitiesCitationIndex(收录1100多种艺术和人文类期刊)2.化学数据库Current
Chemical
ReactionsIndex
Chemicus2.2进入路径→外文数据库→WebofKnowledge→WebofScience选择数据库和设定检索年限选择检索方式2.3检索主界面三个引文数据库选择检索年限两个化学数据库2.4检索方式Search(常规检索)CitedReferenceSearch(引文检索)AdvancedSearch(高级检索)StructureSearch(结构检索)2.4.1.Search如果需要检索三个以上字段,单击此处。选择检索字段选择运算符选择数据库和设定检索年限基本规则在检索框中输入检索词(关键词、著者姓名、刊名等)。词组检索可使用双引号。支持AND、OR、NOT的逻辑组配,同时使用时遵循NOT>AND>OR的运算顺序。提供SAME位置算符,表示检索词必须出现在同一个句子中,前后词序任意。著者检索输入格式为:SmithJP截词符:?替代1个字符;$替代0个或1个字符。*替代多个字符检索字段Topic----在题名、关键词、文摘字段中检索Title----题名Author----著者GroupAuthor----团体著者PublicationName----出版物名称(刊名)YearPublished----出版年Address----著者所在机构地址(缩写)Language----原文语种DocumentType----文献类型点击获得相应的帮助。例1查找有关氨基头孢烷酸(第二代抗生素头孢类抗生素的中间体,具有降低成本,减少环境污染的优点)的研究论文,并了解国内主要有哪些机构在研究该课题?已知缩写:GL-7-ACA检出结果同义词处理输入后检出结果点击论文标题,获得详细内容详细内容论文详细内容获得该记录的电子版全文(需订购)FullTextSFX获取与论文相关的各种电子资源,如:馆藏信息、全文、搜索引擎、作者其他论文等。侧栏1Citedby:该记录的引用文献数。相关文献(具有共引文献的记录)参考文献CreateCitationAlert:对该记录创建引文跟踪,了解今后该文献的被引用情况。第一篇引用文献按顺序浏览其他引用文献RelatedRecords(相关记录):与本文引用了一篇或多篇相同的参考文献的论文。共引记录数RefineResults优化检索结果优化检索结果AnalyzeResults分析检索结果可按以下角度分析检索结果:作者、国家、作者机构、刊名、主题分类、出版年度、语种、文献类型等。AnalyzeResults功能分析功能可以帮助您清晰准确地了解检索结果的相关信息。在本例中您可以了解:氨基头孢烷酸研究论文最多的作者是谁?氨基头孢烷酸研究论文最多的机构是哪里?氨基头孢烷酸研究论文在哪一年发表的最多?氨基头孢烷酸研究论文主要发表在那些杂志上?氨基头孢烷酸研究论文主要涉及哪些研究领域?氨基头孢烷酸研究论文的机构分析表中国科学院分析检索结果界面分析记录执行键在检索分析选择框中依次选择:--需要分析的字段--需要分析的记录数(最多为10000条)--分析结果显示的集合数--分析结果的排序方式然后点击Analyze进行分析分析结果按记录数、百分比、以及柱形图式方式显示对于感兴趣的分析集合可以标记后点击ViewRecord浏览建立引文分析报告
CreateCitationReport建立引文分析报告建立引文分析报告有关课题研究论文20年发表趋势发表论文的20年引文趋势每篇文章的引文趋势2.4.2.CitedReferenceSearchWebofScience精选了全世界8,600多种顶尖的学术期刊的文献信息。每条文献的信息包括论文的参考文献,用户可以通过被引著者或被引文献的出处展开检索,追溯课题的起源和发展。几个重要概念被引用文献(citedpaper)
