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文档简介

第二章、染色体与DNA2.3、DNA的复制自由草12.3和2.4-DNA的复制和特点主要概念:DNA的复制DNA的半保留复制DNA的半不连续复制复制叉复制子自由草22.3和2.4-DNA的复制和特点DNA的复制

(DNAReplication)由于DNA分子由两条多核苷酸链组成,两条链上的碱基——G只能与C相配对,A只能与T相配对,所以,两条链是互补的,一条链上的核苷酸排列顺序决定了另一条链上的核苷酸排列顺序。自由草32.3和2.4-DNA的复制和特点DNA的半保留复制

(semi-conservativereplication)DNA在复制过程中,每条链分别作为模板合成新链,产生互补的两条链。这样新形成的两个DNA分子与原来DNA分子的碱基顺序完全一样。因此,每个子代分子的一条链来自亲代DNA,另一条链则是新合成的,这种复制方式被称为DNA的半保留复制。自由草42.3和2.4-DNA的复制和特点DNA的半保留复制Semi-conservativemechanism15Nlabelingexperiment1958年,Meselson和Stahl研究了经15N标记3个世代的大肠杆菌DNA,首次证明了DNA的半保留复制。DNA的半保留复制保证了DNA在代谢上的稳定性,与DNA的遗传功能相符合。自由草52.3和2.4-DNA的复制和特点DNA的半不连续复制

(semi-discontinuousreplication)由于DNA双螺旋的两条链是反向平行的,因此在复制叉附近解开的DNA链一条是5'→3'方向,另一条是3'→5'方向,两个模板极性不同。而所有已知DNA聚合酶的合成方向都是5'→3',两条链无法同时进行复制。为了解释DNA的等速复制现象,日本学者冈崎(Okazaki)等提出了DNA的半不连续复制模型。自由草62.3和2.4-DNA的复制和特点后随链的合成前导链的合成自由草72.3和2.4-DNA的复制和特点半不连续复制Semi-discontinuousreplication:

冈崎片段Okazakifragment[3H]Thymidinepulse-chaselabelingandalkalinesucrosegradient:discoveryofsemi-discontinousreplication自由草82.3和2.4-DNA的复制和特点1、用3H脱氧胸苷短时间标记后提取DNA,得到不少平均长度为2-3kbDNA片段。2、用DNA连接酶温度敏感突变株进行实验,在连接酶不起作用的温度下,有大量小片段累积,说明复制过程中至少有一条链首先合成较短的片段,然后再生成大分子DNA。3、前导链的连续复制和滞后链的不连续复制在生物界是有普遍性的,因而称之为DNA的半不连续复制。自由草92.3和2.4-DNA的复制和特点半不连续复制生物化学教学课件自由草102.3和2.4-DNA的复制和特点半不连续复制冈崎片段:间断的后随链片段自由草112.3和2.4-DNA的复制和特点复制的起点、方向和速度复制时,双链DNA要解开成两股链分别进行,所以,复制起点呈叉子形式,被称为复制叉(Replicationfork)。DNA的复制是由固定的起始点开始的。一般把生物体的复制单位称为复制子(replicon),一个复制子只含一个复制起点。自由草122.3和2.4-DNA的复制和特点

正在复制的部分在电镜下象只眼睛,称复制眼(泡)自由草132.3和2.4-DNA的复制和特点原核细胞DNA的半不连续复制过程复制叉的移动方向解旋酶DNA聚合酶III解链酶RNA引物引物体DNA聚合酶ISSB3´3´5´前导链随后链3´5´复制的起始DNA链的延长DNA链终止5´RNA引物3´3´复制过程可分为:自由草142.3和2.4-DNA的复制和特点152.3和2.4-DNA的复制和特点参与原核生物DNA复制的有关酶类(peimase)(topoisomerase)(DNAhelicase)(DNAligase)(single-strandbindingprotein,SSB)(DNApolymetases)自由草162.3和2.4-DNA的复制和特点自由草172.3和2.4-DNA的复制和特点自由草182.3和2.4-DNA的复制和特点自由草192.3和2.4-DNA的复制和特点细菌、病毒和线粒体的DNA分子都是作为单个复制子完成复制的;真核生物基因组可以同时在多个复制起点上进行双向复制,也就是说它们的基因组包含有多个复制子。部分生物复制子的比较自由草202.3和2.4-DNA的复制和特点2.3.3复制的几种主要方式2.3.3.1线性DNA双链的复制2.3.3.2环状DNA双链的复制(1)θ型(2)滚环型(rollingcircle)(3)D-环型(D-loop)自由草212.3和2.4-DNA的复制和特点环状DNA双链的复制-θ型大肠杆菌质粒DNA双向复制的模式与实验验证。上:θ形复制模式图;下:3H标记质粒DNA合成图。自由草222.3和2.4-DNA的复制和特点

