第五章(1) PUBMED外文医学期刊文献检索

医学文献检索与利用南华大学图书馆龙颖TELMAIL：1642486074@第五章外文医学期刊文献检索学习目标1、掌握：PubMed、OVID、ElsevierScienceDirect及WebofScience数据库的常用检索途径及检索方法；WebofScience数据库的基本检索方法及检索结果输出与分析方法。2、熟悉：PubMed、OVID、ElsevierScienceDirect及WebofScience数据库的进入方式及检索界面；PUBMED、OVID、ElsevierScienceDirect及WebofScience数据库的检索规则及WebofScience的个性化服务。3、了解：PubMed、OVID、ElsevierScienceDirect数据库的检索结果的显示、下载及个性化服务等；WebofScience收录的数据库资源及特色。PubMed概况PubMed功能栏介绍认识PubMed文献PubMed基本检索PubMed高级检索主题词MeSH检索循证及临床查询检索PubMed全文获取第一节PubMed一、概述：由美国国立医学图书馆下属的国家生物技术信息中心于2000年4月研制开发的免费数据库检索系统，主要用于生物医学领域研究文献的检索。与NCBI所提供的其他数据库，如分子生物学数据库、PubMedCentral、图书库等一样，PubMed也使用Entrez作为其检索系统。网址/pubmed/PubMed收录了超过2400万篇有关生物医学的文摘及题录数据，部分文献可获取全文。这些记录绝大部分可回溯至1984年，部分早期文献可回溯至1865年。主要来自于MEDLINE、生命科学类期刊及在线电子图书等，主要涉及生物医学及健康领域，也包含部分生命科学、行为科学、化学科学及生物工程的内容。此外，PubMed还提供进入其他相关网站的链接。概况网址：/pubmed或/pubmed或(com;org;net)由美国国立医学图书馆（NationalLibraryofMedicine-NLM）国家生物技术信息中心（NationalCenterforBiotechnologyInformation-NCBI）向因特网用户提供免费MEDLINE检索服务(1997-6-26)收录70余个国家4900多种生物医学期刊的题录与文摘，是世界上最权威的医学数据库现有1950年以来的1650多万篇文献的记录(其中MEDLINE记录1400多万条)目前每年增加60余万条文献记录在全部记录中有76%的文献为英文；在2000年以来的记录中90%的文献为英文；收录中文刊60余种概况/pubmed/使用帮助常用工具更多服务检索词输入框PubMed记录唯一识别号PMIDPubMed记录的四种来源1.MEDLINE是PubMed记录的主要来源，标注为[PubMed-indexedforMEDLINE]。2.In-processcitations是系统为加快文献的报道速度，将尚未标引MeSH主题词、文献类型的最新文献记录先存入临时库中，待完成加工处理后再转入MEDLINE的记录，标注为[PubMed-inProcess]。3.Publishersuppliedcitation是PubMed接受出版商提供的非生物医学文献（MEDLINE不收录）的电子期刊文献记录，标注为[PubMed-assuppliedbypublisher]。4.OLDMEDLINE是PubMed中部分1966年以前出版且未被MEDLINE收录的文献记录，标注为[PubMed-OLDMEDLINE]。

