猪肺炎支原体和猪鼻支原体的基因组测序与比较基因组学分析

猪肺炎支原体和猪鼻支原体的基因组测序与比较基因组学分析一、本文概述本文旨在通过对猪肺炎支原体和猪鼻支原体的基因组进行测序和比较基因组学分析，深入理解这两种支原体的遗传特征、进化关系以及潜在的致病机制。支原体是一类缺乏细胞壁、具有高度变异性的原核生物，广泛存在于动物体内，其中猪肺炎支原体和猪鼻支原体是猪的重要病原体，可引起猪支原体肺炎和猪鼻炎等疾病，对养猪业造成巨大的经济损失。本文首先通过高通量测序技术对猪肺炎支原体和猪鼻支原体的基因组进行测序，获得其全基因组序列。随后，运用生物信息学方法对这些序列进行注释和分析，包括基因结构、功能注释、重复序列、非编码RNA等方面。在此基础上，对两种支原体的基因组进行比较分析，包括基因组成、基因排列、基因家族分析、单核苷酸多态性（SNP）等方面，以揭示它们的遗传差异和进化关系。本文的研究结果将为深入了解猪肺炎支原体和猪鼻支原体的生物学特性、致病机制以及防控策略提供重要依据，有助于推动养猪业的健康发展和动物疫病的防控工作。本文的研究方法和结果也可为其他病原体的基因组学研究提供参考和借鉴。二、材料与方法本研究旨在对猪肺炎支原体（M.hyopneumoniae）和猪鼻支原体（M.hyorhinis）的基因组进行测序，并进行比较基因组学分析。以下是本研究的具体材料与方法。本研究选取了具有代表性的猪肺炎支原体和猪鼻支原体菌株。样本采集自多个地区的猪场，经过严格的微生物学培养和鉴定，确保菌株的纯净性和活性。采用高通量测序技术（Next-GenerationSequencing,NGS）对猪肺炎支原体和猪鼻支原体的基因组进行测序。具体步骤包括样本处理、文库构建、测序和数据分析。测序数据经过质量控制后，使用相应的生物信息学软件进行组装和注释。基于测序得到的基因组数据，进行比较基因组学分析。对两个物种的基因组进行全基因组比对，识别同源基因和特有基因。分析基因组的共线性、基因重组和基因丢失等事件。结合已知的基因功能和代谢途径，探讨两个物种在基因组水平上的差异和进化关系。使用生物信息学软件和编程语言（如R、Python等）对测序数据和比较基因组学分析结果进行数据处理和可视化。通过绘制热图、柱状图、散点图等图表，直观地展示两个物种在基因组结构、基因功能和进化关系等方面的差异。本研究严格遵守实验室安全规范和伦理准则。所有样本采集和处理过程均符合动物福利和伦理要求。对测序数据和分析结果进行质量控制，确保数据的准确性和可靠性。三、结果与分析在本研究中，我们对猪肺炎支原体和猪鼻支原体的基因组进行了深入的测序和比较基因组学分析。通过高质量的测序数据，我们成功绘制了两种支原体的完整基因组图谱，并对其进行了精细的注释。我们对两种支原体的基因组大小、GC含量和基因数量等基本信息进行了比较。结果显示，猪肺炎支原体的基因组相对较大，含有更多的基因，而猪鼻支原体的基因组则相对较小，基因数量较少。这一差异可能反映了两种支原体在生物学特性和适应环境方面的不同。我们进行了基因组结构分析，包括基因排列、重复序列和插入序列等。结果显示，两种支原体的基因组结构存在显著的差异。猪肺炎支原体的基因组中重复序列较多，而猪鼻支原体的基因组则较为紧凑，重复序列较少。我们还发现了一些特定的插入序列，这些序列可能与支原体的致病性和适应性有关。在比较基因组学分析中，我们重点关注了两种支原体之间的同源基因和特有基因。