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文档简介
生物化学与分子生物学DNA损伤与修复DNA损伤与修复
DNADamageandRepair第十五章DNA损伤与修复各种体内外因素所导致的DNA组成与结构的变化称为DNA损伤(DNAdamage)其一,DNA的结构发生永久性改变,即突变
其二,导致DNA失去作为复制和/或转录的模板的功能DNA损伤的后果:DNA损伤与修复生物多样性依赖于:DNA突变DNA修复平衡DNA损伤与修复DNA损伤DNADamage第一节DNA损伤与修复一、多种因素通过不同机制导致DNA损伤(一)体内因素DNA复制错误
DNA自身的不稳定性机体代谢过程中产生的活性氧DNA损伤与修复DNA复制错误:在DNA复制过程中,碱基的异构互变、4种dNTP之间浓度的不平衡等均可能引起碱基的错配DNA复制的错配率约1/1010复制错误还表现为片段的缺失或插入。特别是DNA上的短片段重复序列,在真核细胞染色体上广泛分布,导致DNA复制系统工作时可能出现“打滑”现象,使得新生成的DNA上的重复序列拷贝数发生变化。
DNA损伤与修复亨廷顿病性痴呆由Huntington于1872年首先报道,故而得名。属单基因常染色体显性遗传疾病。其脑变性部位广泛,尤以尾状核的萎缩明显,系一种罕见的特发性神经变性疾病。临床主要表现为痴呆和舞蹈样动作。本病较为少见。估计为4/10万~10/10万人。年轻发病者症状一般较重,以肌强直为主,中年发病者以舞蹈症状为主,60岁以上发病者以意向性震颤为主。少年型患者少见。DNA损伤与修复脆性X综合征20世纪初一些学者注意到智力低下患者中男性多于女性。1943年Martin和Bell在一个家系两代人中发现11名男性患者和两名轻度智力低下的女性,认为该家系智力低下是与X连锁的,因此X连锁智力低下又称为Martin-Bell综合征。1969年Lubs首先在男性智力低下患者及其女性亲属中发现了长臂具有“随体和呈细丝状次缢痕”的X染色体。后来,Sortherland证明细丝位位于X染色体长臂2区7带(Xq27)。它在低叶酸培养条件下表达,并提出了脆性部位(fragilesite)的概念。现今人们把在Xq27处有脆性部位的X染色体称为脆性X染色体(fragileX,fraX),而它所导致的疾病称为脆性X染色体综合征。DNA损伤与修复临床表现主要表现为中度到重度的智力低下,其它常见的特征尚有身长和体重超过正常儿,发育快,前额突出,面中部发育不全,下颌大而前突,大耳,高腭弓,唇厚,下唇突出,另一个重要的表现是大睾丸症。一些患者还有多动症,攻击性行为或孤癖症,中、重度智力低下,语言行为障碍。20%患者有癫痫发作。DNA损伤与修复主要表现为中度到重度的智力低下,其它常见的特征尚有身长和体重超过正常儿,发育快,前额突出,面中部发育不全,下颌大而前突,大耳,高颚弓,唇厚,下唇突出,另一个重要的表现是大睾丸症。一些患者还有多动症,攻击性行为或孤癖症,中、重度智力低下,语言行为障碍。20%患者有癫痫发作。DNA损伤与修复发病机理致病基因是FMR-1,它含有(CGG)n三核甘酸重复序列,后者在正常人约为45个拷贝以内,而在正常男性传递者和女性携带者增多到50-200个拷贝,称为小插入,相邻的Cpg岛未被甲基化,这种前突变(premutation)无或只有轻微症状。女性携带者的CGG区不稳定,在向受累后代传递过程中扩增,以致在男性患者和脆性部位高表达的女性达到200个拷贝以上,相邻的CpG岛也被甲基化。这种全突变(fullmutation)可关闭相邻基因的表达,从而出现临床症状。由前突变转化为完全突变只发生母亲向后代传递过程中。DNA损伤与修复DNA损伤与修复DNA自身的不稳定性
