医学信息检索概论

2023/10/81

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医学信息检索信息社会信息资源日益庞大出版速度加快据国外报导，2006年全世界出版科技文献2000印张/秒4-5种新书/小时新增3种刊物/小时载体形式多样化网络信息的大量涌现信息检索需要解决的问题……如何从信息的海洋中获取我需要的知识?我们被信息的海洋包围着,但是确被知识饿死了!

这门课的目的(Purpose)是:

面对日益增长的信息资源，如何通过一种有效的方法，以最少的时间与精力来获取自己所要的信息─这就是信息检索所要解决的问题学习信息检索培养自学能力培养信息素养进行知识更新进行循证医学实践培养科研能力和创新能力文献资源在科研工作中的时间比重

据美国科学基金会统计，一个科研人员花费在查找和消化科技资料上的时间需占全部科研时间的51%，计划思考占8%，实验研究占32%，书面总结占9%。由上述统计数字可以看出，科研人员花费在科技出版物上的时间为全部科研时间的60%。

----美国科学基金会

NSF(NationalScienceFoundation)一个科研人员的时间分配表查资料51%写报告9%实验研究32%计划思考8%课程介绍信息检索课是科学技术迅速发展的现代信息社会应运而生的产物是一门专门研究如何获取所需医学知识的科学方法课涉及医学、情报学、文献学、计算机、网络等多学科知识目的在于培养和提高学生的信息素养能力，科研能力及创新能力课程的发展过程20世纪60-70年代，发达国家开设80年代以后，我国开始在高等学校开始普及我校从1986年开始研究生教学（1984年4月，国家教育部（84）教高一司字004号文件）90年代，转变为“信息检索与利用课”并引入现代信息技术如网络21世纪，与信息素养能力培养结合基本要求1、掌握文献和信息检索的基础知识2、掌握计算机检索的基本技能3、具有有效利用信息技术的素质4、有较高的信息意识和信息能力

信息检索基础理论计算机信息检索基础网络信息检索常用医学数据库检索引擎、医学网站网络全文数据库循证医学信息检索

特种文献检索医学信息分析与利用

学习内容（48学时）参考教材杨克虎

人民卫生出版社郭继军

人民卫生出版社

第一章绪论（基础理论）第一节重要概念第二节图书馆利用第三节信息类型第四节信息检索语言第五节信息检索基础第六节计算机检索

第一节重要概念一.信息（information)

反映事物本质特征的一切外在表现统称为信息。如物质存在方式及其运动规律特点等普遍性、差异性、特征性可传递性、可存储性生物信息自然信息机器信息社会信息二、知识（knowledge）

知识是人们通过信息对自然界，人类社会以及思维活动规律的认识与掌握，是人脑通过思维重新组合的系统化信息的集合。信息→知识人们利用获取的知识创造新信息。知识→信息经济合作与发展组织(OECD)，按内容分：

Know-what（指记载事实的数据）

Know-why（指记载自然和社会的原理与规律方面的理论）

Know-how（指某类工作的实际技巧和经验）

Know-who（指谁知道是什么，谁知道为什么和谁知道怎么做的信息）

解决特定问题所需要的知识或信息知识性：情报来源于知识，任何情报都具有一定的知识性传递性：动态接受与利用效用性：启迪思维、增进见识、改变知识结构、提高认识能力，发挥实用的、社会的、经济的价值

。三、情报（Information）

记录已有知识的一切载体载体是知识的外在表现形式文献记录的知识形式可以是文字、图像、符号、声频、视频等四、文献(Literature,Document)医学文献的现状与特点1.文献数量激增医学期刊：17世纪——10种