通过同源基因分析，我们发现了许多保守的基因家族，这些基因家族在两种支原体中均存在，可能涉及基本的生命活动和代谢过程。同时，我们也发现了一些特有的基因，这些基因可能赋予了两种支原体独特的生物学特性。为了深入了解两种支原体的进化关系，我们还进行了进化树分析。结果显示，猪肺炎支原体和猪鼻支原体在进化树上分别属于不同的分支，表明它们在进化过程中经历了不同的路径。这一结果进一步支持了两种支原体在生物学特性和适应环境方面的差异。通过对猪肺炎支原体和猪鼻支原体的基因组测序和比较基因组学分析，我们深入了解了它们的基因组特征和进化关系。这些结果不仅为揭示两种支原体的生物学特性和致病机制提供了重要线索，也为未来开发针对这两种支原体的新型药物和疫苗提供了理论基础。四、讨论猪肺炎支原体和猪鼻支原体的基因组测序与比较基因组学分析为我们提供了关于这两种病原体基因组结构、功能和进化的深入见解。这两种支原体虽然都属于支原体属，但在基因组大小、基因组成以及潜在的致病机制上显示出明显的差异。在基因组大小方面，猪肺炎支原体的基因组显著大于猪鼻支原体，这可能与它们各自适应不同宿主环境和生态位有关。基因组大小的差异可能反映了两者在进化过程中经历的基因丢失、获得或重组的不同历史。在基因组成方面，我们发现猪肺炎支原体和猪鼻支原体在基因种类和数量上也存在差异。这些差异可能导致了两者在生物学特性、致病性以及免疫应答等方面的不同。例如，猪肺炎支原体可能含有更多的与毒力相关的基因，而猪鼻支原体可能具有更多的与宿主细胞互作和定植相关的基因。比较基因组学分析还揭示了两者在进化上的关系。通过比较两者的基因序列和基因组结构，我们可以推断出它们在进化树上的位置以及可能的共同祖先。这种分析不仅有助于我们理解支原体的进化历程，还可能为未来的疫苗设计和疾病控制策略提供有价值的信息。本研究的结果还强调了基因组测序和比较基因组学在病原体研究中的重要性。通过深入分析病原体的基因组，我们可以更全面地了解它们的生物学特性、致病机制以及进化历史，从而为疾病的预防和控制提供更加精准和有效的策略。本研究通过猪肺炎支原体和猪鼻支原体的基因组测序与比较基因组学分析，揭示了两者在基因组结构、功能和进化上的差异。这些发现不仅有助于我们更深入地理解这两种病原体的生物学特性和致病机制，还为未来的疫苗研发和疾病控制提供了新的思路和方法。五、结论本研究通过对猪肺炎支原体和猪鼻支原体的基因组进行测序和深入的比较基因组学分析，揭示了这两种支原体在基因组结构、基因功能和进化关系上的重要特点。我们发现，尽管猪肺炎支原体和猪鼻支原体均属于支原体目，但在基因组大小、GC含量、基因数量和分布等方面存在显著差异。这些差异可能与其各自在猪体内的生态位、致病机制和进化历史密切相关。在功能基因分析方面，我们鉴定了两种支原体共有的核心基因和特有的基因，这些基因可能与其特定的生物学功能有关。例如，某些特有基因可能与猪肺炎支原体和猪鼻支原体在猪体内的定殖、感染和传播过程中的关键作用有关。我们还发现了一些与抗生素耐药性和毒力相关的基因，这些基因的存在可能对猪支原体病的预防和治疗产生重要影响。在进化关系分析方面，我们利用比较基因组学方法构建了猪肺炎支原体和猪鼻支原体的进化树，揭示了它们在支原体目中的进化地位和与其他支原体的亲缘关系。这些结果有助于我们更好地理解猪支原体病的起源、传播和演化过程。本研究通过基因组测序和比较基因组学分析，为深入理解猪肺炎支原体和猪鼻支原体的基因组结构和功能提供了重要信息。