著者撰文时所引用的文献,也称参考文献。引用文献(citingpaper)
文后引用了参考文献的文献。引文(citation)
引用文献和被引用文献的统称。相关记录(relatedrecords)
共同引用一篇以上相同参考文献的文献。被引用文献被引用文献:期刊文献学术著作专利会议文献技术报告引文检索是指以文献被引者(包括被引著者、被引期刊或被引主题)为检索词来查找引用文献的科学查询方法。作用将原始论文与其参考文献有序地组织起来;反映各学科相互交叉、相互渗透的现象;评价科学论著和科技期刊的价值和生命力、科技工作者的研究能力和影响力以及科学机构的学术研究水平
CitedRefenceSearch引文检索CitedAuthor---被引用著者CitedWork---被引用刊物CitedYear---被引用文献发表年份例2:查找闻玉梅教授发表在Lancet杂志上论文的被引情况输入刊名输入被引作者姓名
Wenym教授
在Lancet中被别人引用过的文献单击浏览详细内容闻玉梅教授论文的摘要TimesCited被引用次数=引用文献篇数该论文的57篇引用文献闻玉梅教授论文的参考文献参考文献(5)篇2.4.3.AdvancedSearch
高级检索能够完成较为复杂的检索,检索更灵活,同时对用户检索技能的要求也更高。字段限定:字段代码=(检索词)
例如:ts=(“stemcell$”)
TS=TopicTI=Title
AU=AuthorGP=GroupAuthor
SO=SourceAD=Address
OG=OrganizationSG=Suborganization
SA=StreetAddressCI=City
PS=Province/StateCU=Country例3脐血干细胞移植治疗脑卒中输入检索式TI=(“cordbloodstemcell$”)ANDTS=(stroke)浏览检索结果2.4.4.StructureSearch只能在Chemistry数据库中使用。该数据库包括:1.Current
Chemical
Reactions
提供1986年以来的75万多条化学反应的信息,以及来自INPI(法国工业产权局)所提供的19世纪以来的化学反应信息,包括化学反应式、反应流程、反应条件等。提供每种合成方法的总反应流程,并提供每一步骤详细、精确的图示。2.4.4.StructureSearch2.index
Chemicus
提供1993年以来近200万个包含主要国际期刊中报道的新有机化合物的结构和评论数据。可利用化学结构、立体化学和生物活性展开检索。2.4.4.StructureSearchStructure检索特点-可利用化学结构及反应类型进行检索-提供绘图工具软件-具有较强的Web链接特性-可使研究人员设计合成路线、选择最佳反应试剂、研究反应机制2.4.4.StructureSearch选择数据库启动软件画结构图BacktoDrawQueryReactionSearchResults-Summary
化学反应检索结果表点击后看化学反应的详细信息点击后看完整记录例4:运用ISIChemistry数据库,检索Vioxx(通用名为罗非考昔)抗炎活性Antiinflammatory反应流程。步骤1在WebofScience中选择化学数据库步骤2
在化合物名称栏和生物学活性栏中分别输入相关检索词浏览生物学活性复合词表输入生物活性关键词选择并添加步骤3.选择复合词添加后的复合词检索结果列表点击可获得详细反应流程详细反应流程中文引文检索中国科学引文数据库(CSCD)中国期刊全文数据库(CJFD)万方数字化期刊子系统中国生物医学文献数据库(CBMdisc)2.5WebofKnowledge