近年来，越来越多的出版社通过电子期刊平台发布最新的文献信息，先于印刷版期刊发表的电子期刊文献标注为[Epubaheadofprint]。MEDLINE与PubMed的区别PubMed是一个免费的搜索引擎，由NLM所属的国家生物技术信息中心（NCBI）于2000年4月开发.基于WEB的生物医学信息检索系统（http:///pubmed/），提供生物医学方面的论文搜寻以及摘要。它的数据库来源有：MEDLINE、OLDMEDLINE、Recordinprocess、Recordsuppliedbypublisher等，数据类型：期刊论文、综述以及与其他数据库链接。PubMed的资讯并不包括期刊论文的全文，但可能提供指向全文提供者（付费或免费）的连结。MEDLINE是一个数据库，是美国国立医学图书馆（TheNationalLibraryofMedicine，NLM）创建的国际性综合生物医学信息书目数据库，是当前国际上最权威的生物医学文献数据库。内容包括美国《医学索引》（IndexMedicus，IM）的全部内容和《牙科文献索引》（IndextoDentalLiterature）、《国际护理索引》（InternationalNursingIndex）的部分内容，涉及基础医学、临床医学、环境医学、营养卫生、职业病学、卫生管理、医疗保健、微生物、药学、社会医学等领域。MEDLINE收录1966年以来世界70多个国家和地区出版的4000余种生物医学期刊的文献，近1400万条记录。目前每年递增30-35万条记录，以题录和文摘形式进行报道，其中75%是英文文献，70%-80%文献有英文文摘。[PubMed-assuppliedbypublisher][PubMed-inProcess][PubMed-indexedforMEDLINE]另：[PubMed]认识PubMed文献出处SO篇名TI作者AU文献类型(状态)Summary认识PubMed文献调整显示设置可改变显示模式，显示数量及检索结果排序显示设置显示摘要显示数量排序模式认识PubMed文献在摘要显示模式下可以看到详细的文献信息作者地址文献摘要文献作者文献篇名全文链接文献类型文献主题词认识PubMed文献出版社上传PreMedlinePubMedMedlinePubMed数据库收录的文献的状态，主要为Medline认识PubMed文献非英文的文献篇名上有中括号[]且注明有语种英文文献土耳其语[篇名]英文文献认识PubMed文献电子优先即最新文献，一般比印刷出版提前三个月以上电子优先2009年5月2008年9月（一）PubMed基本检索

1.自动词语匹配检索

在检索框中键入一个或多个英文单词（大写或小写均可），点击GO按钮，PubMed系统会自动在主题词表，期刊名表，短语表及作者索引中查询与输入的词相匹配的形式，这就是它特有的“自动词汇匹配功能”。例如：检索肿瘤(cancer)方面的文章。在检索框中输入：“cancer”，再点击“Go”按钮。PubMed将自动地利用它的“自动词汇匹配”功能将重要的词语结合在一起，并将不规范的词语转换成MeSH词表中规范的用词进行检索，比如，检索“cancer”将自动转换为："neoplasms"[MeSHTerms]OR"neoplasms"[AllFields]OR"cancer"[AllFields]自由词检索时PubMed自动将不规范的词转换成规范的词进行检索自动词汇转换PubMed基本检索PubMed基本检索布尔逻辑组合检索，常用的逻辑关系词有AND，OR，NOT等ABAB

逻辑与（AND）--检出记录中同时含有检索词A和检索词B.如：AANDB

逻辑非（NOT）--在含检索词A的记录中，去掉含检索词B的记录。如：ANOTB

逻辑或（OR）--检出记录中含有检索词A或检索词B或同时含有检索词A和B的文献。如：AORBAB布尔逻辑检索PubMed基本检索

2.

著者检索按照姓+名缩写（不用标点）的格式键入作者姓名，如：smithja或jonesk,系统会自动在作者字段内进行检索。姓名第一个字母可用大写也可用小写，姓前名后,姓用全称，名字一般用缩写。考虑到作者姓名的不同形式，PubMed采用自动转换功能进行作者姓名检索，如：smithj将检索成smithja,smithjb,smithjr等。精确检索：可以用双引号将作者名引起来，再加作者字段限定[AU]，如："smithj"[au]，这样可避免PubMed自动转换，实现精确查找。PubMed基本检索作者姓名检索按照姓(全写)+名(缩写)，之间不用标点键入作者姓名smithjPubMed基本检索精确检索避免PubMed自动词汇转换，实现精确查找"smithj"[au]PubMed基本检索3.期刊检索在检索框中键入期刊名，如：molecularbiologyofthecell，系统的“自动词语匹配”功能会将它转换成molbiolcell[journal]进行检索。也可以直接输入Medline的期刊标准缩写形式，如：molbiolcell，或者是输入刊物的ISSN（国际标准出版物代码）进行检索，如：1059-1524。如果一个杂志名恰好是主题词或关键词，如：cancer，science，cell等，PubMed会首先将这些词转换成MeSH词表中的主题词进行检索。因此，需要将检索请求进行标准化处理，即在杂志名后面加[TA]。如："cell"[ta]PubMed基本检索期刊的一般检索，是在检索输入框中键入期刊名或期刊的ISSN号EurJImmunolPubMed基本检索期刊的标准检索，是在期刊名后面加字段限定[TA].比如:"cell"[ta]"cell"[ta]PubMed基本检索