:DNA结构自身的不稳定性是DNA自发性损伤中最频繁和最重要的因素。当DNA受热或所处环境的pH值发生改变时,DNA分子上连接碱基和核糖之间的糖苷键可自发发生水解,导致碱基的丢失或脱落,其中以脱嘌呤最为普遍。含有氨基的碱基还可能自发脱氨基反应,转变为另一种碱基,即碱基的转变,如C转变为U,A转变为I(次黄嘌呤)等。DNA损伤与修复(二)体外因素物理因素化学因素生物因素DNA损伤与修复物理因素:电离辐射、紫外线(ultraviolet,UV)DNA损伤与修复化学因素:自由基导致的DNA损伤碱基类似物导致的DNA损伤碱基修饰剂、烷化剂导致的DNA损伤嵌入性染料导致的DNA损伤DNA损伤与修复物理和化学因素对DNA的损伤DNA损伤与修复二、DNA损伤有多种类型
碱基脱落碱基结构破坏嘧啶二聚体形成DNA单链或双链断裂DNA交联DNA损伤与修复碱基损伤与糖基破坏:化学毒物可通过对碱基的某些基团进行修饰而改变碱基的性质。由于碱基损伤或糖基破坏,在DNA链上可能形成一些不稳定点,最终可导致DNA链的断裂。DNA损伤与修复碱基之间发生错配
:碱基类似物的掺入、碱基修饰剂的作用可改变碱基的性质,导致DNA序列中的错误配对。在正常的DNA复制过程中,存在着一定比例的自发碱基错配。最常见的是组成RNA的尿嘧啶替代胸腺嘧啶掺入到DNA分子中。DNA损伤与修复DNA链发生断裂:电离辐射、化学毒剂、磷酸二酯键的断裂、脱氧戊糖的破坏、碱基的损伤和脱落都是引起DNA断裂的原因。碱基损伤或糖基破坏可引起DNA双螺旋局部变性,形成酶敏感性位点,特异的核酸内切酶能识别并切割这样的部位,造成链断裂。DNA链上被损伤的碱基也可以被另一种特异的DNA-糖基化酶除去,形成无嘌呤嘧啶位点(apurinic-apyrimidinicsite,APsite),或称无碱基位点(abasicsite),这些位点在内切酶等的作用下可形成链断裂。DNA损伤与修复DNA
的共价交联:DNA双螺旋链中的一条链上的碱基与另一条链上的碱基以共价键结合,称为DNA链间交联(DNAinterstrandcross-linking)。DNA分子中同一条链中的两个碱基以共价键结合,称为DNA链内交联(DNAintrastrandcross-linking)。DNA分子还可与蛋白质以共价键结合,称为DNA-蛋白质交联(DNAproteincross-linking)。DNA损伤与修复DNA损伤可导致碱基置换缺失插入链的断裂
转换颠换DNA损伤与修复DNA损伤的修复TherepairofDNAdamage第二节DNA损伤与修复DNA修复(DNArepair)是指纠正DNA两条单链间错配的碱基、清除DNA链上受损的碱基或糖基、恢复DNA的正常结构的过程。DNA修复是机体维持DNA结构的完整性与稳定性,保证生命延续和物种稳定的重要环节。
DNA损伤与修复常见的DNA损伤修复途径修复途径修复对象参与修复的酶或蛋白
光复活修复嘧啶二聚体光复活酶
碱基切除修复受损的碱基DNA糖基化酶、无嘌呤嘧啶核酸内切酶
核苷酸切除修复嘧啶二聚体、DNA螺旋结构的改变大肠杆菌中UvrA、UvrB、UvrC和UvrD,人XP系列蛋白XPA、XPB、XPC……XPG等
错配修复复制或重组中的碱基配对错误大肠杆菌中的MutH、MutL、MutS,人的MLH1、MSH2、MSH3、MSH6等
重组修复双链断裂RecA蛋白、Ku蛋白、DNA-PKcs、XRCC4
损伤跨越修复大范围的损伤或复制中来不及修复的损伤RecA蛋白、LexA蛋白、其他类型DNA聚合酶
DNA损伤与修复一、有些DNA损伤可以直接修复
嘧啶二聚体的直接修复
烷基化碱基的直接修复
无嘌呤位点的直接修复
单链断裂的直接修复
