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文档简介
第十五章转录与基因表达调控Transcription,regulationofgeneexpression中心法则(centraldogma)转录(transcription)生物体以DNA为模板合成RNA的过程。
转录RNADNA
反转录复制和转录的相同点:1.都是酶促的核苷酸聚合过程;2.都以DNA为模板;3.都需要依赖DNA的聚合酶;4.聚合过程中都是核苷酸之间形成磷酸二酯键;5.都是从5,到3,方向延伸聚核苷酸链;6.都遵循碱基配对原则复制和转录的区别A-U,T-A,G-CA-T,G-C配对mRNA,tRNA,rRNA子代双链DNA(半保留复制)产物RNA聚合酶(RNA-pol)DNA聚合酶酶NTPdNTP模板链转录(不对称转录)两股链均复制模板转录复制A-U,T-A,G-CA-T,G-CmRNA,tRNA,rRNA子代双链DNA(半保留复制)RNA聚合酶(RNA-pol)DNA聚合酶NTPdNTP
原料模板链转录(不对称转录)两股链均复制引物需要不需要转录Transcription第一节参与转录的物质原料:
NTP(ATP,UTP,GTP,CTP)模板:
DNA酶:
RNA聚合酶(RNApolymerase,RNA-pol)其他蛋白质因子一、转录模板DNA分子上转录出RNA的区段,称为结构基因(structuralgene)。
不对称转录:DNA双链中仅一股链可作为模板而转录,另一条链不转录;模板链并非永远在同一单链上。5
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模板链编码链编码链模板链结构基因转录方向转录方向DNA双链中按碱基配对规律能指引转录生成RNA的一股单链,称为模板链(templatestrand),也称作有意义链(负链)。相对的另一股单链是编码链(codingstrand),也称为反义链(正链)。5′···GCAGTACATGTC···3′3′···cgtgatgtacag···5′5′···GCAGUACAUGUC···3′N······Ala·Val·His·Val······C编码链模板链mRNA蛋白质转录翻译二、RNA聚合酶这是一种不同于引物酶的依赖DNA的RNA聚合酶(DDRP)。(一)原核生物的RNA聚合酶结合核苷酸底物催化磷酸二酯键生成核心酶(coreenzyme)全酶(holoenzyme)
(二)真核生物的RNA聚合酶种类ⅠⅡⅢ对鹅膏蕈碱的反应45S-rRNAhnRNA5S-rRNAtRNAsnRNA耐受极敏感中度敏感转录产物部位核仁核质核质转录过程TheProcessofTranscription一、原核生物的转录过程(一)转录起始(二)转录延长(三)转录终止(一)转录起始转录起始需解决两个问题:RNA聚合酶必须准确地结合在转录模板的起始区域。DNA双链解开,使其中的一条链作为转录的模板。位于基因上游,与RNA聚合酶识别、结合并起始转录有关的一些DNA调控序列被称为启动子(promoter)。启动子序列通常由一些带共性的保守序列构成。RNA聚合酶保护法目录开始转录(Pribnowbox)TATAATPuATATTAPy-10区1-30-5010-10-40-205
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原核生物启动子的保守序列TTGACAAACTGT-35区RNA-pol辨认位点(recognitionsite)5
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RNA聚合酶结合区结构基因3
3
被RNA聚合酶辨认的区段就是位于转录起始点-35区的TTGACA序列。RNA聚合酶与该区结合后,即滑动至-10区的TATAAT序列(Pribnow盒),并启动转录。GpN结构基因RNApol识别结合生成起始复合物转录延长转录终止转录空泡也称转录复合物,是RNA聚合酶的核心酶,DNA模板和转录产物RNA结合在一起的复合物。启动子终止区pppGpppG(二)转录延长1.
亚基脱落,RNA–pol聚合酶核心酶变构,与模板结合松弛,沿着DNA模板迅速前移;
2.在核心酶作用下,NTP不断聚合,RNA链不断延长。50bp/s目录5
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DNA原核生物转录过程中的羽毛状现象核糖体RNARNA聚合酶1.依赖Rho(ρ)因子的转录终止2.非依赖Rho因子的转录终止(三)转录终止指RNA聚合酶在DNA模板上停顿下来不再前进,转录产物RNA链从转录复合物上脱落下来。分类(一)原核生物的转录终止ρ因子(Pr)1.识别结合富含C的RNA链功能:2.ATPase活性3.解螺旋酶(helicase)活性ρ因子+ATP5′3′Polymerase富含C25/501.依赖Rho因子的转录终止RNApol5′3′RNApol失活ρ因子解螺旋酶活性使DNA/RNA杂化双链拆离,利于产物从转录复合物种释放。RNA转录后,形成特殊的结构,以终止转录。2.不依赖ρ因子的转录终止特点:1.RNA单链内部接近终止区域有富含G-C配对区,形成稳定的二级结构。2.在发夹结构的下游有polyU结构。茎环(stemloop)或发夹(hairpin)结构UUGCAGCCUGAGAAAUCAGGCUGAUGG…5’3’…5’3’自发形成发夹结构UUUU………..5’3’1.茎环结构改变RNApol的结构,使其失活2.茎环结构的形成使转录复合物趋于解体,polyU加速这一过程。茎环结构使转录终止的机理:茎环(stem-loop)/发夹的形成使RNA聚合酶变构,转录停顿;当RNA分子形成的局部双链时,DNA分子自然也要回复双链,这就使本来就不稳定的杂化双链变的更不稳定,最终使转录复合物趋于解离,RNA产物释放。5´pppG53
35RNA-pol四.原核细胞的转录后加工1.mRNA:很少进行加工和修饰2.rRNA:1)剪切:特定的RNA酶催化,将初级产物剪成16S,23S和5S三个片段2)修饰:最常见的是2’羟基甲基化3.tRNA:①由核酸内切酶在tRNA两端切断②由核酸外切酶从3’端逐个切去附加顺序,进行修饰③在3’端加上CCA-OH结构④核苷酸的修饰和异构化五、真核生物的转录后修饰Post-transcriptionalModification几种主要的修饰方式1.剪接(splicing)2.剪切(cleavage)3.