检索结果的输出PrintE-mailAddtoMarkedListSavetoEndNoteWeb(需注册)Save(有多种格式)SavetoEndNoteWeb(需注册)3.JournalCitationReportsJCR功能与特色查询最具影响力、最常被引用、最热门的期刊查询发表文献最多的期刊发展并管理期刊馆藏提供五年影响指数趋势图,纵观期刊的影响力JCR的应用对象图书馆图书馆可通过JCR来管理馆藏,了解图书馆特定领域的馆藏是否为目前最热门、最实用的。图书馆也可参考JCR的期刊排名来增删期刊,以达到控制期刊预算目的。科研人员更清楚地知道该投稿到哪家杂志了解特定期刊在其专业领域中的表现3.从下拉菜单中选择主题/出版社/国家选择版本以及从下拉菜单中选择年代。选择查询或浏览的方式选择完毕,单击SUBMIT选择一种或一种以上学科分类选择期刊排序方式ImpactFactor
影响因子影响因子是一种比较相同研究领域中期刊相对重要程度的指标。计算公式影响因子=
被引用次数发表论文数例如:04年=4430
04年=20203年=5876
03年=187Sum:10306
Sum:389
ImpactFact=10306÷389=26.494该刊前两年发表论文在当年被引用的总次数
某刊前两年发表的论文总数ImmediacyIndex即引指数即引指数可以评价期刊在当年之实时影响力或重要性,立即指数愈大,表示该期刊在当年之实时影响力越大或重要性愈高。例5:查找2006年遗传学方面影响
因子最高的期刊。选择相关类目选择按期刊影响因子排序学科分类影响因子排序按影响因子由大至小排列期刊期刊详细信息即引指数例6:查找特定期刊“CellResearch”的影响因子选择查找特定期刊输入刊名cellresearch查看该刊在学科中排名4.全库检索全库检索让用户在一个界面中查找全部数据库,提高检索效率和查全率。例7:在所有数据库中检索有关阿司匹林抑制癌症的的文献。(aspirinandinhibit*and(cancerorcarcinoma)专利MEDLINE检索MeSH转换liverCancer转换确认经MeSH选词转换添加检索检索输入转换在开题、论文写作、投稿过程中如何充分利用WOK的资源
5.如何充分利用WOK论文的选题–成功的关键课题的创新来源:广泛地阅读与自己研究领域相关的期刊,明了近几年来同行在做的研究,了解自己的领域里有哪些题目尚未有人研究。跨领域的思维,用原本的学科背景,去诠释新的领域研究,就是一种创意。例如:当探讨性别差异时,多数研究者会从社会学、文化等角度着手,若用生物的观点进行诠释,便呈现了异于他人的创意从样本去寻找改善研究方法,例如:以往大多采用问卷的方式,若改用访谈或测验的方式,则是一种创意论文的选题–成功的关键课题的调研:追踪溯源–检索某个课题的综述文献快速锁定本课题相关的高影响力的论文分析研究发展趋势了解某特定课题在不同学科的分布情况了解与自己研究方向有关的机构密切关注在该研究领域的顶尖的研究小组所发表的论文Citedreferencesearch帮助获取思路,激发研究思想论文的相互引证----
学术研究之间的交流与联系:学科上的相关性理论与方法:借鉴与利用技术与手段:应用与发展横向上的对应性实验或方法:互相参照与借鉴结果与讨论:比较与应用纵向上的继承性课题的基础与起源发展与进步反引:学术争鸣被引文献检索CitedReferenceSearch的特点:
以一篇文章、一个作者、一个期刊、一篇会议文献或者一本书作为检索词,进行被引文献的检索。在不了解关键词或者难于限定关键词的时候,您可以从一篇高质量的文献出发,了解课题的全貌。某一理论有没有得到进一步的证实?是否已经应用到了新的领域?某项研究的最新进展及其延伸?某个实验方法是否得到改进?
如何了解某篇论文/某部论著被引用情况,揭示其影响力.保存检索历史,创建定题跟踪保存检索历史,创建定题跟踪利用引文跟踪,了解课题最新进展写作与投稿动笔之前:论文的选题–
成功的关键摘要---在阅读中学习写作引言—综述的价值参考文献–您的参考文献遵循了拟投稿期刊的体例要求吗?
