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文档简介
第四章发酵机制无氧呼吸无氧呼吸,又称厌氧呼吸,是一类呼吸链末端的氢受体为外源无机氧化物〔个别为有机氧化物〕的生物氧化。这是一类在无氧条件下进展的产能效率较低的特殊呼吸。其特点是底物按常规途径脱氢后,经部分呼吸链递氢,最终由氧化态的无机物〔个别是有机物延胡索酸〕受氢。〔1〕硝酸盐呼吸又称反硝化作用。硝酸盐在微生物生命活动中具有两种功能,其一是在有氧或无氧条件下所进展的同化性硝酸盐复原作用,亦即微生物利用硝酸盐作为其氮源营养物的作用;其二是在无氧条件下,微生物利用硝酸盐作为呼吸链的最终氢受体,这是一种异化性的硝酸盐复原作用共同特点是硝酸盐都要经过一种含钼的硝酸盐复原酶将其复原为亚硝酸。硫酸盐呼吸是一种由硫酸盐复原细菌〔或称反硫化细菌〕把经呼吸链传送的氢交给硫酸盐这类末端氢受体的一种厌氧呼吸。这是一种异化性的硫酸盐复原作用。经过这一过程,微生物就可在无氧条件下借呼吸链的电子传送磷酸化而获得能量。硫酸盐复原的最终产物是H2S,自然界中的大多数H2S是由这一反响产生的。与硝酸盐复原细菌不同的是,硫酸盐复原细菌都是一些严厉依赖于无氧环境的专性厌氧细菌〔4〕碳酸盐呼吸是一类以CO2或重碳酸盐作为无氧呼吸链的末端氢受体的无氧呼吸。根据其复原产物的不同,可分为两种类型,一类是产甲烷菌产生甲烷的碳酸盐呼吸,另一类为产乙酸细菌产生乙酸的碳酸盐呼吸。能量转移几个概念底物程度磷酸化氧化磷酸化光合磷酸化第二节微生物的合成代谢一、糖类的生物合成二、脂肪酸的生物合成三、氨基酸和核苷酸的生物合成氨基酸的生物合成方式:氨基化作用;转氨基作用;糖代谢的中间产物为前体合成氨基酸。第三节分解代谢和合成代谢间的联络分解代谢的功能在于保证正常合成代谢的进展,而合成代谢又反过来为分解代谢发明了更好的条件,两者相互联络,促进了生物个体的生长繁衍和种族的昌盛开展。中间代谢产物的重要性假设在生物体中只进展能量代谢,那么有机能源的最终结局只是产生ATP、H2O和CO2,这时便没有任何中间代谢物可供累积,因此,合成代谢也不能够正常进展。相反,假设要进展正常的合成代谢,又须抽走大量为分解代谢正常进展所必需的中间代谢物,结果也势必影响具有循环机制的分解代谢的正常运转。一、兼用代谢途径凡在分解代谢和合成代谢中具有双重功能的途径,就称兼用代谢途径。EMP、HMP和TCA循环是重要的兼用代谢途径。①在兼用代谢途径中,合成途径并非分解途径的完全逆转。②在分解与合成代谢途径中,在相应的代谢步骤中,往往还包含了完全不同的中间代谢物。③在真核生物中,合成代谢和分解代谢普通在细胞的不同区域中分隔进展,原核生物因其细胞构造上的间隔程度低,故反响的控制主要在简单的酶分子程度上进展。二、代谢物回补顺序所谓回补顺序,又称补偿途径或添补途径,就是指能补充兼用代谢途径中因合成代谢而耗费的中间代谢物的反响。这样,当重要产能途径中的关键中间代谢物必需被大量用作生物合成的原料时,仍可保证能量代谢的正常进展。微生物的代谢调控与发酵消费微生物有着一整套可塑性极强和极准确的代谢调理系统,以保证上千种酶能正确无误、有条不紊地进展极其复杂的新陈代谢反响。