检索与检索思维

检索与检索思维第1页，课件共104页，创作于2023年2月手机保持关闭或调成无声上课请勿随意讲话，以免影响授课允许做其它的事，但不能发出噪音上机练习，完成上机报告课后欢迎到:“科研教学.我的领地”的生物信息学版块交流()成绩评定：平时表现与提问30％，平时作业30％,期末作业40％，没有补考。要求第2页，课件共104页，创作于2023年2月进度安排绪论 2文献检索2DNA序列分析（双序列比对） 4Clustal 1基于本地与服务器的Blast分析 6上机练习(一) 2进化树分析

4上机练习(二) 2蛋白质结构分析 3上机练习(三) 2SCI检索与发现

3NCBI数据库的使用 2第3页，课件共104页，创作于2023年2月教材与教参说明《生物信息学应用技术》王禄山,化学工业出版社,2007《生物信息学》(美)DavidW.Mount著；钟扬等主译,高等教育出版社，2003《探索基因组学蛋白质组学和生物信息学》(美)A.马乐科姆.坎贝尔,科学出版社,2004《生物信息学与功能基因组学》(美)乔纳森.佩夫斯纳(著).孙之荣(译).化学工业出版社第4页，课件共104页，创作于2023年2月检索与检索思维第5页，课件共104页，创作于2023年2月生物信息学与文献检索生物信息学离不开文献检索。在进行科学研究过程中，首先是进行的文献检索。信息资源的共享能避免重复劳动，少走弯路。面对日益增长的信息资源，必须通过科学的方法，获取自己所需要的信息。许多重点大学的生物信息学课程都有文献检索这一章节，目的是是培养学生的信息意识，掌握用手工方式和计算机方式从文献资料中获取知识和信息的方法。第6页，课件共104页，创作于2023年2月WINDOWS第7页，课件共104页，创作于2023年2月寻找好友第8页，课件共104页，创作于2023年2月PDF软件第9页，课件共104页，创作于2023年2月搜索引擎第10页，课件共104页，创作于2023年2月21世纪科学信息检索科学家通过网络界面进行检索:第11页，课件共104页，创作于2023年2月21世纪科学信息检索科学家通过网络界面检索数据库第12页，课件共104页，创作于2023年2月商品信息第13页，课件共104页，创作于2023年2月邮编第14页，课件共104页，创作于2023年2月车次查询第15页，课件共104页，创作于2023年2月股票第16页，课件共104页，创作于2023年2月天气第17页，课件共104页，创作于2023年2月诗词第18页，课件共104页，创作于2023年2月生词释义第19页，课件共104页，创作于2023年2月纠错第20页，课件共104页，创作于2023年2月

学习的需求:80％的知识来自于第二课堂，学习能力是核心竞争力！生活事业的需求:互联网改变了我们的学习和生活方式,是你的生活事业的需要.

现状:97%人会使用电脑(本科以上),90%认为检索重要,<10%的熟练正确运用检索检索的重要性和必要性第21页，课件共104页，创作于2023年2月

搜索引擎高度智能化，个性化搜索的结果仍然过多搜索引擎种类繁多，需要选择合适的搜索引擎中：Google,Baidu,Openfine，iask，sogou,yisou英：Yahoo,MSN,Aol,Previewseek,A9,Altavista

专业：pubmed,Scirus，Scholarofgoogle

RSS搜索，博客搜索，专利搜索……

检索理论与搜索引擎第22页，课件共104页，创作于2023年2月“工欲善其事，必先利其器”。Internet只有一个，而搜索引擎则有N多个。有搜索高手说，所谓搜索，就是“在正确的地方使用正确的工具和正确的方法寻找正确的内容”。但是，对于普通人而言，掌握诸多搜索引擎的可能性似乎不大。用一两个相对强劲的具代表性的工具达到绝大多数搜索目的更为人们所迫切希望。不同的时期，涌现出不同的强者。就目前而言，我们非常幸运的有了：

*****GOOGLE*****第23页，课件共104页，创作于2023年2月选择搜索引擎的标准按搜索引擎的特点选择:中文非专业和一般专业问题选择百度较专业信息选择google查专业性资料，首选pubmed，当然也可以到各大杂志或数据库的网站查询，如SD，OVID等。有关搜索引擎的基本技巧，只对Google做些简单的介绍。第24页，课件共104页，创作于2023年2月