这些结果不仅有助于我们揭示猪支原体病的致病机制和进化历史，还为该病的预防和治疗提供了新的思路和方法。未来，我们将继续深入研究这两种支原体的生物学特性，以期为猪支原体病的防控提供更为有效的策略和措施。参考资料：肺炎支原体是一种大小介于细菌和病毒之间的微生物，肺炎支原体引起的肺炎是中国5岁及以上儿童最主要的社区获得性肺炎。占住院儿童社区获得性肺炎的10%-40%。每隔3-8年发生一次地区性大流行。新型四环素类抗菌药物是治疗肺炎支原体肺炎的替代药物，主要包括多西环素和米诺环素。肺炎支原体主要通过呼吸道飞沫传播，在咳嗽、打喷嚏、流鼻涕时的分泌物中，均可携带病原体。主要发病机理：肺炎支原体在发病前2～3天直至病愈数周，皆可在呼吸道分泌物中发现。它通过接触感染，长在纤毛上皮之间，不侵入肺实质，其细胞膜上有神经氨酸受体，可吸附于宿主的呼吸道上皮细胞表面，抑制纤毛活动和破坏上皮细胞，同时产生过氧化氢进一步引起局部组织损伤。其致病性可能与患者对病原体或其代谢产物的过敏反应有关。感染后引起体液免疫，大多成年人血清中都已存在抗体，所以很少发病。潜伏期2～3周，起病缓慢，约1/3病例无症状。以气管-支气管炎、肺炎、耳鼓膜炎等的形式出现，而以肺炎最重。发病初有乏力、头痛、咽痛、发冷、发热、肌肉酸痛、食欲减退、恶心、呕吐等，头痛显著。发热高低不一，可高达39℃。2～3天后出现明显的呼吸道症状，如阵发性刺激性咳嗽，咳少量黏痰或黏液脓性痰，有时痰中带血。发热可持续2～3周。热度恢复正常后尚可遗有咳嗽，伴胸骨下疼痛，但无胸痛。体检示轻度鼻塞、流涕，咽中度充血。耳鼓膜常有充血，约15%有鼓膜炎。颈淋巴结可肿大。少数病例有斑丘疹、红斑或唇疱疹。胸部一般无明显异常体征，约半数可闻干性或湿性啰音，10%～15%病例发生少量胸腔积液。儿童支原体肺炎最典型的症状是发热、咳嗽，咳嗽有一定特点，初期是阵发性、刺激性干咳，随着病情进展会出现咳嗽咳痰，部分症状严重的孩子会出现喘息、呼吸困难等表现，应高度警惕，尽快就医。白细胞总数常在正常范围内，但偶尔亦可升高。25%患者白细胞超过0×109/L，少数可达（0～0）×109/L。分类以中性粒细胞或嗜酸粒细胞稍增多。血小板减少。直接库姆斯试验可阳性。血沉在发病初期阶段可增快。因肺炎支原体营养要求高，生长缓慢，需观察10～30天或更长时间，对临床诊断帮助不大。（1）补体结合试验是诊断肺炎支原体感染广泛使用的血清学诊断方法。（3）酶联免疫吸附试验用于检测IgM和IgG抗体。方法敏感、特异性高、快速、经济，是诊断肺炎支原体感染实用可靠的手段。现已有ELISA试剂盒出售。用放射性同位素（32P、125I等）标记的核酸探针技术进行肺炎支原体检测。此法虽灵敏度高且特异性较强，但要求条件也较高，需要使用同位素，故难于在临床推广。自1992年该法用以检查肺炎支原体感染的临床标本。从综合结果看，PCR法检测的阳性率明显高于培养法（灵敏度比普通培养法高10～100倍），也明显高于血清学和探针杂交法。其特异性也较强，与其他支原体无交叉反应，且不受口腔其他菌污染的干扰。所需时间较短，因而采用PCR法可争取早日确诊，以指导临床合理用药。在中枢神经系统出现症状时，快速可靠的诊断更为必要。由于此法相当敏感，故实验操作时应特别小心，避免污染。检查可见模糊云雾状或均匀一致的阴影，近肺门部较致密，向外逐渐变浅，边缘不清楚，通常不侵犯整叶。绝大多数为一叶受累，以下叶多见，左下最多，右下次之，侧位20%左右有少量胸腔积液，10%左右见肺不张，偶见胸膜炎，肺部病变通常在2～3周吸收，完全吸收需4～6周。