DNA损伤与修复嘧啶二聚体的直接修复DNA损伤与修复烷基化碱基的直接修复DNA损伤与修复无嘌呤位点的直接修复
DNA嘌呤插入酶能催化游离嘌呤碱基或脱氧核苷与DNA嘌呤缺失部位重新生成糖苷共价键,导致嘌呤碱基的直接插入。具有很强的专一性。单链断裂的直接修复
DNA连接酶能够催化DNA双螺旋结构中一条链上缺口处的5
-磷酸基团与相邻片段的3
-羟基之间形成磷酸二酯键,从而直接参与部分DNA单链断裂的修复,如电离辐射所造成的切口。DNA损伤与修复二、切除修复是最普遍的DNA损伤修复方式
碱基切除修复
核苷酸切除修复
DNA损伤与修复碱基切除修复(baseexcisionrepair)
①识别水解:DNA糖基化酶特异性识别DNA链中已受损的碱基并将其水解去除,产生一个无碱基位点;②切除:在此位点的5
端,无碱基位点核酸内切酶将DNA链的磷酸二酯键切开,去除剩余的磷酸核糖部分;③合成:DNA聚合酶在缺口处以另一条链为模板修补合成互补序列;④连接:由DNA连接酶将切口重新连接,使DNA恢复正常结构DNA损伤与修复DNA损伤与修复核苷酸切除修复(nucleotideexcisionrepair)
①首先,由一个酶系统识别DNA损伤部位;②其次,在损伤两侧切开DNA链,去除两个切口之间的一段受损的寡核苷酸;③再次,在DNA聚合酶作用下,以另一条链为模板,合成一段新的DNA,填补缺损区;④最后由连接酶连接,完成损伤修复。DNA损伤与修复E.coli的NER主要由4种蛋白质组成:UvrAUvrBUvrCUvrD
DNA损伤与修复人类的DNA损伤核苷酸切除修复①首先由损伤部位识别蛋白XPC和XPA等,再加上DNA复制所需的SSB,结合在损伤DNA的部位;②XPB、XPD发挥解旋酶的活性,与上述物质共同作用在受损DNA周围形成一个凸起;③XPG与XPF发生构象改变,分别在凸起的3′-端和5′-端发挥核酸内切酶活性,在增殖细胞核抗原(PCNA)的帮助下,切除并释放受损的寡核苷酸;④遗留的缺损区由聚合酶δ或ε进行修补合成;⑤最后,由连接酶完成连接。
DNA损伤与修复NER不仅能够修复整个基因组中的损伤,而且能拯救因转录模板链损伤而暂停转录的RNA聚合酶,即参与转录偶联修复(transcription-coupledrepair)。作用方式:NER蛋白质被募集于暂停的RNA聚合酶。转录偶联修复的意义:将修复酶集中于正在转录DNA,使该区域的损伤尽快得以修复。DNA损伤与修复着色性干皮病是一种常染色体隐性遗传性皮肤病,发病率约1:25万,特征是UV照射后DNA损伤不能修复。患者对日光高度敏感,有畏光现象。光暴露部位皮肤萎缩、大量的雀斑样色素加深斑,继而出现新生物,可有多系统累及,许多患者可伴有眼球、神经系统等病变。DNA损伤与修复碱基错配修复(mismatchrepair)错配是指非Watson-Crick碱基配对。碱基错配修复也可被看作是碱基切除修复的一种特殊形式,主要负责纠正:①复制与重组中出现的碱基配对错误;②因碱基损伤所致的碱基配对错误;③碱基插入;④碱基缺失。DNA损伤与修复E.coli错配修复系统修复复制差错DNA损伤与修复Dam甲基化酶(methylase)使E.coli处于暂时的半甲基化状态,标记母链和新合成的DNA链,帮助新合成的DNA链被错配修复系统识别并修复。DNA损伤与修复模板链的GATC序列甲基化MutH仅切割新合成的DNA链DNA损伤与修复MutH的切口位于错配核苷酸的5
侧,使用外切酶Ⅶ或RecJ,按5
3
方向降解DNA;切口位于错配的3’侧,则使用外切酶Ⅰ,按3
5
方向降解DNA。DNA聚合酶Ⅲ填补所产生单链DNA缺口。DNA损伤与修复M
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