修饰(modification)4.
添加(addition)
大多数真核mRNA的5´末端有一个特殊的结构--帽子结构:7-甲基鸟苷三磷酸(m7GpppN)。它是在转录产物的5´末端加上了一个甲基化的鸟苷酸形成的。一、真核生物mRNA的转录后加工(一)首、尾的修饰5
端形成帽子结构(m7GpppGp—)5’-5’相对连接,又称面对面核苷酸结构(Confrontednucleotidestructure)帽子帽子结构(7-甲基鸟嘌呤三磷酸鸟苷)5pppGp…5GpppGp…pppGppi鸟苷酸转移酶5
m7GpppGp…甲基转移酶SAM帽子结构的生成5ppGp…磷酸酶Pi帽子结构功能:1.能促进核蛋白体与mRNA的结合,加速翻译起始速度,2.还可以增强mRNA的稳定性长度:100-200个AMP。
PolyA的长短与维持mRNA作为翻译模板的活性,以及mRNA本身稳定性的因素有关。3
端加上多聚腺苷酸尾巴(polyAtail)1.对大多数基因进行研究,发现都没有相应的3’端多聚T序列,说明polyA的出现并不依赖于模板;2.加入polyA前,先要由核酸外切酶切除3’端一些过剩的核苷酸,然后再加入polyA
3.在hnRNA上也发现polyA
,推测这一过程也在核内完成,并且先于mRNA的剪接(二)mRNA的剪接1.
hnRNA
和snRNA核内的初级mRNA称为杂化核RNA(hetero-nuclearRNA,hnRNA)snRNA(smallnuclearRNA)核内的蛋白质小分子核糖核蛋白体(拼接体,snRNP)snRNA真核生物结构基因,由若干个编码区和非编码区互相间隔开但又连续镶嵌而成,去除非编码区再连接后,可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质,这些基因称为断裂基因。断裂基因(splitegene)CABD编码区A、B、C、D非编码区2.外显子(exon)和内含子(intron)外显子在断裂基因及其初级转录产物上出现,并表达为成熟RNA的核酸序列。内含子隔断基因的线性表达而在剪接过程中被除去的核酸序列。鸡卵清蛋白基因hnRNA首、尾修饰hnRNA剪接成熟的mRNA鸡卵清蛋白基因及其转录、转录后修饰目录鸡卵清蛋白成熟mRNA与DNA杂交电镜图DNAmRNA目录3.
内含子的分类根据基因的类型和剪接的方式,通常把内含子分为4类I:主要存在于线粒体、叶绿体及某些低等真核生物的rRNA基因;II:也发现于线粒体、叶绿体,转录产物是mRNA;III:是常见的形成套索结构后剪接,大多数mRNA基因有此类内含子;IV:是tRNA基因及其初级转录产物中的内含子,剪接过程需酶及ATP。4.mRNA的剪接——除去hnRNA中的内含子,将外显子连接。snRNP与hnRNA结合成为并接体①目录②③UACUACA-AGUGU4U5U6E1E2U1U2UACUACA-AGUGU6E1E2U1、U4、U5•RNA编辑作用说明,基因的编码序列经过转录后加工,是可有多用途分化的,因此也称为分化加工5.mRNA的编辑(mRNAediting)人类apoB基因mRNA(14500个核苷酸)肝脏apoB100(分子量为500000)肠道细胞apoB48(分子量为240000)mRNA编辑(C-U)二、tRNA的转录后加工tRNA前体RNApolⅢTGGCNNAGTGCGGTTCGANNCCDNA目录RNAaseP、内切酶目录tRNA核苷酸转移酶、连接酶ATPADP目录碱基修饰(2)还原反应如:UDHU
(3)核苷内的转位反应如:Uψ(4)脱氨反应如:A
I
如:AAm(1)甲基化(1)(1)(3)(2)(4)目录三、rRNA的转录后加工转录45S-rRNA剪接18S-rRNA5.8S和28S-rRNArDNA内含子内含子28S5.8S18S第二节、基因表达调控
---转录水平调节一.基因表达的概念1.基因:负载遗传信息的DNA片段
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