期刊数据库（journaldatabase)期刊数据库的作用：1、可以查看期刊的详细信息，包括出版国家，出版社，出版语言，期刊类目等等；2、可以根据期刊的主题分类，查看medline收录的各学科的期刊，比如查看medline收录的关于麻醉学(Anesthesiology)方面的期刊；2、方便检索某本期刊上被PubMed收录的所有文章。比如：我们想知道期刊AcadPediatr的全称以及具体的出版社，以方便投稿，如何查？操作方法：点击导航栏上的Journaldatabase，打开期刊数据库检索界面，在检索框中输入AcadPediatr，再点击Go按钮即可。PubMed基本检索期刊数据库在PubMed首页导航栏的右下角部分期刊数据库AcadPediatrJournaldatabase:AcadPediatrPubMed基本检索期刊数据库可以查看指定期刊的详细信息Elsevier出版期刊数据库PubMed基本检索按期刊主题浏览medline收录的各学科的期刊期刊主题期刊数据库PubMed基本检索按字母顺序浏览medline收录的各学科期刊麻醉学方面PubMed基本检索期刊数据库可以方便的查看medline收录的各学科方面的期刊medline收录的麻醉学方面的期刊PubMed基本检索4.短语精确检索PubMed允许使用双引号来强制系统进行短语检索。如：在PubMed主页的检索提问框中键入“singlecell”，并用双引号引起来。点击“GO”按钮，系统会将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行检索。如果不使用双引号进行强制检索，系统就会将其分成2个词：single和cell检索，其检索表达式为：singleANDcell.很明显这样的检索结果是不符号要求的。PubMed基本检索强制检索普通检索"singlecell"singlecellPubMed基本检索

5.截词检索截词检索的作用：扩大检索范围，提高查全率。截词符：用*表示，代表多个字符，将*加在检索词后可以表示对所有以该词开头的词进行检索。如：bacter*，可以检出bacter，bacteria，bacterium，bacteriophage，等最多600个单词。PubMed基本检索截词检索可以扩大检索范围提高查全率。bacter*[TI]PubMed基本检索

6.字段限定检索采用字段限制方式进行检索，其规则是：检索词1[字段标识]逻辑运算符检索词2[字段标识]如：查找作者为crick在1993年发表的有关DNA方面的文献.检索式：DNA[mh]ANDcrick[au]AND1993[dp]PubMed基本检索字段限制检索其规则是：检索词+[字段标识]

DNA[mh]ANDcrick[au]AND1993[dp]PubMed基本检索常用检索字段描述和标识Title[ti]：篇名字段Abstract[ab]：摘要字段Affiliation[ad]：著者地址字段。Authorname[au]：文章的作者，检索格式：姓+名。如："smithja"[au]Journaltitle[ta]：期刊名称。如：cell[ta]Language[la]：论文出版语种。语种检索时可只输入前3个字母，如：chi[la]=chinese[la]；English[lang]=eng[la]比如：检索文章题目中含有高血压的中文文献检索式:hypertension[ti]ANDchi[la]PubMed基本检索hypertension[ti]ANDchi[la]检索文章题目中含有高血压的中文文献PubMed基本检索常用检索字段描述和标识Publicationdate[dp]:出版日期指论文所在期刊的出版日期日期检索的形式为：YYYY/MM/DD[DP]要检索一段时期内的文章，日期之间可以加冒号，如：1993/01:1995/06[DP]Publicationtype[pt]:出版类型。有综述，新闻，传记，临床试验等。如：review[pt]MeSHterms[mh]：主题词字段。如：hypertension[mh]Subheadings[sh]:副主题词。与主题词组配检索.比如：检索1995年到1996年出版的关于高血压方面的综述性文献。hypertension[mh]AND1995/01:1996/12[DP]ANDreview[pt]PubMed基本检索检索1995年到1996年出版的关于高血压方面的综述性文献hypertensi