1968年Gilbert提出滚环复制模型:(1)共价延伸;(2)模板链和新合成的链分开;(3)不需RNA引物,在正链3'-OH上延伸;(4)只有一个复制叉;(5)形成多联体(concatemer)。

自由草232.3和2.4-DNA的复制和特点D-环型(D-loops)Dloop是单向复制的特殊方式。首先在动物线粒体中被发现。一条短RNA与一条DNA互补,取代了该区域原来的互补的DNA链,使得两条链的合成高度不对称,一条链上迅速合成出互补链,另一条链则为游离的单环。自由草242.3和2.4-DNA的复制和特点2.4原核生物和真核生物

DNA的复制特点自由草252.3和2.4-DNA的复制和特点2.4.1原核生物DNA的复制特点大肠杆菌基因组以双链环状DNA分子的形式存在,其DNA复制的中间产物可形成一个θ,复制从定点开始双向等速进行。复制起始后,两个复制叉在距起始点180°处会合。自由草262.3和2.4-DNA的复制和特点大肠杆菌DNA复制起始点(OriC)

保守序列分布图大肠杆菌DNA的复制起始点(OriC)含有3个13bp的串联重复保守序列,GATCTNTTNTTTT,以及4个由9bp的保守序列(TTATNCANA)组成的能够结合DnaA的起始结合位点。识别复制起始点自由草272.3和2.4-DNA的复制和特点2.4.1.1DNA双螺旋的解旋首先,在拓扑异构酶I的作用下解开负超螺旋,并与解链酶共同作用,在复制起点处解开双链。解链过程中必需有SSB蛋白来稳定已解开的单链,以保证该局部结构不会恢复成双链。接着,由引发酶等组成的引发体迅速作用于两条单链DNA上。不论是前导链还是滞后链,都需要一段RNA引物以开始子链DNA的合成。自由草282.3和2.4-DNA的复制和特点(1)DNA解链酶(DNAhelicase)大部分DNA解链酶都沿滞后链模板的5'→3'方向并随着复制叉的前进而移动,只有Rep蛋白沿前导链模板的3'→5'方向移动。因此,Rep蛋白和其他DNA解链酶分别在DNA的两条母链上协同作用,解开双链DNA。自由草292.3和2.4-DNA的复制和特点(2)单链结合蛋白(SSB蛋白)大部分原核SSB蛋白与DNA结合时表现出协同效应:如第一个SSB蛋白结合到DNA上去的能力为1,第二个SSB结合能力则可高达103。SSB蛋白的作用是稳定单链DNA。又称为双螺旋去稳定蛋白(helixdestabilizingprotein)由177个aa组成在E.coli中以四聚体存在分子量为74KDa在原核中SSB与DNA结合表现出协同效应。(1)SSB之间的相互作用;(2)第一个SSB和DNA的结合改变了DNA的结构。自由草302.3和2.4-DNA的复制和特点DNA连接酶催化的条件是:①需一段DNA片段具有3'-OH,而另一段DNA片段具有5'-Pi基;②未封闭的缺口位于双链DNA中,即其中有一条链是完整的;③需要消耗能量,在原核生物中由NAD+供能,在真核生物中由ATP供能。生物化学教学课件E-AMPE-AMP上的AMP转移到DNA的5‘-PO4上使其活化活化的5'-PO4与相邻的3'-OH作用形成3'-5'磷酸二酯键,并释放出AMP(3)DNA连接酶自由草312.3和2.4-DNA的复制和特点(3)DNA连接酶