一、微生物代谢过程中的自我调理1、控制营养物质透过细胞膜进入细胞2、经过酶的定位控制酶与底物的接触3、控制代谢物流向其中以调理代谢流的方式最为重要,它包括两个方面,一是“粗调〞,即调理酶的合成量,二是“细调〞,即调理现成酶分子的催化活力,两者往往亲密配合和协调,以到达最正确调理效果。利用微生物代谢调控才干的自然缺损或经过人为方法获得突破代谢调控的变异菌株,可为发酵工业提供消费有关代谢产物的高产菌株。一、酶活性的调理酶活性的调理是指在酶分子程度上的一种代谢调理,它是经过改动现成的酶分子活性来调理新陈代谢的速率,包括酶活性的激活和抑制两个方面。〔一〕调理方式:1、酶活性的激活:在代谢途径中后面的反响可被较前面的反响产物所促进的景象;常见于分解代谢途径。2、酶活性的抑制:包括:竞争性抑制和反响抑制。概念:反响:指反响链中某些中间代谢产物或终产物对该途径关键酶活性的影响。一、酶活性的调理凡使反响速度加快的称正反响;凡使反响速度减慢的称负反响〔反响抑制〕;反响抑制——主要表如今某代谢途径的末端产物过量时可反过来直接抑制该途径中第一个酶的活性。主要表如今氨基酸、核苷酸合成途径中。特点:作用直接、效果快速、末端产物浓度降低时又可解除,是可逆的。第一个酶〔有活性〕第一个酶〔无活性〕终产物终产物〔调理物〕结合在调理中心酶活性的抑制主要是反响抑制,它主要表如今某代谢途径的末端产物〔即终产物〕过量时,这个产物可反过来直接抑制该途径中第一个酶的活性,促使整个反响过程减慢或停顿,从而防止了末端产物的过多累积。反响抑制的类型1.直线式代谢途径中的反响抑制反响抑制的类型2、分支代谢途径中的反响抑制:在分支代谢途径中,反响抑制的情况较为复杂,为了防止在一个分支上的产物过多时不致同时影响另一分支上产物的供应,微生物开展出多种调理方式。主要有:同功酶的调理,顺序反响,协同反响,积累反响调理等。〔1〕同功酶调理同功酶是指能催化一样的生化反响,但酶蛋白分子构造有差别的一类酶,它们虽同存于一个个体或同一组织中,但在生理、免疫和理化特性上却存在着差别。同功酶的主要功能在于其代谢调理。在一个分支代谢途径中,假设在分支点以前的一个较早的反响是由几个同功酶所催化时,那么分支代谢的几个最终产物往往分别对这几个同功酶发生抑制造用。协同反响抑制
〔concertedfeedbackinhibition〕定义:分支代谢途径中几个末端产物同时过量时才干抑制共同途径中的第一个酶的一种反响调理方式。协作反响抑制
〔cooperativefeedbackinhibition〕定义:系指两种末端产物同时存在时,可以起着比一种末端产物大得多的反响抑制造用。
积累反响抑制
〔cumulativefeedbackinhibition〕每一分支途径末端产物按一定百分比单独抑制共同途径中前面的酶,所以当几种末端产物共同存在时它们的抑制造用是积累的,各末端产物之间既无协同效应,亦无拮抗作用。顺序反响抑制
〔sequentialfeedbackinhibition〕一种终产物的积累,导致前一中间产物的积累,经过后者反响抑制合成途径关键酶的活性,使合成终止。酶活力调理的机制1.变构酶实际:变构酶为一种变构蛋白,酶分子间构象的变化影响酶活。其上具有两个以上立体专注性不同的接受部位,一个是活性中心,另一个是调理中心。活性位点:与底物结合变构位点:与抑制剂结合,构象变化,不能与底物结合与激活剂结合,构象变化,促进与底物结合变构酶上有两个位点:协同效应中,酶有多个调理位点,只需每一位点与终产物结合才产生反响。同功酶〔isoenzyme)实际:某一产物过量仅抑制相应酶活,对其他产物没影响。酶的活性可以调控
