严超赣的静息态数据处理DataProcessing

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DataProcessing严超赣Ph.D.Candidateycg.

©2008SKLCNL严超赣的静息态数据处理DataProcessingOutline

预处理

ALFF,ReHo,FC计算统计结果呈现文献管理严超赣的静息态数据处理DataProcessing预处理

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Filter:0.01-0.08严超赣的静息态数据处理DataProcessing数据整理被试信息整理严超赣的静息态数据处理DataProcessing数据整理被试信息整理严超赣的静息态数据处理DataProcessing数据整理被试信息整理原始数据整理静息功能数据结构数据DTI数据严超赣的静息态数据处理DataProcessing数据整理被试信息整理原始数据整理静息功能数据结构数据DTI数据严超赣的静息态数据处理DataProcessing预处理

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Filter:0.01-0.08严超赣的静息态数据处理DataProcessingDICOM->NIFTIMRIcroN’sdcm2niiguiSPM5’sDICOMImport严超赣的静息态数据处理DataProcessing预处理

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Filter:0.01-0.08严超赣的静息态数据处理DataProcessingSliceTimingWhy?严超赣的静息态数据处理DataProcessingSliceTimingWhy?Huetteletal.,2004严超赣的静息态数据处理DataProcessingSliceTiming1:2:33,2:2:323322-(2/33)33严超赣的静息态数据处理DataProcessingSliceTiming严超赣的静息态数据处理DataProcessing预处理

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Filter:0.01-0.08严超赣的静息态数据处理DataProcessingRealignWhy?严超赣的静息态数据处理DataProcessingRealign严超赣的静息态数据处理DataProcessingRealign检查头动?b=load(‘rp_name.txt’);c=max(abs(b));c(4:6)=c(4:6)*180/pi;严超赣的静息态数据处理DataProcessing预处理

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Filter:0.01-0.08严超赣的静息态数据处理DataProcessingNormalizeWhy?Huetteletal.,2004严超赣的静息态数据处理DataProcessingmean_name.imgr*.imgEPI.nii-90-126-72;9090108333严超赣的静息态数据处理DataProcessingNormalize严超赣的静息态数据处理DataProcessing预处理

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Filter:0.01-0.08严超赣的静息态数据处理DataProcessingSmoothWhy?减少被试间的空间结构差异；有利统计检验的有效性;严超赣的静息态数据处理DataProcessingw*.img平滑核Smooth严超赣的静息态数据处理DataProcessing预处理

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Filter:0.01-0.08严超赣的静息态数据处理DataProcessing滤波Why?关心低频的活动严超赣的静息态数据处理DataProcessing滤波严超赣的静息态数据处理DataProcessingOutline

预处理

ALFF,ReHo,FC计算统计结果呈现文献管理严超赣的静息态数据处理DataProcessingALFFZangetal.,2007严超赣的静息态数据处理DataProcessingALFF严超赣的静息态数据处理DataProcessingReHo注意：预处理时不做平滑，计算完ReHo后再进行平滑。Zangetal.,2004严超赣的静息态数据处理DataProcessingReHo严超赣的静息态数据处理DataProcessing功能连接提取协变量

头动参数:rp_name.txt

全脑信号、脑脊液、白质信号严超赣的静息态数据处理DataProcessing提取协变量严超赣的静息态数据处理DataProcessing提取协变量严超赣的静息态数据处理DataProcessing提取协变量严超赣的静息态数据处理DataProcessing提取协变量严超赣的静息态数据处理DataProcessing提取协变量严超赣的静息态数据处理DataProcessing提取协变量严超赣的静息态数据处理DataProcessing提取协变量严超赣的静息态数据处理DataProcessing功能连接提取协变量

头动参数:rp_name.txt

全脑信号、脑脊液、白质信号协变量组合：RPCov=load('rp_name.txt');BCWCov=load('ROI_FCMap_name.txt');Cov=[RPCov,BCWCov];save('Cov.txt','Cov','-ASCII','-DOUBLE','-TABS');严超赣的静息态数据处理DataProcessing功能连接Voxel-wiseROI-wiser=0.36严超赣的静息态数据处理DataProcessingVoxel-wise严超赣的静息态数据处理DataProcessingVoxel-wise严超赣的静息态数据处理DataProcessingVoxel-wise严超赣的静息态数据处理DataProcessingVoxel-wise严超赣的静息态数据处理DataProcessingVoxel-wise严超赣的静息态数据处理DataProcessingVoxel-wise严超赣的静息态数据处理DataProcessingVoxel-wise1by1Cov.txt严超赣的静息态数据处理DataProcessingROI-wise严超赣的静息态数据处理DataProcessingROI-wise严超赣的静息态数据处理DataProcessingROI-wise1by1Cov.txt严超赣的静息态数据处理DataProcessingOutline

预处理

ALFF,ReHo,FC计算统计结果呈现文献管理严超赣的静息态数据处理DataProcessing统计单样本T检验双样本T检验严超赣的静息态数据处理DataProcessing单样本T检验统计准备

ALFF:mALFFReHo:smReHoFC:zFC严超赣的静息态数据处理DataProcessing单样本T检验mALFF-1,smReHo-1m图像1by1i1-1严超赣的静息态数据处理DataProcessing单样本T检验m*-1图像;zFC图像存放SPM.mat的目录严超赣的静息态数据处理DataProcessing单样本T检验上一步生成的spm.mat严超赣的静息态数据处理DataProcessing单样本T检验上一步生成的spm.mat1严超赣的静息态数据处理DataProcessing单样本T检验HeightthresholdT=2.687659{p<0.05(FDR)}Extentthresholdk=10voxelsspmT_0001.imgPD_1T.img准备制作双样本T检验的MASK严超赣的静息态数据处理DataProcessing双样本T检验统计准备

ALFF：mALFFReHo:smReHoFC:zFCMask严超赣的静息态数据处理DataProcessing双样本T检验MaskMask=PD_1T.img+CON_1T.img>0PD_1T.imgCON_1T.imgMask_2T.imgi1+i2>0严超赣的静息态数据处理DataProcessing双样本T检验两组的m*图像;zFC图像存放SPM.mat的目录Mask_2T.img严超赣的静息态数据处理DataProcessing双样本T检验上一步生成的spm.mat严超赣的静息态数据处理DataProcessing双样本T检验上一步生成的spm.mat1-1严超赣的静息态数据处理DataProcessing双样本T检验HeightthresholdT=Inf{p<0.05(FDR)}Extentthresholdk=0voxelsspmT_0001.img严超赣的静息态数据处理DataProcessingOutline

预处理

ALFF,ReHo,FC计算统计结果呈现文献管理严超赣的静息态数据处理DataProcessing结果呈现SPM5xjviewrest_sliceviewerMRIcroN严超赣的静息态数据处理DataProcessing结果呈现—SPM5严超赣的静息态数据处理DataProcessing结果呈现—SPM5严超赣的静息态数据处理DataProcessing结果呈现—xjview严超赣的静息态数据处理DataProcessing结果呈现—xjview严超赣的静息态数据处理DataProcessing结果呈现—rest_sliceviewer严超赣的静息态数据处理DataProcessing结果呈现—MRIcroN严超赣的静息态数据处理DataProcessing结果呈现—MRIcroN严超赣的静息态数据处理DataProcessingOutline

预处理

ALFF,ReHo,FC计算统计结果呈现文献管理严超赣的静息态数据处理DataProcessing文献管理严超赣的静息态数据处理DataProcessing文献管理严超赣的静息态数据处理DataProcessing文献管理严超赣的静息态数据