其作用机制是分三步进行:1、E+ATP→E-AMP+ppi在E.coli中,E+NAD→E-AMP+NMN(烟酰胺单核苷酸)2、E-AMP上的AMP转移到DNA的5‘-PO4上使其活化3、活化的5'-PO4与相邻的3'-OH作用形成3'-5'磷酸二酯键,并释放出AMP。自由草322.3和2.4-DNA的复制和特点2.4.1.3复制的引发和终止DNA聚合酶只能延长已存在的DNA链,而不能从头合成DNA链,那么,新DNA的复制是怎样开始的呢?研究发现,DNA复制时,往往先由RNA聚合酶在DNA模板上合成一段RNA引物,再由DNA聚合酶从RNA引物3’端开始合成新的DNA链。滞后链的引发过程比较复杂,需要多种蛋白质和酶的协同作用,还牵涉到冈崎片段的形成和连接。自由草332.3和2.4-DNA的复制和特点滞后链的引发过程由引发体(primosome)来完成。引发体由6种蛋白质n、n’、n’’、DnaB、C和I共同组成,只有当引发前体(preprimosome)把这6种蛋白质合在一起并与引发酶(primase)进一步组装后形成引发体,才能发挥其功能。自由草342.3和2.4-DNA的复制和特点引发体在滞后链分叉的方向上前进,并在模板上间断性引发生成滞后链引物---RNA短链,再由DNA聚合酶III作用合成DNA,直至遇到下一个引物或冈崎片段为止。由RNaseH降解RNA引物并由DNA聚合酶I将缺口补齐,再由DNA连接酶将两个冈崎片段连在一起形成大分子DNA。自由草352.3和2.4-DNA的复制和特点

链的终止需要Tus蛋白参与当复制叉前移,遇到20bp重复性终止子序列(Ter)时,Ter-Tus复合物能阻挡复制叉的继续前移,等到相反方向的复制叉到达后在DNA拓扑异构酶IV的作用下使复制叉解体,释放子链DNA。自由草362.3和2.4-DNA的复制和特点大肠杆菌中DNA复制的终止自由草372.3和2.4-DNA的复制和特点

DNApolⅠDNApolⅡDNApolⅢ结构分子量

109KD90KD900KD构成

单体单体异多聚体分子数/细胞

400?10-20酶活性:5'→3'聚合酶

+++3'→5'外切酶

+++5'→3'外切酶

+--(可切单链)突变体突变位点polApolBpolC(dnaE),dnaN,dnaZX,dnaQ,dnaT突变表型修复有缺陷能修复阻止复制大肠杆菌DNA聚合酶I、II和III的性质比较自由草382.3和2.4-DNA的复制和特点DNA聚合酶的共同点:1、都以dNTP为底物。2、都需要Mg2+激活。3、聚合时必须有模板链和具有3‘-OH末端的引物链。不能起始新的DNA链,必须要有引物提供3’-OH。4、链的延伸都方向为5‘→3’。5、除聚合DNA外还有其它功能。自由草392.3和2.4-DNA的复制和特点2.4.2真核生物DNA的复制特点自由草402.3和2.4-DNA的复制和特点SV40:apolyomavirus(多瘤病毒)thatisveryusefulforstudyingeukaryotic(真核)replicationenzymes自由草412.3和2.4-DNA的复制和特点真核生物DNA的复制子被称为ARS(autonomouslyreplicatingsequences,自主复制序列),长约150bp左右,包括数个复制起始必需的保守区。真核生物DNA复制叉的移动速度大约只有50bp/秒。因此,人类DNA中每隔30,000-300,000bp就有一个复制起始位点。真核细胞中有5种DNA聚合酶,分别称为DNA聚合酶α、β、γ、δ和ε。不同ARS序列的共同特征是有一个被称为A区的11bp的保守序列自由草422.3和2.4-DNA的复制和特点真核生物DNA聚合酶的特性比较自由草432.3和2.4-DNA的复制和特点DNA聚合酶α主要参与引物合成。DNA聚合酶β活性水平稳定,主要在DNA损伤的修复中起作用。DNA聚合酶δ是主要负责DNA复制的酶。DNA聚合酶ε的主要功能可能是在去掉RNA引物后把缺口补全。自由草442.3和2.4-DNA的复制和特点2.4.3DNA复制的调控DNA链延伸的速度在同种生物的不同细胞中几乎是恒定的,只是复制叉的数量不同。迅速分裂的细胞具较多的复制叉,而分裂缓慢的细胞复制叉较少并出现复制的间隙。复制起始频率的直接调控因子

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