小儿约30%伴有肺门淋巴结肿大。临床症状如头痛、乏力、肌痛、鼻咽部病变、咳嗽、胸痛、脓痰和血痰，肺部线表现和化验室检查如冷凝集试验等有助诊断。该病具有自限性，多数轻症患者不经治疗可自愈。早期使用抗生素可减轻症状、缩短病程，常用抗菌药物有大环内酯类如罗红霉素、阿奇霉素，喹诺酮类如左氧氟沙星、莫西沙星，四环素类如多西环素、米诺环素等。早期使用抗生素可减轻症状，缩短病程。大环内酯类、四环素类、喹诺酮类抗生素均可选择使用。但应注意儿童患者＜8岁不宜使用四环素类抗生素，＜18岁少年患者不宜使用喹诺酮类抗生素。对于混合其他细菌或病毒感染的患者，应根据社区获得性肺炎指南选择用药。普通支原体肺炎患者无需使用糖皮质激素，对于起病迅速的患者，或难治性支原体肺炎的患者，可考虑使用糖皮质激素治疗，常用的药物是甲泼尼龙。不常规推荐用于普通支原体肺炎的治疗，但如果合并神经系统病变、溶血性贫血、血小板减少性紫癜等疾病，可应用丙种球蛋白进行辅助治疗。软式支气管镜术：软式支气管镜可通过局部冲洗呼吸道，结合异物钳等设备，清除呼吸道分泌物。支原体肺炎患者常有呼吸道黏液阻塞，少数患者可因炎症导致支气管狭窄，及时解除呼吸道阻塞症状对减轻发热、减少并发症有重要意义。早期行软式支气管镜对难治性肺炎支原体肺炎疗效显著。猪支原体性肺炎（Mycoplasmahyopneumoniae），二类传染病、寄生虫病。是由猪肺炎支原体引发的一种慢性肺炎，又称猪地方流行性肺炎，其病原最早由Mare、Switzer(1965)和Goodwin等(1965)从患肺炎猪的肺组织中分离出，并试验复制出本病，报导后该病原被命名为M.hyopneumoniae。猪支原体性肺炎是由猪肺炎支原体引发的一种慢性肺炎，又称猪地方流行性肺炎，其病原最早由Mare、Switzer(1965)和Goodwin等(1965)从患肺炎猪的肺组织中分离出，并试验复制出本病，报导后该病原被命名为M.hyopneumoniae。长期以来，本病一直被认为是对养猪业造成重大经济损失最常发生、流行最广最难净化的重要疫病之一。本病虽为老病，但近年来由于经常和PRRS、圆环病毒等其它病原混合感染，造成重大的经济损失而突显出了其重要性。猪肺炎支原体为本病病原，猪肺炎支原体生长需求极为苛刻，分离相当困难，其在基本肉汤培养物中生长缓慢，经3～30天，培养物才产生轻微的混浊，并产酸使颜色发生变化。Ross和Whittlestone(1983)综述了分离猪肺炎支原体的各种培养基和方法，以及猪肺炎支原体有关的生物学和生物化学特性及特定的鉴别方法。支原体的一个与潜在的致病性和控制有关的很重要的特征是其具有明显改变表面抗原的倾向，Artiushin和Minion(1996)提供了一些猪肺炎支原体分离物中存在异源性抗原的证据。本病我国地方猪种明显较引入品种易感，带菌猪是本病的主要传染源，病原体是经气雾或与病猪的呼吸道分泌物直接接触传播的，其经母猪传给仔猪使本病在猪群中持久存在，其严重程度常因管理水平、季节、通风条件、猪的密度以及其它环境因素改变而有很大差异。最早可能发生于2～3周龄(地方品种有9日龄的)的仔猪，但一般传播缓慢，在6～10周龄感染较普遍，许多猪直到3～6月龄时才出现明显症状。易感猪与带菌猪接触后，发病的潜伏期大的为十天或更长时间，并且所有自然发生的病例均为混合感染，包括支原体、细菌、病毒及寄生虫等。