EndNoteWeb—提高您的论文写作效率题名与摘要:在阅读中学习写作如何突破英语的限制:利用SCI数据库中高被引论文的题名类型进行分析,帮助自己写好英文题名利用SCI数据库中同行相关研究的摘要进行分析,帮助写出地道的英文摘要摘要质量的好坏会对编辑的决定产生强烈影响好的摘要务必:--准确、真实--可独立成篇--不使用专业术语--简短又具体--不引用参考文献摘要是推销您的论文的闪亮名片利用WebofScience数据库学习英文文章写作技巧
阅读10篇文献,总结100个常用句型和常用短语。经常复习。注意,文献作者必须是以英文为母语者,文献内容要与你的专业有关。这属于平时看文献的副产品。找3-5篇技术路线和统计方法与你的课题接近的文章,精读。写出论文的草稿。要按照标题、作者、摘要、背景、目的、材料、方法、结果、讨论、致谢、参考文献、图例、图、表、照片和说明的统一格式来写。这样做的好处是从它可以方便地改成任何杂志的格式。针对论文的每一部分,尤其是某种具体方法、要讨论的某一具体方面,各找5-8篇文献阅读,充实完善。这里讨论的只涉及英文表达,也只推荐给缺乏英文写作经验的人。找到你想投的杂志的投稿要求,再找2-3篇该杂志的article,按它的格式改写。找英文高手改。找不到合适的人,可找专业语言校对公司帮忙。获取全文的方法选择合适的投稿期刊作者必须要十分了解自己研究领域的重要期刊,力求所选择期刊的出版内容与稿件的专题确实密切相关。可以利用SCI数据库来分析选择和您课题相关的热点期刊。如果稿件投向了不合适的期刊,则有可能出现下列3种情况:(1)稿件被简单地退回,理由是稿件的内容“不适合本刊”。这种判断通常是经过编辑初评或同行评议得出的,并有可能经历了数周或数月的时间,这无疑会耽搁稿件的尽快发表。(2)尽管期刊所刊载的论文范围涉及稿件的主题,但由于编辑和审稿人对作者研究领域的了解比较模糊,从而有可能导致稿件受到较差或不公正的同行评议。相反,如果换成另外一个与稿件主题密切相关的期刊,该稿件可能会被接受,并且作者也不会被自己并不同意的修改意见所烦扰。(3)即便稿件被接受和发表,作者的喜悦心情不久也会被失望所代替,因为自己的研究成果被埋没在一份同行很少问津的期刊中,从而达不到与小同行交流的目的。该篇论文也可能从没有被人引用。如何选择拟投稿期刊选择拟投稿的期刊时需要综合考虑的因素主要有:(1)稿件的主题是否适合于期刊所规定的范围为确认哪些期刊能够发表自己的论文,作者首先应在SCI数据库进行检索分析;其次,要认真阅读准备投稿期刊的作者指南,尤其要注意其中有关刊载论文范围的说明,还要仔细阅读最近几期拟投稿期刊的目录和相关论文,以确认是否与自己的稿件的内容相适应。由于不同学科期刊的影响因子存在很大的差异,因此,选择投稿的期刊应注意避免过于看重期刊的影响因子。有时尽管期刊的影响因子很高,作者所投稿件的内容也非常优秀,但因为期刊与稿件的主题不适合,从而使得稿件难以得到录用和发表。(2)期刊的读者群和显示度如何谁阅读这份期刊?作者需要考虑将论文发表在最合适的期刊中。如何选择拟投稿期刊(3)期刊的学术质量和影响力如何,录用率是否适当利用JCR检索该期刊的总被引频次和影响因子来了解期刊的学术影响力。即期刊的总被引频次和影响因子越高,则表明期刊被读者阅读和使用的可能性越大。进而可推断该期刊的潜在的学术影响力也越大。(4)要判断期刊对来稿的录用率和倾向性。在不能确定拟投稿期刊在稿件录用是否具有的倾向性时,可以在SCI数据库检索分析统计该期刊中论文作者的国家来源,帮助作者选择确定投稿期刊。如何选择合适的投稿期刊分析您的文章的参考书目,找出哪些期刊的文章是您大量引用的,这可能代表您的文章与它的取向相同;自己领域的核心期刊自行检索请教同行强大的分析功能-能够处理10万条记录,多层次的分析来源期刊:发现相关的学术期刊进行投稿
分析备选期刊的录用倾向性检索该期刊的发文状况分析发表文章国别,判断录用倾向性选择同行评议审稿专家可推荐的审稿专家科技论文的写作
论文题名作者姓名+通讯地址摘要+关键词引言材料与方法结果
讨论与结论
致谢参考文献综述研究背景指出存在问题阐述研究目的说明研究的意义
