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文档简介
实验七
质粒DNA的提取
(碱法)实验目的实验原理实验仪器、材料与试剂实验步骤实验结果及讨论
实验目的了解碱法提取质粒的原理;掌握碱法提取质粒的方法。实验原理
质粒是一种细菌染色体外的、具有自主复制能力的、共价闭合环状超螺旋结构的小型DNA分子。碱裂解法提取质粒是实验室常用的方法。这种方法是根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体DNA在拓扑学上的差异来分离它们。结构的三大要素:
多克隆位点选择标记(耐药性,LacZ)独立的复制单位种类:
质粒噬菌体酵母人工染色体(YAC)反转录病毒载体表达载体等在碱性条件(pH12.5)下,线性染色体DNA的双螺旋结构解开而变性,质粒DNA的氢键虽然断裂但两条互补链彼此缠绕,紧密结合在一起。当加入乙酸钾恢复至中性时,染色体DNA之间交联形成不溶性结构,而质粒DNA分子很快复性,离心时染色体DNA与细胞碎片一起被沉淀出来,而质粒DNA则留在上清液中。用异丙醇或乙醇沉淀后洗涤,可得到较纯的质粒DNA。实验仪器、材料与试剂(一)仪器1.恒温摇床2.超净工作台3.高压灭菌锅4.高速台式离心机5.微量取液器(二)材料含重组质粒的大肠杆菌。(三)试剂1.LB液体培养基(1L)胰蛋白胨10g
酵母提取物5g
NaCl10g
加去离子水至800ml搅拌,使溶质完全溶解,用NaOH调节pH值至7.0,加入去离子水至总体积为1升,高压蒸汽灭菌20分钟。LB固体培养基(1L)在上述LB液体培养基(1L)中加入琼脂粉15g。2.
SolutionⅠ
50mmol/L葡萄糖25mmol/LTris.·Cl(pH8.0)10mmol/L
EDTA(pH8.0)高压灭菌后,4℃保存备用。3.
SolutionⅡ(现用现配制)
0.2mol/LNaOH1%SDS4.
SolutionⅢ(100ml)5mol/LKAc60ml冰醋酸11.5ml水28.5ml
配制成的溶液Ⅲ含3mol/L钾盐、5mol/L醋酸(pH4.8)。5.
氨苄青霉素(Amp)
用无菌水配制成100mg/ml溶液,置-20℃冰箱保存备用。6.
胰RNA酶
将胰RNA酶(RNA酶A)溶于10mmol/LTris.Cl(pH7.5)、15mmol/LNaCl中,配成10mg/ml的浓度,于100℃加热15分钟,缓慢冷却至室温,分装成小份保存于-20℃。7.氯仿,乙醇,70%乙醇。8.TE缓冲液10mMTris.HCl(pH7.4)1mMEDTA(pH8.0)实验步骤
1.用灭菌的牙签挑取单菌落放入50mlLB液体培养基(含Amp0.1mg/ml)中,37℃振荡培养过夜。2.将菌液倒入1.5mlEppendorf管中,12,000rpm离心2min,去掉上清液。将EP管口朝下,用滤纸吸干水分。3.沉淀悬于100μLSolutionI中,涡旋使充分悬浮,盖子打开,室温放5分钟。4.加入200μLSolutionII,混匀(注意动作轻),冰浴5分钟。5.加入1μLRNase和150μLSolutionIII,上下颠倒5-10次,冰浴10分钟。6.12,000rpm,离心5min,将上清移至1个新EP管中,注意所取体积。7.加入2倍体积无水冰乙醇混匀(注意动作轻),-20℃沉淀10min。8.12,000rpm离心3min,弃上清,加入1ml70%乙醇振荡漂洗一次,再10000rpm离心2min,去上清。9.沉淀于-20℃保存备用。Bi清os销pi狮n质粒DN棋A小量亩提取熟试剂慰盒(实际泻用)操作窜过程1.将1~1.疗5m兴l过夜斥培养偏的细舒菌菌监液加拢入1.灰5m古l离心久管中述。2.于10,00周0r速pm离心30秒,耳并弃埋去上敲清液蛇。如有灶需要晋,可薄多次炎重复痰步骤1、2,以立收集得更多谜细菌御菌体钓。但扛勿过柄量,晒以免杜影响仰提取梳质粒竞的质刚量。3.加25丽0μ朽lRe陕su挤sp浊en笛si雹onBu摆ff摇er,重悬骆细菌扛体沉宁淀。重悬丸后应分该没蚊有细充菌团玻块。4.加25课0μ辽l细胞Ly盒si魔sBu增ff臭er,轻柔迁颠倒4~6次。不要易剧烈父振动广,以慎防止顺基因沾组DN傻A被剪扰切。抗注意杨不要傅让反姻应持用续超姨过5分钟山。5.加35聪0μ掀l爽Ne潜ut捷ra共li姨za错ti伍on谅B曾uf假fe妇r,立即由轻柔圾颠倒纳离心馅管4~6次。溶液钱应该论出现沿絮状扩物,匠但不浙会出丘现局子部沉滤淀。6.于13协,0板00洲rp歼m离心10分钟秩。如离陪心机轮转速固不够绑可延漏长离些心时彼间,责直至匪形成静紧密那的白笔色沉李淀。7.将步展骤6离心因后得次到的犯上清悼液转灾移到Sp后in永c煮ol陕um抱n内。斧于6,差00来0r宣pm离心1分钟耍,并钱弃去膏接液挣管内柄液体寻。8.向Sp竟in圆c跌ol队um狸n内加65座0μ粉l肉Wa昼sh吐B施uf撕fe馒r,于12,00颂0g离心30~60秒,呢并弃端去接退液管同内液秤体。9.重复多第8步一蒸次。10符.再次滩于12,00傅0r唉pm离心1分钟低,然毕后将Sp闻in程c愤ol役um是n转移机到无拥菌的1.促5m面l离心握管中送。如殿不进殊行该奴步离灶心,柜则无需法保疑证离未心柱夜内残圈液被瞎彻底肃清除耍。11舰.向Sp向in剩c闯ol舅um赵n内加20过μl链E固lu串ti苍on据B贡uf铃fe饥r、去离宰子水感或TE溶液罩,并托于室纽奉温静局置1分钟咬。可根撞据实雄验的督实际霜需要行决定弱洗脱添液用水量。12寒.于12,00厌0rp拼m离心1分钟闯,1.粮5m倡l离心肺管内耗溶液阳中含袭有质但粒DN谣A。13掉.提取愧的质乔粒DN脑A可直班接用移于各根类下旁游分岔子生姻物学附实验劫,如物果不疾立即
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