基因符号、蛋白质符号在科技期刊中的使用

基因符号、蛋白质符号在科技期刊中的使用

不同的版本的基因符号和土壤符号的表达，同一出版物也不完整。如何才是规范的,未见深入系统的研究;在科技期刊日趋国际化的今天,很有讨论的必要。1entalrert1基因编码TIG遗传命名指南规定,人类基因的全名不用斜体,其基因符号由斜体大写的罗马字母与阿拉伯数字组成,中间不加点号,也不用上下角标。例如脆性X智力低下基因1,全名fragileXmentalretardation1,不用斜体,基因符号为FMR1,由斜体大写的罗马字母和阿拉伯数字组成。论文中一般不写基因全名,只写基因符号,如KPT1、KPT12、KPT13、TP53、CDKN2A、RB1。等位基因的命名与基因命名相似,由斜体大写字母与阿拉伯数字组成,但要用星号将基因符号与特异的等位基因符号分开,如HBB*S、D3S22*AI(星号不是上角标)。蛋白质的名称用相同的大写基因符号表示,但不用斜体,如KPT1、KPT12、KPT13、TP53、CDKN2A、RB1。实验中常用细菌及动物基因和蛋白质的命名规则如下。1等位基因的编码基因符号由3个小写斜体字母组成。具有相同表型的不同基因座突变用斜体大写字母后缀相区别,如uvrA、uvrB;等位基因用紧随基因座名称后的一系列特定的数字表示,如lacY1、araA1、araA2;如果发生突变的精确基因座不能确定,并且等位基因的名称只有3个字母,则基因座字母由连字符代替,如lac-23、eda-1。蛋白质产物的名称与对应的基因或等位基因相同,但不用斜体,且首字母大写,如UvrA、UvrB。2等位基因的命名基因符号由斜体字母和阿拉伯数字组成,字符总数不超过6个,且首字母大写,如Tyrp、Tyr、Pepc、Prm1、Fa;等位基因的命名是在基因符号的右上角加一上标,如ESIb;蛋白质用相同的基因符号命名,不用斜体,但要大写,如TYRP、TYR、PEPC、PRM1。3其他命名规则基因符号通常用2~4个斜体字母和阿拉伯数字表示,首字母大写,但不用连字符,如Es1、Es2、B2m、Mc1r、Myc、Tyr、Gus;等位基因的命名是在基因符号后加小写的上标,如Es1b、Gpila;蛋白质用基因的相同符号命名,但要正体大写,如ES1、ES2、MC1R、MYC、TYR、GUS。除上述TIG遗传命名规则之外,还有其他命名系统。国外研究者曾先后提出了大肠杆菌、曲霉和啤酒酵母基因符号的建议命名系统。这些系统不是正式的标准,但已为大多数研究者认可。基因座的符号用3个小写斜体字母表示。这3个字母是说明这一基因特性的英文单词或词组的缩写。如组氨酸基因his(histidine的前3个字母)、与核糖体中较大的蛋白质亚基有关的基因rpl(由ribosomalproteinlarge这3个词的首字母组成)等。2科技时代基因符号和蛋白质符号的显示笔者调查了分子生物学和医学2类期刊12种30期,基因和蛋白质符号的使用大致有以下3种情况。1基因和蛋白质符号的表示方法及规则有采用TIG命名系统的,如BMRF1基因,在同一篇文章中都采用大写斜体,P54蛋白采用大写正体,整篇文章中前后一致;但在同一本期刊不同的文章中基因、蛋白质符号又都采用大写正体,如VPZ基因、HA基因、VPZ抗体、B19壳蛋白、TAT蛋白;同一本期刊基因蛋白质又成了斜体,并且基因还是小写斜体,如Taq酶,p21基因。国外期刊也存在同样问题,如p53protein是小写斜体,p53genes也是小写斜体,同一篇文章p53protein又用小写正体。基因和蛋白质符号的表示方法采用TIG遗传命名指南的规则比较科学,因为该指南详细规定了各种基因和蛋白质的表示方法,正确使用这一命名方法,能够提高论文的科学性。责任编辑必须严格把关,使每一篇文章中的符号要统一,主编应整体把关,使整本期刊的符号统一。2ha基因的基因文化如VEGF基因、G6Pase基因、BMRF1基因、VP2基因、HA基因,P54蛋白、VEGF蛋白、B1g壳蛋白、PCNA蛋白、G6Pase蛋白、VP2抗体、TAT蛋白等。这种表示方法不科学,一旦符号后不写基因或蛋白质字样,读者就难以区分它们所表达的内容。3定期阅读基因符号小，蛋白质符号大绝大多数医学期刊采用小写正体字母表示基因,大写正体字母表示蛋白质,但存在如下混乱现象。相同的符号在所有出版物中都不同有的文章基因小写,蛋白质大写,如p21基因、p53基因,P21蛋白;另一篇文章p21基因有时大写有时小写。基因编码及表达如某大学学报(医学版)前后4篇文章的表达4个样:《低温对脑外伤后细胞凋亡的影响》一文,基因符号小写,蛋白质符号大写,如bax及bcl-2基因、Bcl-2蛋白、Bax-蛋白;《基因芯片技术在cox10等无精症患者相关基因的分析》一文,题名中的基因用了正体小写字母,而正文中基因符号又用大写,如COX10基因、CT基因;《莫索尼定对自发性高血压大鼠左室肥厚及c-myc基因表达的影响》一文,基因用小写字母,如c-myc基因;《IS导管血管壁内局部导入c-myc反义寡核苷酸预防PTCA术后再狭窄的实验研究》一文,基因和蛋白质又都用小写字母,如c-myc蛋白、c-myc基因。基因符号法如“cyclinD蛋白表达”“c-myc单克隆抗体”有时大写,有时小写。基因符号用小写字母表示,蛋白质符号用大写正体字母表示,这种方法也比较科学。如果同一基因在人类和动物中都存在,人类中的基因用大写正体字母表示,以示区别。3基因、蛋白质符号的规范表达上述基因及蛋白质符号不规范的表达,往往是由下述原因引起的。1)作者对基因符号、蛋白质符号的表示方法不清楚,往往从网上查一些资料,这些资料中符号本来就不规范,作者也就将错就错。2)期刊出版编辑部门对基因、蛋白质符号没有统一规定。3)编辑不重视。由于分子生物学发展得越来越快,尤其是目前渗透到医学各个领域,医学论文几乎都涉及到分子生物学的内容,它的规范使用直接关系到文章内容的表达,但这并未引起编辑的重视,往往是对作者写的未加以修改和规范。针对这些问题,为了保证科技期刊中基因符号和蛋白质符号的规范表达,建议有关方面做好以下几项工作:1)有关部门应制定有关基因、蛋白质符号的编排格式;2)编辑应注意基因、蛋白质符号的规范化