CriticalReview使用CiteWhileYouWrite™插件即时创建文中和文后参考文献文献综述参考文献检查格式是否符合要求。编辑没有检查格式的义务。哈佛体系(alphabeticalbyauthor/date):Berridge,MJ1998,Neuronalcalciumsignaling,Neuronvol.21:pp.13-26美国心理学会体系(APA)(alphabetical)Berridge,M.J.(1998).Neuronalcalciumsignaling.Neuron21,13-26温哥华体系(numberedinorderorcitation)1.BerridgeMJ.Neuronalcalciumsignaling.Neuron.1998;21:13-26241WebofScience,超越检索……在2004年投向Nature的中国文章有55%(2003年更是高达62%)未经编委审查,在期刊初审阶段就退稿,很大一部分是格式问题,特别是参考文献格式即使是最高水平的期刊,其中也有30%的文章有参考文献的错误,这大大降低了文章被引用次数的统计参考文献要遵循拟投稿期刊的体例要求您知道吗?-参考文献的格式会影响稿件的录用不同的领域,不同的期刊都有不同的参考文献格式要求不同的院校对博硕士研究生的论文的参考文献格式要求不同参考文献的增、删、改以及位置调整会影响文后参考文献的排列
Endnote EndnoteWebEndnoteWeb
边写作边引用下载插件查找引文添加引文编辑引文格式引文与MicrosoftWord自动联接,
您可一边写作一边引用相应的参考文献,帮助您提高写作效率一、建立“library”——按课题建立图书馆,存放收集到的所有文献资料二、收集管理资料——数据库检索导入、搜索引擎导入、直接从EndnoteWeb远程连接导入、手工导入检索到的文献,并随时可以检索、更新、编辑、共享相关文献三、编排参考文献——使用EndnoteWeb方便地插入参考文献,按照期刊要求的格式,自动生成参考文献列表EndnoteWeb能做什么?注册并登录我的EndNoteWeb注册在ISIWebofKnowledge上建立个人帐户如果您已经拥有一个WebofKnowledge配置文件,用您的电子邮件地址以及密码登陆就可以访问EndNoteWeb。任何时候,当您在WebofKnowledge登录后,您就可以访问您的EndNoteweb图书馆您也可以在使用WebofKnowledge配置文件登陆后通过漫游方式访问您的EndNoteweb图书馆
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输入Prof.Kuhlthau的姓氏选中所需的引文添加引文成功FormatBibliography格式化文中与文后的参考文献提供2300多种期刊的参考文献格式格式化后的文中参考文献文后参考文献按照Nature格式化后的参考文献
与MicrosoftWord自动连接,边写作边引用自动生成文中和文后参考文献提供2300多种期刊的参考文献格式提高写作效率:按拟投稿期刊的格式要求自动生成参考文献,节约了大量的时间和精力对文章中的引用进行增、删、改以及位置调整都会自动重新排好序修改退稿,准备另投它刊时,瞬间调整参考文献格式EndnoteWeb–
写作工具课堂练习利用引文检索查找金力教授2001年发表在SCIENCE上的一篇论文的被引次数,并列出最近一篇引用该文章的文献索引;利用JCR数据库检索细胞生物学领域(cellbiology)杂志的影响因子,并列出影响因子最高的三种杂志及其IF结果以学号末两位+姓名发送到:xueyanyang78@NCBI-PUBMED常用核心数据库1.数据库概况主办单位:美国国立医学图书馆(NLM)编制。收录学科内容:主要收录生物医学和健康科学以及生命科学相关领域的文献。包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺学,基础研究和临床、护理、公共卫生、卫生政策发展或相关教育活动的内容。2000年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学方面的研究内容。