20世纪初——1600种

20世纪末——21000种医学文献：21世纪2百万/年2.文种繁多MEDLINE(43种文字）3.发表分散4.老化加快医学文献信息的作用记录、保存、传递医学信息科研和临床实践借鉴、交流的重要载体评价科研水平与成果的主要依据推动促进科研发展的资源动力五、信息意识信息观念，是人们对信息需求的自觉反映。包括对信息的捕捉、分析、判断和吸收的敏感性、主动性和积极性六、信息素养主要体现在信息意识、信息能力和信息道德三个方面。有效地定位、获取、评价和利用信息的一系列能力的总和信息素养信息素养概念是从图书馆检索技能演变而来。美国将图书馆检索技能和计算机技能结合成为一种综合的能力、素质，即信息素养。1989年，美国图书馆协会下属的“信息素养总统委员会”在其研究的终结报告中给信息素养下了这样一个定义：要成为一个有信息素养的人，就必须能够确定何时需要信息，并具有检索、评价和有效使用信息的能力。包括信息意识、信息能力、信息道德信息素养培养目标*确定所需信息的范围*有效地获取所需的信息*鉴别信息及其来源、将检出的信息融入自己的知识基础*有效地利用信息去完成一个具体的任务*了解利用信息所涉及的经济、法律和社会问题，合理、合法地获取和利用信息第二节图书馆利用2023/10/824(08)2023/10/825▼保存医学文献▼订购文献信息数据库中/外文医学、药学、生物学等领域光盘/网络文献数据库▼期刊、图书的借阅▼电子文献制作▼获取外部科技论文一、图书馆的主要功能2023/10/826▼联机公共书目信息▼文献信息数据库中/外文医学、药学、生物学等领域光盘/网络文献数据库▼电子期刊▼电子图书▼电子学位论文▼多媒体课件▼声视频资料二、图书馆的信息资源2023/10/827联机公共书目OPAC(OnlinePublicAccessCatalogue,)联机公共书目查询是图书馆提供的一项最基本的网络信息服务。书目信息是对图书馆馆藏纸本书刊及其它资源的揭示。通过远程网络检索，读者可以了解有关书刊的馆藏情况。1、联机公共书目信息2023/10/828▼1．馆藏联机公共书目查询：对本馆资源的揭示。可预约书刊。▼2．书刊联合目录查询：对多个图书馆馆藏资源的共同揭示，开展馆际互借、资源共享。如：全国西文生物医学期刊联合目录等。▼3．读者借阅信息查询：读者在网上自己查询借阅情况。可自己办理续借手续。▼4．新书通报：报道图书馆新近采集的信息资源。联机公共书目信息2、文献数据库国内文献数据库中国生物医学文献数据库（CBM）CNKI：中国学术期刊网络出版总库VIP：中文科技期刊全文数据库国外文献数据库Medline(医学文献联机数据库）PubMed(公共医学文献联机数据库）IPA（国际药学文摘数据库）DIF（药学全文数据库）2023/10/829三、电子期刊2023/10/830四、电子图书2023/10/8315、电子学位论文2023/10/8326、课件、视频等2023/10/833一、按载体形式二、按出版类型三、按使用级别

四、网络信息资源第三节.信息资源类型

一、按载体类型印刷型缩微型视听型机读型纸张-图书、期刊、专利文献等感光材料-缩微胶片、平片、胶卷磁带等-录音带、录像带、电影胶片磁、光盘-电子期刊、图书、数据库印刷型文献纸张阅读方便存储密度低不易保存缩微型文献胶片、平片存储密度较高易复制不宜阅读视听型文献磁带、录像带载体特点形象、直观机读型文献硬盘、光盘存储密度高、可控性好、形象、易复制、易交流…文献类型不方便磁盘（MagneticDisc）光盘(CD;CompactDisc)网络(network)资源网络检索工具：搜索引擎、网络目录等电子出版物：电子图书、电子期刊专业网站：以提供专业信息为主的站点网络数据库：>1万种，内容涉及不同领域和专业机读（电子型）文献文本型

txtdocpdf超文本/多媒体型

htmlxhtmljpg流媒体型

vod视频点播机读文献类型二、按出版类型图书期刊特种文献内容比较成熟、系统、可靠的出版物,是学习和参考的主要信息源InternationalStandardBookNumber有固定名称和连续卷号、期号的定期出版物。所含信息量大、新颖，是科研工作主要信息源(ISSN)其它文献资料出版物的总称，信息全面、密度高，一般图书馆不做重点收藏文献出版类型电子图书电子期刊三、按使用级别一次文献二次文献三次文献原始创作：记录科研活动，报道新技术、新发明、新见解的文献书目文献：收集整理一次文献而形成的索引、目录、摘要等高级信息产物：综合分析研究大量一次文献，浓缩提炼而成的文献零次文献未经记录、未形成文字材料的非文献型情报信息一次文献(原始信息类）

原始学术信息是指原始的创造，首次记录科研成果，包括新技术，新知识，新发明，新见解等如期刊论文、学位论文、科研报告、专利文献、会议文献等二次文献记录内容包括书名、期刊名、文献中的题名、著者、以及主题、原文的出处（刊登的期刊名称、年、卷期页、网址等）是按一定规律和方法编制成的查找原始文献的检索工具。如目录、索引、文摘等OPAC(联机公共目录检索系统)、CBMDisc(中国生物医学文献光盘数据库）等书目文献数据库