Google（www.G）是一个搜索引擎，由两个斯坦福大学博士生LarryPage与SergeyBrin于1998年9月发明，GoogleInc.于1999年创立。2000年7月份，Google替代Inktomi成为Yahoo公司的搜索引擎，同年9月份，Google成为中国网易公司的搜索引擎。98年至今，Google已经获得30多项业界大奖。到Google的新闻中心（http://www.G/press/index.html），你可以找到关于一切关于Google的历史和新闻资料。

Google简介第25页，课件共104页，创作于2023年2月关键词检索与：用空格非：-（减号）或：OR（大写）Google的基本使用技巧

专业用语：用“”括起来第26页，课件共104页，创作于2023年2月Google的基本使用技巧

示例：搜索所有包含“搜索引擎”和“历史”但不含“文化”、“中国历史”和“世界历史”的中文网页搜索：“搜索引擎历史-文化-中国历史-世界历史”第27页，课件共104页，创作于2023年2月第28页，课件共104页，创作于2023年2月1.英文字符Note:2.“-”操作符与作用的关键字之间，不能有空格3.Google对英文字符大小写不敏感

4.对一些网路上出现频率极高的英文单词，如“i”、“com”、“www”等，以及一些符号如“*”、“.”等，作忽略处理第29页，课件共104页，创作于2023年2月Google的高级使用技巧对搜索的网站进行限制

“site”表示搜索结果局限于某个具体网站或者网站频道，如“”、“”，或者是某个域名，如“”、“com”等等。如果是要排除某网站或者域名范围内的页面，只需用“-网站/域名”。第30页，课件共104页，创作于2023年2月示例：搜索中文教育科研网站（）上关于搜索引擎技巧的页面。

搜索：“搜索引擎技巧site:”第31页，课件共104页，创作于2023年2月注意：site后的冒号为英文字符，而且，冒号后不能有空格，否则，“site:”将被作为一个搜索的关键字。此外，网站域名不能有“http://”前缀，也不能有任何“/”的目录后缀；网站频道则只局限于“频道名.域名”方式，而不能是“域名/频道名”方式。第32页，课件共104页，创作于2023年2月

在某一类文件中查找信息

“filetype:”是Google开发的非常强大实用的一个搜索语法。目前，Google已经能检索微软的Office文档如.xls、.ppt、.doc，.rtf，Adobe的.pdf文档，ShockWave的.swf文档（Flash动画）等。其中最实用的文档搜索是PDF搜索。PDF是ADOBE公司开发的电子文档格式，现在已经成为互联网的电子化出版标准。注意，下载的Office文件可能含有宏病毒，谨慎操作第33页，课件共104页，创作于2023年2月示例：搜索有关DHA方面的专业文章

搜索：“DHAfiletype:pdf”第34页，课件共104页，创作于2023年2月搜索的关键字包含在URL链接中

inurl语法返回的网页链接中包含第一个关键字，后面的关键字则出现在链接中或者网页文档中。有很多网站把某一类具有相同属性的资源名称显示在目录名称或者网页名称中，比如“MP3”、“GALLARY”等，于是，就可以用INURL语法找到这些相关资源链接搜索的关键字全部在URL链接中allinurl:第35页，课件共104页，创作于2023年2月示例：查找软件winzip搜索：“inurl:winzip下载”第36页，课件共104页，创作于2023年2月搜索的关键字包含在网页标题中