文献来源:收录全球70多个国家和地区的近5000种生物医学期刊,大都经美国卫生健康研究院的文献选择技术评估委员会LiteratureSelectionTechnicalReviewCommittee(LSTRC)评估挑选,由NLM和各专业协会的数据协作采集专家推荐。近年数据涉及37种语种,回溯至1950年的数据涉及60种语种。数据库47%为美国本土出版文献,90%为英文文献,79%的文献有著者撰写的英文文摘,(以上数据根据2007年11月数据库提供)。收录数据类型已处理完毕的数据(Indexed)1950-1965回溯数据1966topresent近年数据处理中的数据(Inprocess):
最新的、尚未经规范处理的数据,只有简单的篇名、作者、出处等书目信息和文摘,没有标引规范化医学主题词、物质名称、文献类型等信息。该库中数据在所有标引工作完成后,每周一次转入MEDLINE-Indexed数据库中。不同检索系统中的Medline数据库(2)NCBI网站简介
1988年,美国的参议员ClaudePepper发起,
1988年11月4日通过立法建立国立生物技术信息中心(NCBI)NCBI的任务:
建立基于计算机信息处理的分子生物学、生物化学、遗传学知识的自动存储和分析系统,并进行先进方法的研究。促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用。促进全世界范围内生物技术信息收集的合作NCBI主页NCBI生物信息整合系统
Alldatabase检索大分子生物学数据获取GenBank,EMBL等数据库的核酸序列;获取Swiss-port,PIR,PRF,PDB等蛋白质序列;从核酸序列翻译到蛋白质的序列;获取基因和染色体图谱;蛋白质三维结构数据及大分子模式(MMDB)等其他生物信息数据库检索。PubMed书目文献数据。(3)PubMed简介特点:
1.免费提供题录和文摘
2.提供与原文的网址链接(部分免费获取)
3.提供检索词自动转换匹配
4.操作简便、快捷PubMed收录数据MDENLINEIndexed 1966toprensent的MEDLINE已标引数据,有MeSH字段和摘要,每条记录标有[PubMed-indexedforMEDNLINE]
OldMDENLINE 1950-1965年间的MEDLINE数据,没有MeSH字段和摘要,每条记录标有[PubMed-OLDMDENLINEforPre1966]
PubMed
收录数据MDENLINEInprocess
最新的MDENLINE尚未标引的处理中数据。每条记录标有[PubMed-inprocess]。NotMDENLINE
是出版商提供的电子文献,PubMed收录,而MDENLINE不收录的数据。每条记录标有[PubMed]。基本检索输入框特征栏提供辅助检索功能侧栏提供其他检索如期刊数据库检索、规范词数据库检索、特定文献检索等执行检索PubMed主页高级检索个性化服务检索帮助手册可以在检索栏中输入一个或多个检索词(系统默认空格为AND检索) 如:placentagrowthoxygen可以在检索栏中输入布尔逻辑运算式(运算符必须大写) 如:asthmaAND(therapyORtreatment)(4)PubMed基本检索规则输入多个检索词字段限定符:[]
如:Stem[ti]ANDneuroscience截词符:treat*强迫短语匹配符:“brca1”
严格按输入形式匹配,不再自动转换匹配和扩展检索,常用于词组和专有名词检索。(4)PubMed基本检索规则含字段限定的检索式自动转换匹配检索词:
对常用医学名词进行自动在规范词索引、文本词及所有记录字段中转换匹配。 如:renalfailurekidneyfailure[MESH]ORkidney[AllField]ORrenalfailure[AllField]……(4)PubMed基本检索规则自动扩展检索:
系统自动对主题词、副主题词进行扩展检索。
如:输入hypertensiontherapy,系统自动检索高血压的药物治疗、饮食疗法(4)PubMed基本检索规则著者检索(authors):姓全称在前,名首字母在后。加字段限定符 如:genbacevo[au]
mooream[au]2002年以后的文章可以查著者全名 如:joshualederberg(4)PubMed基本检索规则著者检索mooream[au](三)PubMed基本检索规则期刊检索(journals):刊名全称检索 如:newenglandjournalofmedicine[so]MEDLINE认可的标准刊名缩写检索 如:clinexpimmunol[so]国际标准期刊号检索 如:1059-1524(4)PubMed基本检索规则刊名的检索(字段限定来源SO)PubMed记录字段说明文摘第一著者单位地址出版商提供文献识别号著者群版权说明参考评论文献合著者文献参考评论定稿版校样版输入日期输入完成日期电子出版日期电子出版日期文献出版日期数据加入PubMed日期文献勘误参考文献勘误全部著者姓名全部调研者姓名作为文章主题的著者全称文献相关注释基金编号基因符号期编号资助调研者资助调研单位国际标准期刊号美国立医学图书馆识别号期刊全称最后修订日期规范词表词规范词确立日期系统组织的文摘版权拥有者题录提供机构的识别号病史相关与原始记录其他关键词提供其他关键词的机构数据提供者机构文章总页数出版商提供数据时间期刊出版国数据库文献编号作为主题词的个人姓名出版状态文献类型出版模式(纸张或电子)参考文献数已撤回的文献酶或化学物质代码正在撤消中的文章初版文献修订和再版的文章子专题文档太空署提供的数据二次文献数据库以及文章讨论的分子序列访问号原文来源引用了病例的文献内部处理代码标准期刊缩写文献标题翻译标题更新文献文献正在更新期刊卷号(5)PubMed的辅助检索1.Limits(检索限制选择):字段限制:著者、刊名、篇名、出版日期、滤过(filter原文收藏处)等限制。数据输入时间:默认检索可回溯到1950年,限制选择30天-10年。各种文献类型限制各种语种限制期刊类别与学科文档限制作者限定添加作者姓名输入框清除限定期刊限定作者姓名索引选词多作者逻辑匹配选项全文、免费全文、摘要限定日期限定Limits—检索限制出版日期限定入库日期限定研究对象人/动物限定研究对象性别限定语种限定子文档限定检索字段限定执行检索清除所有限定文献类型限定研究对象年龄限定2.Previw/index(检索策略预览/索引):浏览检索式,预览检出文献数量修改检索式组配检索式 如:可用检索式编号#1OR#2浏览索引(index)选词检索(5)PubMed的辅助检索检索预览检索历史索引加词检索PubMed-Index索引检索例johnshopkinsasthma选择著者地址字段输入地址起始单词点击显示索引词表选择相关词条选择词条间的逻辑关系添加到检索框执行检索
3.History(检索史):历次检索式回顾编辑检索式 如:#5ANDgenbacevo[au](5)PubMed的辅助检索检索历史回顾检索式检索时间检出篇数检索式编号可替代检索式进行输入检索如:#6ANDgenbacevo[au]4.Details(检索的详细匹配过程):显示检索词转换匹配运算详细过程用途:转换、确定规范词如:livercancer
liverneoplasms修改检索策略(5)PubMed的辅助检索检索明细数据库匹配过程检索词转换显示用户输入的检索式检索策略(检索式)的修改
以下途径均能实现检索策略的修改:基本检索框中随时修改“Limit”“Preview/index”“History”“Details”(6)PubMed的高级检索在一个网页中集检索史、检索字段选择、检索词输入、词表查询、逻辑算符选择、检索限定于一体。选择检索字段后,检索框内只能输入检索词,不能输入检索式。多栏复合检索词表查询栏间逻辑组配(7)PubMed其他检索服务1.Me
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