CBMDisc题录格式标题：红细胞葡萄糖6磷酸脱氢酶缺陷与糖尿病关系的研究著者：朱易萍;陶元

；陈莉农出处：四川医学1996.06.15;17(3):152-154三次文献在阅读一次文献的基础上，分析综合归纳信息后，组织形成具有资料性、查考性、阅读性的文献。如教科书、综述、百科全书、事实性数据库等综述(Survey,Review)是指综合分析和描述一定时间范围内，某一学科或专业科研发展、现状、并预测未来的一类文献。四、网络信息资源“通过计算机网络可以利用的各种信息资源的总和”

网络中存在着大量的生物学和医药学信息资源，它连接着世界上许多著名的医学研究机构、医科大学和医院,成为一个集生物医学信息资源为一体的数据资源网在数量、结构、分布和传播的范围、载体形态、内涵和传递手段等方面都显示出了新的特点网络资源类型网络搜索引擎：Google,Medscape联机馆藏目录：OPAC（联机公共目录检索系统）数据库资源：CBM,cnki,Medline,PubMed电子出版物:电子期刊，电子图书参考工具：牛津大词典，网际金典网络动态信息：E-Mail,BBS,NewsGroup网络资源特点数量巨大，增长迅速内容丰富，形式多样时效性强，变化迅速交互性好，可以共享分布广泛,无序化信息冗余,缺乏管理商业性强,多数收费第四节信息检索语言用以描述文献信息特征，表达检索需求的一种专门的人工语言，是联系信息生产者、管理者与使用者之间的桥梁。一、检索原理信息检索（informationretrieval）是指将信息按一定的方式组织存储起来，并根据信息用户的需要找出相关信息的过程信息检索是由信息的存储和信息的查寻两个不可分割的过程所组成一、检索原理大量信息信息存贮信息检索信息特征存贮标识不同索引分析检索转化分析排序转化选择途径检索标识提问标识检索需求检索工具检索语言检索工具关键：检索标识与存贮标识相一致匹配二、检索语言的种类规范性非规范性：标题、关键词、文本词规范性：分类、叙词（主题词）描述信息特征外部特征：标题、著者、序号、引文内部特征：分类、主题、代码（分子式）检索语言的类型外部特征的检索语言著者索引题名索引文献序号索引引文索引以文献著者姓名字顺为标识的检索语言。著者包括译者、编者、文摘人、专利权人、学会和机关团体名、学术会议名等。著者索引题名索引文献序号索引引文索引以文献发表时的题目（篇名）、刊名或书名字顺为标识的检索语言。包括书名目录（索引）、刊名目录（索引）、篇名索引等。外部特征的检索语言外部特征的检索语言著者索引题名索引文献序号索引引文索引以文献所特有的序号为检索标识的检索语言。专利号索引、科技报告序号索引、技术标准号、国际标准书号（ISSN)索引等。外部特征的检索语言著者索引题名索引文献序号索引引文索引以文献所附注的参考文献为检索标识的检索语言。利用文献的引用和被引用关系建立起来的文献检索系统称为引文索引。参考文献指著者在文献末尾附加的用来表明论据或数据来源出处的文献资料。分类检索语言主题检索语言内部特征的检索语言以分类号和类目名称作为标识符号，按学科、专业集中文献。典型代表：《中图法》以名词术语为标识符号，从主题概念的角度来集中文献。典型代表：《MeSH》三、分类检索语言按学科、专业集中文献，从知识分类的角度揭示不同文献在内容上的区别和联系以分类号为标识符号体系分类语言（学科分类语言）中国图书分类法美国医学主题词表（MeSH)