在代谢途径中调理酶活性几个酶或十几个酶前后配合,完成一系列代谢反响,构成一条代谢途径。在一条代谢途径中,经常是前一个酶促反响的产物,便是下一个酶促反响的底物。共价调理有时候,酶蛋白分子可以和一个基团构成共价结合,结合的结果,使酶蛋白分子构造发生改动,使酶活性发生改动。例如,与磷酸根的结合。这种调理酶活性的情况称为酶的共价调理。竞争性抑制有的酶在遇到一些化学构造与底物类似的分子时,这些分子与底物竞争结合酶的活性中心,亦会表现出酶活性的降低〔抑制〕。这种情况称为酶的竞争性抑制。竞争性抑制剂在构造上与底物类似二、酶合成的调理酶合成的调理是一种经过调理酶的合成量进而调理代谢速率的调理机制,这是一种在基因程度上〔在原核生物中主要在转录程度上〕的代谢调理。凡能促进酶生物合成的景象,称为诱导。能妨碍酶生物合成的景象,那么称为阻遏。与上述调理酶活性的反响抑制等相比,调理酶的合成〔即产酶量〕而实现代谢调理的方式是一类较间接而缓慢的调理方式。其优点那么是经过阻止酶的过量合成,有利于节约生物合成的原料和能量。在正常代谢途径中,酶活性调理和酶合成调理两者是同时存在且亲密配合、协调进展的。〔一〕酶合成调理的类型1.诱导根据酶的生成能否与环境中所存在的该酶底物或其有关物的关系,可把酶划分成组成酶和诱导酶两类。诱导酶是细胞为顺应外来底物或其构造类似物而暂时合成的一类酶。能促进诱导酶产生的物质称为诱导物,它可以是该酶的底物,也可以是难以代谢的底物类似物或是底物的前体物质。酶的诱导合成类型同时诱导:即当诱导物参与后,微生物能同时或几乎同时诱导几种酶的合成,它主要存在于短的代谢途径中。例如,将乳糖参与到E.coli培育基中后,即可同时诱导出β-半乳糖苷透性酶、β-半乳糖苷酶和半乳糖苷转乙酰酶的合成;顺序诱导:即先合成能分解底物的酶,再依次合成分解各中间代谢物的酶,以到达对较复杂代谢途径的分段调理。2.阻遏在微生物的代谢过程中,当代谢途径中某末端产物过量时,除可用前述的反响抑制的方式来抑制该途径中关键酶的活性以减少末端产物的生成外,还可经过阻遏作用来妨碍代谢途径中包括关键酶在内的一系列酶的生物合成,从而更彻底地控制代谢和减少末端产物的合成。阻遏作用有利于生物体节省有限的养料和能量。阻遏的类型主要有末端代谢产物阻遏和分解代谢产物阻遏两种。〔1〕末端产物阻遏指由某代谢途径末端产物的过量累积而引起的阻遏。对直线式反响途径来说,末端产物阻遏的情况较为简单,即产物作用于代谢途径中的各种酶,使之合成受阻遏。对分支代谢途径来说,情况就较复杂。每种末端产物仅专注地阻遏合成它的那条分支途径的酶。代谢途径分支点以前的“公共酶〞仅受一切分支途径末端产物的阻遏,此即称多价阻遏作用。末端产物阻遏在代谢调理中有着重要的作用,它可保证细胞内各种物质维持适当的浓度。〔2〕分解代谢物阻遏景象:当细胞内同时存在两种可利用底物〔碳源或氮源〕时,利用快的底物会阻遏与利用慢的底物有关的酶合成。缘由:阻遏并不是由于快速利用底物直接作用的结果,而是由这种底物分解过程中产生的中间代谢物引起的,所以称为分解代谢物阻遏分解代谢产物阻遏葡萄糖效应二次生长景象大肠杆菌利用混合碳源生长时时,发现葡萄糖会抑制其它糖的利用大肠杆菌在含乳糖和葡萄糖的培育基中,优先利用葡萄糖,并只需当葡萄糖耗尽后才开场利用乳糖,这就构成了在两个对数生长期中间的第二个生长停滞期1.