猪呼吸道复合征(PRDC)便是猪肺炎支原体与环境及多种病原微生物协同作用的结果，这里的病原微生物可以有猪瘟(HC)，猪流感(SI)、伪狂犬病(PR)、猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)、克雷伯氏杆菌、副嗜血杆菌(HPS)、猪圆环病毒(PCV)、猪传染性胸膜肺炎放线杆菌(APP)、猪多杀性巴氏杆菌(PmT)、猪霍乱沙门氏菌等，其也可以和萎缩性鼻炎(AR)、断奶后多系统衰弱综合征(PMWS)等互作，从而使猪只6～10周龄、12～15周龄、18～22周龄问题发生率明显上升。近两年，由于PCV引起的PMWS和间质性坏死性肺炎(PNDS)以及PRRS与MPS的互作使猪只免疫功能受损，易导致猪瘟免疫失败，链球菌、弓形体病等感染率升高，多种因素的互作已对当前的养猪业提出了严重挑战。感染初期，支原体聚集并粘连在支气管、细支气管以及气管上皮细胞上；有人把这种现象称为表面寄生。在深处的细小微支气管和肺泡处，几乎找不到支原体。肺炎支原体首先附着在纤毛上皮细胞上，然后逐渐引起感染细胞发生病变、死亡，导致部分纤毛功能受损或脱落；由于肺炎支原体感染引起纤毛变短变少，纤毛正常的摆动功能显著的下降，以致无法排除肺泡分泌液、空气源性的微细粉尘和各种致病原，为继发性感染大开方便之门。猪感染肺炎支原体后，通常会有大量中性粒细胞聚集在腔体、气管周围以及肺泡中；随着病情的进一步恶化，淋巴细胞的数量也在增加，它们分布在血管周围、支气管周边以及微支气管周边的组织上，并侵占气管的粘膜固有层。大约经过二十天后，在气管附近会出现套袖现象，白细胞聚集；同时也出现支气管附近淋巴组织增生，从而使肺泡之间的间隙增厚；这种增生的淋巴小结常常会压迫支气管，引起支气管扩张困难，每次呼吸时，有效的气体交换就减少，从而迫使猪增加呼吸频率，病情严重的猪就会出现喘气现象。即使当肺部病变缓解后，仍能看到失去功能的肺泡和大量增生的淋巴小结。对不是非常严重，但非常典型的肺部病变的组织学研究表明：喘气病的主要病变是肺部出现实变性病变，主要集中在肺尖叶和心叶，且病灶与非病变区有明显的界限，颜色通常为紫红到黄褐色。感染后10～12周，若无继发感染，肺部病变组织会逐渐自我康复，但仍会留下永久性的组织伤痕，也可看到明显的肺泡萎缩。继发其他细菌感染时，常引起肺和胸膜的纤维素性、化脓性病变，甚至出现明显的环死灶。肺炎支原体感染后会出现免疫抑制现象，有资料表明：猪只感染肺炎支原体后，会导致支气管淋巴结和血液淋巴细胞发生有丝分裂反应；有学者把这种现象看作是支原体的致病机制之一。另外还证实从被支原体感染的猪身上取出的淋巴细胞对非相关抗原产生抗体的能力显著下降；再者猪的细胞免疫能力下降，比如巨噬细胞的活动受到抑制，而T抑制细胞的活动增强。事实上，一旦发生猪肺炎支原体感染，则继发感染几乎不能避免；继发性感染会和猪肺炎支原体的免疫抑制反应共同作用，从而引起严重的临床症状，造成更大的经济损失。对肺炎支原体的致病机理及引起的症状病变已有较多的研究报道；但对其分泌的毒素尚未做深入的研究。业已证实附着粘连是猪肺炎支原体侵入呼吸道的必要条件和致病关键。支原体会首先附着在纤毛的上端，然后往深部侵入；使细胞发生病变和死亡，并导致纤毛萎缩，通过摆动清除异物的功能受损；接着支原体还会进一步破坏粘膜层，导致其他病原菌易于侵入而引起继发感染。目前还不了解猪肺炎支原体表面粘连结构的实质，体外模型试验表明支原体表面会散发出丝状体，这些丝状体(本质上可能是蛋白质)具有粘连附着功能。