“intitle”和“allintitle”的用法类似于上面的inurl和allinurl，只是后者对URL进行查询，而前者对网页的标题栏进行查询。网页标题，就是HTML标记语言title中之间的部分。网页设计的一个原则就是要把主页的关键内容用简洁的语言表示在网页标题中。因此，只查询标题栏，通常也可以找到高相关率的专题页面。第37页，课件共104页，创作于2023年2月示例：查找北京大学图书馆主页搜索：“intitle:北京大学图书馆”第38页，课件共104页，创作于2023年2月通配符Google对通配符支持有限。它目前只可以用“*”来替代单个字符，而且包含“*”必须用“”引起来。比如，“"以*治国"”，表示搜索第一个为“以”，末两个为“治国”的四字短语，中间的“*”可以为任何字符第39页，课件共104页，创作于2023年2月第40页，课件共104页，创作于2023年2月图片搜索Google图像搜索目前支持的语法包括基本的搜索语法如“”、“-”、“OR”、“site”和“filetype:”。其中“filetype:”的后缀只能是几种限定的图片类似，如JPG，GIF等。Google首页点击“图像”链接就进入了图像搜索界面“images.G”。第41页，课件共104页，创作于2023年2月示例：搜索lipase有关的图片搜索：“lipase”第42页，课件共104页，创作于2023年2月网页快照

网页快照是Google抓下来缓存在服务器上的网页。它有三个作用：

第一，如果原地址打开很慢，那么可以直接查看Google缓存页面，因为Google服务器速度极快。

第二，如果原链接已经死掉或者因为网络的原因暂时链接不通，那么可以通过Google快照看到该页面信息。当然，快照内容不是该页最新页面。

第三，如果打开的页面信息量巨大，一下子找不到关键词所在位置，那么可以通过Google快照，因为快照中Google用黄色表明关键字位置。

第43页，课件共104页，创作于2023年2月网页翻译如果搜索出来的页面是德文、法文、拉丁文这些语言怎么办？Google提供了网页翻译功能！！虽然目前只支持有限的拉丁语、法语、西班牙语、德语和葡萄牙文第44页，课件共104页，创作于2023年2月第45页，课件共104页，创作于2023年2月单词英文解释写英文文章的时候，最头疼的事情就是对某个英文单词的用法不确定。现在有了Google，一切就迎刃而解了！无论你是想查找某个生词的意思还是想了解某个单词的用法，均可使用在线词典。第46页，课件共104页，创作于2023年2月第47页，课件共104页，创作于2023年2月Google翻译/language_tools?hl=zh-CN第48页，课件共104页，创作于2023年2月google学术检索/第49页，课件共104页，创作于2023年2月Book检索/第50页，课件共104页，创作于2023年2月专利搜索/patents//Patent/Search.rails第51页，课件共104页，创作于2023年2月////第52页，课件共104页，创作于2023年2月google个性化设置第53页，课件共104页，创作于2023年2月Google的其它有用站点/insights/search//trends第54页，课件共104页，创作于2023年2月第55页，课件共104页，创作于2023年2月第56页，课件共104页，创作于2023年2月据说用百度的人和用google的人的区别用百度的人年龄偏小(12-28岁)

用google的人年龄相对较大(20-45岁)

用百度的人电脑水平较低

用google的人电脑水平较高

用百度的人上网多为娱乐,喜欢玩劲5,国产网游

用google的人多数为工作,关注新闻,各大社区论坛,玩QQ游戏.

用百度的人性格张扬,自我.

用google的人性格较保守,含蓄第57页，课件共104页，创作于2023年2月今天你Google了吗？第58页，课件共104页，创作于2023年2月搜索引擎与低碳经济一位哈佛大学学者表示，一般使用台式机进行一笔搜索会产生7克的二氧化碳，搜索两次等于煮一壶水产生的二氧化碳。“Google在全世界都设有资料中心，会耗用极为庞大的电力。”AlexWissner-Gross向媒体表示。“因此使用Google来做搜索当然对地球也会有影响。”不用搜索引擎，办同样的事要排放更多的CO2

