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文档简介
教育部化學生物與資訊人才培育銜接計畫蛋白質結構與功能之化學基礎PartI錢嘉琳5/14/2008AminoAcids,Peptides,andProteinsAminoAcidsPeptidesandProteinsProteinStructureProteinSequencesGeneralstructureofaminoacid-carbona-carboxyl
groupa-aminogroupSidechain*Forallthestandardaminoacidsexcept
glycine,thea-carboniscovalentlybonded
tofourdifferentgroups(-COO-,-NH3+,-H
and-R).Thea-carbonisachiralcenter.
*Allmoleculeswithachiralcenterarealso
opticallyactive.Thetwostereoisomersofalinine,L-andD-alanine,arenonsuperimposablemirrorimagesofeachother(enantiomers).StericrelationshipofthestereoisomersofalaninetotheabsoluteconfigurationofL-andD-glyceraldehyde.Theaminoacidresiduesinproteinsare
LstereoisomersAminoacidscanbeclassifiedbyRgroupTryptophanandtyrosineabsorbultravioletlight.Theabsorbancemaximaforbothoccursnearawavelengthof280nm.Phenylalaninegenerallycontributeslittletotheabsorbancepropertiesofproteins,Reversibleformationofadisulfidebondbytheoxidationoftwomoleculesofcysteine.DisulfidebondsbetweenCysresiduesstabilizethestructuresofmanyproteinsTheadditionalcarbonsinanRgrouparecommonlydesignated,,,,andsoforth,proceedingoutfromthecarbon,
PeptidesandProteinsThepolymersofaminoacidsthatarelinkedbypeptidebonds.Theproteinisapolypeptide.FormationofapeptidebondbycondensationThepentapeptideSer-Gly-Tyr-Ala-LeuBio猪log膝ica滋lly何ac轻tiv屿ep顾ept制ide现sa扇nd沸pol店ype赏pti腐des悔oc塌cur舌in葵a蜻vas估tr剑ang伪eo候fs呆ize艺sOxy歇toc稍in:nin潜ea波min梅oa族cid拨re仍sid旋ues高,s拨ecr巨ete猛db破yt宅he偏pos简ter喂ior拒pi寒tui杰tar槽ya府nd先sti膏mul穗ate仁su懒ter唯ine展co龄ntr闯act球ion速s.Gluc晨agon:29邮res架idu姻es,色a饶pan推cre备ati突ch浇orm邻one粗,o枕ppo章sin于gt色he彻act伶ion蔑of狸in疯sul坦in.Leng渣ths强ofp增rote巨ins盘vary仪con庙side残rabl澡yDif勒fer办ent腿pr浆ote仙ins律co茫nta顽in柄dif方fer芒ent火am亩ino泻ac贯id浆com熔pos字iti回onsSom嫁ep滩rot蒙ein强sc数ont支ain忆ch塌emi肝cal简gr涉oup梯so忆the老rt常han罚am氧ino偶ac济idsLeve矛lso显fst或ruct棕ure尽inp西rote什insColu舍mnC错hrom坐atog劳raph路y3.皮Ion踏-ex啦cha妻nge训Ch轮rom摊ato妻gra挣phy4.S盐ize-光excl筑usio听nchr灾oma鸟tog依rap恨hy5.A刑ffin挤itychro菜mato著grap欺hyElec静trop置hore叔sis:银at膀echn甩ique宝for贸the躬sep尽arat恩ion诱ofp拦rote批ins捕isb赢ased虑on预the倘migr战atio约nof唱cha宽rged滥pro合tein穴sin冻an间elec斜tric军fie申ld.Ele币ctr卸oph征ore嫁sis脱of挠pr睁ote失ins最is糠ge血ner贪all菌yc获arr舟ied鞭ou哭ti线ng贴els胆ma梅de誓up雪of际the突cr掀oss欠-li玩nke啊dp装oly倒mer太po君lya睁cry浸lam掘ide疗.The衰po摔lya本cry逆lam破ide岛ge朋la脊cts颗as牺a赛mol干ecu漏lar拢si萌eve喂.S悠epa令rat游ion栗of茄pr钢ote紧ins辫is晃ba谷sed戒on下th踢eir演ch款arg绢e-t驳om筋ass站ra佳tio章.Ele喝ctr柄oph剖ore率sis写in怒th辅ep菌res供enc钳eo是fS砖DS猎se厚par贼ate暑sp雕rot季ein沈so件nt爸he扩bas四is满of饮mol伤ecu束lar址we敢igh供t.SDS纸bi苍nds亮to悬mo更st宪pro妄tei赤ns句in拜amo坡unt早ro歉ugh张ly蹦pro橡por子tio幻玉nal绕to丝式th丑em厘ole赔cul葡ar每wei莫ght品of臣th倘ep否rot羽ein粗.The谋boun惧dSD饮Sco关ntri等bute鹅sa见larg眯ene允tne惰gati壮vec宝harg进e,r拿ende轰ring姑the竟int挤rins艇icc狐harg登eof色the拘pro北tein博ins断igni铺fica劝nt.The蓄na爸tiv戴ec古onf绍orm缺ati同on恭of坟ap凑rot屠ein雷is庆al虎ter舱ed东whe院nS赤DS闲is休bou防nd.Diff蚊eren矛tsa顿mple秃sar稻elo米aded厉in板well棉at童the趁top棕oft冻hepol筹yac反ryl撒ami鲜de箩gel舌.Afte蛙rel喂ectr紧opho倦resi顷s,t纹hep忧rote跑ins萌are别visu屯aliz涂edb局yaddi医nga要dye匆suc旱has役Coo睬mass当ieb勿lue,内whi团chb权inds苦to浊prot收einsSDS-樱PAGE寇can疗est欧imat益eth膝emo抢lecu贤lar喜weig垒hto夸fa室prot权einIso禽ele慕ctr箱ic珠foc劫usi克ng妹at沸ech设niq查ue姻use批dt且od殿ete向rmi头ne幕the致is泡oel滋ect躺ric伐po北int家.Ap速Hg粗rad偷ien订ti制se乓sta服bli返she谷db枝ya浇llo超win腐ga衣mi忠xtu帜re聚of怖amp车hol川yte哨st活od舍ist泽rib与ute读th茂ems驴elv辆es户in小an隐ele享ctr痒ic筛fie足ld貌gen决era耻ted练ac油ros债st速he饮gel词.When问ap殖rote序inm吹ixtu演rei猴sap吵plie团d,e醒ach讯prot价ein舟migr屡ates狡unt磨ili碌tre恳ache怀sth猜epH伪tha阴tma呜tche掏sit夫spI窑.Iso环ele动ctr鞭ic疤foc欺usi翁ngTwo恋-di画men垄sio以nalelec馒trop失hore封sisMor赔et茫han浸1,仇000创di治ffe敢ren糕tp誓rot逃ein笛sf蔑rom倾E廊col壮ic凳an易be决res细olv捞ed厅usi伴ng各thi不st也ech离niq重ueThe哨Fu肿nct科ion锄of签a卸pro占tei届nd止epe不nds慰on勤it份sa灵min恋oa逗cid冲se据que骆nceThe调ba惜cte另riu拨mE闷.c饺oli便pr笑odu干ces豪mo亦re赞tha门n3坛,00铸0d呀iff膜ere里nt驼pro膊tei扇ns;土a迷hum挪an拳pro腿duc冒es羊25,够000傍to促35泡,00办0.Each音typ关eof稳pro妻tein什has勾au助niqu招eth担ree-乒dime刊nsio禁nal特stru更ctur撤ean明dth看iss委truc特ture予con摸fers邪au仍niqu撒efu玩ncti础on.Eac贺ht庸ype磨of奸pr头ote闷in供has遍a盼uni肤que肤am工ino串ac遇id亿seq逼uen蜻ce.Thou德sand沸sof免hum阔ang助enet清ics翠dise监ases弟hav颜ebe档ent贴race情dto昼the垂pro掀duct趋ion程ofd阶efec演tive冷pro惰tein街s.Per时hap痰so择ne-塔thi序rd站of柿the狸se忌pro砍tei宁ns联are旦de厨fec也tiv忠eb薄eca迅use接of纳a板sin贼gle栽ch游ang喂ei巩nt誓hei挥ra乡丰min崖oa冷cid舒se证que赌nce贱;h开enc四e,绳if摔the银pr星ima么ry驶str备uct都ure纪is便al组ter捆ed,姑th忍ef矿unc厨tio闹no渔ft锤he裳pro存tei甲nm薪ay努als肆ob示ec牵han宴ged激.On敏com拔par派ing色fu堆nct竿ion圾all良ys狐imi役lar堡pr锡ote总ins硬of拔ten巧ha边ve标sim障ila驳ra司min珠oa农cid糠se奖que室nce秋s,龟as喊an鞋ext迅rem祖ec采ase备is柔ub姑iqu夸iti荣n.Is展the席am遵ino鹅ac涝id也seq静uen闯ce仓abs怪olu铅tel蓬yf么ixe烫d,旷or倘inv娇ari绝ant斑,f休or慰ap侍ert锈icu颈lar康pr夹ote柜in?NO;重so分me恼fle侧xib泛ili验ty是is送pos鹿sib洪le.An绞est只ima裙ted话20榜%t绍o3忍0%峡of翼the绢pr更ote朗ins觉in债hu狮man斜ar很epoly靠morp漠hic,ha朽ving救ami碎noa逮cid名sequ座ence允var慌iant耽sin坊the柿hum信anp遍opul踢atio在n.Man买yo预ft飞hes课ev小ari朴ati扯ons跃in评se症que属nce漠ha劝ve抵lit咳tle膏or鸽no刘ef恭fec备to冬nt孙he载fun任cti行on笑of荣the丢pr库ote朴in.Alt苏hou按gh障the反am昆ino次ac猎id软seq需uen蛙ce垦in缠som纯er猪egi瞧ons喇of闻th钟ep拳rim化ary亦st辆ruc美tur消em掘igh暮tv慰ary沃co核nsi渣der退abl雕yw猾ith客out眨af诱fec饮tin舟gb雹iol驶ogi炕cal碌fu扔nct跑ion糠,m仙ost抖pr适ote杀ins筐co骂nta必in普cru炉cia罚lr驻egi蝇ons肃th净at环are亏es历sen禽tia含lt奴ot逢hei漂rf开unc早tio年na串nd客who家se半seq捕uen脏ce姑is典the棒ref兵ore怨co立nse投rve棕d.Met爷hod语so壶fp堵rot苏ein颠se贞que诞nci护ngAut醒oma耐ted示Ed辽man看de祥gra疯dat际ionDNA联se鲜que锤nci篮ngMas御ss禾pec冠tro萍met谨ryAmin图oac躬ids村eque断nce邪ofp粒rote船inc眼anb傍ede智duce枕dby也its剪DNA侍seq啦uenc怕eJ.B遵.Fe吧nn(着1917柄~)K.T度ana换ka(195蜻9~)Kur标tW勉üth而ric猜hESISLDNMRThe姑No遍bel减Pr潮ize桌Wi凑nne通rs胖in扣Che欲mis阿try剥20渗02
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