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文档简介
蛋白质的分子结构蛋白质的分子结构包括:
高级结构一级结构(primarystructure)二级结构(secondarystructure)三级结构(tertiarystructure)四级结构(quaternarystructure)生物化学与分子生物学(第9版)定义:蛋白质的一级结构指在蛋白质分子从N-端至C-端的氨基酸排列顺序。一、氨基酸的排列顺序决定蛋白质的一级结构主要的化学键:肽键,有些蛋白质还包括二硫键。生物化学与分子生物学(第9版)一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础,但不是决定蛋白质空间构象的唯一因素。牛胰岛素的一级结构生物化学与分子生物学(第9版)目前已知一级结构的蛋白质数量已相当可观,并且还以更快的速度增加。国际互联网有若干重要的蛋白质数据库,例如:EMBL(EuropeanMolecularBiologyLaboratoryDataLibrary)Genbank(GeneticSequenceDatabank)PIR(ProteinIdentificationResourceSequenceDatabase)收集了大量最新的蛋白质一级结构及其他资料,为蛋白质结构与功能的深入研究提供了便利。生物化学与分子生物学(第9版)二、多肽链的局部主链构象为蛋白质二级结构蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构,即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象
。定义:主要的化学键:氢键
生物化学与分子生物学(第9版)
-螺旋(-helix)
-折叠(-pleatedsheet)
-转角(-turn)
无规卷曲(randomcoil)蛋白质二级结构所谓肽链主链骨架原子即N(氨基氮)、Cα(α-碳原子)和Co(羰基碳)3个原子依次重复排列。
生物化学与分子生物学(第9版)(一)参与肽键形成的6个原子在同一平面上参与肽键的6个原子C1、C、O、N、H、C2位于同一平面,C1和C2在平面上所处的位置为反式(trans)构型,此同一平面上的6个原子构成了所谓的肽单元(peptideunit)。肽键与肽单元生物化学与分子生物学(第9版)(二)α-螺旋结构是常见的蛋白质二级结构蛋白质二级结构
-螺旋(-helix)
-折叠(-pleatedsheet)
-转角(-turn)
无规卷曲(randomcoil)生物化学与分子生物学(第9版)α-螺旋生物化学与分子生物学(第9版)(三)-折叠使多肽链形成片层结构β-折叠生物化学与分子生物学(第9版)(四)-转角和无规卷曲在蛋白质分子中普遍存在-转角无规卷曲是用来阐述没有确定规律性的那部分肽链结构。生物化学与分子生物学(第9版)(五)氨基酸残基的侧链影响二级结构的形成蛋白质二级结构是以一级结构为基础的。一段肽链其氨基酸残基的侧链适合形成-螺旋或β-折叠,它就会出现相应的二级结构。生物化学与分子生物学(第9版)三、多肽链进一步折叠成蛋白质三级结构(一)二级结构可组成蛋白质分子中的模体在许多蛋白质分子中,可发现二个或三个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个有规则的二级结构组合,被称为超二级结构。二级结构组合形式有3种:αα,βαβ,ββ。生物化学与分子生物学(第9版)二个或三个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个特殊的空间构象,称为模体(motif)。模体是具有特殊功能的超二级结构。Βαβ
ββ
亮氨酸拉链
生物化学与分子生物学(第9版)钙结合蛋白中结合钙离子的模体锌指结构α-螺旋-β转角(或环)-α-螺旋模体链-β转角-链模体链-β转角-α-螺旋-β转角-链模体模体常见的形式生物化学与分子生物学(第9版)(二)结构域是三级结构层次上的独立功能区分子量较大的蛋白质常可折叠成多个结构较为紧密且稳定的区域,并各行其功能,称为结构域(domain)。大多数结构域含有序列上连续的100至200个氨基酸残基,若用限制性蛋白酶水解,含多个结构域的蛋白质常分解出独立的结构域,而各结构域的构象可以基本不改变,并保持其功能。超二级结构则不具备这种特点。因此,结构域也可看作是球状蛋白质的独立折叠单位,有较为独立的三维空间结构。生物化学与分子生物学(第9版)3-磷酸甘油醛脱氢酶亚基的结构示意图生物化学与分子生物学(第9版)疏水键、离子键、氢键和范德华力等。主要的化学键:整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中所有原子在三维空间的排布位置。定义:(三)三级结构是指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置生物化学与分子生物学(第9版)
肌红蛋白(Mb)N端C端生物化学与分子生物学(第9版)(a)氢键(b)离子键(c)疏水键维持蛋白质分子构象的各种化学键生物化学与分子生物学(第9版)(四)蛋白质的多肽链须折叠成正确的空间构象分子伴侣(molecularchaperone)通过提供一个保护环境从而加速蛋白质折叠成天然构象或形成四级结构。分子伴侣可逆地与未折叠肽段的疏水部分结合随后松开,如此重复进行可防止错误的聚集发生,使肽链正确折叠。分子伴侣也可与错误聚集的肽段结合,使之解聚后,再诱导其正确折叠。分子伴侣在蛋白质分子折叠过程中二硫键的正确形成起了重要的作用。生物化学与分子生物学(第9版)亚基之间的结合主要是氢键和离子键。四、含有二条以上多肽链的蛋白质具有四级结构蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用,称为蛋白质的四级结构。许多功能性蛋白质分子含有2条或2条以上多肽链。每一条多肽链都有完整的三级结构,称为蛋白质的亚基(subunit)。生物化学与分子生物学(第9版)由2个亚基组成的蛋白质四级结构中,若亚基分子结构相同,称之为同二聚体(homodimer),若亚基分子结构不同,则称之为异二聚体(heterodimer)。血红蛋白的四级结构生物化学与分子生物学(第9版)五、蛋白质的分类根据蛋白质组成成分:单纯蛋白质缀合蛋白质=蛋白质部分+非蛋白质部分根据蛋白质形状:纤维状蛋白质球状蛋白质生物化学与分子生物学(第9版)蛋白质家族(proteinfamily)
:
氨基酸序列相似而
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