第59页，课件共104页，创作于2023年2月检索思维≠会使用搜索引擎第60页，课件共104页，创作于2023年2月

分析问题确定检索主题词和检索工具检索结果的分析将得到的结论用运到实际检索思维检索思维：完成一项复杂检索流程的思考

技巧：溯源检索或称逆向检索第61页，课件共104页，创作于2023年2月分析问题

善于观察思考勤于归纳总结

从抽象的提问中提取关键信息选择合适的搜索引擎,对信息进行放大和精确化归纳总结信息,得出结果

第62页，课件共104页，创作于2023年2月找到：蓝田博士在Science上发现人大脑仍在进化的原始文献分析难点：（1）文献是英文，但没有关键词。（2）已知的信息都不能使用。如蓝田（3）关键词并不是自己熟悉的领域。思考：（1）首先从中文文章中找到一点引子（百度），至少拿到一两个较特异性的关键词，然后再深入（google,pubmed)。检索实例1第63页，课件共104页，创作于2023年2月蓝田大脑进化中山大学干细胞与组织工程研究中心OngoingAdaptiveEvolutionofASPM,aBrainSizeDeterminantinHomosapiens.Science,2005,309(5741):1720-1722/pubmed/16151010?dopt=Abstract第64页，课件共104页，创作于2023年2月请查出美国FDA批准曼地亚红豆杉提取的紫杉醇应用于临床的文件。曼地亚红豆杉紫杉醇TaxusmadiapaclitaxelFDATaxusmadiapaclitaxelsite:检索实例2第65页，课件共104页，创作于2023年2月找出马泰克公司2009年有关DHA的年度报告找出马泰克公司2009年有关配方奶粉的收入是多少？检索实例3第66页，课件共104页，创作于2023年2月马泰克DHAmartekDHA//language_tools?hl=zh-CN年度报告->Annualreport直接在martek网站上找Annualreportsite:第61页第67页，课件共104页，创作于2023年2月寻找JNeurosci杂志的登录网址与登录密码检索实例4Google1、JNeurosci2、"JournalofNeuroscience"password-forget-forgotten-required第68页，课件共104页，创作于2023年2月第69页，课件共104页，创作于2023年2月检索实例5查阅天龙八部具体是哪八部1，如果知道八部中的某一部，比如阿修罗，增加“阿修罗”关键字。“天龙八部阿修罗”的搜索结果就只有1,050项，可以很快找到全部八部。2，如果不知道八部中的任何一部，但知道这与佛教相关，可以排除与金庸小说相关的记录。“天龙八部佛教-金庸”的查询结果为1,120项，可以迅速找到需要的资料。第70页，课件共104页，创作于2023年2月检索实例62008年，有新闻报道，《Nature》上新发表了一篇有关“制备稳定WOW乳液的新方法”的文章，内容如下，Professor对这篇文章很感兴趣，希望你找到这篇文章原稿。请给出适当的检索思路，使得短时间内能找到原稿。第71页，课件共104页，创作于2023年2月Google“naturewow”，找到文章的题目用题目查找文章。第72页，课件共104页，创作于2023年2月检索实例7查找最好的T4DNA连接酶的DNA序列NCBI？NEB公司/nebecomm/products/productm0202.asp第73页，课件共104页，创作于2023年2月第74页，课件共104页，创作于2023年2月/science/article/pii/0378111983900690第75页，课件共104页，创作于2023年2月第76页，课件共104页，创作于2023年2月第77页，课件共104页，创作于2023年2月第78页，课件共104页，创作于2023年2月第79页，课件共104页，创作于2023年2月第80页，课件共104页，创作于2023年2月第81页，课件共104页，创作于2023年2月检索实例8进入同济大学图书馆第82页，课件共104页，创作于2023年2月/prx/000/http/localhost/login国家励志奖学金site:filetype:xls得到一个xls文档，打开大家就明白了。（用baidu）040171/103204040141/024026第83页，课件共104页，创作于2023年2月第84页，课件共104页，创作于2023年2月第85页，课件共104页，创作于2023年2月第86页，课件共104页，创作于2023年2月第87页，课件共104页，创作于2023年2月第88页，课件共104页，创作于2023年2月检索实例9第89页，课件共104页，创作于2023年2月第90页，课件共104页，创作于2023年2月第91页，课件共104页，创作于2023年2月第92页，课件共104页，创作于2023年2月检索实例10中国人民大学图书馆第93页，课件共104页，创作于2023年2月第94页，课件共104页，创作于2023年2月第95页，课件共104页，创作于2023年2月第96页，课件共104页，创作于2023年2月第97页，课件共104页，创作于2023年2月检索实例11利用检索工具防止上当受骗第98页，课件共104页，创作于2023年2月第99页，课件共104页，创作于2023年2月第100页，课件共104页，创作于2023年2月检索实例12第101页，课件共104页，创作于