单独参与葡萄糖时,菌体生长几乎没有延迟期;单独参与乳糖时,菌体生长有明显的延迟期;2.同时参与葡萄糖和乳糖时,菌体呈二次生长〔二〕酶合成调理的机制酶合成的诱导支配子学说:支配子〔operon〕:是基因表达和控制的一个完好单元,其中包括启动基因(promoter)、支配基因(operator)和构造基因(Structuralgene)3部分。启动基因是一种能被依赖于DNA的RNA多聚酶所识别的碱基顺序,它既是RNA多聚酶的结合部位,也是转录的起始点;支配基因是位于启动基因和构造基因之间的一段碱基顺序,能与阻遏物〔一种调理蛋白〕相结合,以此来决议构造基因的转录能否能进展;构造基因那么是决议某一多肽的DNA模板,可根据其上的碱基顺序转录出对应的mRNA,然后再可经过核糖体而转译出相应的酶。一个支配子的转录,就合成了一个mRNA分子。调理基因用于编码组成型调理蛋白的基因。调理基因普通位于相应支配子的附近。效应物是一类低分子量的信号物质〔如糖类及其衍生物、氨基酸和核苷酸等〕,包括诱导物和辅阻遏物两种,它们可与调理蛋白相结合以使后者发生变构作用,并进一步提高或降低与支配基因的结合才干。色氨酸支配子模型支配子分两类:一类是诱导型支配子,只需当存在诱导物〔一种效应物〕时,其转录频率才最高,并随之转译出大量诱导酶,出现诱导景象。另一类是阻遏型支配子,只需当缺乏辅阻遏物〔一种效应物〕时,其转录频率才最高。由阻遏型支配子所编码的酶的合成,只需经过去阻遏作用才干起动。腺苷酸环化酶乳糖支配子模型解释分解代谢物的阻遏机制乳糖支配子的启动基因内,除RNA聚合酶结合位点外,还有一个称为CAP-cAMP复合物的结合位点cAMP是环腺苷酸,CAP是降解物基因活化蛋白〔又称为cAMP受体蛋白,CRP〕,当CAP与cAMP结合后,就会被活化。CAP-cAMP复合物又会激活启动基因,并使RNA聚合酶与启动基因结合。乳糖与葡萄糖同时存在时,由于分解葡萄糖的酶类属于组成酶,能迅速地将葡萄糖降解成某种中间产物〔X〕,X既会阻止ATP环化构成cAMP,同时又会促进cAMP分解成AMP,从而降低了cAMP的浓度,继而阻遏了与乳糖降解有关的诱导酶合成。只需当葡萄糖耗尽后,cAMP才干上升到正常浓度,支配子重新开启,并开场利用乳糖作为碳源,构成菌体的二次生长。当代谢产生末端代谢产物色氨酸后,色氨酸作为效应物与原阻遏物结合,使后者发生变构效应,并能与支配基因结合,从而阻止了构造基因的表达酶阻遏的色氨酸支配子模型三、调控实际的运用食品发酵的目的:大量积累人们所需求的微生物代谢产物。代谢的人工控制:人为地突破微生物的代谢控制体系,使代谢朝着人们希望的方向进展。人工控制代谢的手段:改动微生物遗传特性(遗传学方法〕;控制发酵条件〔生物化学方法〕;改动细胞膜透性。(一)遗传学方法1、挑选抗反响突变株如:对诱变后的菌种用终产物构造类似物,挑选对终产物积累不敏感的细胞株。产生缘由:1〕酶构造发生改动;2〕酶系统发生改动。因此细胞不受终产物反响抑制,产生过量的产物。(一)遗传学方法2、营养缺陷型菌株的运用〔1〕对于直线式代谢途径:选育营养缺陷性突变株只能积累中间代谢产物
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