多种迹象表明猪肺炎支原体的吸附过程是一个多面性的感染和复杂的感染过程。免疫按性质分为主动免疫和被动免疫两种。被动免疫是指仔猪从母乳中获得针对性的抗体。如母猪曾接种过疫苗或自然感染过，则它的初乳中就含有特定抗体，仔猪只需吃奶就能获得母源抗体；但母源抗体的保护是短暂的，并具有某种程度的不稳定性，同时也不能保证新生仔猪免受感染。指望依靠母猪源抗体来给仔猪提供全面保护是危险的。最好的办法是通过接种疫苗来刺激机体产生主动免疫。当然猪自然感染肺炎支原体也能够产生免疫，但由于支原体的免疫原性较差，要想获得有效的免疫保护，需要花相当长的时间；通过感染获得免疫的办法，经常见效太慢，来不及保护肥育猪免受MPS的侵害；不过，自然感染后可有效减少母猪排毒，降低感染压力，反复进行天然攻毒可以提高猪只的免疫力。研究还发现：猪群中初产母猪比例越高，发生喘气病的机会就越大。由于经多次诱发的自然免疫，或许能保护较长一段时间；大概是这个原因，经常暴露在猪肺炎支原体下的猪，哪怕是长期感染的猪群，也不会表现出明显临床症状。感染过的母猪，即使是生过二至四胎后仍可能携带猪肺炎支原体，但只有初产母猪才是喘气病的主要传染源。为了保护猪群不受喘气病的侵害，需要及早对仔猪进行免疫接种。在仔猪感染支原体前就要进行免疫，这时诱发的免疫保护效果会很好，而且保护时间会很长。由于无法预测仔猪在何时会受到感染，所以仔猪一出生，就应尽早进行预防接种。另外早期免疫接种要考虑到母源抗体会不会对疫苗产生不良影响。当然选择高质量的疫苗和制定合理的免疫程序(如三周龄进行两次肌肉注射)对免疫效果也至关重要。由于猪感染肺炎支原体后，常易继发其他细菌和病毒的感染。因此，预防接种不仅可以保护猪免受肺炎支原体的侵害，同时还可以防止其它继发病原体的感染，为猪提供更广泛的保护。尽可能自繁自养，自育及全进全出；保持舍内空气新鲜，加强通风减少尘埃，人工清除干粪降低舍内氨气浓度；断奶后10～15天内仔猪环境温度应为28～30℃，保育阶段温度应在20℃以上，最少不低于16℃。保育、产房还要注意减少温差，同时注意防止猪群过度拥挤，使用良好的地板隔离，对猪群进行定期驱虫；尽量减少迁移，降低混群应激；避免饲料突然更换，定期消毒，彻底消毒空舍等。脉冲性使用抗生素可减缓疾病的临床症状和避免继发感染的发生。常用的抗生素有四环素类、泰乐菌素、林肯霉素、氯甲砜霉素、泰妙灵、螺旋霉素、奎诺酮类(恩诺沙星、诺氟沙星等)，但使用抗生素不会阻止感染发生，且一旦停止用药，疾病很快就会复发。另外在生产实践中预防性使用抗生素也会出现瓶颈现象，由于是防御性措施，通常使用的抗生素浓度较低，这易导致病原体产生耐药性，以后再用类似药物效果就不好。发生喘气病后，再想彻底杀灭病原体，是十分困难的，对呼吸道感染而言尤为如此，因为抗生素很难渗入到肺部粘膜表面而发挥作用；同时抗生素治疗也无法修复已造成的病变损伤。如果停止治疗，病原又会逸出、种种症状又会重新出现。除此之外，使用抗生素疗法可能带来的弊病还包括肉质会发生改变(由于持续用药会有药物残留)，而且人工费和成本费也随之提高。值得注意的是猪肺炎支原体对青霉素，阿莫西林，羟氨苄青霉素，头孢菌素Ⅱ，磺胺二甲氧嘧啶，红霉素，竹桃霉素和多粘菌素都有抗菌性。因此应针对该病应考虑使用综合防治措施：许多国家曾大力推进根除猪肺炎支原体的计划，丹麦、英国和美国都有未感染猪肺炎支原体的SPF猪群；但由于猪肺炎支原体可以通过气溶胶传播，很难彼此隔离阻断；所以猪肺炎支原体通常是这类SPF猪群最先感染的病原；对于未感染猪肺炎支原体的猪群来说，感染猪肺炎支原体的可能性很大，如距离感染猪群较近、猪群过大、当地生物饲养密度过大、离生猪贩运的主干道太近，这些都极易导致支原体传播与感染。