第五章 细菌的分类与命名

第五章细菌的分类与命名第1页，共24页，2023年，2月20日，星期三一、基本概念1．细菌分类根据细菌各自的特征，并按照亲缘关系分类，以不同等级编排系统。分类有两种：第2页，共24页，2023年，2月20日，星期三①细菌的生理生化分类法，包括有传统分类法和数值分类法；②细菌核酸、蛋白质结构的同源程度进行分类法，称种系分类或自然分类。第3页，共24页，2023年，2月20日，星期三2．细菌命名在分类基础上，给每种细菌一个科学名称，便于交流并保证所有的科研工作者给予同样名称。第4页，共24页，2023年，2月20日，星期三3．细菌鉴定将未知细菌按分类原则,确定细菌的分类地位。第5页，共24页，2023年，2月20日，星期三二、分类等级

1.细菌的分类等级依次为界、门、纲、目、科、属、种。细菌属于原核生物界，包括有细菌、放线菌、支原体、衣原体、立克次体和螺旋体。分类等级表示方法如下：目、亚目、科、亚科等。第6页，共24页，2023年，2月20日，星期三2.种是细菌分类的基本单位，将生物学性状基本相同的细菌群体归成一个菌种；性状相近、关系密切的若干菌种组成一个菌属；相近的属归为一科；依次类推。在两个等级之间，可添加次要的分类单位，如亚门、亚纲、亚属和亚种等。群和组不是正式分类等级，具有某种共同特性的某个集体，任何等级都可借用。第7页，共24页，2023年，2月20日，星期三

3.同一菌种在某些方面仍有差异，可再分成亚种，亚种以下的分类等级为型，以区别某些特殊的特征。例如抗原结构不同而分的血清型；对噬菌体敏感性不同的噬菌体型；对细菌素敏感性不同的细菌素型，生化反应和某些生物学性状不同的生物型。

第8页，共24页，2023年，2月20日，星期三4.由不同来源分离的同一种、同一亚种或同一型的细菌，称为株。株是从一次单独分离物的单个原始菌落传代的纯培养物，例如从10

个肺结核患者的痰液中分离出的10株结核分枝杆菌。具有某种细菌典型特征的菌株称为模式菌或标准菌株，它是该种菌株的参比菌株。在细菌的分类、鉴定和命名时以模式菌为依据，也可作为质量控制的标准。第9页，共24页，2023年，2月20日，星期三三、细菌命名法

细菌的学名的生物双名式，具备拉丁化文字形式和明确分类等级的两个特点，即有一个属名和一个种名构成。属名在前，是名词，首字母大写；种名在后，是形容词，均用小写；两者均用斜体表示。细菌学名的中文译名则种名在前，属名在后。第10页，共24页，2023年，2月20日，星期三例如Salmonellatyphi(沙寒沙门菌)。属名也可用第一个字母代表，如Styphi等。有时泛指某一属细菌而不特指其中的某个细菌则可在属名之后加上sp，如Salmonellasp，即表示沙门菌属细菌(sp代表菌种species，复数用spp)；第11页，共24页，2023年，2月20日，星期三如果使用1个亚种的名称，则在种名后再加亚种名如Klesbsiellapenumomaesubspeciespneumomae。第12页，共24页，2023年，2月20日，星期三第二节细菌的分类方法

一、生理学与生化学分类法

细菌的形态、染色以及特殊结构是最早的分类依据，方法有传统分类和数值分类法两种。

第13页，共24页，2023年，2月20日，星期三1．传统分类法19世纪以来，以形态生理特征为依据选择稳定的生物学性状，如形态结构、染色性、培养特性、生化反应、抗原性作为分类依据，然后按主次顺序逐级区分。使用方便，分类亦明确，但有主观性。第14页，共24页，2023年，2月20日，星期三2．数值分类法20世纪60年代，随计算机的应用而发展的分类方法。它对各种生物学性状按“等重要原则”进行分类，选用50项以上的生理生化指标进行比较，分析相似度，划分属和种，并确定亲缘关系。第15页，共24页，2023年，2月20日，星期三二、遗传学分类法遗传学分类是以细菌的核酸、蛋白质等组成的同源程度分类。该分类法的优点是：

第16页，共24页，2023年，2月20日，星期三①对细菌的“种”有较为一致的概念；②使分类不会出现根本性的变化；③可制定可靠的细菌鉴定方案；④有利于了解进化和亲缘关系。第17页，共24页，2023年，2月20日，星期三基因型分类法有如下几种:

1．DNAG+Cmol％测定

DNA分子两条链上4种碱基的总分子量为

100，测定其中G+C或A／T摩尔百分比，能反映出细菌间DNA分子同源程度，习惯上以G+C作为细菌分类标记。不同菌属间的G+Cmol％范围很大，在25％—75％之间，但同一种细菌G+Cmol％相当稳定，不受菌龄、培养条件和其他外界因素影响，亲缘关系越近的细菌，它们

G+Cmol％越相近。第18页，共24页，2023年，2月20日，星期三2．核酸同源值测定利用DNA分子杂交技术测定DNA分子的相似度。其步骤是先提取DNA，加热变性解链,然后将两种变性的DNA(其中一种为标记DNA或rRNA)混合液在一定的温度下保温复性,重新得到杂交的双螺旋DNA分子，鉴定其双螺旋结合率。第19页，共24页，2023年，2月20日，星期三结合率大小反映DNA碱基序列相似程度和菌种间的亲缘关系。同一菌的结合率为100％，80％—90％的同源为同种内、同亚种的细菌，60％-70％的同源性为同种内不同亚种的细菌，20％-60％则认为是同属中的不同菌种。第20页，共24页，2023年，2月20日，星期三3．核蛋白体RNA碱基序列测定细菌核蛋白体RNA序列比较保守，其变化十分缓慢。分离提取细菌

16SrRNA，用T1核酸酶消化，分析寡核苷酸的碱基序列可测出rRNA的相关性。绘制各类群关系和树状谱，从而确定种系的发生关系。第21页，共24页，2023年，2月20日，星期三第三节细菌的分类糸统医学有关的细菌分类表第22页，共24页，2023年，2月20日，星期三Ⅰ类，G—有细胞壁的真细菌

分类依据菌属需氧/微需氧、有动力、螺形螺菌属、弯菌属G—菌螺杆菌属需氧/微需氧、G—杆菌与球菌假单胞菌属、军团菌属、奈瑟菌属、莫拉菌属产碱杆菌属、布鲁斯菌属、罗卡利马体属、鲍特菌属、弗郎西斯菌属兼性厌氧G—杆菌、弧菌埃希菌属、志贺菌属、沙门菌属、克雷伯菌属变形杆菌属、普罗威登斯菌属、耶尔森菌属、弧菌属、巴氏杆菌属、嗜血杆菌属厌氧G—直、弯或螺形杆菌类杆菌属、梭杆菌属厌氧G—球菌韦荣球菌属立克次体与衣原体立克次体属、考克斯体属、衣原体属螺旋体密螺旋体属、疏螺旋体属、钩端螺旋体属第23页，共24页，2023年，2月20日，星期三Ⅱ类，G+有细胞壁的细菌

G+球菌肠球菌属、球菌属链球菌属、消化链球菌属形成芽胞的杆菌芽胞杆菌属、