树状结构表（TreeStructure）分类语言的特点

体现学科系统性

反映事物间的从属、派生、平行等隶属关系分类号使用数字/字母有序排列

从上到下，从总体到局部，等级分明

分类语言的类型学科分类法组配分类法

中国图书分类法

（中图法）是我国目前统一使用的分类法其分类号由字母与数字组成共分为22个大类R类为医药卫生类，共有17个二级类目按概念间的隶属关系进行排列

R医药、卫生

R1预防医学、卫生学R2中国医学

R3基础医学

R4临床医学

R5内科学

R6外科学

R71妇产科学

R72儿科学

R73肿瘤学

R74神经病与精神病学

R75皮肤病学与性病学

R76耳鼻咽喉科学

R77眼科学

R78口腔科学

R79外国民族医学

R8特种医学

R9药学R73肿瘤学R733造血器及淋巴系肿瘤R733.1网状内皮系统肿瘤R733.2脾脏肿瘤R733.3骨髓肿瘤R733.4淋巴结肿瘤R733.7白血病R733.71急性白血病R733.72慢性白血病R733.73其他类型白血病分类语言的缺点不易分类文献分散不能反映新概念检索不够灵活四、主题检索语言以语词作为检索标识来表达各种概念、并按字顺组织起来的一种检索语言。具有专指性、直接性的特点根据表达概念的不同分为：标题词语言（篇名词）关键词语言叙词语言（主题词）单元词语言（自由词、文本词）主题语言的特点直接揭示文献的内容特征按照字顺编排，检索方便文献集中表达新概念叙词语言最具代表性主题语言的类型文本词（自由词）摘要词关键词标题词叙词（主题词）主题词:

能表达文献的实质内容，经过规范化处理的名词术语。关键词：能表达文献主要内容的词汇或术语，未经过规范化处理。关键词与主题词的关系：关键词(自由词)：

cancer,carcinoma,tumor,neoplasm

用《医学主题词表》进行规范化处理主题词

neoplasm叙词（主题词）的特点：词语与概念唯一对应可组配副主题词增加专指性采用参照系统揭示词间关系有主题词分类索引（TreeStructure)内容与规则构成一部主题词表（MeSH）医学主题词表—MeSH

（MedicalSubjectHeadings）美国NLM出版，相当于一部医学检索词典，用于指导医学检索工具的主题标引和检索，是规范标引用词和检索用词的工具。目前，MeSH使用的主题词约22000个，副主题词83个。16个主要类目疾病主要类目

医学主题词表（MeSH）前言/介绍（包括副主题词表、主题词变更表） 主题词字顺表(包括主题词,副主题词,常用非主题词）树状结构表(分类表，分16个大类）

AAnatomy解剖学

BOrganisms生物体

CDiseases疾病

DChemicals&Drugs化学物质与药物

EAnalytical……

诊断治疗技术与设备

FPsychiatry……

精神病与心理学

……作用

规范主题词

结构疾病主要类目HemicandImmume..(NonMeSH)A15BloodA15.145BloodCellsA15.145.229BloodPlateletsA88ErythrocytesA13ErythrocytesMembraneA13.270Erythrocytes,AbnormalA13.330LeukocytesA37

Leukocytes,MononuclearA37.555LymphocytesA37.555.567KillerCellsA37.555.567.532B-LymphocytesA37.555.567.562T-LymphocytesA37.555.567.569

CD4-PositiveT-Lym…A37.555.567.569.200CD8-PositiveT-ym….A37.555.567.569.220

CD4阳性T淋巴细胞→

CD4-PositiveLymphocytes第五节信息检索基础

一、检索工具检索工具的作用存储作用

检索作用报道作用检索工具的特点

收录内容的有限性报道信息的时滞性标引深度的有限性检索工具的要求收录全面，标引准确，检索途径多，更新迅速，下载方便一、检索工具检索工具的类型

印刷型：目录、索引、文摘

电子型：书目型、事实型、全文型、多媒体型检索工具的结构

印刷型：说明、正文、辅助索引、附录

电子型：文档、记录、字段常用工具-书目型检索工具书目型检索工具一般只提供文献的题录，如文献的篇名、著者、原文登载的期刊刊名及其卷、期、页和文摘。印刷型：中目、IM、EM、CA、BA、SCI光盘数据库：CBMdisc、Medline,IPA(国际药学文摘)网络数据库：CBM、NSTL,CNKI，PubMed，BIOSISPreviews、EMBASE、SciFinderScholar、WebofKnowledge常用工具-全文型检索工具

中国学术期刊库（CNKI清华同方公司）中国科技期刊库(重庆维普公司）万方全文数据库（万方资讯）OvidJournalFulltext(美)SpringerLink(德)ScienceDirect(荷兰)Freemedicaljournals(法)HighwirePress(美)检索途径（检索入口）

是指检索文献信息的出发点和路线，是在使用不同检索语言有序存储信息的同时形成检索标识（检索词）是指能表达检索课题主题概念和信息需求的名词术语、分类号、名称及代码等的总称，它与检索途径相对应，是检索途径的具体化。包括主题词、关键词、分类号、专利号等二、检索途径与检索标识篇名途径：文献篇名中的名词术语主题途径：规范化的主题词分类途径：学科分类号或类目名称关键词途径：文献的关键词著者途径：著者姓名或机