采取根除MPS措施时，会发现要启动并维护无支原体感染状态的花费很大，而且可操作性不强(因为还必须对进入猪场的猪进行限制，控制它们携带的病原)。由于猪肺炎支原体是靠空气传播的，这也给保护未感染猪群带来难度。在猪密度过高的地区，问题犹为棘手，未感染猪群很可能会出现持续反复的感染。以上几种措施，无论是加强饲养环境管理、使用抗生素、还是采取根除措施，都不是防治喘气病的理想方案，它们都无法给猪整个生长周期的提供全程保护，使猪免受猪肺炎支原体的感染。1有条件的猪场应尽可能实施多点隔离式生产(SEW)技术，也可考虑利用康复母猪基本不带菌，不排菌的原理，使用各种抗生素治疗使病猪康复，然后将康复母猪单个隔离饲养、人工授精，使用药物培育健康群。怀孕母猪分娩前14～20天以支原净、利高霉素或林可霉素、克林霉素、氟甲砜霉素等投药7天。仔猪1日龄口服5ml庆大霉素，5～7日龄、21日龄2次免疫喘气病灭活苗。仔猪15日龄、25日龄注射恩诺沙星一次，有腹泻或PRDC严重的猪场断奶前后定期用药，可选用支原净、利高霉素、泰乐菌素、土霉素、氟甲砜霉复方。保育猪、育肥猪、怀孕母猪脉冲用药，可选用1000mg/kg土霉素，110mg/kg克林霉素。另外根据猪群背景要求加强对HC、AR、PR、链球菌、弓形体的免疫与控制。在搞好全进全出，加强管理与卫生消毒工作，提高生物安全标准的基础上，加对怀孕母猪尤其是初产母猪隐性感染和潜伏性感染的药物控制，加强仔猪特别是初产母猪的仔猪的早期免疫，及时检疫，立即隔离发病猪，根据猪群具体情总采取定期用药，预防用药策略等措施是控制场内MPS危害的关键。肺炎支原体（M.Pneumonia）是人类支原体肺炎的病原体。支原体肺炎的病理改变以间质性肺炎为主，有时并发支气管肺炎，称为原发性非典型性肺炎。主要经飞沫传染，潜伏期2～3周，发病率以青少年最高。临床症状较轻，甚至根本无症状，若有也只是头痛、咽痛、发热、咳嗽等一般的呼吸道症状，但也有个别死亡报道。一年四季均可发生，但多在秋冬时节。支原体是介于细菌和病毒之间的已知能独立生活的病原微生物中的最小者。支原体广泛分布自然界，有80余种。肺炎支原体属于支原体的一个类别，因其一端有一种特殊的末端结构，能使支原体粘附于呼吸道粘膜上皮细胞表面，引起肺部感染，所以被称为肺炎支原体。肺炎支原体感染临床症状轻重不一，大多起病不急，有发热、厌食、咳嗽、畏寒、头痛、咽痛、胸骨下疼痛等症状，以发热和咳嗽为主要表现。体温在37℃-41℃，大多数在39℃左右。主要经飞沫传播，潜伏期2-3周，发病率以青少年最高。肺炎支原体(MP)感染有一定自限性，轻症病例可在门诊治疗，以阿奇霉素为首选的大环内酯类抗菌药物是抗MP感染的一线药物，其他常用的大环内酯类药物包括红霉素、克拉霉素等。另外，四环素类、喹诺酮类药物都表现出对MPP的有效性，可以缩短症状持续时间。当患儿确定存在混合感染的时候，应在基础治疗同时及早给予经验性抗菌治疗。近年来重症肺炎支原体肺炎（SMPP）及难治性肺炎支原体肺炎（RMPP）比例不断增高，部分MPP患儿由于受到各种因素的影响，在经过系统的药物治疗干预后，病情依然恶化、迁延不愈，临床上称为RMPP。糖皮质激素具有抗炎、抗过敏及调节免疫等广泛的药理作用，全身使用糖皮质激素是治疗SMPP或RMPP的重要选择之一，首选甲泼尼龙或泼尼松。一般认为应用大环内酯类药物7d仍有发热或病情进展时开始应用，多数能取得良好疗效。RMPP或SMPP合并中枢神经系统病变、免疫性溶血性贫血、免疫性血小板减少性紫癜等自身免疫性疾病时可考虑应用人免疫球蛋白。经过临床积极抗感染、抗炎等治疗效果不佳的难治性肺炎或重症肺炎合并肺不张、胸腔积液、闭塞性支气管炎、血管栓塞（如肺栓塞、心脏栓塞、脑栓塞等）等肺内、外并发症者，此时内科保守治疗不能满足危重患儿的需求，我们会建议患儿进一步行支气管镜检查与治疗。支气管镜不仅可清除痰栓及坏死黏膜阻塞，还可收集肺泡灌洗液进行病原分析，甚至局部介入治疗，解决RMPP并发的气道狭窄问题。大环内酯类药物是治疗儿童肺炎支原体感染的首选药物。常用的大环内酯类药物包括阿奇霉素、红霉素、克拉霉素等。近年来，随着大环内酯类药物在儿童呼吸道感染中的广泛应用，儿童耐药肺炎支原体感染呈上升趋势。新型四环素类抗菌药物是治疗肺炎支原体肺炎的替代药物，主要包括多西环素和米诺环素。对耐药肺炎支原体肺炎有确切疗效，用于可疑或确定的肺炎支原体耐药的难治性肺炎支原体肺炎、大环内酯类药物无反应性肺炎支原体肺炎、重症肺炎支原体肺炎治疗。由于可能导致牙齿发黄和牙釉质发育不良，仅适用于8岁以上儿童。8岁以下儿童属于超说明书用药。米诺环素的作用相对较强，多西环素的安全性较高，在推荐剂量和疗程内，尚无持久牙齿黄染的报道。另一类替代药物为喹诺酮类药物，常用的为左氧氟沙星、环丙沙星、莫西沙星等，由于存在幼年动物软骨损伤和人类肌腱断裂的风险，我国18岁以下儿童使用属超说明书用药。2011年由儿科感染病学会和美国感染病学会联合制定的首个婴儿及＞3月龄儿童的社区获得性肺炎处理指南推荐。对于骨骼发育成熟的青少年或者不能耐受大环内酯类的≥6个月的儿童也可选喹诺酮类作为替代药物。在美国及日本作为替代药物可应用于儿童。肺炎支原体是一种大小介于细菌和病毒之间的微生物，肺炎支原体引起的肺炎是中国5岁及以上儿童最主要的社区获得性肺炎。占住院儿童社区获得性肺炎的10%-40%。每隔3-8年发生一次地区性大流行。新型四环素类抗菌药物是治疗肺炎支原体肺炎的替代药物，主要包括多西环素和米诺环素。肺炎支原体主要通过呼吸道飞沫传播，在咳嗽、打喷嚏、流鼻涕时的分泌物中，均可携带病原体。主要发病机理：肺炎支原体在发病前2～3天直至病愈数周，皆可在呼吸道分泌物中发现。它通过接触感染，长在纤毛上皮之间，不侵入肺实质，其细胞膜上有神经氨酸受体，可吸附于宿主的呼吸道上皮细胞表面，抑制纤毛活动和破坏上皮细胞，同时产生过氧化氢进一步引起局部组织损伤。其致病性可能与患者对病原体或其代谢产物的过敏反应有关。感染后引起体液免疫，大多成年人血清中都已存在抗体，所以很少发病。潜伏期2～3周，起病缓慢，约1/3病例无症状。以气管-支气管炎、肺炎、耳鼓膜炎等的形式出现，而以肺炎最重。发病初有乏力、头痛、咽痛、发冷、发热、肌肉酸痛、食欲减退、恶心、呕吐等，头痛显著。发热高低不一，可高达39℃。2～3天后出现明显的呼吸道症状，如阵发性刺激性咳嗽，咳少量黏痰或黏液脓性痰，有时痰中带血。发热可持续2～3周。热度恢复正常后尚可遗有咳嗽，伴胸骨下疼痛，但无胸痛。体检示轻度鼻塞、流涕，咽中度充血。耳鼓膜常有充血，约15%有鼓膜炎。颈淋巴结可肿大。少数病例有斑丘疹、红斑或唇疱疹。胸部一般无明显异常体征，约半数可闻干性或湿性啰音，10%～15%病例发生少量胸腔积液